Protein–RNA interactions for Protein: Q9JME7

Trappc2l, Trafficking protein particle complex subunit 2-like protein, mousemouse

Predictions only

Length 139 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trappc2lQ9JME7 4933436I20Rik-201ENSMUST00000189405 1434 ntTSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
Trappc2lQ9JME7 Cadps2-204ENSMUST00000115356 3533 ntTSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
Trappc2lQ9JME7 Pcnx3-201ENSMUST00000068169 5276 ntTSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
Trappc2lQ9JME7 Mapt-202ENSMUST00000106988 2202 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.56□□□□□ -0.4
Trappc2lQ9JME7 Trip10-201ENSMUST00000019631 2224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
Trappc2lQ9JME7 Etv3-202ENSMUST00000119109 5309 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
Trappc2lQ9JME7 Scube1-201ENSMUST00000016907 3991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
Trappc2lQ9JME7 Nsl1-203ENSMUST00000139340 837 ntTSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
Trappc2lQ9JME7 Gm15889-201ENSMUST00000159142 1083 ntTSL 3 BASIC12.56□□□□□ -0.4
Trappc2lQ9JME7 Sct-202ENSMUST00000167790 507 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
Trappc2lQ9JME7 2310033P09Rik-201ENSMUST00000020719 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
Trappc2lQ9JME7 Cox4i1-201ENSMUST00000034276 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
Trappc2lQ9JME7 Sct-201ENSMUST00000046156 534 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
Trappc2lQ9JME7 Ripply2-201ENSMUST00000058846 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
Trappc2lQ9JME7 Exosc5-201ENSMUST00000079634 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
Trappc2lQ9JME7 Fxn-201ENSMUST00000081333 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
Trappc2lQ9JME7 Gm14634-201ENSMUST00000139163 1662 ntTSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
Trappc2lQ9JME7 Lamb2-201ENSMUST00000065014 5629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
Trappc2lQ9JME7 Ntrk2-205ENSMUST00000224402 2284 ntBASIC12.56□□□□□ -0.4
Trappc2lQ9JME7 Tead4-201ENSMUST00000006311 3076 ntTSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
Trappc2lQ9JME7 Men1-204ENSMUST00000113500 2742 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.56□□□□□ -0.4
Trappc2lQ9JME7 2810013P06Rik-201ENSMUST00000186531 2137 ntBASIC12.56□□□□□ -0.4
Trappc2lQ9JME7 Rhbg-201ENSMUST00000171887 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
Trappc2lQ9JME7 Tmem248-202ENSMUST00000111298 3570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
Trappc2lQ9JME7 Nrg1-218ENSMUST00000209107 2972 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.56□□□□□ -0.4
Trappc2lQ9JME7 Arid5a-208ENSMUST00000137906 5504 ntTSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
Trappc2lQ9JME7 Gatc-201ENSMUST00000139167 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
Trappc2lQ9JME7 Rassf7-208ENSMUST00000209500 1560 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.56□□□□□ -0.4
Trappc2lQ9JME7 Nptn-212ENSMUST00000177292 1390 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.56□□□□□ -0.4
Trappc2lQ9JME7 Zfyve27-207ENSMUST00000169536 5611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
Trappc2lQ9JME7 Lhfpl3-202ENSMUST00000197992 3115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
Trappc2lQ9JME7 Mphosph8-201ENSMUST00000116468 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
Trappc2lQ9JME7 Gm19684-201ENSMUST00000173128 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
Trappc2lQ9JME7 Homer2-206ENSMUST00000207983 1634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
Trappc2lQ9JME7 Taf15-201ENSMUST00000021018 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
Trappc2lQ9JME7 Tnn-201ENSMUST00000039178 5817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
Trappc2lQ9JME7 Trim2-203ENSMUST00000107691 7428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
Trappc2lQ9JME7 Anks1b-219ENSMUST00000182600 1697 ntTSL 5 BASIC12.55□□□□□ -0.4
Trappc2lQ9JME7 Rtn3-201ENSMUST00000025667 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
Trappc2lQ9JME7 Chaf1b-201ENSMUST00000023666 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
Trappc2lQ9JME7 Prrc2a-206ENSMUST00000174805 6741 ntTSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
Trappc2lQ9JME7 Kdf1-201ENSMUST00000042919 1708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
Trappc2lQ9JME7 Macrod2-201ENSMUST00000043836 3552 ntTSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
Trappc2lQ9JME7 Spdya-202ENSMUST00000124001 1247 ntTSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
Trappc2lQ9JME7 Pabpc1l2b-ps-201ENSMUST00000124538 690 ntBASIC12.55□□□□□ -0.4
Trappc2lQ9JME7 H2afz-207ENSMUST00000174561 810 ntTSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
Trappc2lQ9JME7 Cenps-207ENSMUST00000177408 689 ntTSL 2 BASIC12.55□□□□□ -0.4
Trappc2lQ9JME7 1700025A08Rik-201ENSMUST00000200753 609 ntBASIC12.55□□□□□ -0.4
Trappc2lQ9JME7 Olfr464-201ENSMUST00000074874 1084 ntAPPRIS P1 BASIC12.55□□□□□ -0.4
Trappc2lQ9JME7 Gm10812-201ENSMUST00000099864 546 ntBASIC12.55□□□□□ -0.4
Trappc2lQ9JME7 Dgke-201ENSMUST00000000285 5208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
Trappc2lQ9JME7 Phf21b-203ENSMUST00000159939 3639 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
Trappc2lQ9JME7 Rtn1-202ENSMUST00000078505 3629 ntTSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
Trappc2lQ9JME7 Acot7-206ENSMUST00000167926 1505 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
Trappc2lQ9JME7 Erg-207ENSMUST00000171646 1519 ntTSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
Trappc2lQ9JME7 Fa2h-201ENSMUST00000038475 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
Trappc2lQ9JME7 Creg2-201ENSMUST00000053355 6091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
Trappc2lQ9JME7 Asb2-204ENSMUST00000149431 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
Trappc2lQ9JME7 Pfkfb4-203ENSMUST00000198140 3488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
Trappc2lQ9JME7 Wbp1-202ENSMUST00000113936 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
Trappc2lQ9JME7 Hmg20b-213ENSMUST00000167481 1321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.55□□□□□ -0.4
Trappc2lQ9JME7 Polr1c-201ENSMUST00000087026 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
Trappc2lQ9JME7 Pax8-201ENSMUST00000028355 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
Trappc2lQ9JME7 Mvp-202ENSMUST00000165096 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
Trappc2lQ9JME7 Cyp2u1-201ENSMUST00000106337 4378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
Trappc2lQ9JME7 Smox-203ENSMUST00000110180 1617 ntTSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
Trappc2lQ9JME7 Snapc3-201ENSMUST00000030206 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
Trappc2lQ9JME7 Eif4a2-201ENSMUST00000023599 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
Trappc2lQ9JME7 Dpagt1-201ENSMUST00000054708 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
Trappc2lQ9JME7 Nr1h2-203ENSMUST00000107911 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
Trappc2lQ9JME7 Syde2-204ENSMUST00000212479 3810 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.54□□□□□ -0.4
Trappc2lQ9JME7 Slc35e4-202ENSMUST00000109995 3063 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.54□□□□□ -0.4
Trappc2lQ9JME7 Slc35e4-201ENSMUST00000051207 3059 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
Trappc2lQ9JME7 Myrf-202ENSMUST00000186056 3636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
Trappc2lQ9JME7 Gusb-203ENSMUST00000111308 2038 ntTSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
Trappc2lQ9JME7 Mfsd4b3-201ENSMUST00000095749 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
Trappc2lQ9JME7 Kctd8-201ENSMUST00000054095 2859 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
Trappc2lQ9JME7 Zfp786-201ENSMUST00000058844 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
Trappc2lQ9JME7 Snx8-201ENSMUST00000031539 2627 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
Trappc2lQ9JME7 Flt4-201ENSMUST00000020617 6255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
Trappc2lQ9JME7 Il6ra-202ENSMUST00000197679 8639 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
Trappc2lQ9JME7 Taco1os-201ENSMUST00000140736 644 ntTSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
Trappc2lQ9JME7 B430219N15Rik-201ENSMUST00000147230 835 ntTSL 2 BASIC12.54□□□□□ -0.4
Trappc2lQ9JME7 Khdc3-204ENSMUST00000173734 1228 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
Trappc2lQ9JME7 Arl2-201ENSMUST00000025893 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
Trappc2lQ9JME7 Mvb12a-201ENSMUST00000034272 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
Trappc2lQ9JME7 Irak1bp1-201ENSMUST00000034783 1159 ntTSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
Trappc2lQ9JME7 Cd2bp2-201ENSMUST00000035771 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
Trappc2lQ9JME7 Zfp995-205ENSMUST00000190066 2221 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.54□□□□□ -0.4
Trappc2lQ9JME7 Ss18l1-201ENSMUST00000041126 4343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
Trappc2lQ9JME7 Isg20l2-201ENSMUST00000055984 2893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
Trappc2lQ9JME7 Nap1l4-201ENSMUST00000072727 2285 ntTSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
Trappc2lQ9JME7 Ero1lb-203ENSMUST00000221560 1964 ntTSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
Trappc2lQ9JME7 Tcta-201ENSMUST00000044725 1668 ntTSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
Trappc2lQ9JME7 Rhpn2-201ENSMUST00000032705 3508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
Trappc2lQ9JME7 Otud4-203ENSMUST00000173286 7213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
Trappc2lQ9JME7 Gm4756-201ENSMUST00000207585 1716 ntTSL 5 BASIC12.54□□□□□ -0.4
Trappc2lQ9JME7 Golph3-201ENSMUST00000059680 2652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
Trappc2lQ9JME7 Zfp385b-202ENSMUST00000111829 2073 ntTSL 5 BASIC12.53□□□□□ -0.4
Trappc2lQ9JME7 Slc35b2-202ENSMUST00000223987 1766 ntBASIC12.53□□□□□ -0.4
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.7 ms