Protein–RNA interactions for Protein: Q9JJY4

Ddx20, Probable ATP-dependent RNA helicase DDX20, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 825 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ddx20Q9JJY4 Slc11a1-201ENSMUST00000027368 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Ddx20Q9JJY4 Slc46a1-201ENSMUST00000001126 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Ddx20Q9JJY4 Tbcel-201ENSMUST00000066148 5000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Ddx20Q9JJY4 Dph5-204ENSMUST00000189799 1558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Ddx20Q9JJY4 Rbm42-202ENSMUST00000108141 1526 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Ddx20Q9JJY4 Prr15-201ENSMUST00000059138 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Ddx20Q9JJY4 Iqsec2-207ENSMUST00000168786 5993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Ddx20Q9JJY4 Arhgef10-201ENSMUST00000084207 5528 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Ddx20Q9JJY4 Mmd-201ENSMUST00000004050 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Ddx20Q9JJY4 Arfip1-203ENSMUST00000143514 1343 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Ddx20Q9JJY4 4933412A08Rik-201ENSMUST00000061046 1343 ntBASIC18.35■□□□□ 0.53
Ddx20Q9JJY4 Gm26664-201ENSMUST00000181140 705 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Ddx20Q9JJY4 Impdh1-210ENSMUST00000162739 2471 ntTSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Ddx20Q9JJY4 Lonp2-201ENSMUST00000034141 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Ddx20Q9JJY4 N6amt1-201ENSMUST00000054442 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Ddx20Q9JJY4 Casq1-201ENSMUST00000003554 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Ddx20Q9JJY4 Sil1-201ENSMUST00000025215 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Ddx20Q9JJY4 Terf1-201ENSMUST00000027057 1581 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Ddx20Q9JJY4 Gtf2b-201ENSMUST00000029938 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Ddx20Q9JJY4 H2-D1-202ENSMUST00000172785 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Ddx20Q9JJY4 Zfand5-201ENSMUST00000025659 2834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Ddx20Q9JJY4 Mettl27-203ENSMUST00000111218 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Ddx20Q9JJY4 Sirt5-211ENSMUST00000223194 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Ddx20Q9JJY4 Phyhd1-204ENSMUST00000113645 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Ddx20Q9JJY4 Eps8-201ENSMUST00000058210 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Ddx20Q9JJY4 Dtx2-201ENSMUST00000005072 2562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Ddx20Q9JJY4 Ifna12-201ENSMUST00000102806 797 ntAPPRIS P1 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Ddx20Q9JJY4 Gm6226-201ENSMUST00000117765 1146 ntBASIC18.34■□□□□ 0.53
Ddx20Q9JJY4 Rpl13-ps5-201ENSMUST00000117813 630 ntBASIC18.34■□□□□ 0.53
Ddx20Q9JJY4 Gm11745-201ENSMUST00000121669 448 ntBASIC18.34■□□□□ 0.53
Ddx20Q9JJY4 Arhgap27os1-201ENSMUST00000130556 923 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Ddx20Q9JJY4 9530003J23Rik-202ENSMUST00000159193 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Ddx20Q9JJY4 Cldn25-ps-201ENSMUST00000197641 693 ntBASIC18.34■□□□□ 0.53
Ddx20Q9JJY4 Gm19164-201ENSMUST00000210667 640 ntBASIC18.34■□□□□ 0.53
Ddx20Q9JJY4 Pecr-201ENSMUST00000027381 1186 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Ddx20Q9JJY4 Calcb-201ENSMUST00000032902 962 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Ddx20Q9JJY4 Crygn-201ENSMUST00000047119 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Ddx20Q9JJY4 Lce1f-201ENSMUST00000047153 728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Ddx20Q9JJY4 Rnaseh2a-201ENSMUST00000065049 1006 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Ddx20Q9JJY4 Kctd9-205ENSMUST00000152243 2528 ntTSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Ddx20Q9JJY4 Fam57b-207ENSMUST00000207020 1777 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Ddx20Q9JJY4 Gm42417-201ENSMUST00000191849 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Ddx20Q9JJY4 Taf6l-205ENSMUST00000176496 2224 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Ddx20Q9JJY4 Ube2w-201ENSMUST00000117146 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Ddx20Q9JJY4 Lmnb2-202ENSMUST00000105332 1643 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Ddx20Q9JJY4 Prkag1-201ENSMUST00000168846 1638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Ddx20Q9JJY4 Gm5421-201ENSMUST00000181698 2354 ntBASIC18.33■□□□□ 0.53
Ddx20Q9JJY4 Ago4-201ENSMUST00000084289 6537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Ddx20Q9JJY4 Mrps27-201ENSMUST00000052249 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Ddx20Q9JJY4 Rnpep-202ENSMUST00000077340 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Ddx20Q9JJY4 Kank3-202ENSMUST00000172649 2652 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Ddx20Q9JJY4 Prrt4-201ENSMUST00000159200 3411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Ddx20Q9JJY4 Grip1os3-202ENSMUST00000146294 957 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Ddx20Q9JJY4 4930448I06Rik-201ENSMUST00000194002 546 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Ddx20Q9JJY4 Hnrnpa1l2-ps2-201ENSMUST00000022493 963 ntBASIC18.33■□□□□ 0.52
Ddx20Q9JJY4 Mrpl54-201ENSMUST00000046114 604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Ddx20Q9JJY4 Smim4-202ENSMUST00000064032 791 ntTSL 3 BASIC18.33■□□□□ 0.52
Ddx20Q9JJY4 Gm8281-202ENSMUST00000163719 1954 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
Ddx20Q9JJY4 Aspscr1-205ENSMUST00000106160 1550 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Ddx20Q9JJY4 1700010B13Rik-202ENSMUST00000189435 1549 ntTSL 3 BASIC18.33■□□□□ 0.52
Ddx20Q9JJY4 Wscd1-202ENSMUST00000108510 2956 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
Ddx20Q9JJY4 Ctdsp2-202ENSMUST00000105256 4817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Ddx20Q9JJY4 Raver2-201ENSMUST00000038463 4045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Ddx20Q9JJY4 Spdef-201ENSMUST00000025054 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Ddx20Q9JJY4 Ankrd29-201ENSMUST00000118525 3242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Ddx20Q9JJY4 Gm16835-201ENSMUST00000140488 2809 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Ddx20Q9JJY4 1700001O22Rik-201ENSMUST00000050003 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Ddx20Q9JJY4 Cacfd1-205ENSMUST00000114007 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Ddx20Q9JJY4 Mef2b-205ENSMUST00000163756 1337 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Ddx20Q9JJY4 Arhgap21-201ENSMUST00000114594 7351 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Ddx20Q9JJY4 Tspan5-203ENSMUST00000121826 1114 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Ddx20Q9JJY4 A530058N18Rik-205ENSMUST00000143993 550 ntTSL 3 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Ddx20Q9JJY4 Mir7023-201ENSMUST00000185093 64 ntBASIC18.32■□□□□ 0.52
Ddx20Q9JJY4 Gm37335-201ENSMUST00000192656 447 ntTSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Ddx20Q9JJY4 Gm10747-201ENSMUST00000217799 1014 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Ddx20Q9JJY4 Plpp2-205ENSMUST00000218241 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Ddx20Q9JJY4 AC122024.2-201ENSMUST00000220086 871 ntBASIC18.32■□□□□ 0.52
Ddx20Q9JJY4 Olfr370-201ENSMUST00000058609 1096 ntAPPRIS P1 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Ddx20Q9JJY4 Ggn-204ENSMUST00000208330 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Ddx20Q9JJY4 Nfe2-208ENSMUST00000149111 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Ddx20Q9JJY4 Pcdhac2-201ENSMUST00000047479 5888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Ddx20Q9JJY4 Ndufs2-202ENSMUST00000111318 1545 ntTSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Ddx20Q9JJY4 Gm27198-201ENSMUST00000184172 1517 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Ddx20Q9JJY4 Yipf4-201ENSMUST00000024873 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Ddx20Q9JJY4 Gpr20-201ENSMUST00000064166 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Ddx20Q9JJY4 Proser2-201ENSMUST00000054254 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Ddx20Q9JJY4 Mid1ip1-202ENSMUST00000115524 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Ddx20Q9JJY4 Mid1ip1-201ENSMUST00000008179 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Ddx20Q9JJY4 Scube2-202ENSMUST00000106728 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Ddx20Q9JJY4 Sufu-202ENSMUST00000111867 1747 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Ddx20Q9JJY4 Tgfb1i1-207ENSMUST00000167965 1746 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Ddx20Q9JJY4 Cd151-203ENSMUST00000177840 1708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Ddx20Q9JJY4 Poglut1-201ENSMUST00000036210 2758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Ddx20Q9JJY4 Tbx21-201ENSMUST00000001484 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Ddx20Q9JJY4 Snx11-202ENSMUST00000107661 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Ddx20Q9JJY4 B230217C12Rik-203ENSMUST00000164364 1859 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Ddx20Q9JJY4 Mfge8-201ENSMUST00000032825 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Ddx20Q9JJY4 Zfp668-203ENSMUST00000106262 3169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Ddx20Q9JJY4 Tsc22d3-203ENSMUST00000112996 1552 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Ddx20Q9JJY4 Chd5-202ENSMUST00000030775 9486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.5 ms