Protein–RNA interactions for Protein: Q9QXT0

Cnpy2, Protein canopy homolog 2, mousemouse

Predictions only

Length 182 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cnpy2Q9QXT0 Ccdc88a-201ENSMUST00000040182 9376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Cnpy2Q9QXT0 Idnk-201ENSMUST00000051490 764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Cnpy2Q9QXT0 Cebpzos-201ENSMUST00000063817 753 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Cnpy2Q9QXT0 Sult2b1-201ENSMUST00000075571 1193 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Cnpy2Q9QXT0 Gzme-201ENSMUST00000089549 916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Cnpy2Q9QXT0 Kmt5b-213ENSMUST00000176262 3933 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Cnpy2Q9QXT0 Tenm3-204ENSMUST00000110346 2267 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Cnpy2Q9QXT0 Atp2b2-201ENSMUST00000089003 7067 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Cnpy2Q9QXT0 Gja4-201ENSMUST00000053753 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Cnpy2Q9QXT0 Zkscan17-202ENSMUST00000101150 3771 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Cnpy2Q9QXT0 Arpp19-201ENSMUST00000007800 4046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Cnpy2Q9QXT0 Adck1-204ENSMUST00000222695 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Cnpy2Q9QXT0 Ppp1r12b-202ENSMUST00000086444 3137 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Cnpy2Q9QXT0 Olah-203ENSMUST00000194918 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Cnpy2Q9QXT0 Gm12359-202ENSMUST00000141696 713 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Cnpy2Q9QXT0 Gm12359-203ENSMUST00000153181 680 ntTSL 3 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Cnpy2Q9QXT0 Nagpa-201ENSMUST00000023911 2143 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Cnpy2Q9QXT0 Antxr1-205ENSMUST00000205033 3160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Cnpy2Q9QXT0 Gm3468-201ENSMUST00000165193 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Cnpy2Q9QXT0 Gm2956-201ENSMUST00000177786 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Cnpy2Q9QXT0 Ero1lb-203ENSMUST00000221560 1964 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Cnpy2Q9QXT0 Klf7-201ENSMUST00000055001 1477 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Cnpy2Q9QXT0 Cpne6-207ENSMUST00000171643 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Cnpy2Q9QXT0 Lncpint-201ENSMUST00000115107 1676 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Cnpy2Q9QXT0 Irf5-205ENSMUST00000167252 1693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Cnpy2Q9QXT0 5830415G21Rik-201ENSMUST00000192543 1332 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
Cnpy2Q9QXT0 Phf21b-203ENSMUST00000159939 3639 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Cnpy2Q9QXT0 Bicd2-201ENSMUST00000048544 6309 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Cnpy2Q9QXT0 Kcna6-204ENSMUST00000185333 5836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Cnpy2Q9QXT0 Pex5l-206ENSMUST00000108226 2632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Cnpy2Q9QXT0 4930524O07Rik-203ENSMUST00000193135 2289 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
Cnpy2Q9QXT0 Kcnk10-203ENSMUST00000221305 1357 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Cnpy2Q9QXT0 Aaed1-207ENSMUST00000222570 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Cnpy2Q9QXT0 9430015G10Rik-208ENSMUST00000169550 2660 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Cnpy2Q9QXT0 Adipor1-201ENSMUST00000027727 3123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Cnpy2Q9QXT0 Rad23a-202ENSMUST00000109761 1842 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Cnpy2Q9QXT0 Tmx4-203ENSMUST00000110120 2602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Cnpy2Q9QXT0 Myrf-202ENSMUST00000186056 3636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Cnpy2Q9QXT0 Gpr142-202ENSMUST00000106584 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Cnpy2Q9QXT0 Mir8098-201ENSMUST00000184011 137 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
Cnpy2Q9QXT0 Gm27459-201ENSMUST00000184860 107 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
Cnpy2Q9QXT0 Gm43347-201ENSMUST00000200226 580 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
Cnpy2Q9QXT0 AC125350.1-201ENSMUST00000225115 903 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
Cnpy2Q9QXT0 Gpr142-201ENSMUST00000045319 1098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Cnpy2Q9QXT0 Hist1h1a-201ENSMUST00000055770 741 ntAPPRIS P1 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Cnpy2Q9QXT0 Rad51d-203ENSMUST00000092844 1228 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Cnpy2Q9QXT0 Rarb-201ENSMUST00000063750 3108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Cnpy2Q9QXT0 Sdc1-205ENSMUST00000171158 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Cnpy2Q9QXT0 Gm44616-201ENSMUST00000206417 1732 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
Cnpy2Q9QXT0 Adam15-202ENSMUST00000074582 2799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Cnpy2Q9QXT0 Acadvl-202ENSMUST00000102574 2168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Cnpy2Q9QXT0 Tox2-201ENSMUST00000099110 2166 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Cnpy2Q9QXT0 Slc25a29-201ENSMUST00000021693 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Cnpy2Q9QXT0 Phf7-203ENSMUST00000226565 1971 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
Cnpy2Q9QXT0 Zfp879-203ENSMUST00000109134 2414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Cnpy2Q9QXT0 Zfp879-201ENSMUST00000049625 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Cnpy2Q9QXT0 Nat8l-201ENSMUST00000056355 6529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Cnpy2Q9QXT0 Ubqln4-201ENSMUST00000008748 3330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Cnpy2Q9QXT0 Gps1-202ENSMUST00000116305 1827 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Cnpy2Q9QXT0 Tyro3-201ENSMUST00000028763 3989 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Cnpy2Q9QXT0 Gm42473-201ENSMUST00000201056 2291 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
Cnpy2Q9QXT0 Rhcg-201ENSMUST00000032766 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Cnpy2Q9QXT0 Kazn-201ENSMUST00000036476 3843 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Cnpy2Q9QXT0 Podn-203ENSMUST00000106709 3170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Cnpy2Q9QXT0 Ube2e1-201ENSMUST00000022296 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Cnpy2Q9QXT0 Tbp-201ENSMUST00000014911 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Cnpy2Q9QXT0 Nrsn1-204ENSMUST00000167305 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Cnpy2Q9QXT0 Akap7-203ENSMUST00000100012 2321 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Cnpy2Q9QXT0 Nrxn1-206ENSMUST00000160800 5683 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Cnpy2Q9QXT0 Strn-203ENSMUST00000145910 8629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Cnpy2Q9QXT0 Slc9a3r1-201ENSMUST00000021077 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Cnpy2Q9QXT0 Ndufaf3-201ENSMUST00000074208 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Cnpy2Q9QXT0 Mapk8ip3-208ENSMUST00000121787 5431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Cnpy2Q9QXT0 Gm13524-201ENSMUST00000125869 662 ntTSL 3 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Cnpy2Q9QXT0 Gm26871-202ENSMUST00000180774 695 ntTSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Cnpy2Q9QXT0 AC153889.1-201ENSMUST00000219257 330 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
Cnpy2Q9QXT0 Prm2-201ENSMUST00000037996 621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Cnpy2Q9QXT0 Ankle2-206ENSMUST00000197188 4077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Cnpy2Q9QXT0 St6galnac2-201ENSMUST00000079545 3643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Cnpy2Q9QXT0 Helt-201ENSMUST00000058636 1541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Cnpy2Q9QXT0 Asic4-201ENSMUST00000037708 2464 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Cnpy2Q9QXT0 Layn-201ENSMUST00000098782 1786 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Cnpy2Q9QXT0 Ankrd13a-201ENSMUST00000102578 3717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Cnpy2Q9QXT0 Rgma-204ENSMUST00000139780 3371 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Cnpy2Q9QXT0 Nprl3-201ENSMUST00000020530 2865 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Cnpy2Q9QXT0 Gm6190-201ENSMUST00000220683 1374 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
Cnpy2Q9QXT0 Pfkfb4-203ENSMUST00000198140 3488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Cnpy2Q9QXT0 Gm14634-201ENSMUST00000139163 1662 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Cnpy2Q9QXT0 Stat3-207ENSMUST00000138438 2506 ntTSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Cnpy2Q9QXT0 Rasgef1b-206ENSMUST00000161516 2523 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Cnpy2Q9QXT0 Pdzd4-202ENSMUST00000114438 3625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Cnpy2Q9QXT0 Inppl1-201ENSMUST00000035836 4995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Cnpy2Q9QXT0 Axin1-201ENSMUST00000074370 3777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Cnpy2Q9QXT0 Gm5864-201ENSMUST00000202263 970 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
Cnpy2Q9QXT0 Gm40457-201ENSMUST00000205319 1174 ntTSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Cnpy2Q9QXT0 Txnrd3-202ENSMUST00000101171 2494 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Cnpy2Q9QXT0 Syt3-202ENSMUST00000118962 2494 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Cnpy2Q9QXT0 Gm26892-201ENSMUST00000181695 1636 ntTSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Cnpy2Q9QXT0 Cep152-201ENSMUST00000089776 5768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Cnpy2Q9QXT0 Plpp7-201ENSMUST00000057423 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 52.7 ms