Protein–RNA interactions for Protein: Q9JLB9

Nectin3, Nectin-3, mousemouse

Predictions only

Length 549 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nectin3Q9JLB9 Fbxo36-201ENSMUST00000097672 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Nectin3Q9JLB9 Tead2-203ENSMUST00000107801 3396 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Nectin3Q9JLB9 Ttll3-202ENSMUST00000038889 3114 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Nectin3Q9JLB9 Mau2-204ENSMUST00000212308 2887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Nectin3Q9JLB9 AC013548.1-201ENSMUST00000228850 4738 ntAPPRIS P1 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Nectin3Q9JLB9 Ggn-205ENSMUST00000209019 2148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Nectin3Q9JLB9 Abcg5-202ENSMUST00000163375 1613 ntTSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Nectin3Q9JLB9 Gm26892-201ENSMUST00000181695 1636 ntTSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Nectin3Q9JLB9 Zbed5-201ENSMUST00000041466 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Nectin3Q9JLB9 Nlk-201ENSMUST00000142739 4444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Nectin3Q9JLB9 Plxnc1-201ENSMUST00000099337 7302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Nectin3Q9JLB9 Ube2e1-201ENSMUST00000022296 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
Nectin3Q9JLB9 Tbcb-201ENSMUST00000006254 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
Nectin3Q9JLB9 Pax8-201ENSMUST00000028355 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
Nectin3Q9JLB9 Agbl3-205ENSMUST00000115017 3719 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
Nectin3Q9JLB9 Smarcd1-201ENSMUST00000023759 3153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
Nectin3Q9JLB9 Ppp1r2-201ENSMUST00000060188 4078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
Nectin3Q9JLB9 Phc2-201ENSMUST00000030588 3949 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.04
Nectin3Q9JLB9 Parp6-201ENSMUST00000026267 2709 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.04
Nectin3Q9JLB9 Tmx4-201ENSMUST00000038228 5488 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Nectin3Q9JLB9 Hmg20b-204ENSMUST00000122993 1502 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Nectin3Q9JLB9 Strn4-202ENSMUST00000108495 3082 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Nectin3Q9JLB9 Mastl-201ENSMUST00000028119 5590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Nectin3Q9JLB9 Slc25a32-201ENSMUST00000022908 5905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Nectin3Q9JLB9 Pcsk6-201ENSMUST00000055576 4405 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.04
Nectin3Q9JLB9 Gm10231-201ENSMUST00000181584 441 ntBASIC14.83□□□□□ -0.04
Nectin3Q9JLB9 Gm27389-201ENSMUST00000183622 195 ntBASIC14.83□□□□□ -0.04
Nectin3Q9JLB9 Atp5g2-202ENSMUST00000185641 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Nectin3Q9JLB9 Nsg1-204ENSMUST00000201363 820 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.83□□□□□ -0.04
Nectin3Q9JLB9 Gm43791-201ENSMUST00000202914 468 ntTSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.04
Nectin3Q9JLB9 Gm10175-202ENSMUST00000208752 441 ntBASIC14.83□□□□□ -0.04
Nectin3Q9JLB9 Gm26709-202ENSMUST00000223049 819 ntTSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.04
Nectin3Q9JLB9 AL731706.1-201ENSMUST00000227806 944 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.83□□□□□ -0.04
Nectin3Q9JLB9 Uchl3-201ENSMUST00000002289 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Nectin3Q9JLB9 Krtap1-5-201ENSMUST00000054532 1041 ntAPPRIS P1 BASIC14.83□□□□□ -0.04
Nectin3Q9JLB9 Atp5g2-201ENSMUST00000075630 441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Nectin3Q9JLB9 Tdg-201ENSMUST00000092266 2959 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Nectin3Q9JLB9 Nagk-203ENSMUST00000113851 1323 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Nectin3Q9JLB9 Cdkn1b-201ENSMUST00000003115 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Nectin3Q9JLB9 Fam221a-201ENSMUST00000060561 2730 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Nectin3Q9JLB9 Anks1b-214ENSMUST00000182356 7561 ntTSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.04
Nectin3Q9JLB9 Stxbp3-201ENSMUST00000102621 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Nectin3Q9JLB9 Cdhr5-201ENSMUST00000080654 2133 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Nectin3Q9JLB9 Il11ra1-204ENSMUST00000108042 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Nectin3Q9JLB9 Dok2-201ENSMUST00000022698 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Nectin3Q9JLB9 4933436I20Rik-201ENSMUST00000189405 1434 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Nectin3Q9JLB9 Ube2d1-201ENSMUST00000020085 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Nectin3Q9JLB9 Entpd6-201ENSMUST00000094467 2540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Nectin3Q9JLB9 Usp53-201ENSMUST00000090379 6185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Nectin3Q9JLB9 Tpcn1-201ENSMUST00000046426 4712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Nectin3Q9JLB9 Siglece-201ENSMUST00000032667 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Nectin3Q9JLB9 Gm14317-201ENSMUST00000151754 1464 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Nectin3Q9JLB9 Rnf14-203ENSMUST00000171461 3351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Nectin3Q9JLB9 Poli-203ENSMUST00000159389 2662 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Nectin3Q9JLB9 Kcnq4-201ENSMUST00000030376 3919 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Nectin3Q9JLB9 Miga1-205ENSMUST00000199397 2842 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Nectin3Q9JLB9 Irf3-201ENSMUST00000003284 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Nectin3Q9JLB9 Disc1-208ENSMUST00000122389 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Nectin3Q9JLB9 Fam229a-201ENSMUST00000106043 558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Nectin3Q9JLB9 Gm13420-201ENSMUST00000129574 1091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Nectin3Q9JLB9 Prr3-209ENSMUST00000174849 581 ntTSL 2 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Nectin3Q9JLB9 Fgf8-201ENSMUST00000026240 1117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Nectin3Q9JLB9 Atp23-201ENSMUST00000026504 903 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Nectin3Q9JLB9 Mtx2-201ENSMUST00000028511 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Nectin3Q9JLB9 Cltb-201ENSMUST00000049575 1004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Nectin3Q9JLB9 Lce1h-201ENSMUST00000051521 706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Nectin3Q9JLB9 4933427E11Rik-201ENSMUST00000056711 1214 ntBASIC14.82□□□□□ -0.04
Nectin3Q9JLB9 Dock1-206ENSMUST00000211593 2589 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Nectin3Q9JLB9 Serf2-204ENSMUST00000139253 3056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Nectin3Q9JLB9 Sf1-203ENSMUST00000113488 2282 ntTSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Nectin3Q9JLB9 Gbe1-203ENSMUST00000163832 2984 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Nectin3Q9JLB9 Arl4c-202ENSMUST00000159814 3997 ntAPPRIS P1 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Nectin3Q9JLB9 Adam9-204ENSMUST00000208247 4044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Nectin3Q9JLB9 Vwa5b2-203ENSMUST00000100074 2512 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Nectin3Q9JLB9 Cpeb2-205ENSMUST00000169035 7050 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Nectin3Q9JLB9 Tead4-201ENSMUST00000006311 3076 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Nectin3Q9JLB9 Mettl16-201ENSMUST00000010698 2073 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Nectin3Q9JLB9 Tle3-218ENSMUST00000178113 5205 ntTSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
Nectin3Q9JLB9 Dsn1-202ENSMUST00000103130 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Nectin3Q9JLB9 Rsph6a-202ENSMUST00000076887 1580 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Nectin3Q9JLB9 Slc39a11-203ENSMUST00000106633 2688 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Nectin3Q9JLB9 4833445I07Rik-201ENSMUST00000193193 1642 ntBASIC14.81□□□□□ -0.04
Nectin3Q9JLB9 Wipi1-201ENSMUST00000047186 3338 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Nectin3Q9JLB9 Stx6-201ENSMUST00000027743 4589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Nectin3Q9JLB9 Mff-211ENSMUST00000161648 1715 ntTSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
Nectin3Q9JLB9 Olah-203ENSMUST00000194918 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Nectin3Q9JLB9 Txnrd3-202ENSMUST00000101171 2494 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Nectin3Q9JLB9 Nup98-205ENSMUST00000211022 3132 ntTSL 2 BASIC14.81□□□□□ -0.04
Nectin3Q9JLB9 Elavl3-201ENSMUST00000003501 5014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Nectin3Q9JLB9 Dnajc1-202ENSMUST00000091418 5070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Nectin3Q9JLB9 Dcxr-202ENSMUST00000106148 830 ntTSL 2 BASIC14.81□□□□□ -0.04
Nectin3Q9JLB9 Utp23-204ENSMUST00000161651 582 ntTSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
Nectin3Q9JLB9 Ndufab1-ps-201ENSMUST00000166096 468 ntBASIC14.81□□□□□ -0.04
Nectin3Q9JLB9 Gm26827-201ENSMUST00000181911 148 ntTSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
Nectin3Q9JLB9 Gm29707-201ENSMUST00000196325 491 ntBASIC14.81□□□□□ -0.04
Nectin3Q9JLB9 Gm18101-201ENSMUST00000215769 548 ntBASIC14.81□□□□□ -0.04
Nectin3Q9JLB9 Mrpl14-201ENSMUST00000024734 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Nectin3Q9JLB9 Banf1-201ENSMUST00000025762 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Nectin3Q9JLB9 Vpreb1-201ENSMUST00000075017 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Nectin3Q9JLB9 Myoz1-201ENSMUST00000090469 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 163.5 ms