Protein–RNA interactions for Protein: Q9QUN9

Dkk3, Dickkopf-related protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 349 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Dkk3Q9QUN9 2810474O19Rik-202ENSMUST00000100765 5356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Dkk3Q9QUN9 Dbndd2-204ENSMUST00000109350 1055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Dkk3Q9QUN9 4930401G09Rik-201ENSMUST00000139500 637 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Dkk3Q9QUN9 Hint3-203ENSMUST00000161074 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Dkk3Q9QUN9 Lce1k-201ENSMUST00000179917 663 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Dkk3Q9QUN9 Gm26887-201ENSMUST00000181282 547 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Dkk3Q9QUN9 Ank2-226ENSMUST00000189368 339 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Dkk3Q9QUN9 Ube2t-201ENSMUST00000027687 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Dkk3Q9QUN9 Cebpzos-201ENSMUST00000063817 753 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Dkk3Q9QUN9 Gmnn-201ENSMUST00000006898 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Dkk3Q9QUN9 Cyp2f2-201ENSMUST00000003100 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Dkk3Q9QUN9 Pqlc1-202ENSMUST00000091798 1989 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Dkk3Q9QUN9 Tfdp2-201ENSMUST00000034982 7354 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Dkk3Q9QUN9 E330011M16Rik-201ENSMUST00000193614 1794 ntBASIC15.08■□□□□ 0.01
Dkk3Q9QUN9 Krt83-201ENSMUST00000023718 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Dkk3Q9QUN9 Ccdc174-201ENSMUST00000037783 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Dkk3Q9QUN9 Chpf-202ENSMUST00000094818 3065 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Dkk3Q9QUN9 Glg1-204ENSMUST00000169020 7021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Dkk3Q9QUN9 Pde4dip-201ENSMUST00000045243 6185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Dkk3Q9QUN9 Krt90-201ENSMUST00000023714 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Dkk3Q9QUN9 Zfp281-202ENSMUST00000112046 4937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Dkk3Q9QUN9 Letm2-208ENSMUST00000210616 2974 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Dkk3Q9QUN9 Mipep-201ENSMUST00000063562 3015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Dkk3Q9QUN9 Krt28-201ENSMUST00000006963 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Dkk3Q9QUN9 Itgav-201ENSMUST00000028499 7054 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Dkk3Q9QUN9 Fbrsl1-201ENSMUST00000056124 2700 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
Dkk3Q9QUN9 Mis18bp1-202ENSMUST00000124201 717 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
Dkk3Q9QUN9 1810010D01Rik-204ENSMUST00000208788 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Dkk3Q9QUN9 Rpl18-204ENSMUST00000209693 535 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Dkk3Q9QUN9 Krt10-202ENSMUST00000211768 557 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
Dkk3Q9QUN9 Gm26709-203ENSMUST00000223260 715 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Dkk3Q9QUN9 Etfb-201ENSMUST00000004729 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Dkk3Q9QUN9 Insl6-201ENSMUST00000052380 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Dkk3Q9QUN9 Lce1a1-201ENSMUST00000074142 705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Dkk3Q9QUN9 Hic2-201ENSMUST00000090190 6354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Dkk3Q9QUN9 Gja4-201ENSMUST00000053753 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Dkk3Q9QUN9 Tead3-201ENSMUST00000114799 2448 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Dkk3Q9QUN9 Crem-203ENSMUST00000082141 2820 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Dkk3Q9QUN9 Sgpp1-202ENSMUST00000220285 3200 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Dkk3Q9QUN9 Kdf1-201ENSMUST00000042919 1708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Dkk3Q9QUN9 Zcchc17-202ENSMUST00000134159 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Dkk3Q9QUN9 Arap3-201ENSMUST00000042944 5224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Dkk3Q9QUN9 Ap1s1-201ENSMUST00000111080 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Dkk3Q9QUN9 Tssc4-206ENSMUST00000177841 1364 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
Dkk3Q9QUN9 Hspb6-201ENSMUST00000044048 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Dkk3Q9QUN9 Cables1-202ENSMUST00000171109 3396 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Dkk3Q9QUN9 Bicdl1-201ENSMUST00000055408 3026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Dkk3Q9QUN9 Gm32996-201ENSMUST00000199828 1447 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Dkk3Q9QUN9 Pcdha1-201ENSMUST00000070797 5248 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Dkk3Q9QUN9 Klf9-201ENSMUST00000036884 3263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Dkk3Q9QUN9 Brap-201ENSMUST00000031414 3744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Dkk3Q9QUN9 Cnot11-203ENSMUST00000161515 3482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Dkk3Q9QUN9 Gpr150-201ENSMUST00000056130 2146 ntAPPRIS P1 BASIC15.07■□□□□ 0
Dkk3Q9QUN9 Csnk1e-201ENSMUST00000117786 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Dkk3Q9QUN9 Coch-202ENSMUST00000164782 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Dkk3Q9QUN9 Fdft1-204ENSMUST00000224625 3698 ntAPPRIS P1 BASIC15.07■□□□□ 0
Dkk3Q9QUN9 Stxbp3-205ENSMUST00000138552 1789 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Dkk3Q9QUN9 Rnf181-203ENSMUST00000114095 869 ntTSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
Dkk3Q9QUN9 Gm15952-201ENSMUST00000122858 490 ntTSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
Dkk3Q9QUN9 Hist1h2bc-201ENSMUST00000018246 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Dkk3Q9QUN9 Gm17807-201ENSMUST00000186869 298 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Dkk3Q9QUN9 Gm10459-201ENSMUST00000202708 1155 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Dkk3Q9QUN9 Slc35d2-204ENSMUST00000222168 472 ntTSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
Dkk3Q9QUN9 Hist1h2ba-201ENSMUST00000052776 384 ntAPPRIS P1 BASIC15.07■□□□□ 0
Dkk3Q9QUN9 4930451I11Rik-201ENSMUST00000061695 481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Dkk3Q9QUN9 Emilin3-202ENSMUST00000109454 3396 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Dkk3Q9QUN9 Adnp2-201ENSMUST00000066743 5012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Dkk3Q9QUN9 Cdc27-202ENSMUST00000106961 1863 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Dkk3Q9QUN9 Srpr-201ENSMUST00000034541 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Dkk3Q9QUN9 Cspg5-204ENSMUST00000197850 7868 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Dkk3Q9QUN9 Haghl-201ENSMUST00000077938 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Dkk3Q9QUN9 1700052K11Rik-201ENSMUST00000190120 3708 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Dkk3Q9QUN9 Nipa2-201ENSMUST00000032635 3197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Dkk3Q9QUN9 Sike1-201ENSMUST00000029447 7375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Dkk3Q9QUN9 Ormdl3-201ENSMUST00000052919 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Dkk3Q9QUN9 Hoxaas2-202ENSMUST00000155922 1567 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Dkk3Q9QUN9 Spred1-201ENSMUST00000028829 6016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Dkk3Q9QUN9 Ptn-201ENSMUST00000101534 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Dkk3Q9QUN9 Pla2g2c-201ENSMUST00000030530 1618 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
Dkk3Q9QUN9 Abcd4-201ENSMUST00000021666 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Dkk3Q9QUN9 Slc39a1-201ENSMUST00000015467 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Dkk3Q9QUN9 Cend1-202ENSMUST00000124444 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Dkk3Q9QUN9 Runx2-202ENSMUST00000113571 5898 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Dkk3Q9QUN9 Adgrb2-208ENSMUST00000121049 4871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Dkk3Q9QUN9 Spg21-201ENSMUST00000034955 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Dkk3Q9QUN9 Fbxl16-201ENSMUST00000045692 3478 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Dkk3Q9QUN9 Inpp5e-202ENSMUST00000114090 2790 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Dkk3Q9QUN9 Synm-204ENSMUST00000208231 4457 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Dkk3Q9QUN9 Insr-201ENSMUST00000091291 9355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Dkk3Q9QUN9 A230072E10Rik-203ENSMUST00000175942 2940 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Dkk3Q9QUN9 Cldn7-204ENSMUST00000108597 913 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
Dkk3Q9QUN9 Adal-203ENSMUST00000110662 1231 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Dkk3Q9QUN9 Gm13312-201ENSMUST00000119631 718 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Dkk3Q9QUN9 Mir3081-201ENSMUST00000175305 84 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Dkk3Q9QUN9 Celrr-203ENSMUST00000185678 937 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Dkk3Q9QUN9 Rgs7-203ENSMUST00000192227 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Dkk3Q9QUN9 Gm43077-201ENSMUST00000200602 491 ntTSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
Dkk3Q9QUN9 Spem1-201ENSMUST00000045771 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Dkk3Q9QUN9 Foxg1-204ENSMUST00000179669 3973 ntAPPRIS P1 BASIC15.06■□□□□ 0
Dkk3Q9QUN9 Dpm1-209ENSMUST00000154111 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24 ms