Protein–RNA interactions for Protein: Q9JKN6

Nova1, RNA-binding protein Nova-1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 507 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nova1Q9JKN6 C330022C24Rik-201ENSMUST00000190581 1077 ntTSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Nova1Q9JKN6 Mesp1-201ENSMUST00000032760 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Nova1Q9JKN6 Ubtf-206ENSMUST00000107123 2759 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.97□□□□□ -0.01
Nova1Q9JKN6 Tubb4b-201ENSMUST00000043584 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Nova1Q9JKN6 Agfg2-201ENSMUST00000031736 2893 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Nova1Q9JKN6 Fhad1-201ENSMUST00000036701 1366 ntTSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Nova1Q9JKN6 Itpkb-201ENSMUST00000070181 6235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Nova1Q9JKN6 Gsk3b-201ENSMUST00000023507 8303 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Nova1Q9JKN6 Crk-203ENSMUST00000108425 4290 ntTSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Nova1Q9JKN6 1700051A21Rik-201ENSMUST00000147937 1516 ntTSL 5 BASIC14.97□□□□□ -0.01
Nova1Q9JKN6 Usp13-202ENSMUST00000108228 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Nova1Q9JKN6 Rb1-201ENSMUST00000022701 4656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Nova1Q9JKN6 Kbtbd11-201ENSMUST00000069399 6973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Nova1Q9JKN6 Gm5366-201ENSMUST00000215494 1338 ntBASIC14.96□□□□□ -0.01
Nova1Q9JKN6 Trbc1-201ENSMUST00000103291 512 ntAPPRIS P1 BASIC14.96□□□□□ -0.01
Nova1Q9JKN6 Trbc2-201ENSMUST00000103299 692 ntAPPRIS P1 BASIC14.96□□□□□ -0.01
Nova1Q9JKN6 Hsd17b14-201ENSMUST00000107752 1400 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.01
Nova1Q9JKN6 Rerg-203ENSMUST00000119610 890 ntTSL 3 BASIC14.96□□□□□ -0.01
Nova1Q9JKN6 Haghl-203ENSMUST00000133071 1128 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Nova1Q9JKN6 Hoxb8-203ENSMUST00000168043 1141 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.01
Nova1Q9JKN6 Gm5628-201ENSMUST00000222318 1049 ntBASIC14.96□□□□□ -0.01
Nova1Q9JKN6 Rnf138rt1-201ENSMUST00000059320 1191 ntAPPRIS P1 BASIC14.96□□□□□ -0.01
Nova1Q9JKN6 Cdpf1-201ENSMUST00000071876 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Nova1Q9JKN6 Tmem107-202ENSMUST00000094081 1263 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Nova1Q9JKN6 Abcb10-201ENSMUST00000075578 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Nova1Q9JKN6 Pus1-207ENSMUST00000170468 1510 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.02
Nova1Q9JKN6 Mark3-202ENSMUST00000084953 3365 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
Nova1Q9JKN6 Nespas-203ENSMUST00000151472 2248 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
Nova1Q9JKN6 Slc35c2-203ENSMUST00000109299 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
Nova1Q9JKN6 Gm26728-202ENSMUST00000203423 1333 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Nova1Q9JKN6 AC159621.2-201ENSMUST00000223519 1326 ntBASIC14.95□□□□□ -0.02
Nova1Q9JKN6 Syt9-201ENSMUST00000073459 3817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Nova1Q9JKN6 5330438I03Rik-201ENSMUST00000168347 2845 ntBASIC14.95□□□□□ -0.02
Nova1Q9JKN6 Arhgap39-202ENSMUST00000077821 4494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Nova1Q9JKN6 Cables1-201ENSMUST00000046948 3202 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Nova1Q9JKN6 Dnlz-201ENSMUST00000028295 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Nova1Q9JKN6 Tmem131l-201ENSMUST00000052342 4815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Nova1Q9JKN6 St8sia1-201ENSMUST00000032421 8991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Nova1Q9JKN6 Kif21a-205ENSMUST00000109288 6142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Nova1Q9JKN6 Med28-202ENSMUST00000118833 734 ntTSL 2 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Nova1Q9JKN6 Gm15358-201ENSMUST00000119249 520 ntBASIC14.95□□□□□ -0.02
Nova1Q9JKN6 Gm18489-201ENSMUST00000172565 551 ntBASIC14.95□□□□□ -0.02
Nova1Q9JKN6 Gm28237-202ENSMUST00000189477 748 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Nova1Q9JKN6 Kcnk16-201ENSMUST00000024155 916 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Nova1Q9JKN6 Gnptg-201ENSMUST00000038973 1234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Nova1Q9JKN6 Med8-202ENSMUST00000073881 1052 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Nova1Q9JKN6 Gm16499-203ENSMUST00000204633 2177 ntBASIC14.95□□□□□ -0.02
Nova1Q9JKN6 Lhx6-203ENSMUST00000112963 3481 ntTSL 2 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Nova1Q9JKN6 Mink1-202ENSMUST00000072873 4610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Nova1Q9JKN6 0610009E02Rik-201ENSMUST00000133463 1609 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Nova1Q9JKN6 Eml1-203ENSMUST00000109860 4160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Nova1Q9JKN6 Pi4k2b-201ENSMUST00000031081 3139 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Nova1Q9JKN6 P2ry1-203ENSMUST00000193943 2203 ntAPPRIS P1 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Nova1Q9JKN6 Coq10a-205ENSMUST00000220027 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Nova1Q9JKN6 Taok3-203ENSMUST00000111978 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Nova1Q9JKN6 Atp6v1c1-201ENSMUST00000022904 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Nova1Q9JKN6 Myo5b-201ENSMUST00000074157 6745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Nova1Q9JKN6 Snip1-201ENSMUST00000052183 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Nova1Q9JKN6 Fam20c-201ENSMUST00000026972 3582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Nova1Q9JKN6 Rcbtb2-226ENSMUST00000171767 2692 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Nova1Q9JKN6 Asnsd1-201ENSMUST00000027264 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Nova1Q9JKN6 Lmo4-202ENSMUST00000121112 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Nova1Q9JKN6 Crhr2-209ENSMUST00000213026 1443 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Nova1Q9JKN6 Rnf181-201ENSMUST00000069580 1434 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Nova1Q9JKN6 Sh3gl2-203ENSMUST00000107188 2286 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Nova1Q9JKN6 Taf6l-213ENSMUST00000189739 1794 ntTSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Nova1Q9JKN6 Clns1a-201ENSMUST00000026506 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Nova1Q9JKN6 Tnfrsf13b-202ENSMUST00000101103 750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Nova1Q9JKN6 Id1-202ENSMUST00000109824 1160 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Nova1Q9JKN6 Gm20496-202ENSMUST00000173770 523 ntTSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Nova1Q9JKN6 Gm17399-201ENSMUST00000181824 1181 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Nova1Q9JKN6 Alkbh6-201ENSMUST00000060834 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Nova1Q9JKN6 AC121598.2-201ENSMUST00000228376 2325 ntBASIC14.94□□□□□ -0.02
Nova1Q9JKN6 Tulp1-202ENSMUST00000114794 1738 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Nova1Q9JKN6 Gm5922-201ENSMUST00000214963 1723 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Nova1Q9JKN6 Ecel1-204ENSMUST00000161002 3033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Nova1Q9JKN6 Snap91-202ENSMUST00000074468 4336 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Nova1Q9JKN6 9330111N05Rik-202ENSMUST00000181043 2449 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Nova1Q9JKN6 Nmt2-203ENSMUST00000102989 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Nova1Q9JKN6 Ptprd-206ENSMUST00000107289 9899 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Nova1Q9JKN6 Fam170b-201ENSMUST00000104926 1694 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Nova1Q9JKN6 Chst3-203ENSMUST00000167915 1672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Nova1Q9JKN6 Ppp1r1a-201ENSMUST00000023133 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Nova1Q9JKN6 Tmem132c-201ENSMUST00000119026 5134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Nova1Q9JKN6 Tlk2-201ENSMUST00000015107 3212 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Nova1Q9JKN6 Gm45844-204ENSMUST00000209833 1524 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Nova1Q9JKN6 Aarsd1-201ENSMUST00000070395 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Nova1Q9JKN6 Enah-210ENSMUST00000193074 1971 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Nova1Q9JKN6 Gimap3-201ENSMUST00000038811 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Nova1Q9JKN6 Wnt4-201ENSMUST00000045747 4194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Nova1Q9JKN6 Hist1h2ae-201ENSMUST00000102969 704 ntAPPRIS P1 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Nova1Q9JKN6 Rpl13-ps5-201ENSMUST00000117813 630 ntBASIC14.93□□□□□ -0.02
Nova1Q9JKN6 Hrasls5-201ENSMUST00000025929 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Nova1Q9JKN6 Casp16-ps-201ENSMUST00000088673 531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Nova1Q9JKN6 Hist1h2ah-201ENSMUST00000091742 405 ntAPPRIS P1 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Nova1Q9JKN6 2900055J20Rik-201ENSMUST00000096572 723 ntAPPRIS P1 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Nova1Q9JKN6 Gm15408-201ENSMUST00000124198 1379 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Nova1Q9JKN6 Mon1a-201ENSMUST00000035202 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Nova1Q9JKN6 Gtf2b-201ENSMUST00000029938 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Nova1Q9JKN6 Atp6v1c2-201ENSMUST00000020884 1569 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.5 ms