Protein–RNA interactions for Protein: Q9JMK2

Csnk1e, Casein kinase I isoform epsilon, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 416 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Csnk1eQ9JMK2 Tmprss5-201ENSMUST00000070390 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Csnk1eQ9JMK2 Cask-201ENSMUST00000033321 4057 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Csnk1eQ9JMK2 Dhdds-203ENSMUST00000105886 1015 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Csnk1eQ9JMK2 Gm16151-201ENSMUST00000129696 639 ntTSL 3 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Csnk1eQ9JMK2 Ndufa1-201ENSMUST00000016571 419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Csnk1eQ9JMK2 Spr-ps1-202ENSMUST00000186281 706 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Csnk1eQ9JMK2 Gm44596-201ENSMUST00000204223 647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Csnk1eQ9JMK2 Gm7787-201ENSMUST00000216858 688 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
Csnk1eQ9JMK2 Zswim1-201ENSMUST00000017908 2705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Csnk1eQ9JMK2 Lzts2-201ENSMUST00000039016 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Csnk1eQ9JMK2 Penk-201ENSMUST00000070375 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Csnk1eQ9JMK2 Acaa2-201ENSMUST00000041053 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Csnk1eQ9JMK2 Uhmk1-201ENSMUST00000027979 7864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Csnk1eQ9JMK2 Cables1-201ENSMUST00000046948 3202 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Csnk1eQ9JMK2 Sfn-201ENSMUST00000057311 1613 ntAPPRIS P1 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Csnk1eQ9JMK2 Pgm3-202ENSMUST00000072585 1920 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Csnk1eQ9JMK2 Plppr2-201ENSMUST00000046371 2626 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Csnk1eQ9JMK2 Lmnb2-202ENSMUST00000105332 1643 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Csnk1eQ9JMK2 Cbarp-201ENSMUST00000105369 3121 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Csnk1eQ9JMK2 Gm14701-201ENSMUST00000117156 348 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
Csnk1eQ9JMK2 Nrip2-202ENSMUST00000120405 1468 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Csnk1eQ9JMK2 Slc38a6-204ENSMUST00000126488 589 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Csnk1eQ9JMK2 Gm13403-202ENSMUST00000134271 674 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Csnk1eQ9JMK2 6430710C18Rik-203ENSMUST00000136807 1540 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Csnk1eQ9JMK2 Fam241b-208ENSMUST00000142796 1135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Csnk1eQ9JMK2 1700051A21Rik-201ENSMUST00000147937 1516 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Csnk1eQ9JMK2 Crem-228ENSMUST00000150235 2662 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Csnk1eQ9JMK2 Gm26547-201ENSMUST00000181186 1508 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Csnk1eQ9JMK2 Gm26517-201ENSMUST00000181279 1172 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Csnk1eQ9JMK2 Rhbdl1-202ENSMUST00000183929 1349 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Csnk1eQ9JMK2 2010010A06Rik-203ENSMUST00000190465 650 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Csnk1eQ9JMK2 Cdkn1a-201ENSMUST00000023829 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Csnk1eQ9JMK2 Ndufv2-201ENSMUST00000024909 927 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Csnk1eQ9JMK2 Sclt1-201ENSMUST00000026866 3005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Csnk1eQ9JMK2 Rflna-201ENSMUST00000036109 1681 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Csnk1eQ9JMK2 Cmtm8-201ENSMUST00000047013 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Csnk1eQ9JMK2 Chmp2b-201ENSMUST00000004965 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Csnk1eQ9JMK2 Cadm3-201ENSMUST00000005470 2518 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Csnk1eQ9JMK2 Cdkn2d-201ENSMUST00000086374 1264 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Csnk1eQ9JMK2 Slc25a23-201ENSMUST00000040280 3362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Csnk1eQ9JMK2 Mpped2-202ENSMUST00000111063 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Csnk1eQ9JMK2 Ggnbp2-201ENSMUST00000018547 2478 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Csnk1eQ9JMK2 Arhgef7-205ENSMUST00000110909 4926 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Csnk1eQ9JMK2 Gm5421-201ENSMUST00000181698 2354 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
Csnk1eQ9JMK2 Senp3-202ENSMUST00000066760 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Csnk1eQ9JMK2 Nagpa-201ENSMUST00000023911 2143 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Csnk1eQ9JMK2 Trappc11-202ENSMUST00000120987 2060 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Csnk1eQ9JMK2 Mrps27-201ENSMUST00000052249 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Csnk1eQ9JMK2 Idh2-201ENSMUST00000107384 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Csnk1eQ9JMK2 Vac14-201ENSMUST00000034190 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Csnk1eQ9JMK2 Fam103a1-202ENSMUST00000118190 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Csnk1eQ9JMK2 Lancl1-203ENSMUST00000119559 1385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Csnk1eQ9JMK2 Csk-201ENSMUST00000034863 2749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Csnk1eQ9JMK2 Mrpl58-202ENSMUST00000103036 749 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Csnk1eQ9JMK2 Meig1-203ENSMUST00000115082 603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Csnk1eQ9JMK2 Acyp1-203ENSMUST00000117138 735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Csnk1eQ9JMK2 0610025J13Rik-201ENSMUST00000131324 652 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Csnk1eQ9JMK2 Gm44492-201ENSMUST00000197012 141 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
Csnk1eQ9JMK2 AC159295.1-201ENSMUST00000225326 940 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
Csnk1eQ9JMK2 Tspo-201ENSMUST00000047419 837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Csnk1eQ9JMK2 Pex1-202ENSMUST00000121291 4555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Csnk1eQ9JMK2 Dag1-201ENSMUST00000080435 4364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Csnk1eQ9JMK2 Chpt1-201ENSMUST00000020253 3898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Csnk1eQ9JMK2 Eefsec-201ENSMUST00000165242 2679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Csnk1eQ9JMK2 Smtnl1-201ENSMUST00000028471 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Csnk1eQ9JMK2 Zbtb22-201ENSMUST00000053429 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Csnk1eQ9JMK2 Gjb1-202ENSMUST00000119080 1513 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Csnk1eQ9JMK2 Gm26675-201ENSMUST00000181068 1525 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Csnk1eQ9JMK2 Clns1a-201ENSMUST00000026506 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Csnk1eQ9JMK2 Fam178b-202ENSMUST00000170295 2286 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Csnk1eQ9JMK2 1600014C10Rik-207ENSMUST00000179503 784 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Csnk1eQ9JMK2 Thap4-205ENSMUST00000189728 713 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Csnk1eQ9JMK2 AC155714.1-201ENSMUST00000214033 956 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Csnk1eQ9JMK2 AC151836.1-202ENSMUST00000226259 753 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
Csnk1eQ9JMK2 Lce1b-201ENSMUST00000029531 647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Csnk1eQ9JMK2 Mt3-201ENSMUST00000034211 536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Csnk1eQ9JMK2 Rpl8-201ENSMUST00000004072 862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Csnk1eQ9JMK2 Hist1h3c-201ENSMUST00000091752 630 ntAPPRIS P1 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Csnk1eQ9JMK2 Klhl42-201ENSMUST00000036003 6267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Csnk1eQ9JMK2 Dmrtb1-201ENSMUST00000069271 1861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Csnk1eQ9JMK2 Sctr-202ENSMUST00000189037 1819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Csnk1eQ9JMK2 Tbc1d12-201ENSMUST00000037302 4209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Csnk1eQ9JMK2 Rbpj-203ENSMUST00000113865 5440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Csnk1eQ9JMK2 Iqsec2-203ENSMUST00000112605 6017 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Csnk1eQ9JMK2 Wnt10b-206ENSMUST00000228546 2709 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
Csnk1eQ9JMK2 Ckap4-202ENSMUST00000167671 2606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Csnk1eQ9JMK2 Coro2a-202ENSMUST00000107756 4154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Csnk1eQ9JMK2 Gm8189-202ENSMUST00000211035 2039 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Csnk1eQ9JMK2 Asic2-201ENSMUST00000021045 3436 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Csnk1eQ9JMK2 Cdc27-202ENSMUST00000106961 1863 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Csnk1eQ9JMK2 Cabp1-201ENSMUST00000031519 1370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Csnk1eQ9JMK2 Whrn-206ENSMUST00000102867 4013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Csnk1eQ9JMK2 Cd151-203ENSMUST00000177840 1708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Csnk1eQ9JMK2 Dlk1-203ENSMUST00000109842 1129 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Csnk1eQ9JMK2 Gm15920-201ENSMUST00000118998 402 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
Csnk1eQ9JMK2 1700025N23Rik-201ENSMUST00000186189 915 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Csnk1eQ9JMK2 Gm7063-201ENSMUST00000186840 981 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
Csnk1eQ9JMK2 Gm9682-201ENSMUST00000197505 556 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
Csnk1eQ9JMK2 5033428I22Rik-203ENSMUST00000210614 952 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Csnk1eQ9JMK2 Prdx4-201ENSMUST00000026328 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.3 ms