Protein–RNA interactions for Protein: Q9QXD8

Limd1, LIM domain-containing protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 668 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Limd1Q9QXD8 Ighv1-15-201ENSMUST00000192077 351 ntAPPRIS P1 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Limd1Q9QXD8 Gm7229-201ENSMUST00000214719 1007 ntBASIC17.43■□□□□ 0.38
Limd1Q9QXD8 Meaf6-201ENSMUST00000055213 872 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Limd1Q9QXD8 C920006O11Rik-201ENSMUST00000180974 1444 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Limd1Q9QXD8 Uri1-201ENSMUST00000085513 3441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Limd1Q9QXD8 Stk35-202ENSMUST00000166282 5445 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Limd1Q9QXD8 Eif2b4-201ENSMUST00000077693 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Limd1Q9QXD8 Brsk2-202ENSMUST00000075528 2160 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Limd1Q9QXD8 Prnp-201ENSMUST00000091288 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Limd1Q9QXD8 1700029J07Rik-202ENSMUST00000098786 1340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Limd1Q9QXD8 Dnajc9-201ENSMUST00000022345 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Limd1Q9QXD8 Mis18bp1-208ENSMUST00000222244 2053 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Limd1Q9QXD8 Rgs3-203ENSMUST00000098031 2072 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Limd1Q9QXD8 Sept11-205ENSMUST00000201700 3478 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Limd1Q9QXD8 Ercc6l2-203ENSMUST00000067821 2743 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Limd1Q9QXD8 Mex3a-201ENSMUST00000172699 5778 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Limd1Q9QXD8 Klhl40-201ENSMUST00000098272 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Limd1Q9QXD8 Alcam-201ENSMUST00000023312 6036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Limd1Q9QXD8 Mrpl58-202ENSMUST00000103036 749 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Limd1Q9QXD8 Cyb5rl-204ENSMUST00000106760 840 ntTSL 3 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Limd1Q9QXD8 Naa10-203ENSMUST00000114387 979 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Limd1Q9QXD8 Mymx-202ENSMUST00000169137 616 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Limd1Q9QXD8 Gm44945-201ENSMUST00000206764 1187 ntBASIC17.42■□□□□ 0.38
Limd1Q9QXD8 Gm45231-201ENSMUST00000208629 1064 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Limd1Q9QXD8 Gm19164-201ENSMUST00000210667 640 ntBASIC17.42■□□□□ 0.38
Limd1Q9QXD8 Stard3nl-209ENSMUST00000221380 1268 ntTSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Limd1Q9QXD8 Pak4-202ENSMUST00000108283 2899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Limd1Q9QXD8 Cep104-201ENSMUST00000047497 5151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Limd1Q9QXD8 Pik3r2-201ENSMUST00000034296 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Limd1Q9QXD8 Mzf1-202ENSMUST00000182087 2197 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Limd1Q9QXD8 Mycbp-201ENSMUST00000030400 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Limd1Q9QXD8 Cux1-206ENSMUST00000176172 4882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Limd1Q9QXD8 Bicc1-203ENSMUST00000143791 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Limd1Q9QXD8 Ilkap-201ENSMUST00000027534 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Limd1Q9QXD8 Klhdc4-201ENSMUST00000045884 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Limd1Q9QXD8 Anp32a-201ENSMUST00000085519 2113 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Limd1Q9QXD8 Npas3-201ENSMUST00000101432 5879 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Limd1Q9QXD8 Rala-201ENSMUST00000009003 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Limd1Q9QXD8 Col11a2-203ENSMUST00000114255 5722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Limd1Q9QXD8 Kctd6-202ENSMUST00000170111 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Limd1Q9QXD8 Itpripl2-201ENSMUST00000178344 6865 ntAPPRIS P1 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Limd1Q9QXD8 Hmgn1-201ENSMUST00000050884 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Limd1Q9QXD8 0610025J13Rik-201ENSMUST00000131324 652 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Limd1Q9QXD8 Edn3-203ENSMUST00000140908 731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Limd1Q9QXD8 Gm5253-201ENSMUST00000187104 1025 ntBASIC17.41■□□□□ 0.38
Limd1Q9QXD8 A430093F15Rik-205ENSMUST00000188480 509 ntTSL 3 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Limd1Q9QXD8 Coq10b-202ENSMUST00000087617 834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Limd1Q9QXD8 Dag1-201ENSMUST00000080435 4364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Limd1Q9QXD8 Mybl2-201ENSMUST00000018005 3651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Limd1Q9QXD8 Degs1-201ENSMUST00000035295 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Limd1Q9QXD8 Foxa3-201ENSMUST00000036018 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Limd1Q9QXD8 Rab34-203ENSMUST00000108322 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Limd1Q9QXD8 Gm14634-201ENSMUST00000139163 1662 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Limd1Q9QXD8 Fnbp1-204ENSMUST00000100208 1859 ntTSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Limd1Q9QXD8 Rasip1-201ENSMUST00000057927 3202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Limd1Q9QXD8 Zcchc4-203ENSMUST00000113904 2485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Limd1Q9QXD8 Gm26547-201ENSMUST00000181186 1508 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Limd1Q9QXD8 Clns1a-201ENSMUST00000026506 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Limd1Q9QXD8 Klf14-201ENSMUST00000101589 3056 ntAPPRIS P1 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Limd1Q9QXD8 Large1-204ENSMUST00000212459 4746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Limd1Q9QXD8 9530018F02Rik-201ENSMUST00000219513 2599 ntBASIC17.4■□□□□ 0.38
Limd1Q9QXD8 Htatip2-201ENSMUST00000085272 1418 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Limd1Q9QXD8 Shisa2-201ENSMUST00000053949 3119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Limd1Q9QXD8 Abi2-206ENSMUST00000188594 1658 ntTSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Limd1Q9QXD8 9230020A06Rik-203ENSMUST00000214621 1682 ntTSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Limd1Q9QXD8 Gm45799-202ENSMUST00000106786 409 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Limd1Q9QXD8 Rabepk-202ENSMUST00000113086 1106 ntTSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Limd1Q9QXD8 Tex30-206ENSMUST00000133677 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Limd1Q9QXD8 Fam71e1-204ENSMUST00000205422 366 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Limd1Q9QXD8 AC122024.2-201ENSMUST00000220086 871 ntBASIC17.4■□□□□ 0.38
Limd1Q9QXD8 Ndufaf2-202ENSMUST00000223734 556 ntBASIC17.4■□□□□ 0.38
Limd1Q9QXD8 Tsfm-201ENSMUST00000040560 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Limd1Q9QXD8 Gprc5b-201ENSMUST00000008878 4518 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Limd1Q9QXD8 Rasgrp1-201ENSMUST00000102534 5229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Limd1Q9QXD8 Matk-202ENSMUST00000117488 1980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Limd1Q9QXD8 Eif5-201ENSMUST00000050993 1969 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Limd1Q9QXD8 Gm5648-201ENSMUST00000122244 1587 ntBASIC17.4■□□□□ 0.38
Limd1Q9QXD8 Rnf13-205ENSMUST00000198214 2027 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Limd1Q9QXD8 Tasp1-201ENSMUST00000046656 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Limd1Q9QXD8 Cabp1-201ENSMUST00000031519 1370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Limd1Q9QXD8 Mettl16-201ENSMUST00000010698 2073 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Limd1Q9QXD8 Phykpl-201ENSMUST00000020625 1609 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.38
Limd1Q9QXD8 Rabl2-201ENSMUST00000023294 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.38
Limd1Q9QXD8 Fgfr1-214ENSMUST00000178276 4741 ntTSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.38
Limd1Q9QXD8 Hspa8-201ENSMUST00000015800 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.38
Limd1Q9QXD8 Atp2c1-205ENSMUST00000163879 2408 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Limd1Q9QXD8 Ncoa5-201ENSMUST00000040381 3179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Limd1Q9QXD8 Prrt4-201ENSMUST00000159200 3411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Limd1Q9QXD8 Gm128-201ENSMUST00000090815 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Limd1Q9QXD8 Hnrnpa1-202ENSMUST00000087351 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Limd1Q9QXD8 R3hdm4-202ENSMUST00000171416 1543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Limd1Q9QXD8 Gdap1l1-203ENSMUST00000109421 1206 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Limd1Q9QXD8 Rhox7b-201ENSMUST00000115156 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Limd1Q9QXD8 Gm4913-201ENSMUST00000117075 1290 ntBASIC17.39■□□□□ 0.37
Limd1Q9QXD8 Gm13849-201ENSMUST00000153328 835 ntTSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Limd1Q9QXD8 Tex30-213ENSMUST00000156392 1122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Limd1Q9QXD8 Sap25-206ENSMUST00000177466 1005 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Limd1Q9QXD8 Gm36972-201ENSMUST00000194000 676 ntTSL 3 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Limd1Q9QXD8 Ndufv2-201ENSMUST00000024909 927 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Limd1Q9QXD8 Rpl8-201ENSMUST00000004072 862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22 ms