Protein–RNA interactions for Protein: Q9QVN7

Tcea2, Transcription elongation factor A protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 299 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tcea2Q9QVN7 Efr3b-201ENSMUST00000111178 6547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Tcea2Q9QVN7 Gtpbp3-208ENSMUST00000168847 2803 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Tcea2Q9QVN7 Msh3-205ENSMUST00000187424 666 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Tcea2Q9QVN7 Tmem201-201ENSMUST00000054459 4631 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Tcea2Q9QVN7 Rflna-201ENSMUST00000036109 1681 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Tcea2Q9QVN7 Cdc27-202ENSMUST00000106961 1863 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Tcea2Q9QVN7 N6amt1-201ENSMUST00000054442 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Tcea2Q9QVN7 Slc22a16-202ENSMUST00000078314 2269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Tcea2Q9QVN7 Lhx5-201ENSMUST00000031591 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Tcea2Q9QVN7 Leprotl1-201ENSMUST00000033910 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Tcea2Q9QVN7 Slain1-201ENSMUST00000069443 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Tcea2Q9QVN7 Rnf139-201ENSMUST00000036904 4348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Tcea2Q9QVN7 Gm16201-202ENSMUST00000139218 2330 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Tcea2Q9QVN7 Mal-202ENSMUST00000028854 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Tcea2Q9QVN7 Klhl40-201ENSMUST00000098272 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Tcea2Q9QVN7 Zfp668-201ENSMUST00000054415 5768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Tcea2Q9QVN7 Snx9-201ENSMUST00000002436 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Tcea2Q9QVN7 Npr3-201ENSMUST00000066529 6892 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Tcea2Q9QVN7 Fus-203ENSMUST00000106251 5536 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Tcea2Q9QVN7 Hebp2-203ENSMUST00000214548 2083 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Tcea2Q9QVN7 Fiz1-208ENSMUST00000208944 2306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Tcea2Q9QVN7 Adss-201ENSMUST00000016105 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Tcea2Q9QVN7 Gja4-201ENSMUST00000053753 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Tcea2Q9QVN7 Nagpa-201ENSMUST00000023911 2143 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Tcea2Q9QVN7 Pfkfb4-203ENSMUST00000198140 3488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Tcea2Q9QVN7 Tsnax-201ENSMUST00000075896 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Tcea2Q9QVN7 B3gnt6-201ENSMUST00000098278 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Tcea2Q9QVN7 B3gat2-203ENSMUST00000144602 1488 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Tcea2Q9QVN7 Fam72a-201ENSMUST00000068613 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Tcea2Q9QVN7 Map1s-201ENSMUST00000019405 3314 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Tcea2Q9QVN7 Gm15372-201ENSMUST00000120729 834 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
Tcea2Q9QVN7 Zfp133-ps-202ENSMUST00000124788 1079 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Tcea2Q9QVN7 Snrpf-201ENSMUST00000020203 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Tcea2Q9QVN7 Dcdc2c-201ENSMUST00000020963 1041 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Tcea2Q9QVN7 Zfyve21-204ENSMUST00000221375 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Tcea2Q9QVN7 Rhoc-201ENSMUST00000002303 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Tcea2Q9QVN7 Rfc4-201ENSMUST00000023598 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Tcea2Q9QVN7 Arntl-201ENSMUST00000047321 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Tcea2Q9QVN7 Arhgef2-202ENSMUST00000107510 4390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Tcea2Q9QVN7 Kcnq4-201ENSMUST00000030376 3919 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Tcea2Q9QVN7 Dand5-201ENSMUST00000065539 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Tcea2Q9QVN7 Ubn1-201ENSMUST00000052449 6455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Tcea2Q9QVN7 Ubl7-201ENSMUST00000163329 1364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Tcea2Q9QVN7 Mir124-2hg-202ENSMUST00000186746 1368 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Tcea2Q9QVN7 Arpc1b-211ENSMUST00000196111 1394 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Tcea2Q9QVN7 Slc25a39-201ENSMUST00000018821 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Tcea2Q9QVN7 Pcdha9-201ENSMUST00000115659 5341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Tcea2Q9QVN7 Snx27-202ENSMUST00000107283 3531 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Tcea2Q9QVN7 Ahctf1-201ENSMUST00000027768 8506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Tcea2Q9QVN7 Rnf111-201ENSMUST00000034739 4880 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Tcea2Q9QVN7 Ube2d3-202ENSMUST00000166033 2504 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Tcea2Q9QVN7 Scamp1-201ENSMUST00000022197 4259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Tcea2Q9QVN7 Mycn-201ENSMUST00000043396 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Tcea2Q9QVN7 Shisa5-218ENSMUST00000200515 1005 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Tcea2Q9QVN7 Tead3-201ENSMUST00000114799 2448 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Tcea2Q9QVN7 Tubb4b-201ENSMUST00000043584 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Tcea2Q9QVN7 Bud23-201ENSMUST00000071677 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Tcea2Q9QVN7 Col16a1-201ENSMUST00000044565 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Tcea2Q9QVN7 Lncpint-201ENSMUST00000115107 1676 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Tcea2Q9QVN7 D10Jhu81e-201ENSMUST00000001242 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Tcea2Q9QVN7 Pofut1-203ENSMUST00000099192 1385 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Tcea2Q9QVN7 Map2k5-201ENSMUST00000034920 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Tcea2Q9QVN7 Sctr-201ENSMUST00000072886 2012 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Tcea2Q9QVN7 Ythdf3-202ENSMUST00000108346 4929 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Tcea2Q9QVN7 G3bp2-202ENSMUST00000164378 3026 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Tcea2Q9QVN7 Casq1-201ENSMUST00000003554 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Tcea2Q9QVN7 Malsu1-203ENSMUST00000128616 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Tcea2Q9QVN7 Unc5a-202ENSMUST00000109994 3827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Tcea2Q9QVN7 AC154231.1-201ENSMUST00000220564 2175 ntBASIC15.08■□□□□ 0.01
Tcea2Q9QVN7 Sh2b1-201ENSMUST00000032978 3393 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Tcea2Q9QVN7 Golph3-201ENSMUST00000059680 2652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Tcea2Q9QVN7 Mapk8ip2-201ENSMUST00000023291 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Tcea2Q9QVN7 Serf2-204ENSMUST00000139253 3056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Tcea2Q9QVN7 Thap3-202ENSMUST00000105665 832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Tcea2Q9QVN7 Gm13216-201ENSMUST00000117145 591 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Tcea2Q9QVN7 Gm12536-201ENSMUST00000129102 358 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
Tcea2Q9QVN7 Atp6v0b-208ENSMUST00000150204 935 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Tcea2Q9QVN7 Tsen15-201ENSMUST00000015124 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Tcea2Q9QVN7 Dgcr6-208ENSMUST00000153123 920 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Tcea2Q9QVN7 Hrh3-204ENSMUST00000165248 1224 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Tcea2Q9QVN7 1700001G17Rik-201ENSMUST00000191779 889 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Tcea2Q9QVN7 AC164629.2-201ENSMUST00000217916 270 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Tcea2Q9QVN7 AC127349.1-201ENSMUST00000224590 266 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Tcea2Q9QVN7 Gpank1-201ENSMUST00000052167 1295 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Tcea2Q9QVN7 Gusb-203ENSMUST00000111308 2038 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Tcea2Q9QVN7 Llgl1-201ENSMUST00000052346 4303 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Tcea2Q9QVN7 Wscd2-201ENSMUST00000094452 4302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Tcea2Q9QVN7 Rbfox2-204ENSMUST00000171751 3558 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Tcea2Q9QVN7 Xpo6-201ENSMUST00000009344 4455 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Tcea2Q9QVN7 Ch25h-201ENSMUST00000050562 1350 ntAPPRIS P1 BASIC15.08■□□□□ 0
Tcea2Q9QVN7 Snx11-202ENSMUST00000107661 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Tcea2Q9QVN7 Elavl3-201ENSMUST00000003501 5014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Tcea2Q9QVN7 Kank3-202ENSMUST00000172649 2652 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Tcea2Q9QVN7 Etnk2-203ENSMUST00000135222 2297 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Tcea2Q9QVN7 Chga-201ENSMUST00000021610 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Tcea2Q9QVN7 Gal3st1-201ENSMUST00000063004 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Tcea2Q9QVN7 Gm14317-201ENSMUST00000151754 1464 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Tcea2Q9QVN7 Usp53-201ENSMUST00000090379 6185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Tcea2Q9QVN7 Fignl2-202ENSMUST00000213610 4462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Tcea2Q9QVN7 Fancg-201ENSMUST00000030165 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.4 ms