Protein–RNA interactions for Protein: Q9JJF6

Efcc1, EF-hand and coiled-coil domain-containing protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 558 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Efcc1Q9JJF6 Nnat-202ENSMUST00000109526 1213 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Efcc1Q9JJF6 Lhx1os-201ENSMUST00000126072 589 ntTSL 3 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Efcc1Q9JJF6 Gm6443-201ENSMUST00000203599 874 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
Efcc1Q9JJF6 Csrp2-207ENSMUST00000220409 780 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Efcc1Q9JJF6 4930428E07Rik-201ENSMUST00000222132 920 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Efcc1Q9JJF6 Thoc7-201ENSMUST00000065865 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Efcc1Q9JJF6 Rcc2-201ENSMUST00000038893 3767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Efcc1Q9JJF6 Bicc1-203ENSMUST00000143791 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Efcc1Q9JJF6 Pitx2-206ENSMUST00000174623 1493 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Efcc1Q9JJF6 Gm38575-203ENSMUST00000215824 1490 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Efcc1Q9JJF6 Atat1-202ENSMUST00000061052 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Efcc1Q9JJF6 Rerg-202ENSMUST00000117919 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Efcc1Q9JJF6 Twf2-201ENSMUST00000024047 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Efcc1Q9JJF6 Nipa2-201ENSMUST00000032635 3197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Efcc1Q9JJF6 9130024F11Rik-201ENSMUST00000135238 1300 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Efcc1Q9JJF6 Cd2bp2-201ENSMUST00000035771 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Efcc1Q9JJF6 Lcat-201ENSMUST00000038896 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Efcc1Q9JJF6 Fam135a-201ENSMUST00000027337 5536 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Efcc1Q9JJF6 Ank1-203ENSMUST00000110688 7206 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Efcc1Q9JJF6 Sgta-202ENSMUST00000218208 1964 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Efcc1Q9JJF6 Gm10435-202ENSMUST00000162526 2878 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Efcc1Q9JJF6 Tmem132c-201ENSMUST00000119026 5134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Efcc1Q9JJF6 Gm44729-201ENSMUST00000206759 2052 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
Efcc1Q9JJF6 Noc4l-201ENSMUST00000042147 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Efcc1Q9JJF6 Rplp2-203ENSMUST00000106004 421 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Efcc1Q9JJF6 BC051226-201ENSMUST00000172526 837 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Efcc1Q9JJF6 H2-T-ps-201ENSMUST00000172538 1067 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
Efcc1Q9JJF6 Gm27646-201ENSMUST00000183989 110 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
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Efcc1Q9JJF6 Sod1-201ENSMUST00000023707 646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Efcc1Q9JJF6 Hist1h2ak-201ENSMUST00000074752 393 ntAPPRIS P1 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Efcc1Q9JJF6 Gnas-202ENSMUST00000087871 3903 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Efcc1Q9JJF6 Dtx3-204ENSMUST00000130855 1925 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Efcc1Q9JJF6 Fam161a-205ENSMUST00000172602 1935 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Efcc1Q9JJF6 Dtx3-201ENSMUST00000038217 1944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Efcc1Q9JJF6 Nhs-201ENSMUST00000081569 4881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Efcc1Q9JJF6 Fam171a1-203ENSMUST00000091505 3449 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Efcc1Q9JJF6 Gjb1-201ENSMUST00000052130 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Efcc1Q9JJF6 Taf5l-202ENSMUST00000165628 2973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Efcc1Q9JJF6 Ldha-201ENSMUST00000005051 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Efcc1Q9JJF6 Mettl7a1-201ENSMUST00000067752 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Efcc1Q9JJF6 Pip4k2a-201ENSMUST00000006912 3477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Efcc1Q9JJF6 Apaf1-208ENSMUST00000162618 5151 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
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Efcc1Q9JJF6 Fbxl3-206ENSMUST00000145693 3352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Efcc1Q9JJF6 C130073E24Rik-201ENSMUST00000210222 6144 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Efcc1Q9JJF6 Hsdl2-201ENSMUST00000030078 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Efcc1Q9JJF6 Ccl27a-217ENSMUST00000155240 343 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
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Efcc1Q9JJF6 Dnal4-201ENSMUST00000023055 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
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Efcc1Q9JJF6 Raet1e-204ENSMUST00000181645 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
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Efcc1Q9JJF6 H2-Bl-201ENSMUST00000173080 1138 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Efcc1Q9JJF6 Coa3-201ENSMUST00000017332 886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Efcc1Q9JJF6 Gm21887-203ENSMUST00000180251 531 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Efcc1Q9JJF6 H2-Bl-204ENSMUST00000184502 862 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
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Efcc1Q9JJF6 Fam120c-201ENSMUST00000073364 5463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Efcc1Q9JJF6 Ankrd13b-201ENSMUST00000037593 3105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Efcc1Q9JJF6 Slc6a1-204ENSMUST00000204074 1740 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Efcc1Q9JJF6 Smpd4-221ENSMUST00000170996 1619 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Efcc1Q9JJF6 Rffl-202ENSMUST00000071152 3633 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Efcc1Q9JJF6 Ppfibp1-201ENSMUST00000016631 4851 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Efcc1Q9JJF6 Mycbp-201ENSMUST00000030400 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Efcc1Q9JJF6 Tmem131l-201ENSMUST00000052342 4815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Efcc1Q9JJF6 Homez-202ENSMUST00000142283 4713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Efcc1Q9JJF6 Gm10505-201ENSMUST00000151398 1587 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Efcc1Q9JJF6 Scamp3-203ENSMUST00000120697 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Efcc1Q9JJF6 Loxl4-205ENSMUST00000171432 2274 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Efcc1Q9JJF6 Ntrk2-205ENSMUST00000224402 2284 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
Efcc1Q9JJF6 Pex5-202ENSMUST00000080557 3073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
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