Protein–RNA interactions for Protein: Q9QXE4

Trp53inp1, Tumor protein p53-inducible nuclear protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 239 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trp53inp1Q9QXE4 Gm13074-201ENSMUST00000124848 2735 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Trp53inp1Q9QXE4 Ccdc158-204ENSMUST00000151180 3352 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Trp53inp1Q9QXE4 Slc5a5-201ENSMUST00000000809 2928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Trp53inp1Q9QXE4 Rb1-201ENSMUST00000022701 4656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Trp53inp1Q9QXE4 R74862-202ENSMUST00000133630 2482 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Trp53inp1Q9QXE4 Dcdc2a-201ENSMUST00000036932 2345 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Trp53inp1Q9QXE4 D430001F17Rik-201ENSMUST00000141344 1858 ntTSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Trp53inp1Q9QXE4 Rnf141-201ENSMUST00000106682 1101 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Trp53inp1Q9QXE4 Gm12963-201ENSMUST00000131846 783 ntTSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Trp53inp1Q9QXE4 Lce1k-201ENSMUST00000179917 663 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Trp53inp1Q9QXE4 Gm26887-201ENSMUST00000181282 547 ntTSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Trp53inp1Q9QXE4 Pnmt-201ENSMUST00000041301 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Trp53inp1Q9QXE4 Pdia3-201ENSMUST00000028683 2770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Trp53inp1Q9QXE4 Dctd-203ENSMUST00000170263 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Trp53inp1Q9QXE4 Ssfa2-201ENSMUST00000111784 4999 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Trp53inp1Q9QXE4 Zfp318-201ENSMUST00000113481 7850 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Trp53inp1Q9QXE4 Ldha-201ENSMUST00000005051 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Trp53inp1Q9QXE4 Hps5-202ENSMUST00000107653 4702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Trp53inp1Q9QXE4 Rnf13-205ENSMUST00000198214 2027 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Trp53inp1Q9QXE4 Golt1a-201ENSMUST00000094557 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Trp53inp1Q9QXE4 Fam174b-201ENSMUST00000107456 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Trp53inp1Q9QXE4 Wt1-201ENSMUST00000111098 2395 ntTSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Trp53inp1Q9QXE4 Ube2d3-212ENSMUST00000197859 3833 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Trp53inp1Q9QXE4 Apaf1-202ENSMUST00000159110 6433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Trp53inp1Q9QXE4 Ptgs1-201ENSMUST00000062069 2867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Trp53inp1Q9QXE4 Ruvbl2-201ENSMUST00000107771 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Trp53inp1Q9QXE4 She-201ENSMUST00000050401 5733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Trp53inp1Q9QXE4 Mettl16-201ENSMUST00000010698 2073 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Trp53inp1Q9QXE4 Ccdc69-201ENSMUST00000055040 1402 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Trp53inp1Q9QXE4 Zbtb25-201ENSMUST00000167011 1681 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Trp53inp1Q9QXE4 Slc38a10-203ENSMUST00000076697 1672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Trp53inp1Q9QXE4 Pitpna-206ENSMUST00000179521 3727 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Trp53inp1Q9QXE4 Psma3-204ENSMUST00000160864 859 ntTSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Trp53inp1Q9QXE4 Shisa5-218ENSMUST00000200515 1005 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Trp53inp1Q9QXE4 Arf2-202ENSMUST00000063347 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Trp53inp1Q9QXE4 Rpl3l-202ENSMUST00000170239 1375 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Trp53inp1Q9QXE4 Zxdc-202ENSMUST00000075117 4126 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Trp53inp1Q9QXE4 Ermp1-203ENSMUST00000159692 7058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Trp53inp1Q9QXE4 Rabep1-201ENSMUST00000076270 5408 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Trp53inp1Q9QXE4 2810408A11Rik-204ENSMUST00000108621 1455 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Trp53inp1Q9QXE4 Lmnb1-201ENSMUST00000025486 2843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Trp53inp1Q9QXE4 Crem-203ENSMUST00000082141 2820 ntTSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Trp53inp1Q9QXE4 Il7-203ENSMUST00000192202 2057 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Trp53inp1Q9QXE4 Col18a1-202ENSMUST00000081654 5063 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Trp53inp1Q9QXE4 Robo3-202ENSMUST00000115038 4797 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Trp53inp1Q9QXE4 Babam1-201ENSMUST00000002473 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Trp53inp1Q9QXE4 Calb2-201ENSMUST00000003754 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Trp53inp1Q9QXE4 Barhl1-201ENSMUST00000050776 3666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Trp53inp1Q9QXE4 Rrbp1-201ENSMUST00000016072 5177 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Trp53inp1Q9QXE4 Rfx7-202ENSMUST00000163401 7880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Trp53inp1Q9QXE4 Gdf15-201ENSMUST00000003808 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Trp53inp1Q9QXE4 Gm10501-201ENSMUST00000151136 2200 ntTSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Trp53inp1Q9QXE4 Myrf-202ENSMUST00000186056 3636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Trp53inp1Q9QXE4 1700052K11Rik-201ENSMUST00000190120 3708 ntBASIC17.23■□□□□ 0.35
Trp53inp1Q9QXE4 Elavl3-203ENSMUST00000215901 3037 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Trp53inp1Q9QXE4 Trim67-202ENSMUST00000167588 8735 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Trp53inp1Q9QXE4 P2ry2-206ENSMUST00000208340 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Trp53inp1Q9QXE4 Ppp3cb-206ENSMUST00000161989 2322 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Trp53inp1Q9QXE4 Btn1a1-202ENSMUST00000110434 1077 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Trp53inp1Q9QXE4 Hrh3-204ENSMUST00000165248 1224 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Trp53inp1Q9QXE4 Ankrd23-204ENSMUST00000194853 1073 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Trp53inp1Q9QXE4 Gm35154-202ENSMUST00000217008 1093 ntTSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Trp53inp1Q9QXE4 AC164629.2-201ENSMUST00000217916 270 ntBASIC17.23■□□□□ 0.35
Trp53inp1Q9QXE4 Birc2-201ENSMUST00000054878 378 ntBASIC17.23■□□□□ 0.35
Trp53inp1Q9QXE4 Angptl8-201ENSMUST00000058777 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Trp53inp1Q9QXE4 Gbe1-203ENSMUST00000163832 2984 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Trp53inp1Q9QXE4 Tgfb2-201ENSMUST00000045288 5116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Trp53inp1Q9QXE4 Gm13285-201ENSMUST00000179725 1462 ntAPPRIS P1 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Trp53inp1Q9QXE4 C2cd2l-206ENSMUST00000214602 2808 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Trp53inp1Q9QXE4 Rnf207-201ENSMUST00000076183 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Trp53inp1Q9QXE4 Cry1-201ENSMUST00000020227 3026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Trp53inp1Q9QXE4 Pprc1-203ENSMUST00000111899 5246 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Trp53inp1Q9QXE4 Rassf1-204ENSMUST00000122225 1783 ntTSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Trp53inp1Q9QXE4 Ocln-205ENSMUST00000160859 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Trp53inp1Q9QXE4 Prss54-201ENSMUST00000052690 1438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Trp53inp1Q9QXE4 Tacc1-201ENSMUST00000084030 7788 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Trp53inp1Q9QXE4 Snx1-201ENSMUST00000034946 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Trp53inp1Q9QXE4 Hacd3-201ENSMUST00000036615 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Trp53inp1Q9QXE4 Gm26761-201ENSMUST00000180650 2192 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Trp53inp1Q9QXE4 1700066M21Rik-201ENSMUST00000042734 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Trp53inp1Q9QXE4 Atf4-201ENSMUST00000109605 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Trp53inp1Q9QXE4 Zdhhc6-209ENSMUST00000225495 1711 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
Trp53inp1Q9QXE4 Atg7-215ENSMUST00000183165 2012 ntTSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Trp53inp1Q9QXE4 Rabggta-205ENSMUST00000227061 2882 ntAPPRIS P1 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Trp53inp1Q9QXE4 E2f7-205ENSMUST00000173634 827 ntTSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Trp53inp1Q9QXE4 Gm26644-201ENSMUST00000181365 958 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Trp53inp1Q9QXE4 Gm28659-201ENSMUST00000188013 759 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
Trp53inp1Q9QXE4 Gtf3c2-202ENSMUST00000200871 318 ntTSL 3 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Trp53inp1Q9QXE4 Mrps18a-201ENSMUST00000024763 884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Trp53inp1Q9QXE4 Ppib-201ENSMUST00000034947 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Trp53inp1Q9QXE4 Ccdc13-202ENSMUST00000135986 2640 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Trp53inp1Q9QXE4 Zyx-207ENSMUST00000203652 2605 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Trp53inp1Q9QXE4 Rassf7-208ENSMUST00000209500 1560 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Trp53inp1Q9QXE4 Rpn2-201ENSMUST00000029171 2621 ntTSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Trp53inp1Q9QXE4 Pcolce-202ENSMUST00000054564 1585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Trp53inp1Q9QXE4 Zfp281-201ENSMUST00000047734 4933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Trp53inp1Q9QXE4 Sirt6-202ENSMUST00000119324 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Trp53inp1Q9QXE4 Lias-202ENSMUST00000122026 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Trp53inp1Q9QXE4 Arntl2-204ENSMUST00000111639 2923 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Trp53inp1Q9QXE4 Irf7-202ENSMUST00000097952 1764 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 54 ms