Protein–RNA interactions for Protein: Q9JKV5

Scamp4, Secretory carrier-associated membrane protein 4, mousemouse

Predictions only

Length 230 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Scamp4Q9JKV5 AC069562.2-201ENSMUST00000224644 2146 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
Scamp4Q9JKV5 Wwox-207ENSMUST00000160862 1715 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Scamp4Q9JKV5 Lca5l-202ENSMUST00000113804 3162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Scamp4Q9JKV5 Cnbd2-201ENSMUST00000037096 2277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Scamp4Q9JKV5 Flot1-209ENSMUST00000174080 1383 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Scamp4Q9JKV5 Smad3-201ENSMUST00000034973 5090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Scamp4Q9JKV5 Col18a1-202ENSMUST00000081654 5063 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Scamp4Q9JKV5 Phtf1-202ENSMUST00000063717 3327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Scamp4Q9JKV5 Wdr41-203ENSMUST00000160115 2851 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Scamp4Q9JKV5 Slc35c2-203ENSMUST00000109299 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Scamp4Q9JKV5 Mxd4-201ENSMUST00000042701 3872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Scamp4Q9JKV5 Col13a1-203ENSMUST00000105452 3037 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Scamp4Q9JKV5 Erg-207ENSMUST00000171646 1519 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Scamp4Q9JKV5 Chn1-203ENSMUST00000112024 4050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Scamp4Q9JKV5 Chn1-210ENSMUST00000180045 4050 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Scamp4Q9JKV5 Synpo-206ENSMUST00000130360 5159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Scamp4Q9JKV5 Tstd3-201ENSMUST00000029915 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Scamp4Q9JKV5 Spag16-201ENSMUST00000065425 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Scamp4Q9JKV5 Map2k3-201ENSMUST00000019076 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Scamp4Q9JKV5 Parg-204ENSMUST00000164137 3013 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Scamp4Q9JKV5 Gm1043-204ENSMUST00000207866 4296 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Scamp4Q9JKV5 Nrip2-201ENSMUST00000001561 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Scamp4Q9JKV5 Spdya-201ENSMUST00000064420 1877 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Scamp4Q9JKV5 Afg1l-201ENSMUST00000041024 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Scamp4Q9JKV5 Eda-202ENSMUST00000113775 5088 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Scamp4Q9JKV5 Scml4-203ENSMUST00000105495 1033 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Scamp4Q9JKV5 9430038I01Rik-202ENSMUST00000117404 699 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Scamp4Q9JKV5 Pym1-202ENSMUST00000163377 1158 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Scamp4Q9JKV5 Pmf1-205ENSMUST00000193338 795 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Scamp4Q9JKV5 1700016B15Rik-201ENSMUST00000209027 733 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
Scamp4Q9JKV5 1700012D14Rik-201ENSMUST00000209597 605 ntTSL 3 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Scamp4Q9JKV5 Pdcd6-201ENSMUST00000022060 1131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Scamp4Q9JKV5 Acyp2-201ENSMUST00000074613 863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Scamp4Q9JKV5 Chst14-202ENSMUST00000110837 1991 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Scamp4Q9JKV5 1700034J05Rik-202ENSMUST00000111622 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Scamp4Q9JKV5 Gm5837-201ENSMUST00000191844 1369 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
Scamp4Q9JKV5 Mrps2-201ENSMUST00000038600 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Scamp4Q9JKV5 Myc-202ENSMUST00000159327 2186 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Scamp4Q9JKV5 Aste1-202ENSMUST00000123807 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Scamp4Q9JKV5 Ercc6l2-202ENSMUST00000021926 1592 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Scamp4Q9JKV5 Large2-201ENSMUST00000068586 2445 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Scamp4Q9JKV5 Jakmip1-202ENSMUST00000121010 2496 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Scamp4Q9JKV5 Rnf145-201ENSMUST00000019333 3570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Scamp4Q9JKV5 Dhcr24-201ENSMUST00000047973 4028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Scamp4Q9JKV5 Gramd4-204ENSMUST00000138134 4292 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Scamp4Q9JKV5 Anks6-201ENSMUST00000084616 3552 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Scamp4Q9JKV5 Rcc2-201ENSMUST00000038893 3767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Scamp4Q9JKV5 Drap1-202ENSMUST00000113673 744 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Scamp4Q9JKV5 Gm12480-201ENSMUST00000129576 774 ntTSL 3 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Scamp4Q9JKV5 Pantr2-201ENSMUST00000180589 463 ntTSL 3 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Scamp4Q9JKV5 Gm5864-201ENSMUST00000202263 970 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
Scamp4Q9JKV5 Hmgb1-rs17-201ENSMUST00000210634 972 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
Scamp4Q9JKV5 Pabpn1l-202ENSMUST00000212966 1113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Scamp4Q9JKV5 Gm6296-201ENSMUST00000222599 943 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
Scamp4Q9JKV5 Magohb-201ENSMUST00000032307 767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Scamp4Q9JKV5 Gm38392-202ENSMUST00000165196 1303 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Scamp4Q9JKV5 Anks1-202ENSMUST00000088027 6781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Scamp4Q9JKV5 Poglut1-201ENSMUST00000036210 2758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Scamp4Q9JKV5 Dnajc3-201ENSMUST00000022734 5141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Scamp4Q9JKV5 Sept8-207ENSMUST00000147912 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Scamp4Q9JKV5 BC024978-204ENSMUST00000179391 1748 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Scamp4Q9JKV5 Dera-201ENSMUST00000087675 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Scamp4Q9JKV5 Ermp1-203ENSMUST00000159692 7058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Scamp4Q9JKV5 Spdef-201ENSMUST00000025054 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Scamp4Q9JKV5 Dbx1-201ENSMUST00000032717 2091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Scamp4Q9JKV5 Elp6-201ENSMUST00000068071 2219 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Scamp4Q9JKV5 Pde4d-208ENSMUST00000120671 2455 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Scamp4Q9JKV5 R74862-202ENSMUST00000133630 2482 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Scamp4Q9JKV5 Ddx50-201ENSMUST00000020270 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Scamp4Q9JKV5 Arntl-203ENSMUST00000210074 2554 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Scamp4Q9JKV5 Kbtbd2-201ENSMUST00000114321 3868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Scamp4Q9JKV5 Stam-202ENSMUST00000102960 5000 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Scamp4Q9JKV5 Arhgef11-201ENSMUST00000039476 6776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Scamp4Q9JKV5 1700020A23Rik-202ENSMUST00000110281 521 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Scamp4Q9JKV5 Btn1a1-202ENSMUST00000110434 1077 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Scamp4Q9JKV5 Gm11452-201ENSMUST00000122376 690 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
Scamp4Q9JKV5 Gm17112-201ENSMUST00000163194 432 ntTSL 3 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Scamp4Q9JKV5 Prkag1-201ENSMUST00000168846 1638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Scamp4Q9JKV5 Gm26646-202ENSMUST00000205705 439 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Scamp4Q9JKV5 Tcp11-202ENSMUST00000043925 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Scamp4Q9JKV5 Ube3c-201ENSMUST00000049453 5048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Scamp4Q9JKV5 Ube2d2b-201ENSMUST00000072578 1678 ntAPPRIS P1 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Scamp4Q9JKV5 Utp3-201ENSMUST00000090413 1629 ntAPPRIS P1 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Scamp4Q9JKV5 Lce3f-201ENSMUST00000090863 611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Scamp4Q9JKV5 Lmtk2-201ENSMUST00000041804 8114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Scamp4Q9JKV5 Hook2-201ENSMUST00000064495 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Scamp4Q9JKV5 Tbc1d19-201ENSMUST00000037337 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Scamp4Q9JKV5 Gm36447-201ENSMUST00000201101 1978 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Scamp4Q9JKV5 Lrrc24-202ENSMUST00000049956 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Scamp4Q9JKV5 Inhbc-201ENSMUST00000026472 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Scamp4Q9JKV5 Ankrd16-201ENSMUST00000056108 1618 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Scamp4Q9JKV5 Gm4425-201ENSMUST00000172838 2857 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Scamp4Q9JKV5 Axin1-202ENSMUST00000118904 2833 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Scamp4Q9JKV5 Snupn-201ENSMUST00000068856 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Scamp4Q9JKV5 Gm12355-201ENSMUST00000104933 1311 ntAPPRIS P1 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Scamp4Q9JKV5 Tsacc-202ENSMUST00000107556 584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Scamp4Q9JKV5 Gm37584-201ENSMUST00000193595 1290 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
Scamp4Q9JKV5 Gm44202-201ENSMUST00000203549 532 ntTSL 3 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Scamp4Q9JKV5 Bcl2l12-201ENSMUST00000003290 1075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Scamp4Q9JKV5 A330070K13Rik-201ENSMUST00000063656 633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.8 ms