Protein–RNA interactions for Protein: Q9JKS4

Ldb3, LIM domain-binding protein 3, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 723 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ldb3Q9JKS4 Acp7-201ENSMUST00000040112 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
Ldb3Q9JKS4 AC093043.3-201ENSMUST00000226531 2273 ntBASIC14.38□□□□□ -0.11
Ldb3Q9JKS4 Ch25h-201ENSMUST00000050562 1350 ntAPPRIS P1 BASIC14.37□□□□□ -0.11
Ldb3Q9JKS4 Gm10516-201ENSMUST00000180598 2615 ntTSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Ldb3Q9JKS4 Kbtbd2-201ENSMUST00000114321 3868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Ldb3Q9JKS4 Mycbp-201ENSMUST00000030400 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Ldb3Q9JKS4 Ccdc43-201ENSMUST00000092569 2366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Ldb3Q9JKS4 Snph-203ENSMUST00000109875 4910 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Ldb3Q9JKS4 Spg21-201ENSMUST00000034955 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Ldb3Q9JKS4 1810010H24Rik-201ENSMUST00000106767 1100 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.37□□□□□ -0.11
Ldb3Q9JKS4 Snx15-207ENSMUST00000154601 767 ntTSL 5 BASIC14.37□□□□□ -0.11
Ldb3Q9JKS4 Rnf5-201ENSMUST00000015622 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Ldb3Q9JKS4 Gm17092-201ENSMUST00000166606 698 ntTSL 2 BASIC14.37□□□□□ -0.11
Ldb3Q9JKS4 Epsti1-202ENSMUST00000169978 1175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.37□□□□□ -0.11
Ldb3Q9JKS4 Gm26871-202ENSMUST00000180774 695 ntTSL 2 BASIC14.37□□□□□ -0.11
Ldb3Q9JKS4 Jpx-202ENSMUST00000182447 712 ntTSL 3 BASIC14.37□□□□□ -0.11
Ldb3Q9JKS4 Dnmt3a-ps1-201ENSMUST00000192011 1271 ntBASIC14.37□□□□□ -0.11
Ldb3Q9JKS4 Ssr2-205ENSMUST00000193934 569 ntTSL 3 BASIC14.37□□□□□ -0.11
Ldb3Q9JKS4 Gm42456-201ENSMUST00000196840 387 ntTSL 3 BASIC14.37□□□□□ -0.11
Ldb3Q9JKS4 Gm7506-201ENSMUST00000207758 815 ntBASIC14.37□□□□□ -0.11
Ldb3Q9JKS4 Epsti1-203ENSMUST00000227903 1178 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.37□□□□□ -0.11
Ldb3Q9JKS4 Mgst3-201ENSMUST00000028005 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Ldb3Q9JKS4 Apof-201ENSMUST00000050901 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Ldb3Q9JKS4 Tm6sf2-201ENSMUST00000049197 1418 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Ldb3Q9JKS4 Anks6-201ENSMUST00000084616 3552 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.37□□□□□ -0.11
Ldb3Q9JKS4 Irak1-201ENSMUST00000033769 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Ldb3Q9JKS4 Hsf4-201ENSMUST00000036127 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Ldb3Q9JKS4 Mid1-206ENSMUST00000112107 3194 ntTSL 5 BASIC14.37□□□□□ -0.11
Ldb3Q9JKS4 Myc-202ENSMUST00000159327 2186 ntTSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Ldb3Q9JKS4 Mid2-202ENSMUST00000112990 6271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.37□□□□□ -0.11
Ldb3Q9JKS4 Cndp2-201ENSMUST00000025546 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Ldb3Q9JKS4 Col4a3bp-203ENSMUST00000179226 3040 ntTSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Ldb3Q9JKS4 Ppm1d-201ENSMUST00000020835 2899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Ldb3Q9JKS4 Oas1b-201ENSMUST00000086377 1832 ntTSL 5 BASIC14.36□□□□□ -0.11
Ldb3Q9JKS4 Bcor-203ENSMUST00000115512 6887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Ldb3Q9JKS4 Gm6588-201ENSMUST00000100882 2313 ntAPPRIS P1 BASIC14.36□□□□□ -0.11
Ldb3Q9JKS4 Mapk1ip1-203ENSMUST00000119664 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Ldb3Q9JKS4 Trmt2a-203ENSMUST00000115640 2367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Ldb3Q9JKS4 Map1s-201ENSMUST00000019405 3314 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Ldb3Q9JKS4 Gm8784-201ENSMUST00000222096 1435 ntBASIC14.36□□□□□ -0.11
Ldb3Q9JKS4 Fosl2-201ENSMUST00000031017 6537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Ldb3Q9JKS4 Gm15246-201ENSMUST00000149873 540 ntTSL 3 BASIC14.36□□□□□ -0.11
Ldb3Q9JKS4 Tm4sf5-201ENSMUST00000019063 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Ldb3Q9JKS4 Ankrd23-204ENSMUST00000194853 1073 ntTSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Ldb3Q9JKS4 Pabpn1l-202ENSMUST00000212966 1113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Ldb3Q9JKS4 Sprn-201ENSMUST00000059241 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Ldb3Q9JKS4 Zfp384-207ENSMUST00000112427 3072 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.36□□□□□ -0.11
Ldb3Q9JKS4 Mapk14-204ENSMUST00000114754 3592 ntTSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Ldb3Q9JKS4 Slc8a3-202ENSMUST00000085238 4927 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Ldb3Q9JKS4 Ripor2-205ENSMUST00000110384 5608 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Ldb3Q9JKS4 Gm26669-201ENSMUST00000181323 1808 ntTSL 5 BASIC14.36□□□□□ -0.11
Ldb3Q9JKS4 Sox13-201ENSMUST00000094551 1842 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Ldb3Q9JKS4 Ube2d2b-201ENSMUST00000072578 1678 ntAPPRIS P1 BASIC14.36□□□□□ -0.11
Ldb3Q9JKS4 Mios-201ENSMUST00000040017 3710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Ldb3Q9JKS4 Atxn7l2-203ENSMUST00000117784 2387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Ldb3Q9JKS4 Ahsa1-201ENSMUST00000021425 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Ldb3Q9JKS4 Ift74-202ENSMUST00000107104 1713 ntTSL 2 BASIC14.35□□□□□ -0.11
Ldb3Q9JKS4 Gm11696-201ENSMUST00000070956 2765 ntTSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Ldb3Q9JKS4 Gm26889-201ENSMUST00000181523 2252 ntTSL 5 BASIC14.35□□□□□ -0.11
Ldb3Q9JKS4 Gata6-201ENSMUST00000047762 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Ldb3Q9JKS4 Dhfr-201ENSMUST00000022218 5347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Ldb3Q9JKS4 Pqlc2-205ENSMUST00000172747 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.35□□□□□ -0.11
Ldb3Q9JKS4 Rnf145-201ENSMUST00000019333 3570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Ldb3Q9JKS4 Zfp36l3-201ENSMUST00000071711 2347 ntAPPRIS P1 BASIC14.35□□□□□ -0.11
Ldb3Q9JKS4 Naa35-201ENSMUST00000022038 3793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Ldb3Q9JKS4 Afg1l-201ENSMUST00000041024 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Ldb3Q9JKS4 Tfpt-202ENSMUST00000108641 1166 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Ldb3Q9JKS4 Gm4459-201ENSMUST00000118750 468 ntBASIC14.35□□□□□ -0.11
Ldb3Q9JKS4 Gm12497-201ENSMUST00000138778 237 ntBASIC14.35□□□□□ -0.11
Ldb3Q9JKS4 Syne4-208ENSMUST00000176304 1006 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.35□□□□□ -0.11
Ldb3Q9JKS4 9530052E02Rik-201ENSMUST00000180750 949 ntTSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Ldb3Q9JKS4 Washc3-203ENSMUST00000182183 838 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.35□□□□□ -0.11
Ldb3Q9JKS4 Lmbrd1-202ENSMUST00000186096 688 ntTSL 2 BASIC14.35□□□□□ -0.11
Ldb3Q9JKS4 Gm34391-201ENSMUST00000203706 907 ntBASIC14.35□□□□□ -0.11
Ldb3Q9JKS4 AL669916.2-201ENSMUST00000213219 358 ntTSL 2 BASIC14.35□□□□□ -0.11
Ldb3Q9JKS4 Rhoc-201ENSMUST00000002303 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Ldb3Q9JKS4 Vamp8-201ENSMUST00000059983 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Ldb3Q9JKS4 Methig1-201ENSMUST00000075675 1029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Ldb3Q9JKS4 Hbb-bt-201ENSMUST00000098192 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Ldb3Q9JKS4 Snn-201ENSMUST00000089011 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Ldb3Q9JKS4 Ephb1-203ENSMUST00000149800 3471 ntTSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Ldb3Q9JKS4 Ado-201ENSMUST00000075686 4445 ntAPPRIS P1 BASIC14.35□□□□□ -0.11
Ldb3Q9JKS4 Ptprd-206ENSMUST00000107289 9899 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.35□□□□□ -0.11
Ldb3Q9JKS4 Hnrnpu-201ENSMUST00000037748 7640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Ldb3Q9JKS4 Slc25a11-201ENSMUST00000014750 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Ldb3Q9JKS4 Celf1-201ENSMUST00000005643 4830 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.35□□□□□ -0.11
Ldb3Q9JKS4 Ybx2-202ENSMUST00000108601 1351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Ldb3Q9JKS4 Slc22a1-201ENSMUST00000024596 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Ldb3Q9JKS4 4921536K21Rik-201ENSMUST00000020712 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Ldb3Q9JKS4 Ptprn-201ENSMUST00000027404 3554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Ldb3Q9JKS4 Tcf24-202ENSMUST00000185184 4193 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.34□□□□□ -0.11
Ldb3Q9JKS4 Camk2d-226ENSMUST00000199300 5524 ntTSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Ldb3Q9JKS4 Pde4d-208ENSMUST00000120671 2455 ntTSL 5 BASIC14.34□□□□□ -0.11
Ldb3Q9JKS4 Ewsr1-202ENSMUST00000073308 2269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Ldb3Q9JKS4 Prodh2-201ENSMUST00000058280 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Ldb3Q9JKS4 Dmrtb1-201ENSMUST00000069271 1861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.34□□□□□ -0.11
Ldb3Q9JKS4 Gm4609-201ENSMUST00000106443 1002 ntBASIC14.34□□□□□ -0.11
Ldb3Q9JKS4 Gm5138-201ENSMUST00000113842 1002 ntBASIC14.34□□□□□ -0.11
Ldb3Q9JKS4 Gm15191-201ENSMUST00000117933 1000 ntBASIC14.34□□□□□ -0.11
Ldb3Q9JKS4 Gm12182-201ENSMUST00000118655 1008 ntBASIC14.34□□□□□ -0.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 65.3 ms