Protein–RNA interactions for Protein: Q9JJS6

Bco1, Beta,beta-carotene 15,15'-dioxygenase, mousemouse

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Length 566 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Bco1Q9JJS6 Emd-201ENSMUST00000002029 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Bco1Q9JJS6 Nipal3-201ENSMUST00000102549 5153 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Bco1Q9JJS6 Rundc3b-201ENSMUST00000047485 3677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Bco1Q9JJS6 Isg20l2-201ENSMUST00000055984 2893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Bco1Q9JJS6 Taf5l-201ENSMUST00000093039 2912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Bco1Q9JJS6 2210408F21Rik-212ENSMUST00000152157 490 ntTSL 2 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Bco1Q9JJS6 Rnf5-201ENSMUST00000015622 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Bco1Q9JJS6 Bex3-204ENSMUST00000178632 933 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Bco1Q9JJS6 Gm26644-201ENSMUST00000181365 958 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Bco1Q9JJS6 Gm27867-201ENSMUST00000184778 125 ntBASIC14.82□□□□□ -0.04
Bco1Q9JJS6 Vsig2-201ENSMUST00000002008 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
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Bco1Q9JJS6 Cmtm7-202ENSMUST00000084867 874 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Bco1Q9JJS6 Npffr1-201ENSMUST00000020287 3479 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Bco1Q9JJS6 Fam159b-201ENSMUST00000043061 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Bco1Q9JJS6 Tssc4-206ENSMUST00000177841 1364 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Bco1Q9JJS6 Mif4gd-201ENSMUST00000021087 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Bco1Q9JJS6 Celf1-206ENSMUST00000111451 4678 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Bco1Q9JJS6 Mesp2-201ENSMUST00000107394 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Bco1Q9JJS6 Pip4k2a-201ENSMUST00000006912 3477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Bco1Q9JJS6 Gm3248-201ENSMUST00000163885 2055 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
Bco1Q9JJS6 Zpbp-201ENSMUST00000020413 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Bco1Q9JJS6 Zhx1-201ENSMUST00000070143 4764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Bco1Q9JJS6 Senp7-211ENSMUST00000202000 3218 ntTSL 2 BASIC14.81□□□□□ -0.04
Bco1Q9JJS6 Trip6-201ENSMUST00000024119 2168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Bco1Q9JJS6 Pex12-205ENSMUST00000175741 2337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
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Bco1Q9JJS6 Sorbs1-213ENSMUST00000225153 3589 ntAPPRIS P4 BASIC14.81□□□□□ -0.04
Bco1Q9JJS6 Scube3-201ENSMUST00000043503 6699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Bco1Q9JJS6 Ace-201ENSMUST00000001963 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Bco1Q9JJS6 Hint3-203ENSMUST00000161074 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
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Bco1Q9JJS6 Mamstr-201ENSMUST00000148532 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Bco1Q9JJS6 Mccc1-201ENSMUST00000029259 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
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Bco1Q9JJS6 Dtx2-202ENSMUST00000111142 2650 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Bco1Q9JJS6 Slc1a6-201ENSMUST00000005490 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
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Bco1Q9JJS6 Dguok-201ENSMUST00000014698 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Bco1Q9JJS6 Gm13054-201ENSMUST00000154192 820 ntTSL 3 BASIC14.8□□□□□ -0.04
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Bco1Q9JJS6 Rftn1-201ENSMUST00000044503 4029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Bco1Q9JJS6 Tlnrd1-201ENSMUST00000094216 4433 ntAPPRIS P1 BASIC14.79□□□□□ -0.04
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Bco1Q9JJS6 Apeh-206ENSMUST00000193254 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
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Bco1Q9JJS6 Gzmm-201ENSMUST00000020549 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
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Bco1Q9JJS6 Pgc-201ENSMUST00000024782 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Bco1Q9JJS6 Ogfod3-201ENSMUST00000026169 1308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Bco1Q9JJS6 Fcnb-201ENSMUST00000028179 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Bco1Q9JJS6 Zswim4-201ENSMUST00000039480 4625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Bco1Q9JJS6 Kctd8-201ENSMUST00000054095 2859 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Bco1Q9JJS6 Birc2-201ENSMUST00000054878 378 ntBASIC14.79□□□□□ -0.04
Bco1Q9JJS6 4931422A03Rik-201ENSMUST00000056170 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
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