Protein–RNA interactions for Protein: Q9JK48

Sh3glb1, Endophilin-B1, mousemouse

Predictions only

Length 365 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sh3glb1Q9JK48 Ptf1aos-201ENSMUST00000122978 916 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Sh3glb1Q9JK48 Gm15889-201ENSMUST00000159142 1083 ntTSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Sh3glb1Q9JK48 Gm2990-201ENSMUST00000180662 1118 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Sh3glb1Q9JK48 Gm4217-201ENSMUST00000182243 1002 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Sh3glb1Q9JK48 Gm21814-202ENSMUST00000203277 873 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Sh3glb1Q9JK48 Kazn-201ENSMUST00000036476 3843 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Sh3glb1Q9JK48 Nkx1-2-201ENSMUST00000054562 3264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Sh3glb1Q9JK48 Mus81-202ENSMUST00000124334 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Sh3glb1Q9JK48 Ubash3b-201ENSMUST00000044155 6354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Sh3glb1Q9JK48 Tbc1d8-201ENSMUST00000054462 4451 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Sh3glb1Q9JK48 Gm10010-201ENSMUST00000071101 2346 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Sh3glb1Q9JK48 Maged2-201ENSMUST00000026302 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Sh3glb1Q9JK48 Itgb1-201ENSMUST00000090006 3815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Sh3glb1Q9JK48 Iqsec3-201ENSMUST00000046373 6840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Sh3glb1Q9JK48 Gm37019-201ENSMUST00000192133 2134 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Sh3glb1Q9JK48 Cpeb2-205ENSMUST00000169035 7050 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Sh3glb1Q9JK48 Slc43a1-203ENSMUST00000111625 2487 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Sh3glb1Q9JK48 Ppp1r1b-204ENSMUST00000137634 1343 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Sh3glb1Q9JK48 Nabp1-201ENSMUST00000027279 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Sh3glb1Q9JK48 Irf5-205ENSMUST00000167252 1693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Sh3glb1Q9JK48 Elavl3-201ENSMUST00000003501 5014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Sh3glb1Q9JK48 Slc29a1-222ENSMUST00000171847 2033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Sh3glb1Q9JK48 Lurap1l-201ENSMUST00000055922 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Sh3glb1Q9JK48 Uvrag-201ENSMUST00000037968 5157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Sh3glb1Q9JK48 Mocos-201ENSMUST00000068006 2884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Sh3glb1Q9JK48 Rasgef1b-206ENSMUST00000161516 2523 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Sh3glb1Q9JK48 Uchl5-201ENSMUST00000018333 1845 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Sh3glb1Q9JK48 Sctr-202ENSMUST00000189037 1819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Sh3glb1Q9JK48 Tekt1-203ENSMUST00000108503 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Sh3glb1Q9JK48 Wscd1-202ENSMUST00000108510 2956 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Sh3glb1Q9JK48 Pgpep1-208ENSMUST00000211715 676 ntTSL 3 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Sh3glb1Q9JK48 Tdg-201ENSMUST00000092266 2959 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Sh3glb1Q9JK48 Rassf1-204ENSMUST00000122225 1783 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Sh3glb1Q9JK48 Zfp655-206ENSMUST00000200039 1765 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Sh3glb1Q9JK48 Ankra2-201ENSMUST00000022164 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Sh3glb1Q9JK48 Trim14-201ENSMUST00000046897 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Sh3glb1Q9JK48 Cbl-201ENSMUST00000037644 4901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Sh3glb1Q9JK48 Map3k9-202ENSMUST00000222322 3303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Sh3glb1Q9JK48 Gm20460-201ENSMUST00000168709 1572 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Sh3glb1Q9JK48 Zfp316-202ENSMUST00000161448 6891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Sh3glb1Q9JK48 Hmg20b-213ENSMUST00000167481 1321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Sh3glb1Q9JK48 Gm26666-201ENSMUST00000180763 2461 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Sh3glb1Q9JK48 Cpeb3-212ENSMUST00000154376 5671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Sh3glb1Q9JK48 Crhbp-201ENSMUST00000045583 1701 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Sh3glb1Q9JK48 Dera-201ENSMUST00000087675 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Sh3glb1Q9JK48 Nfasc-208ENSMUST00000188307 3049 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Sh3glb1Q9JK48 Anks1-203ENSMUST00000114842 5610 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Sh3glb1Q9JK48 Nap1l4-209ENSMUST00000209098 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Sh3glb1Q9JK48 Fam83h-202ENSMUST00000170153 4534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Sh3glb1Q9JK48 Gatc-201ENSMUST00000139167 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Sh3glb1Q9JK48 Spag1-202ENSMUST00000171205 3219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Sh3glb1Q9JK48 2410018L13Rik-205ENSMUST00000149246 3370 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Sh3glb1Q9JK48 Bmper-201ENSMUST00000071982 3791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Sh3glb1Q9JK48 Gmppa-201ENSMUST00000037796 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Sh3glb1Q9JK48 Slc24a4-202ENSMUST00000159329 4465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Sh3glb1Q9JK48 Noc4l-201ENSMUST00000042147 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Sh3glb1Q9JK48 Cenps-202ENSMUST00000105695 544 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Sh3glb1Q9JK48 Gm11539-201ENSMUST00000119837 557 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
Sh3glb1Q9JK48 Spdya-202ENSMUST00000124001 1247 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Sh3glb1Q9JK48 B430219N15Rik-201ENSMUST00000147230 835 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Sh3glb1Q9JK48 Mir5122-201ENSMUST00000175004 89 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
Sh3glb1Q9JK48 Fxyd1-208ENSMUST00000205807 539 ntTSL 3 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Sh3glb1Q9JK48 Zfp787-204ENSMUST00000207628 576 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Sh3glb1Q9JK48 Arhgef33-211ENSMUST00000225658 473 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
Sh3glb1Q9JK48 Arl2-201ENSMUST00000025893 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Sh3glb1Q9JK48 Siglecf-203ENSMUST00000122423 2607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Sh3glb1Q9JK48 Ubc-202ENSMUST00000136312 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Sh3glb1Q9JK48 Rcbtb1-201ENSMUST00000022551 3957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Sh3glb1Q9JK48 Krt27-201ENSMUST00000017732 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Sh3glb1Q9JK48 Dand5-201ENSMUST00000065539 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Sh3glb1Q9JK48 Nagpa-201ENSMUST00000023911 2143 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Sh3glb1Q9JK48 Nhlrc4-201ENSMUST00000085027 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Sh3glb1Q9JK48 Tomm70a-201ENSMUST00000166897 3778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Sh3glb1Q9JK48 Xpo6-201ENSMUST00000009344 4455 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Sh3glb1Q9JK48 Pcdhb22-201ENSMUST00000097609 2266 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Sh3glb1Q9JK48 Syt17-204ENSMUST00000203796 2957 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Sh3glb1Q9JK48 Rdx-201ENSMUST00000000590 4380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Sh3glb1Q9JK48 Suco-201ENSMUST00000048377 6327 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Sh3glb1Q9JK48 Cpne6-207ENSMUST00000171643 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Sh3glb1Q9JK48 Arhgef1-218ENSMUST00000206508 3195 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Sh3glb1Q9JK48 Coq6-201ENSMUST00000021661 1602 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Sh3glb1Q9JK48 Secisbp2-202ENSMUST00000110044 1915 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Sh3glb1Q9JK48 Malt1-201ENSMUST00000049248 5073 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Sh3glb1Q9JK48 Kcnq2-217ENSMUST00000149964 8209 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Sh3glb1Q9JK48 Fam102a-201ENSMUST00000048375 4223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Sh3glb1Q9JK48 Camta1-203ENSMUST00000105668 4962 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Sh3glb1Q9JK48 Rabggta-203ENSMUST00000169237 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Sh3glb1Q9JK48 Miga1-205ENSMUST00000199397 2842 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Sh3glb1Q9JK48 Zfp36l1-201ENSMUST00000021552 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Sh3glb1Q9JK48 Gm40773-201ENSMUST00000218113 1502 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Sh3glb1Q9JK48 Men1-204ENSMUST00000113500 2742 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Sh3glb1Q9JK48 Keap1-201ENSMUST00000049567 3172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Sh3glb1Q9JK48 Cadm3-202ENSMUST00000111220 5155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Sh3glb1Q9JK48 Ptpa-203ENSMUST00000113603 2169 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Sh3glb1Q9JK48 Dnajb3-201ENSMUST00000119972 1051 ntAPPRIS P1 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Sh3glb1Q9JK48 Jph4-202ENSMUST00000124493 3200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Sh3glb1Q9JK48 Cenps-207ENSMUST00000177408 689 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Sh3glb1Q9JK48 Zfp264-201ENSMUST00000208656 1563 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
Sh3glb1Q9JK48 Ruvbl2-205ENSMUST00000211214 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Sh3glb1Q9JK48 AC135963.1-201ENSMUST00000211640 717 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.6 ms