Protein–RNA interactions for Protein: Q9QUG2

Polk, DNA polymerase kappa, mousemouse

Predictions only

Length 852 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PolkQ9QUG2 Ccdc51-201ENSMUST00000026735 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
PolkQ9QUG2 Dph5-204ENSMUST00000189799 1558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
PolkQ9QUG2 Rabl2-201ENSMUST00000023294 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
PolkQ9QUG2 Gpr160-207ENSMUST00000166278 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
PolkQ9QUG2 AC131104.1-201ENSMUST00000222118 1739 ntTSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
PolkQ9QUG2 Uso1-204ENSMUST00000202155 3707 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
PolkQ9QUG2 Ldb1-205ENSMUST00000137771 2014 ntTSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
PolkQ9QUG2 Prr14-201ENSMUST00000033095 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
PolkQ9QUG2 Sec1-201ENSMUST00000040636 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
PolkQ9QUG2 Gm20604-201ENSMUST00000174651 2795 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
PolkQ9QUG2 Myh7b-201ENSMUST00000092995 6163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
PolkQ9QUG2 Rab34-203ENSMUST00000108322 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
PolkQ9QUG2 D16Ertd472e-203ENSMUST00000114220 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
PolkQ9QUG2 Nsmf-205ENSMUST00000114386 2685 ntTSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
PolkQ9QUG2 Gm14701-201ENSMUST00000117156 348 ntBASIC17.34■□□□□ 0.37
PolkQ9QUG2 Spock3-204ENSMUST00000119068 3201 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
PolkQ9QUG2 Rgma-204ENSMUST00000139780 3371 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
PolkQ9QUG2 Gm7063-201ENSMUST00000186840 981 ntBASIC17.34■□□□□ 0.37
PolkQ9QUG2 Tma7-203ENSMUST00000192801 386 ntTSL 3 BASIC17.34■□□□□ 0.37
PolkQ9QUG2 Gm17968-201ENSMUST00000194902 784 ntBASIC17.34■□□□□ 0.37
PolkQ9QUG2 Tmco1-204ENSMUST00000195015 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
PolkQ9QUG2 Gm38318-201ENSMUST00000195769 1706 ntBASIC17.34■□□□□ 0.37
PolkQ9QUG2 AC158538.2-201ENSMUST00000225455 906 ntBASIC17.34■□□□□ 0.37
PolkQ9QUG2 Emg1-201ENSMUST00000004379 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
PolkQ9QUG2 Sfn-201ENSMUST00000057311 1613 ntAPPRIS P1 BASIC17.34■□□□□ 0.37
PolkQ9QUG2 Dmkn-203ENSMUST00000085688 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
PolkQ9QUG2 Mtmr3-202ENSMUST00000109943 5674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
PolkQ9QUG2 Tspoap1-202ENSMUST00000100644 7390 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
PolkQ9QUG2 Rasl10b-202ENSMUST00000108140 3156 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
PolkQ9QUG2 Nsmf-203ENSMUST00000100334 2957 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
PolkQ9QUG2 Fam221a-201ENSMUST00000060561 2730 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
PolkQ9QUG2 Gdf5-201ENSMUST00000040162 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
PolkQ9QUG2 Saysd1-201ENSMUST00000059666 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
PolkQ9QUG2 Ggn-204ENSMUST00000208330 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.37
PolkQ9QUG2 Gusb-203ENSMUST00000111308 2038 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
PolkQ9QUG2 Cpne6-207ENSMUST00000171643 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.37
PolkQ9QUG2 Sigirr-206ENSMUST00000210167 1897 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
PolkQ9QUG2 Mael-202ENSMUST00000194057 1691 ntTSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.37
PolkQ9QUG2 Itpkb-201ENSMUST00000070181 6235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
PolkQ9QUG2 Rnase10-202ENSMUST00000164632 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
PolkQ9QUG2 Mir7036b-201ENSMUST00000184791 63 ntBASIC17.33■□□□□ 0.36
PolkQ9QUG2 Thap4-205ENSMUST00000189728 713 ntTSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
PolkQ9QUG2 Gm37335-201ENSMUST00000192656 447 ntTSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
PolkQ9QUG2 Mt3-201ENSMUST00000034211 536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
PolkQ9QUG2 Ccdc182-201ENSMUST00000037268 1204 ntAPPRIS P1 BASIC17.33■□□□□ 0.36
PolkQ9QUG2 Tm9sf1-205ENSMUST00000122358 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
PolkQ9QUG2 Gm18336-201ENSMUST00000180787 2298 ntAPPRIS P1 BASIC17.33■□□□□ 0.36
PolkQ9QUG2 Gm5898-201ENSMUST00000121016 2071 ntBASIC17.33■□□□□ 0.36
PolkQ9QUG2 Zdhhc1-203ENSMUST00000212303 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
PolkQ9QUG2 Gm3739-201ENSMUST00000165744 2011 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
PolkQ9QUG2 Gm128-201ENSMUST00000090815 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
PolkQ9QUG2 Nsmf-201ENSMUST00000006646 2922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
PolkQ9QUG2 Acbd6-201ENSMUST00000035560 5592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
PolkQ9QUG2 Mink1-202ENSMUST00000072873 4610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
PolkQ9QUG2 Clvs2-203ENSMUST00000160299 2610 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
PolkQ9QUG2 Gm14634-201ENSMUST00000139163 1662 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
PolkQ9QUG2 Pard3-209ENSMUST00000160272 5815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
PolkQ9QUG2 Chst8-201ENSMUST00000078686 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
PolkQ9QUG2 Large1-204ENSMUST00000212459 4746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
PolkQ9QUG2 Fam109a-203ENSMUST00000198271 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
PolkQ9QUG2 Lonp1-201ENSMUST00000047226 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
PolkQ9QUG2 Anp32a-201ENSMUST00000085519 2113 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
PolkQ9QUG2 Bicc1-203ENSMUST00000143791 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
PolkQ9QUG2 Mef2b-203ENSMUST00000110143 1312 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
PolkQ9QUG2 A230087F16Rik-202ENSMUST00000181561 1303 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
PolkQ9QUG2 Plcxd1-201ENSMUST00000086687 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
PolkQ9QUG2 Pou2f2-206ENSMUST00000108418 1934 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
PolkQ9QUG2 Usf2-202ENSMUST00000108119 849 ntTSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
PolkQ9QUG2 Slc7a10-203ENSMUST00000135452 629 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
PolkQ9QUG2 Rhox2a-202ENSMUST00000173650 735 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
PolkQ9QUG2 Rhox2c-204ENSMUST00000184688 720 ntTSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
PolkQ9QUG2 AC127302.2-201ENSMUST00000215212 268 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
PolkQ9QUG2 Mapk7-203ENSMUST00000108714 3069 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
PolkQ9QUG2 Man2a2-201ENSMUST00000098346 6554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
PolkQ9QUG2 Klhl31-201ENSMUST00000057781 6494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
PolkQ9QUG2 Abcd4-201ENSMUST00000021666 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
PolkQ9QUG2 9230020A06Rik-203ENSMUST00000214621 1682 ntTSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
PolkQ9QUG2 Sbk2-202ENSMUST00000182214 2236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
PolkQ9QUG2 Hcn2-202ENSMUST00000099513 3195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
PolkQ9QUG2 Umad1-202ENSMUST00000159335 2615 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
PolkQ9QUG2 Lrrc47-205ENSMUST00000169622 3468 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
PolkQ9QUG2 Vsig10l-204ENSMUST00000203769 2473 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
PolkQ9QUG2 Pak4-202ENSMUST00000108283 2899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
PolkQ9QUG2 Sgpp1-201ENSMUST00000021450 3323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
PolkQ9QUG2 Inhbc-201ENSMUST00000026472 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
PolkQ9QUG2 Grk6-207ENSMUST00000225925 2769 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
PolkQ9QUG2 Arhgap39-202ENSMUST00000077821 4494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
PolkQ9QUG2 Brsk2-202ENSMUST00000075528 2160 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
PolkQ9QUG2 Xpo4-209ENSMUST00000174545 8680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
PolkQ9QUG2 Letmd1-201ENSMUST00000037001 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
PolkQ9QUG2 Disc1-201ENSMUST00000074562 2597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
PolkQ9QUG2 Disc1-203ENSMUST00000098311 2597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
PolkQ9QUG2 Commd5-202ENSMUST00000109793 920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
PolkQ9QUG2 Ndufa5-202ENSMUST00000118558 315 ntTSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
PolkQ9QUG2 Gm28308-201ENSMUST00000128102 752 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.31■□□□□ 0.36
PolkQ9QUG2 AC124549.3-201ENSMUST00000225541 367 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
PolkQ9QUG2 Ly6d-201ENSMUST00000040404 744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
PolkQ9QUG2 Pomgnt2-206ENSMUST00000216669 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
PolkQ9QUG2 Cdv3-202ENSMUST00000072249 3787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
PolkQ9QUG2 Sirt4-202ENSMUST00000112067 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 64.9 ms