Protein–RNA interactions for Protein: Q9QXN3

Trip4, Activating signal cointegrator 1, mousemouse

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Length 581 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trip4Q9QXN3 Cd164-201ENSMUST00000019962 2922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Trip4Q9QXN3 Aftph-201ENSMUST00000035350 3998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Trip4Q9QXN3 Poli-203ENSMUST00000159389 2662 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Trip4Q9QXN3 Smurf2-201ENSMUST00000092517 3125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Trip4Q9QXN3 Appbp2-201ENSMUST00000018625 6463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Trip4Q9QXN3 Cd5-201ENSMUST00000025571 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Trip4Q9QXN3 Gm4609-201ENSMUST00000106443 1002 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
Trip4Q9QXN3 B9d2-201ENSMUST00000108403 1021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Trip4Q9QXN3 Gm5138-201ENSMUST00000113842 1002 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
Trip4Q9QXN3 Gm15191-201ENSMUST00000117933 1000 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
Trip4Q9QXN3 Gm12182-201ENSMUST00000118655 1008 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
Trip4Q9QXN3 Gm13882-201ENSMUST00000120886 1002 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
Trip4Q9QXN3 Gm10284-201ENSMUST00000145057 1005 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
Trip4Q9QXN3 Gm10481-201ENSMUST00000179228 1002 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
Trip4Q9QXN3 Gapdh-ps15-201ENSMUST00000180966 1002 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
Trip4Q9QXN3 Gm2574-201ENSMUST00000181051 1002 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
Trip4Q9QXN3 Gm26549-201ENSMUST00000181112 1209 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Trip4Q9QXN3 4930445N18Rik-202ENSMUST00000181345 1033 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Trip4Q9QXN3 Gm3200-201ENSMUST00000181493 1002 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
Trip4Q9QXN3 Gm8825-201ENSMUST00000182565 998 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
Trip4Q9QXN3 Gm4518-201ENSMUST00000182638 718 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
Trip4Q9QXN3 Gm8330-201ENSMUST00000182754 1008 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
Trip4Q9QXN3 Gm4575-201ENSMUST00000182991 1002 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
Trip4Q9QXN3 Gm8709-201ENSMUST00000183230 1012 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
Trip4Q9QXN3 Gm37584-201ENSMUST00000193595 1290 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
Trip4Q9QXN3 Fosb-206ENSMUST00000208446 1090 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Trip4Q9QXN3 5830454E08Rik-202ENSMUST00000213974 744 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
Trip4Q9QXN3 Gm10293-201ENSMUST00000076317 1002 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
Trip4Q9QXN3 Gm6316-201ENSMUST00000082064 1020 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
Trip4Q9QXN3 Aurkaip1-201ENSMUST00000084097 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Trip4Q9QXN3 Dnaaf3-201ENSMUST00000094897 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Trip4Q9QXN3 Kif7-201ENSMUST00000059836 4521 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Trip4Q9QXN3 Gm8784-201ENSMUST00000222096 1435 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
Trip4Q9QXN3 Ppp1r11-201ENSMUST00000040402 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Trip4Q9QXN3 Gm26904-201ENSMUST00000181301 1742 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Trip4Q9QXN3 Plekhh3-206ENSMUST00000164474 3010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Trip4Q9QXN3 Mapk8ip2-201ENSMUST00000023291 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Trip4Q9QXN3 Lmnb2-202ENSMUST00000105332 1643 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Trip4Q9QXN3 Acap3-201ENSMUST00000079031 4301 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Trip4Q9QXN3 Crebl2-201ENSMUST00000046303 3629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Trip4Q9QXN3 Cdc25a-201ENSMUST00000094324 3632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Trip4Q9QXN3 Marveld1-201ENSMUST00000061111 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Trip4Q9QXN3 Agps-201ENSMUST00000047232 7359 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Trip4Q9QXN3 Rab34-201ENSMUST00000002128 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Trip4Q9QXN3 Shisa2-201ENSMUST00000053949 3119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Trip4Q9QXN3 Rbfox2-206ENSMUST00000227314 1810 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
Trip4Q9QXN3 Jade2-201ENSMUST00000020655 6273 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Trip4Q9QXN3 Ctcf-201ENSMUST00000005841 3782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Trip4Q9QXN3 Nrip1-201ENSMUST00000054178 4529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Trip4Q9QXN3 D16Ertd472e-203ENSMUST00000114220 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Trip4Q9QXN3 Ube2w-201ENSMUST00000117146 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Trip4Q9QXN3 Gm13418-201ENSMUST00000119097 944 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
Trip4Q9QXN3 Gm12480-201ENSMUST00000129576 774 ntTSL 3 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Trip4Q9QXN3 Gm11780-201ENSMUST00000136880 516 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
Trip4Q9QXN3 Gm16194-203ENSMUST00000141239 362 ntTSL 3 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Trip4Q9QXN3 Pmf1-205ENSMUST00000193338 795 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Trip4Q9QXN3 Gabra5-202ENSMUST00000206382 2607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Trip4Q9QXN3 Gm18195-201ENSMUST00000207604 706 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
Trip4Q9QXN3 Gm31727-201ENSMUST00000210102 360 ntTSL 3 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Trip4Q9QXN3 Tac4-201ENSMUST00000021242 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Trip4Q9QXN3 Idnk-201ENSMUST00000051490 764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Trip4Q9QXN3 T-201ENSMUST00000074667 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Trip4Q9QXN3 Trmt2a-202ENSMUST00000100099 2235 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Trip4Q9QXN3 Sucla2-203ENSMUST00000160507 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Trip4Q9QXN3 Kdr-201ENSMUST00000113516 5924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Trip4Q9QXN3 Kcnq2-204ENSMUST00000103047 2899 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Trip4Q9QXN3 Dtwd2-203ENSMUST00000163590 2857 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Trip4Q9QXN3 Hey2-201ENSMUST00000019924 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Trip4Q9QXN3 Smox-204ENSMUST00000110181 2299 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Trip4Q9QXN3 Sf1-203ENSMUST00000113488 2282 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Trip4Q9QXN3 Ankrd10-201ENSMUST00000033905 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Trip4Q9QXN3 Pex5-202ENSMUST00000080557 3073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Trip4Q9QXN3 Lats1-202ENSMUST00000165952 7209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Trip4Q9QXN3 Neu1-201ENSMUST00000007253 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.18
Trip4Q9QXN3 Cachd1-202ENSMUST00000097955 4277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Trip4Q9QXN3 Tcp11-202ENSMUST00000043925 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Trip4Q9QXN3 Ifrd2-201ENSMUST00000010192 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Trip4Q9QXN3 Zfp385b-202ENSMUST00000111829 2073 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Trip4Q9QXN3 Gm26774-201ENSMUST00000181534 2401 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Trip4Q9QXN3 Chrm4-201ENSMUST00000045537 1440 ntAPPRIS P1 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Trip4Q9QXN3 Pcdha3-201ENSMUST00000192503 5332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Trip4Q9QXN3 Mgarp-203ENSMUST00000141156 1246 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Trip4Q9QXN3 H2-T-ps-201ENSMUST00000172538 1067 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
Trip4Q9QXN3 Gm26787-201ENSMUST00000180474 608 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Trip4Q9QXN3 Timm10b-211ENSMUST00000210350 529 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Trip4Q9QXN3 Ndufb9-201ENSMUST00000022980 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Trip4Q9QXN3 Lce3c-201ENSMUST00000055375 567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Trip4Q9QXN3 B4galt7-201ENSMUST00000064701 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Trip4Q9QXN3 Rapsn-201ENSMUST00000050323 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Trip4Q9QXN3 Megf11-210ENSMUST00000164113 6018 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Trip4Q9QXN3 BC030336-201ENSMUST00000060175 4831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Trip4Q9QXN3 Cd2bp2-201ENSMUST00000035771 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Trip4Q9QXN3 Cndp2-201ENSMUST00000025546 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Trip4Q9QXN3 Sox14-201ENSMUST00000054819 2065 ntAPPRIS P1 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Trip4Q9QXN3 Fignl2-202ENSMUST00000213610 4462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Trip4Q9QXN3 Ankrd44-210ENSMUST00000179030 6140 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Trip4Q9QXN3 Ccdc24-201ENSMUST00000106422 1365 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Trip4Q9QXN3 Rbpms-203ENSMUST00000053251 2466 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Trip4Q9QXN3 Grk3-203ENSMUST00000197776 1570 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Trip4Q9QXN3 Cd40-202ENSMUST00000073707 1596 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.6 ms