Protein–RNA interactions for Protein: Q9JIS8

Slc12a4, Solute carrier family 12 member 4, mousemouse

Predictions only

Length 1,085 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Slc12a4Q9JIS8 Ndufab1-ps-201ENSMUST00000166096 468 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Slc12a4Q9JIS8 4930579K19Rik-202ENSMUST00000190541 632 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Slc12a4Q9JIS8 Gm8797-201ENSMUST00000192045 490 ntAPPRIS P1 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Slc12a4Q9JIS8 Gm21559-201ENSMUST00000220638 855 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Slc12a4Q9JIS8 Hoxa6-201ENSMUST00000062829 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Slc12a4Q9JIS8 Gm8587-201ENSMUST00000076538 843 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Slc12a4Q9JIS8 Serf2-204ENSMUST00000139253 3056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Slc12a4Q9JIS8 Tmem56-203ENSMUST00000128909 6696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Slc12a4Q9JIS8 Runx2-203ENSMUST00000113572 6463 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Slc12a4Q9JIS8 Sf1-203ENSMUST00000113488 2282 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
Slc12a4Q9JIS8 Nupl2-201ENSMUST00000049887 2914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Slc12a4Q9JIS8 Slc38a10-203ENSMUST00000076697 1672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Slc12a4Q9JIS8 Dlgap1-207ENSMUST00000133983 7173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Slc12a4Q9JIS8 Slc41a3-202ENSMUST00000044019 2412 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Slc12a4Q9JIS8 Tmem229b-201ENSMUST00000056660 3860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Slc12a4Q9JIS8 Usp35-202ENSMUST00000168435 3982 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
Slc12a4Q9JIS8 Slc35c1-202ENSMUST00000125276 2668 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Slc12a4Q9JIS8 Gm13425-201ENSMUST00000145389 5391 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Slc12a4Q9JIS8 Hoxd3-203ENSMUST00000111983 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Slc12a4Q9JIS8 Gm16731-201ENSMUST00000132432 922 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Slc12a4Q9JIS8 Slc25a51-203ENSMUST00000132815 1005 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Slc12a4Q9JIS8 Surf1-201ENSMUST00000015934 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Slc12a4Q9JIS8 Fbxo6-208ENSMUST00000168503 1240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Slc12a4Q9JIS8 Gm9745-201ENSMUST00000021573 684 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Slc12a4Q9JIS8 Gm18101-201ENSMUST00000215769 548 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
Slc12a4Q9JIS8 Rln3-201ENSMUST00000061923 634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Slc12a4Q9JIS8 Olfr315-201ENSMUST00000081533 998 ntAPPRIS P1 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Slc12a4Q9JIS8 Abcc5-203ENSMUST00000096199 1136 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Slc12a4Q9JIS8 Ube2w-201ENSMUST00000117146 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Slc12a4Q9JIS8 Antxr1-205ENSMUST00000205033 3160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Slc12a4Q9JIS8 Crhr2-203ENSMUST00000114374 1440 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Slc12a4Q9JIS8 Tm9sf1-204ENSMUST00000121937 2398 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Slc12a4Q9JIS8 Klhl33-202ENSMUST00000170855 1422 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Slc12a4Q9JIS8 Ube2d1-201ENSMUST00000020085 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Slc12a4Q9JIS8 Ccdc158-204ENSMUST00000151180 3352 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Slc12a4Q9JIS8 Ipo8-201ENSMUST00000048418 5360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Slc12a4Q9JIS8 Cdon-202ENSMUST00000119129 7503 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Slc12a4Q9JIS8 Ggnbp1-201ENSMUST00000053683 1525 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Slc12a4Q9JIS8 Dmpk-203ENSMUST00000108474 2591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Slc12a4Q9JIS8 Poli-201ENSMUST00000043286 2591 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Slc12a4Q9JIS8 Fam81a-201ENSMUST00000034749 3703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Slc12a4Q9JIS8 Sirt6-202ENSMUST00000119324 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Slc12a4Q9JIS8 Pbk-201ENSMUST00000022612 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Slc12a4Q9JIS8 Medag-201ENSMUST00000093110 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Slc12a4Q9JIS8 Strn4-202ENSMUST00000108495 3082 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Slc12a4Q9JIS8 Ap1g1-202ENSMUST00000093157 6899 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Slc12a4Q9JIS8 Gm26825-201ENSMUST00000181751 2026 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Slc12a4Q9JIS8 Tfeb-201ENSMUST00000024786 2296 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Slc12a4Q9JIS8 Nyap1-204ENSMUST00000212152 2499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Slc12a4Q9JIS8 Pik3ap1-201ENSMUST00000059672 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Slc12a4Q9JIS8 Lrrc7-204ENSMUST00000199890 6326 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Slc12a4Q9JIS8 B230219D22Rik-201ENSMUST00000057844 4652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Slc12a4Q9JIS8 Washc1-202ENSMUST00000116556 2887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Slc12a4Q9JIS8 Nkx1-2-201ENSMUST00000054562 3264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Slc12a4Q9JIS8 Gpd2-202ENSMUST00000112618 5759 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Slc12a4Q9JIS8 Fam229a-201ENSMUST00000106043 558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Slc12a4Q9JIS8 AA467197-202ENSMUST00000110512 751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Slc12a4Q9JIS8 1810012K08Rik-201ENSMUST00000155199 574 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Slc12a4Q9JIS8 Gm36967-201ENSMUST00000193814 266 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Slc12a4Q9JIS8 Rpl18-204ENSMUST00000209693 535 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Slc12a4Q9JIS8 Ankrd40-201ENSMUST00000021227 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Slc12a4Q9JIS8 Gm26709-202ENSMUST00000223049 819 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Slc12a4Q9JIS8 Gm16759-201ENSMUST00000126238 1393 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Slc12a4Q9JIS8 Stard6-201ENSMUST00000114959 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Slc12a4Q9JIS8 Stxbp5l-202ENSMUST00000114775 1691 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Slc12a4Q9JIS8 Cend1-201ENSMUST00000084436 1672 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Slc12a4Q9JIS8 Irf7-202ENSMUST00000097952 1764 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Slc12a4Q9JIS8 Tfap2b-202ENSMUST00000064976 1946 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Slc12a4Q9JIS8 Dmc1-201ENSMUST00000023065 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Slc12a4Q9JIS8 Nelfa-201ENSMUST00000030993 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Slc12a4Q9JIS8 Flrt2-202ENSMUST00000110117 3223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Slc12a4Q9JIS8 Tmtc2-201ENSMUST00000061506 5629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Slc12a4Q9JIS8 C77080-201ENSMUST00000052602 5187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Slc12a4Q9JIS8 Tox2-202ENSMUST00000109428 2947 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Slc12a4Q9JIS8 Slc48a1-201ENSMUST00000117892 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Slc12a4Q9JIS8 Slc39a1-201ENSMUST00000015467 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Slc12a4Q9JIS8 Cpne6-207ENSMUST00000171643 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Slc12a4Q9JIS8 Dcaf17-201ENSMUST00000064141 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Slc12a4Q9JIS8 N6amt1-201ENSMUST00000054442 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Slc12a4Q9JIS8 E330011M16Rik-201ENSMUST00000193614 1794 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
Slc12a4Q9JIS8 Gm45723-201ENSMUST00000212135 1783 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Slc12a4Q9JIS8 Fam110a-201ENSMUST00000062047 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Slc12a4Q9JIS8 Gm26752-201ENSMUST00000181086 1537 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Slc12a4Q9JIS8 Lmo4-202ENSMUST00000121112 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Slc12a4Q9JIS8 Nagk-203ENSMUST00000113851 1323 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Slc12a4Q9JIS8 Gm13524-201ENSMUST00000125869 662 ntTSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Slc12a4Q9JIS8 Gm13420-201ENSMUST00000129574 1091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Slc12a4Q9JIS8 Cldn18-203ENSMUST00000131922 860 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Slc12a4Q9JIS8 Gm37722-201ENSMUST00000193757 208 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
Slc12a4Q9JIS8 BC048679-203ENSMUST00000207871 567 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Slc12a4Q9JIS8 Nudt1-201ENSMUST00000050205 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Slc12a4Q9JIS8 Nudt1-202ENSMUST00000071881 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Slc12a4Q9JIS8 Vpreb1-201ENSMUST00000075017 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Slc12a4Q9JIS8 3110070M22Rik-201ENSMUST00000099148 1123 ntAPPRIS P1 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Slc12a4Q9JIS8 Lats1-202ENSMUST00000165952 7209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Slc12a4Q9JIS8 Hsp90b1-201ENSMUST00000020238 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Slc12a4Q9JIS8 Taf10-203ENSMUST00000141116 4281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Slc12a4Q9JIS8 Dcdc2a-201ENSMUST00000036932 2345 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Slc12a4Q9JIS8 Eif4g1-202ENSMUST00000073840 5394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Slc12a4Q9JIS8 Rnf145-201ENSMUST00000019333 3570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.7 ms