Protein–RNA interactions for Protein: Q9JKF7

Mrpl39, 39S ribosomal protein L39, mitochondrial, mousemouse

Predictions only

Length 336 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mrpl39Q9JKF7 Antxr1-205ENSMUST00000205033 3160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Mrpl39Q9JKF7 Golph3-201ENSMUST00000059680 2652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Mrpl39Q9JKF7 Ube2o-201ENSMUST00000082152 5205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Mrpl39Q9JKF7 Snx11-201ENSMUST00000021246 2551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Mrpl39Q9JKF7 Atp5g1-203ENSMUST00000107686 691 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Mrpl39Q9JKF7 Gm44924-201ENSMUST00000138087 421 ntTSL 3 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Mrpl39Q9JKF7 Smim1-209ENSMUST00000145527 562 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Mrpl39Q9JKF7 A230065N10Rik-201ENSMUST00000172178 1028 ntBASIC13.74□□□□□ -0.21
Mrpl39Q9JKF7 Gm5091-201ENSMUST00000181658 1179 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Mrpl39Q9JKF7 Gm44210-201ENSMUST00000205253 713 ntTSL 3 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Mrpl39Q9JKF7 Tpgs1-201ENSMUST00000020552 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Mrpl39Q9JKF7 Asph-201ENSMUST00000038564 1174 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Mrpl39Q9JKF7 Asph-205ENSMUST00000098275 1007 ntTSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Mrpl39Q9JKF7 Cd82-205ENSMUST00000116457 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Mrpl39Q9JKF7 Pias3-201ENSMUST00000064900 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Mrpl39Q9JKF7 Sec24a-203ENSMUST00000109092 2094 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Mrpl39Q9JKF7 Parp3-203ENSMUST00000123555 2495 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Mrpl39Q9JKF7 Fgfr1op2-204ENSMUST00000111663 2880 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Mrpl39Q9JKF7 Rbm26-203ENSMUST00000163499 4212 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Mrpl39Q9JKF7 Zfp90-203ENSMUST00000212606 2685 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Mrpl39Q9JKF7 Tulp3-201ENSMUST00000001562 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Mrpl39Q9JKF7 Wscd1-202ENSMUST00000108510 2956 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Mrpl39Q9JKF7 Tmem47-203ENSMUST00000171953 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Mrpl39Q9JKF7 Irf7-202ENSMUST00000097952 1764 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Mrpl39Q9JKF7 Trappc12-203ENSMUST00000170994 2818 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Mrpl39Q9JKF7 Kcna1-202ENSMUST00000203094 3150 ntAPPRIS P1 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Mrpl39Q9JKF7 Wt1-202ENSMUST00000111099 2441 ntTSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Mrpl39Q9JKF7 Sync-201ENSMUST00000102599 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Mrpl39Q9JKF7 Pcdha11-202ENSMUST00000115657 5360 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Mrpl39Q9JKF7 Ttc14-202ENSMUST00000108210 2684 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Mrpl39Q9JKF7 Cdh11-201ENSMUST00000075190 5647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Mrpl39Q9JKF7 Slc22a1-201ENSMUST00000024596 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Mrpl39Q9JKF7 Hdgfl1-201ENSMUST00000055915 1993 ntAPPRIS P1 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Mrpl39Q9JKF7 Zfp334-201ENSMUST00000103084 8205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Mrpl39Q9JKF7 Zyx-207ENSMUST00000203652 2605 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Mrpl39Q9JKF7 Hoxb8-201ENSMUST00000052650 2635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Mrpl39Q9JKF7 Pkn2-201ENSMUST00000043812 6207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Mrpl39Q9JKF7 Ssu72-202ENSMUST00000105595 874 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Mrpl39Q9JKF7 Stk11-210ENSMUST00000213772 1239 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Mrpl39Q9JKF7 Fitm1-201ENSMUST00000022826 971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Mrpl39Q9JKF7 Jun-201ENSMUST00000107094 3189 ntAPPRIS P1 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Mrpl39Q9JKF7 Kmt5b-208ENSMUST00000113977 6002 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Mrpl39Q9JKF7 Msi1-208ENSMUST00000150779 3133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Mrpl39Q9JKF7 Raf1-201ENSMUST00000000451 3070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Mrpl39Q9JKF7 Dok1-201ENSMUST00000089651 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Mrpl39Q9JKF7 Rassf1-204ENSMUST00000122225 1783 ntTSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Mrpl39Q9JKF7 4933421O10Rik-201ENSMUST00000155691 3847 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Mrpl39Q9JKF7 Glg1-204ENSMUST00000169020 7021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Mrpl39Q9JKF7 Gk-201ENSMUST00000026039 4340 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Mrpl39Q9JKF7 Safb-201ENSMUST00000095224 3106 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Mrpl39Q9JKF7 Slc48a1-201ENSMUST00000117892 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Mrpl39Q9JKF7 Kmt5b-206ENSMUST00000113973 6130 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Mrpl39Q9JKF7 Cpz-201ENSMUST00000038676 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Mrpl39Q9JKF7 A330009N23Rik-201ENSMUST00000180639 1392 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Mrpl39Q9JKF7 Prrg2-208ENSMUST00000210690 1623 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Mrpl39Q9JKF7 4930512B01Rik-201ENSMUST00000021378 1856 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Mrpl39Q9JKF7 Rfx5-203ENSMUST00000107254 4450 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Mrpl39Q9JKF7 Cyp4f37-201ENSMUST00000077639 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Mrpl39Q9JKF7 Tmem184b-201ENSMUST00000074991 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Mrpl39Q9JKF7 Phf21b-203ENSMUST00000159939 3639 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Mrpl39Q9JKF7 Echdc2-204ENSMUST00000116309 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Mrpl39Q9JKF7 Gm13186-201ENSMUST00000118031 316 ntBASIC13.72□□□□□ -0.21
Mrpl39Q9JKF7 Gm17949-201ENSMUST00000210548 1179 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Mrpl39Q9JKF7 Tmem126a-201ENSMUST00000032844 799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Mrpl39Q9JKF7 Cspg5-204ENSMUST00000197850 7868 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Mrpl39Q9JKF7 Gatc-201ENSMUST00000139167 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Mrpl39Q9JKF7 Slc35b2-202ENSMUST00000223987 1766 ntBASIC13.72□□□□□ -0.21
Mrpl39Q9JKF7 Atg7-215ENSMUST00000183165 2012 ntTSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Mrpl39Q9JKF7 Mst1-201ENSMUST00000035211 2262 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Mrpl39Q9JKF7 Gtf2h5-201ENSMUST00000039487 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Mrpl39Q9JKF7 Rgl1-203ENSMUST00000111859 5092 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Mrpl39Q9JKF7 Ptp4a3-201ENSMUST00000053232 3608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Mrpl39Q9JKF7 Dip2b-202ENSMUST00000100203 8914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Mrpl39Q9JKF7 Atp13a3-201ENSMUST00000061350 7220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Mrpl39Q9JKF7 Rabggta-205ENSMUST00000227061 2882 ntAPPRIS P1 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Mrpl39Q9JKF7 Snapc3-201ENSMUST00000030206 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Mrpl39Q9JKF7 Ifngr1-201ENSMUST00000020188 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Mrpl39Q9JKF7 Nabp1-201ENSMUST00000027279 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Mrpl39Q9JKF7 2810474O19Rik-202ENSMUST00000100765 5356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Mrpl39Q9JKF7 Steap2-205ENSMUST00000115427 3470 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Mrpl39Q9JKF7 Gpd1l-204ENSMUST00000146623 4391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Mrpl39Q9JKF7 Ccdc124-201ENSMUST00000007865 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Mrpl39Q9JKF7 B4galt2-203ENSMUST00000106421 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Mrpl39Q9JKF7 Tpbg-201ENSMUST00000006559 3603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Mrpl39Q9JKF7 Nyap1-204ENSMUST00000212152 2499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Mrpl39Q9JKF7 Zfp862-ps-203ENSMUST00000203848 1776 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Mrpl39Q9JKF7 Cct7-201ENSMUST00000032078 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Mrpl39Q9JKF7 Ggnbp1-201ENSMUST00000053683 1525 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Mrpl39Q9JKF7 Tom1l2-201ENSMUST00000064019 2151 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Mrpl39Q9JKF7 Rspo4-201ENSMUST00000042217 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Mrpl39Q9JKF7 Kdf1-201ENSMUST00000042919 1708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Mrpl39Q9JKF7 AC013548.1-201ENSMUST00000228850 4738 ntAPPRIS P1 BASIC13.71□□□□□ -0.21
Mrpl39Q9JKF7 Fam208b-201ENSMUST00000096069 8338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Mrpl39Q9JKF7 Cyp4f41-ps-201ENSMUST00000126790 1077 ntBASIC13.71□□□□□ -0.21
Mrpl39Q9JKF7 Gm15939-201ENSMUST00000160756 2147 ntTSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.21
Mrpl39Q9JKF7 Pgpep1-208ENSMUST00000211715 676 ntTSL 3 BASIC13.71□□□□□ -0.21
Mrpl39Q9JKF7 Gm36033-202ENSMUST00000214827 745 ntTSL 2 BASIC13.71□□□□□ -0.21
Mrpl39Q9JKF7 Gm7791-201ENSMUST00000219066 539 ntBASIC13.71□□□□□ -0.21
Mrpl39Q9JKF7 Gm20049-201ENSMUST00000219950 730 ntBASIC13.71□□□□□ -0.21
Mrpl39Q9JKF7 BC048679-201ENSMUST00000073406 522 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
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