Protein–RNA interactions for Protein: Q9JK83

Pard6b, Partitioning defective 6 homolog beta, mousemouse

Predictions only

Length 371 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pard6bQ9JK83 Map6-203ENSMUST00000122101 3233 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Pard6bQ9JK83 Fam178b-201ENSMUST00000114981 1659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Pard6bQ9JK83 Tmcc3-201ENSMUST00000065060 5530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Pard6bQ9JK83 Arhgef25-201ENSMUST00000019611 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Pard6bQ9JK83 Kdm3a-201ENSMUST00000065509 4816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Pard6bQ9JK83 Atp5g1-203ENSMUST00000107686 691 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Pard6bQ9JK83 Zfp13-202ENSMUST00000115516 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Pard6bQ9JK83 Vps51-209ENSMUST00000160590 840 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Pard6bQ9JK83 Gm17949-201ENSMUST00000210548 1179 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Pard6bQ9JK83 Myl6-206ENSMUST00000218127 691 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Pard6bQ9JK83 Gm7791-201ENSMUST00000219066 539 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
Pard6bQ9JK83 Ppic-201ENSMUST00000025419 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Pard6bQ9JK83 Tmem239-201ENSMUST00000055421 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Pard6bQ9JK83 BC048679-201ENSMUST00000073406 522 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Pard6bQ9JK83 Ube2j1-202ENSMUST00000124992 3530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Pard6bQ9JK83 Gm39027-201ENSMUST00000208560 2942 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
Pard6bQ9JK83 Anks1-201ENSMUST00000025058 6844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Pard6bQ9JK83 Gm14066-201ENSMUST00000134801 2057 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Pard6bQ9JK83 Hook2-201ENSMUST00000064495 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Pard6bQ9JK83 Gxylt2-201ENSMUST00000032157 7658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Pard6bQ9JK83 Adamts17-201ENSMUST00000098382 6025 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
Pard6bQ9JK83 Gna15-201ENSMUST00000043709 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Pard6bQ9JK83 Serpine2-201ENSMUST00000027467 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Pard6bQ9JK83 Cpne6-201ENSMUST00000074225 2201 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Pard6bQ9JK83 Bsx-201ENSMUST00000067375 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Pard6bQ9JK83 Adarb1-202ENSMUST00000098374 6584 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Pard6bQ9JK83 Fam69c-201ENSMUST00000052501 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Pard6bQ9JK83 Coil-202ENSMUST00000107898 3120 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Pard6bQ9JK83 Tm9sf1-203ENSMUST00000121791 2148 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Pard6bQ9JK83 Lrrc32-203ENSMUST00000205956 4576 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Pard6bQ9JK83 Camta1-202ENSMUST00000097774 8533 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Pard6bQ9JK83 Cyp21a1-201ENSMUST00000025223 2058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Pard6bQ9JK83 Trip10-202ENSMUST00000224152 1812 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Pard6bQ9JK83 Kcnt1-213ENSMUST00000198204 4714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Pard6bQ9JK83 Gm45133-201ENSMUST00000207548 2773 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Pard6bQ9JK83 Zfp655-206ENSMUST00000200039 1765 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Pard6bQ9JK83 Slc12a5-201ENSMUST00000099092 6028 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Pard6bQ9JK83 Scrn2-201ENSMUST00000021249 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Pard6bQ9JK83 Ovca2-201ENSMUST00000071562 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Pard6bQ9JK83 Hmga1-206ENSMUST00000119486 1003 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Pard6bQ9JK83 Dohh-202ENSMUST00000121047 946 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Pard6bQ9JK83 Gtf3a-204ENSMUST00000146511 1298 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Pard6bQ9JK83 Casp3-203ENSMUST00000210534 583 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Pard6bQ9JK83 Rps23-201ENSMUST00000051955 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Pard6bQ9JK83 A230083G16Rik-201ENSMUST00000069553 991 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Pard6bQ9JK83 Gm10638-201ENSMUST00000098532 905 ntAPPRIS P1 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Pard6bQ9JK83 Foxg1-204ENSMUST00000179669 3973 ntAPPRIS P1 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Pard6bQ9JK83 Ndst2-202ENSMUST00000223679 3907 ntAPPRIS P1 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Pard6bQ9JK83 Mob2-206ENSMUST00000211206 2140 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Pard6bQ9JK83 Kif22-201ENSMUST00000032915 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Pard6bQ9JK83 Irf5-205ENSMUST00000167252 1693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Pard6bQ9JK83 Ntng2-203ENSMUST00000091153 1695 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Pard6bQ9JK83 Las1l-201ENSMUST00000079987 2530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Pard6bQ9JK83 Camsap1-201ENSMUST00000091268 7978 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Pard6bQ9JK83 Lonrf3-201ENSMUST00000016383 2911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Pard6bQ9JK83 Kat5-201ENSMUST00000113641 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Pard6bQ9JK83 Ecel1-203ENSMUST00000160810 2898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Pard6bQ9JK83 Mark2-209ENSMUST00000165965 2874 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Pard6bQ9JK83 Zfp316-201ENSMUST00000051665 3054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Pard6bQ9JK83 Gbp5-201ENSMUST00000090127 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Pard6bQ9JK83 Miga1-202ENSMUST00000073089 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Pard6bQ9JK83 Fam155a-206ENSMUST00000208933 1569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Pard6bQ9JK83 Pik3ap1-201ENSMUST00000059672 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Pard6bQ9JK83 Rtn4-201ENSMUST00000060992 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Pard6bQ9JK83 Flrt2-202ENSMUST00000110117 3223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Pard6bQ9JK83 Arvcf-205ENSMUST00000115614 4698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Pard6bQ9JK83 Slk-202ENSMUST00000051691 4239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Pard6bQ9JK83 Phf8-204ENSMUST00000112666 2556 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Pard6bQ9JK83 Srrm1-208ENSMUST00000136342 3152 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Pard6bQ9JK83 Gdf15-201ENSMUST00000003808 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Pard6bQ9JK83 Nr1h3-202ENSMUST00000111354 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Pard6bQ9JK83 Zfp467-209ENSMUST00000114566 543 ntTSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
Pard6bQ9JK83 Steap1-201ENSMUST00000015796 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Pard6bQ9JK83 Ramp1-203ENSMUST00000188475 711 ntTSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
Pard6bQ9JK83 Rpl18-204ENSMUST00000209693 535 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Pard6bQ9JK83 Gm18115-201ENSMUST00000221209 621 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Pard6bQ9JK83 Cmc1-201ENSMUST00000044220 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Pard6bQ9JK83 Lsm10-201ENSMUST00000055575 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Pard6bQ9JK83 Ube2s-201ENSMUST00000079496 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Pard6bQ9JK83 Gpd1l-204ENSMUST00000146623 4391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Pard6bQ9JK83 Tmem116-204ENSMUST00000111795 2221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Pard6bQ9JK83 P3h1-204ENSMUST00000121111 3188 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Pard6bQ9JK83 Islr2-203ENSMUST00000163897 4303 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
Pard6bQ9JK83 Gm32996-201ENSMUST00000199828 1447 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Pard6bQ9JK83 4930474H06Rik-201ENSMUST00000132822 1590 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Pard6bQ9JK83 Uck2-202ENSMUST00000053686 4731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Pard6bQ9JK83 Gm16425-201ENSMUST00000118143 3130 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Pard6bQ9JK83 Gart-202ENSMUST00000120450 1865 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Pard6bQ9JK83 Unc5a-202ENSMUST00000109994 3827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Pard6bQ9JK83 Skor1-203ENSMUST00000119146 3610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Pard6bQ9JK83 Gm37305-201ENSMUST00000195714 4279 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Pard6bQ9JK83 Gm10676-201ENSMUST00000098778 3221 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Pard6bQ9JK83 Mex3c-201ENSMUST00000091852 3738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Pard6bQ9JK83 Lamc1-201ENSMUST00000027752 7622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Pard6bQ9JK83 Ssu72-202ENSMUST00000105595 874 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Pard6bQ9JK83 Gm15690-201ENSMUST00000128728 432 ntTSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Pard6bQ9JK83 Tpgs1-201ENSMUST00000020552 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Pard6bQ9JK83 Stmn1-201ENSMUST00000030636 1060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Pard6bQ9JK83 Tmem33-204ENSMUST00000161369 6164 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Pard6bQ9JK83 Pdzrn3-201ENSMUST00000075994 4104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36 ms