Protein–RNA interactions for Protein: Q9JJY3

Smpd3, Sphingomyelin phosphodiesterase 3, mousemouse

Predictions only

Length 655 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smpd3Q9JJY3 Atf3-201ENSMUST00000027941 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Smpd3Q9JJY3 Cdc42ep1-201ENSMUST00000059619 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Smpd3Q9JJY3 Arnt-204ENSMUST00000107160 783 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Smpd3Q9JJY3 Gm14464-201ENSMUST00000119658 1254 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Smpd3Q9JJY3 Gm22697-201ENSMUST00000175194 63 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Smpd3Q9JJY3 Pldi-201ENSMUST00000036304 853 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Smpd3Q9JJY3 Rpl39l-201ENSMUST00000044103 805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Smpd3Q9JJY3 Ppp1r12b-202ENSMUST00000086444 3137 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Smpd3Q9JJY3 Osr1-201ENSMUST00000057021 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Smpd3Q9JJY3 Acvr1c-204ENSMUST00000112608 1497 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Smpd3Q9JJY3 Magi1-202ENSMUST00000089317 7209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Smpd3Q9JJY3 Lias-202ENSMUST00000122026 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Smpd3Q9JJY3 Tmem266-201ENSMUST00000034862 2408 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Smpd3Q9JJY3 Hps1-201ENSMUST00000026194 2647 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Smpd3Q9JJY3 Otud4-202ENSMUST00000173078 7354 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Smpd3Q9JJY3 Gm43598-201ENSMUST00000202482 2479 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Smpd3Q9JJY3 Cacna2d2-202ENSMUST00000085092 5183 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Smpd3Q9JJY3 Spire2-202ENSMUST00000212404 2158 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Smpd3Q9JJY3 Gbe1-203ENSMUST00000163832 2984 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Smpd3Q9JJY3 Rgma-204ENSMUST00000139780 3371 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Smpd3Q9JJY3 Kdelr2-201ENSMUST00000110731 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Smpd3Q9JJY3 Klhl33-202ENSMUST00000170855 1422 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Smpd3Q9JJY3 Prmt6-203ENSMUST00000190378 3051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Smpd3Q9JJY3 Trim11-201ENSMUST00000093061 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Smpd3Q9JJY3 Fam3a-206ENSMUST00000114143 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Smpd3Q9JJY3 Gatad2a-203ENSMUST00000177851 5007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Smpd3Q9JJY3 Spdya-202ENSMUST00000124001 1247 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Smpd3Q9JJY3 Pabpc1l2b-ps-201ENSMUST00000124538 690 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Smpd3Q9JJY3 Hist1h2br-203ENSMUST00000180288 1256 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Smpd3Q9JJY3 Lce1h-201ENSMUST00000051521 706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Smpd3Q9JJY3 Hist1h2bq-202ENSMUST00000091749 1254 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Smpd3Q9JJY3 Stam2-202ENSMUST00000127316 1928 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Smpd3Q9JJY3 Actl10-201ENSMUST00000104928 1501 ntAPPRIS P1 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Smpd3Q9JJY3 Eme2-202ENSMUST00000121542 1521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Smpd3Q9JJY3 Actl10-202ENSMUST00000226583 1501 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Smpd3Q9JJY3 5830415G21Rik-201ENSMUST00000192543 1332 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Smpd3Q9JJY3 Apmap-201ENSMUST00000046399 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Smpd3Q9JJY3 Fam174b-201ENSMUST00000107456 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Smpd3Q9JJY3 Arrdc1-202ENSMUST00000102935 1574 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Smpd3Q9JJY3 Cfap97-202ENSMUST00000110376 2043 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Smpd3Q9JJY3 Tle3-205ENSMUST00000159630 4065 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Smpd3Q9JJY3 Mllt1-201ENSMUST00000025053 3608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Smpd3Q9JJY3 Barhl1-201ENSMUST00000050776 3666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Smpd3Q9JJY3 Rdx-201ENSMUST00000000590 4380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Smpd3Q9JJY3 Pxn-201ENSMUST00000067268 3706 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Smpd3Q9JJY3 Jup-202ENSMUST00000107403 2386 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Smpd3Q9JJY3 Gtf3a-201ENSMUST00000132102 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Smpd3Q9JJY3 Ubqln4-201ENSMUST00000008748 3330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Smpd3Q9JJY3 Kazn-201ENSMUST00000036476 3843 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Smpd3Q9JJY3 Gm26781-201ENSMUST00000181385 1477 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Smpd3Q9JJY3 Slc45a4-204ENSMUST00000132607 2457 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Smpd3Q9JJY3 Dnm2-211ENSMUST00000173397 3510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Smpd3Q9JJY3 Skp1a-203ENSMUST00000109072 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Smpd3Q9JJY3 Gmcl1-202ENSMUST00000113679 960 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Smpd3Q9JJY3 Hmga1-206ENSMUST00000119486 1003 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Smpd3Q9JJY3 Bola2-203ENSMUST00000130498 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Smpd3Q9JJY3 Cldn18-203ENSMUST00000131922 860 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Smpd3Q9JJY3 Gm15889-201ENSMUST00000159142 1083 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Smpd3Q9JJY3 Gm6659-201ENSMUST00000174752 547 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Smpd3Q9JJY3 Gm7370-201ENSMUST00000219471 767 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Smpd3Q9JJY3 Hoxa6-201ENSMUST00000062829 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Smpd3Q9JJY3 Crtc3-201ENSMUST00000122255 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Smpd3Q9JJY3 Espnl-202ENSMUST00000176156 2886 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Smpd3Q9JJY3 Abraxas1-202ENSMUST00000055245 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Smpd3Q9JJY3 Sgpp1-202ENSMUST00000220285 3200 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Smpd3Q9JJY3 Gm16861-201ENSMUST00000181498 1647 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Smpd3Q9JJY3 Ptpa-203ENSMUST00000113603 2169 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Smpd3Q9JJY3 Cpne6-203ENSMUST00000165262 2178 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Smpd3Q9JJY3 Ccr9-202ENSMUST00000163559 3004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Smpd3Q9JJY3 Gm3488-202ENSMUST00000181562 1945 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Smpd3Q9JJY3 A830009L08Rik-201ENSMUST00000181054 2807 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Smpd3Q9JJY3 Rasgrp2-208ENSMUST00000113476 2296 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Smpd3Q9JJY3 Trim25-202ENSMUST00000100627 1433 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Smpd3Q9JJY3 Tekt1-202ENSMUST00000108502 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Smpd3Q9JJY3 Rnf139-201ENSMUST00000036904 4348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Smpd3Q9JJY3 Arf2-202ENSMUST00000063347 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Smpd3Q9JJY3 Xpo1-202ENSMUST00000102869 6004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Smpd3Q9JJY3 Myrf-202ENSMUST00000186056 3636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Smpd3Q9JJY3 Trmo-201ENSMUST00000030015 1527 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Smpd3Q9JJY3 Ano8-201ENSMUST00000093450 3653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Smpd3Q9JJY3 Nup98-205ENSMUST00000211022 3132 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Smpd3Q9JJY3 Cdk16-201ENSMUST00000033380 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Smpd3Q9JJY3 4930448E22Rik-201ENSMUST00000181712 1581 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Smpd3Q9JJY3 Gm28876-201ENSMUST00000188137 703 ntTSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Smpd3Q9JJY3 Spata33-206ENSMUST00000212637 569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Smpd3Q9JJY3 Metrn-201ENSMUST00000002344 987 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Smpd3Q9JJY3 Chaf1b-201ENSMUST00000023666 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Smpd3Q9JJY3 Homer2-206ENSMUST00000207983 1634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Smpd3Q9JJY3 Kif12-201ENSMUST00000030042 2250 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Smpd3Q9JJY3 Rhot1-203ENSMUST00000077451 3297 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Smpd3Q9JJY3 Camta1-202ENSMUST00000097774 8533 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Smpd3Q9JJY3 Spsb2-203ENSMUST00000112473 1322 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Smpd3Q9JJY3 4933402J07Rik-201ENSMUST00000093342 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Smpd3Q9JJY3 Gm6190-201ENSMUST00000220683 1374 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Smpd3Q9JJY3 Asic1-201ENSMUST00000023758 4114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Smpd3Q9JJY3 Pigw-202ENSMUST00000108080 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Smpd3Q9JJY3 Pitpnm2-209ENSMUST00000161938 5866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Smpd3Q9JJY3 Il7-203ENSMUST00000192202 2057 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Smpd3Q9JJY3 Med20-201ENSMUST00000024778 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Smpd3Q9JJY3 Gpam-201ENSMUST00000061856 3832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.3 ms