Protein–RNA interactions for Protein: Q9JK54

Msgn1, Mesogenin-1, mousemouse

Predictions only

Length 188 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Msgn1Q9JK54 Ddit4l-201ENSMUST00000053855 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Msgn1Q9JK54 Gm20604-201ENSMUST00000174651 2795 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Msgn1Q9JK54 Hhipl1-201ENSMUST00000021685 5174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Msgn1Q9JK54 Pqlc3-208ENSMUST00000222203 1706 ntTSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Msgn1Q9JK54 Stk3-201ENSMUST00000018476 2914 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Msgn1Q9JK54 Fxyd6-201ENSMUST00000085939 1788 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Msgn1Q9JK54 Vps9d1-203ENSMUST00000122363 2952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Msgn1Q9JK54 Bpifb3-201ENSMUST00000088950 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Msgn1Q9JK54 Mllt11-201ENSMUST00000065482 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Msgn1Q9JK54 Nkx1-2-201ENSMUST00000054562 3264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Msgn1Q9JK54 Nsmf-201ENSMUST00000006646 2922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Msgn1Q9JK54 Nfib-206ENSMUST00000107248 3294 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Msgn1Q9JK54 Mrpl55-204ENSMUST00000108786 757 ntTSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Msgn1Q9JK54 Gm9385-201ENSMUST00000117563 472 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
Msgn1Q9JK54 Gm12008-201ENSMUST00000117791 755 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
Msgn1Q9JK54 Rprl2-201ENSMUST00000157150 290 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
Msgn1Q9JK54 Hddc3-206ENSMUST00000206074 565 ntTSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Msgn1Q9JK54 Nmur1-202ENSMUST00000212058 1287 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Msgn1Q9JK54 Gm29909-201ENSMUST00000214500 922 ntTSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Msgn1Q9JK54 Alkbh7-201ENSMUST00000002737 917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Msgn1Q9JK54 Smim4-202ENSMUST00000064032 791 ntTSL 3 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Msgn1Q9JK54 Mtg2-201ENSMUST00000087563 1346 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Msgn1Q9JK54 Sirt5-211ENSMUST00000223194 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Msgn1Q9JK54 Rnf181-201ENSMUST00000069580 1434 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Msgn1Q9JK54 Tpi1-205ENSMUST00000172132 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Msgn1Q9JK54 Tmtc4-209ENSMUST00000148661 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Msgn1Q9JK54 Krt84-201ENSMUST00000023720 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Msgn1Q9JK54 Mterf1a-202ENSMUST00000117463 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Msgn1Q9JK54 Scly-201ENSMUST00000027532 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Msgn1Q9JK54 Matk-203ENSMUST00000119547 1916 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Msgn1Q9JK54 Gm20708-201ENSMUST00000132298 1780 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.33
Msgn1Q9JK54 Tfap2d-201ENSMUST00000037294 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Msgn1Q9JK54 Sart1-201ENSMUST00000044207 5091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Msgn1Q9JK54 Fam170b-201ENSMUST00000104926 1694 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Msgn1Q9JK54 Snai3-201ENSMUST00000006762 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Msgn1Q9JK54 Ppil1-201ENSMUST00000024802 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Msgn1Q9JK54 Fam53b-204ENSMUST00000106165 1232 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Msgn1Q9JK54 Gm16198-201ENSMUST00000118766 670 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
Msgn1Q9JK54 Mmab-203ENSMUST00000123256 1277 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Msgn1Q9JK54 9530003J23Rik-202ENSMUST00000159193 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Msgn1Q9JK54 Zfp511-201ENSMUST00000168194 1076 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Msgn1Q9JK54 Cebpzos-202ENSMUST00000180077 602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Msgn1Q9JK54 6030443J06Rik-204ENSMUST00000195898 786 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Msgn1Q9JK54 Tmem38a-203ENSMUST00000212763 882 ntTSL 3 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Msgn1Q9JK54 Tomm20l-201ENSMUST00000021482 578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Msgn1Q9JK54 AC140397.2-201ENSMUST00000224213 834 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
Msgn1Q9JK54 Trem2-201ENSMUST00000024791 1088 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Msgn1Q9JK54 Rxfp4-201ENSMUST00000063119 1245 ntAPPRIS P1 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Msgn1Q9JK54 Immp2l-201ENSMUST00000080160 239 ntTSL 3 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Msgn1Q9JK54 Nphp3-201ENSMUST00000035167 5899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Msgn1Q9JK54 Ncoa5-201ENSMUST00000040381 3179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Msgn1Q9JK54 Snn-201ENSMUST00000089011 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Msgn1Q9JK54 Gdpd2-202ENSMUST00000113744 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Msgn1Q9JK54 Sdc3-201ENSMUST00000070478 4973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Msgn1Q9JK54 Sgpp1-201ENSMUST00000021450 3323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Msgn1Q9JK54 Tnfrsf13c-202ENSMUST00000109535 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Msgn1Q9JK54 Phax-201ENSMUST00000008445 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Msgn1Q9JK54 6030419C18Rik-202ENSMUST00000216294 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Msgn1Q9JK54 Rps6ka2-201ENSMUST00000024575 5404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Msgn1Q9JK54 Gm26728-202ENSMUST00000203423 1333 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Msgn1Q9JK54 1810032O08Rik-206ENSMUST00000144049 966 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Msgn1Q9JK54 Gm8318-201ENSMUST00000182954 872 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
Msgn1Q9JK54 5430405H02Rik-203ENSMUST00000185402 904 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Msgn1Q9JK54 1700086L19Rik-202ENSMUST00000185822 1028 ntTSL 3 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Msgn1Q9JK54 Prr29-205ENSMUST00000190268 1141 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Msgn1Q9JK54 Gm40123-201ENSMUST00000198175 1027 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Msgn1Q9JK54 Gm29683-202ENSMUST00000208511 720 ntTSL 3 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Msgn1Q9JK54 Smdt1-201ENSMUST00000023086 705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Msgn1Q9JK54 Smarca4-201ENSMUST00000034707 6354 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Msgn1Q9JK54 Ptp4a2-201ENSMUST00000030578 3646 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Msgn1Q9JK54 Afg1l-201ENSMUST00000041024 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Msgn1Q9JK54 Pick1-202ENSMUST00000053926 2415 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Msgn1Q9JK54 Gm10532-201ENSMUST00000181913 2301 ntTSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Msgn1Q9JK54 Ccdc68-201ENSMUST00000043929 1618 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Msgn1Q9JK54 Tnfsf13-202ENSMUST00000108648 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Msgn1Q9JK54 Pdk3-201ENSMUST00000045748 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Msgn1Q9JK54 Antxr2-202ENSMUST00000199088 2739 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Msgn1Q9JK54 P4ha2-215ENSMUST00000174616 2094 ntTSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Msgn1Q9JK54 Dcun1d3-203ENSMUST00000106519 1475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Msgn1Q9JK54 Lhfp-203ENSMUST00000147139 1932 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Msgn1Q9JK54 Gapvd1-201ENSMUST00000028224 5695 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Msgn1Q9JK54 Trafd1-202ENSMUST00000120784 2425 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Msgn1Q9JK54 Trav3-1-201ENSMUST00000103569 385 ntAPPRIS P1 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Msgn1Q9JK54 Trav3-4-201ENSMUST00000103670 458 ntAPPRIS P1 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Msgn1Q9JK54 Ube2v2-202ENSMUST00000115776 1236 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Msgn1Q9JK54 Rerg-203ENSMUST00000119610 890 ntTSL 3 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Msgn1Q9JK54 Gm28050-201ENSMUST00000124394 449 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Msgn1Q9JK54 Hpca-207ENSMUST00000139450 812 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Msgn1Q9JK54 Nnat-209ENSMUST00000173793 386 ntTSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Msgn1Q9JK54 Gm25948-201ENSMUST00000175334 112 ntBASIC17.06■□□□□ 0.32
Msgn1Q9JK54 Ccer2-201ENSMUST00000178767 1054 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Msgn1Q9JK54 Tssk3-201ENSMUST00000000421 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Msgn1Q9JK54 Nutf2-201ENSMUST00000008594 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Msgn1Q9JK54 Olfr520-201ENSMUST00000098264 951 ntAPPRIS P1 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Msgn1Q9JK54 Nup98-205ENSMUST00000211022 3132 ntTSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Msgn1Q9JK54 Gm45277-201ENSMUST00000210549 1695 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Msgn1Q9JK54 Crtac1-201ENSMUST00000048630 2616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Msgn1Q9JK54 Trim24-201ENSMUST00000031859 4042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Msgn1Q9JK54 Gm15635-204ENSMUST00000208024 2539 ntBASIC17.06■□□□□ 0.32
Msgn1Q9JK54 Lonp1-201ENSMUST00000047226 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.5 ms