Protein–RNA interactions for Protein: Q9JKY5

Hip1r, Huntingtin-interacting protein 1-related protein, mousemouse

Predictions only

Length 1,068 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hip1rQ9JKY5 Usp27x-201ENSMUST00000115744 3240 ntAPPRIS P1 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Hip1rQ9JKY5 Specc1-210ENSMUST00000201723 2690 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Hip1rQ9JKY5 Wipf3-204ENSMUST00000132855 4516 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Hip1rQ9JKY5 Rd3-203ENSMUST00000181512 1760 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Hip1rQ9JKY5 Rffl-206ENSMUST00000108173 3489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Hip1rQ9JKY5 Esr1-203ENSMUST00000105589 2612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Hip1rQ9JKY5 Axin1-202ENSMUST00000118904 2833 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Hip1rQ9JKY5 Zkscan8-202ENSMUST00000110481 728 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Hip1rQ9JKY5 Fam107b-203ENSMUST00000115053 688 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Hip1rQ9JKY5 Chd3os-202ENSMUST00000151617 389 ntTSL 3 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Hip1rQ9JKY5 Snrpf-201ENSMUST00000020203 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Hip1rQ9JKY5 Hs3st2-202ENSMUST00000206880 1149 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Hip1rQ9JKY5 AC108846.1-201ENSMUST00000214531 513 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
Hip1rQ9JKY5 AC159641.1-201ENSMUST00000221117 177 ntTSL 3 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Hip1rQ9JKY5 Cmtm5-203ENSMUST00000227441 610 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
Hip1rQ9JKY5 Fcnb-201ENSMUST00000028179 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Hip1rQ9JKY5 Gm9857-201ENSMUST00000050914 393 ntAPPRIS P1 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Hip1rQ9JKY5 Ntrk2-205ENSMUST00000224402 2284 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
Hip1rQ9JKY5 Gm19430-201ENSMUST00000193847 2137 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
Hip1rQ9JKY5 Cd2bp2-201ENSMUST00000035771 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Hip1rQ9JKY5 Tpd52-205ENSMUST00000120143 6317 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Hip1rQ9JKY5 Men1-203ENSMUST00000079327 2639 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Hip1rQ9JKY5 Anxa2-201ENSMUST00000034756 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Hip1rQ9JKY5 Nrxn1-216ENSMUST00000174331 6282 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Hip1rQ9JKY5 Mif4gd-203ENSMUST00000106507 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Hip1rQ9JKY5 Ifngr1-201ENSMUST00000020188 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Hip1rQ9JKY5 Nhlrc4-201ENSMUST00000085027 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Hip1rQ9JKY5 G3bp2-202ENSMUST00000164378 3026 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Hip1rQ9JKY5 Urgcp-201ENSMUST00000053427 5527 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Hip1rQ9JKY5 Nap1l1-201ENSMUST00000065917 1486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Hip1rQ9JKY5 Naa35-201ENSMUST00000022038 3793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Hip1rQ9JKY5 Zfp42-202ENSMUST00000209356 1744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Hip1rQ9JKY5 Lrch1-205ENSMUST00000228252 3125 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Hip1rQ9JKY5 Pgam1-ps2-201ENSMUST00000117129 765 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
Hip1rQ9JKY5 AC127349.1-201ENSMUST00000224590 266 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
Hip1rQ9JKY5 Tomm22-201ENSMUST00000023062 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Hip1rQ9JKY5 Olfr571-201ENSMUST00000061738 969 ntAPPRIS P1 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Hip1rQ9JKY5 Slc25a3-206ENSMUST00000170810 1341 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Hip1rQ9JKY5 Dscc1-201ENSMUST00000023059 1324 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Hip1rQ9JKY5 Mettl7a2-202ENSMUST00000176287 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Hip1rQ9JKY5 Mettl7a2-201ENSMUST00000088142 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Hip1rQ9JKY5 Dok1-201ENSMUST00000089651 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Hip1rQ9JKY5 Rbfox2-204ENSMUST00000171751 3558 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Hip1rQ9JKY5 Kctd12-202ENSMUST00000184744 6057 ntAPPRIS P1 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Hip1rQ9JKY5 Fhl1-201ENSMUST00000023854 2356 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Hip1rQ9JKY5 Kctd8-201ENSMUST00000054095 2859 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Hip1rQ9JKY5 Cadps2-202ENSMUST00000069074 3935 ntTSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Hip1rQ9JKY5 Rcc2-202ENSMUST00000071169 3999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Hip1rQ9JKY5 B020017C02Rik-201ENSMUST00000197444 1688 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
Hip1rQ9JKY5 Oxr1-206ENSMUST00000170127 4251 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Hip1rQ9JKY5 Snrk-201ENSMUST00000118886 4811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Hip1rQ9JKY5 Tef-201ENSMUST00000023024 4079 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Hip1rQ9JKY5 Ppp2r2a-204ENSMUST00000225380 1988 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
Hip1rQ9JKY5 Apeh-206ENSMUST00000193254 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Hip1rQ9JKY5 Dnal4-201ENSMUST00000023055 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Hip1rQ9JKY5 Cep152-201ENSMUST00000089776 5768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Hip1rQ9JKY5 Tmem150b-202ENSMUST00000086364 2822 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Hip1rQ9JKY5 Tmem87b-201ENSMUST00000110325 4807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Hip1rQ9JKY5 Gm14964-202ENSMUST00000149574 716 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Hip1rQ9JKY5 Tsfm-207ENSMUST00000152054 655 ntTSL 3 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Hip1rQ9JKY5 Sec61g-206ENSMUST00000166950 754 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Hip1rQ9JKY5 Gm25745-201ENSMUST00000174945 133 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
Hip1rQ9JKY5 Sec61g-207ENSMUST00000178855 779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Hip1rQ9JKY5 Gm28626-201ENSMUST00000187004 520 ntTSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Hip1rQ9JKY5 Calm2-201ENSMUST00000040440 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Hip1rQ9JKY5 Ppt1-202ENSMUST00000097902 1191 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Hip1rQ9JKY5 Bicdl1-204ENSMUST00000121746 1568 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Hip1rQ9JKY5 Sh3bp2-203ENSMUST00000118545 3034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Hip1rQ9JKY5 Kdelc2-201ENSMUST00000037853 3642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Hip1rQ9JKY5 Grk6-202ENSMUST00000099482 2169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Hip1rQ9JKY5 Lefty2-201ENSMUST00000085797 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Hip1rQ9JKY5 Gm6583-201ENSMUST00000051117 2233 ntAPPRIS P1 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Hip1rQ9JKY5 Cbl-204ENSMUST00000205968 2809 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Hip1rQ9JKY5 Arrdc1-201ENSMUST00000028349 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Hip1rQ9JKY5 Wnk1-202ENSMUST00000060043 10575 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Hip1rQ9JKY5 Nubpl-201ENSMUST00000040090 2987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Hip1rQ9JKY5 Gm44729-201ENSMUST00000206759 2052 ntBASIC18.14■□□□□ 0.5
Hip1rQ9JKY5 Ldha-201ENSMUST00000005051 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
Hip1rQ9JKY5 Krt90-201ENSMUST00000023714 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Hip1rQ9JKY5 Slc39a7-201ENSMUST00000025186 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Hip1rQ9JKY5 Arrdc1-202ENSMUST00000102935 1574 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Hip1rQ9JKY5 Lmnb2-202ENSMUST00000105332 1643 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Hip1rQ9JKY5 Bud23-201ENSMUST00000071677 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Hip1rQ9JKY5 Crybb1-202ENSMUST00000112375 793 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Hip1rQ9JKY5 Gm15372-201ENSMUST00000120729 834 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
Hip1rQ9JKY5 Tmem208-201ENSMUST00000015000 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Hip1rQ9JKY5 Gm13054-201ENSMUST00000154192 820 ntTSL 3 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Hip1rQ9JKY5 Tulp3-205ENSMUST00000157005 1053 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Hip1rQ9JKY5 Gm17178-201ENSMUST00000163273 357 ntTSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Hip1rQ9JKY5 Gm44264-201ENSMUST00000203049 742 ntTSL 3 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Hip1rQ9JKY5 Mgst3-201ENSMUST00000028005 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Hip1rQ9JKY5 Hist1h2ab-201ENSMUST00000078369 473 ntAPPRIS P1 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Hip1rQ9JKY5 Hist1h3g-201ENSMUST00000080859 530 ntAPPRIS P1 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Hip1rQ9JKY5 Spr-ps1-201ENSMUST00000089584 605 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
Hip1rQ9JKY5 Rab34-203ENSMUST00000108322 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Hip1rQ9JKY5 Ift74-202ENSMUST00000107104 1713 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Hip1rQ9JKY5 Celf1-201ENSMUST00000005643 4830 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Hip1rQ9JKY5 Rmi2-201ENSMUST00000037913 3742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Hip1rQ9JKY5 Arpc1b-211ENSMUST00000196111 1394 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Hip1rQ9JKY5 Sox13-201ENSMUST00000094551 1842 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.8 ms