Protein–RNA interactions for Protein: Q9JIM1

Slc29a1, Equilibrative nucleoside transporter 1, mousemouse

Predictions only

Length 460 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Slc29a1Q9JIM1 Dcdc2a-201ENSMUST00000036932 2345 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Slc29a1Q9JIM1 Ablim2-202ENSMUST00000101280 3042 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Slc29a1Q9JIM1 Cstf2-201ENSMUST00000033609 4502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Slc29a1Q9JIM1 AC154412.1-201ENSMUST00000226540 2786 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
Slc29a1Q9JIM1 Rfc5-201ENSMUST00000086461 2796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Slc29a1Q9JIM1 Syn1-201ENSMUST00000081893 3209 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Slc29a1Q9JIM1 Dock1-206ENSMUST00000211593 2589 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Slc29a1Q9JIM1 Tfg-202ENSMUST00000121554 716 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Slc29a1Q9JIM1 Gm9013-201ENSMUST00000132939 882 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
Slc29a1Q9JIM1 Ctsg-201ENSMUST00000015583 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Slc29a1Q9JIM1 Shc3-203ENSMUST00000223543 1241 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Slc29a1Q9JIM1 AC121577.1-201ENSMUST00000227302 707 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
Slc29a1Q9JIM1 Cebpzos-201ENSMUST00000063817 753 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Slc29a1Q9JIM1 Taar2-201ENSMUST00000079134 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Slc29a1Q9JIM1 Nat8l-201ENSMUST00000056355 6529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Slc29a1Q9JIM1 Emx2-201ENSMUST00000062216 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Slc29a1Q9JIM1 Rps6kl1-201ENSMUST00000019379 2304 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Slc29a1Q9JIM1 Lhx8-205ENSMUST00000205251 1729 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Slc29a1Q9JIM1 BC037032-201ENSMUST00000140003 3974 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Slc29a1Q9JIM1 Tcf3-204ENSMUST00000105340 2826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Slc29a1Q9JIM1 Tcf3-202ENSMUST00000020379 2829 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Slc29a1Q9JIM1 Gid8-201ENSMUST00000029090 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Slc29a1Q9JIM1 Apmap-201ENSMUST00000046399 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Slc29a1Q9JIM1 Rpn2-201ENSMUST00000029171 2621 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Slc29a1Q9JIM1 Trpc1-204ENSMUST00000189137 4559 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Slc29a1Q9JIM1 Ubtf-205ENSMUST00000107119 3013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Slc29a1Q9JIM1 Ankrd61-202ENSMUST00000110717 1498 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Slc29a1Q9JIM1 Ccdc158-204ENSMUST00000151180 3352 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Slc29a1Q9JIM1 Renbp-202ENSMUST00000116578 1418 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Slc29a1Q9JIM1 Slc37a4-203ENSMUST00000213388 2344 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Slc29a1Q9JIM1 Podn-203ENSMUST00000106709 3170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Slc29a1Q9JIM1 Ttbk1-201ENSMUST00000047034 6959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Slc29a1Q9JIM1 1700066M21Rik-201ENSMUST00000042734 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Slc29a1Q9JIM1 Hmgb3-204ENSMUST00000114582 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Slc29a1Q9JIM1 Hmgb3-203ENSMUST00000088874 1728 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Slc29a1Q9JIM1 Apopt1-204ENSMUST00000163220 671 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Slc29a1Q9JIM1 Tppp3-202ENSMUST00000176419 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Slc29a1Q9JIM1 Rnf13-209ENSMUST00000199041 1062 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Slc29a1Q9JIM1 Gm17808-201ENSMUST00000200859 894 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
Slc29a1Q9JIM1 AC125350.1-201ENSMUST00000225115 903 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
Slc29a1Q9JIM1 Cenps-201ENSMUST00000030813 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Slc29a1Q9JIM1 Akap1-201ENSMUST00000018572 3758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Slc29a1Q9JIM1 Pten-201ENSMUST00000013807 8292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Slc29a1Q9JIM1 Ptgs1-201ENSMUST00000062069 2867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Slc29a1Q9JIM1 Ier5-201ENSMUST00000055322 3276 ntAPPRIS P1 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Slc29a1Q9JIM1 Cmtm3-201ENSMUST00000034343 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Slc29a1Q9JIM1 Sh3glb1-202ENSMUST00000198254 5945 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Slc29a1Q9JIM1 Zyx-205ENSMUST00000203401 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Slc29a1Q9JIM1 Fam155a-206ENSMUST00000208933 1569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Slc29a1Q9JIM1 Gde1-201ENSMUST00000038791 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Slc29a1Q9JIM1 Erf-201ENSMUST00000045847 3505 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Slc29a1Q9JIM1 Slit1-201ENSMUST00000025993 5045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Slc29a1Q9JIM1 Pdlim7-206ENSMUST00000131306 1915 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Slc29a1Q9JIM1 Rfx7-202ENSMUST00000163401 7880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Slc29a1Q9JIM1 Gm26560-201ENSMUST00000181240 2619 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Slc29a1Q9JIM1 Tbc1d20-201ENSMUST00000028963 3386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Slc29a1Q9JIM1 Pprc1-203ENSMUST00000111899 5246 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Slc29a1Q9JIM1 Arsi-201ENSMUST00000040359 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Slc29a1Q9JIM1 Pkp2-201ENSMUST00000039408 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Slc29a1Q9JIM1 Tcf3-210ENSMUST00000105346 2839 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Slc29a1Q9JIM1 Mir124-2hg-202ENSMUST00000186746 1368 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Slc29a1Q9JIM1 Tmem260-201ENSMUST00000111735 5485 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Slc29a1Q9JIM1 Coch-202ENSMUST00000164782 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Slc29a1Q9JIM1 9430015G10Rik-208ENSMUST00000169550 2660 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Slc29a1Q9JIM1 Eml3-202ENSMUST00000224272 2978 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Slc29a1Q9JIM1 Lmnb2-202ENSMUST00000105332 1643 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Slc29a1Q9JIM1 Prrg2-208ENSMUST00000210690 1623 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Slc29a1Q9JIM1 Fgf8-205ENSMUST00000111927 843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Slc29a1Q9JIM1 Lcn12-202ENSMUST00000114245 619 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Slc29a1Q9JIM1 2410004I01Rik-201ENSMUST00000138424 1187 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Slc29a1Q9JIM1 Mir9-3hg-206ENSMUST00000182937 636 ntTSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Slc29a1Q9JIM1 Gda-201ENSMUST00000087600 5428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Slc29a1Q9JIM1 Osbpl1a-206ENSMUST00000121774 2931 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Slc29a1Q9JIM1 Zfp691-201ENSMUST00000052715 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Slc29a1Q9JIM1 Sybu-202ENSMUST00000110267 3127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Slc29a1Q9JIM1 Slc25a29-201ENSMUST00000021693 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Slc29a1Q9JIM1 St6galnac2-201ENSMUST00000079545 3643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Slc29a1Q9JIM1 Acadvl-202ENSMUST00000102574 2168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Slc29a1Q9JIM1 Dmrtb1-201ENSMUST00000069271 1861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Slc29a1Q9JIM1 Gm29340-201ENSMUST00000188763 3854 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
Slc29a1Q9JIM1 Enah-204ENSMUST00000111030 2844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Slc29a1Q9JIM1 Gm11950-201ENSMUST00000121615 838 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
Slc29a1Q9JIM1 Gm5577-203ENSMUST00000153372 815 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Slc29a1Q9JIM1 Gm23634-201ENSMUST00000175071 91 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
Slc29a1Q9JIM1 Gm20675-201ENSMUST00000175861 338 ntTSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Slc29a1Q9JIM1 Gm29518-201ENSMUST00000190858 372 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
Slc29a1Q9JIM1 Ankrd39-202ENSMUST00000194894 664 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Slc29a1Q9JIM1 Cep55-203ENSMUST00000169673 2761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Slc29a1Q9JIM1 Gnas-211ENSMUST00000109096 2465 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Slc29a1Q9JIM1 Nlk-201ENSMUST00000142739 4444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Slc29a1Q9JIM1 Sox1ot-201ENSMUST00000080795 5064 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Slc29a1Q9JIM1 Sdk1-202ENSMUST00000085774 10352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Slc29a1Q9JIM1 Selenok-201ENSMUST00000112268 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Slc29a1Q9JIM1 Hbegf-201ENSMUST00000025363 2373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Slc29a1Q9JIM1 Gabrb3-201ENSMUST00000039697 5579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Slc29a1Q9JIM1 Hmbs-201ENSMUST00000077353 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Slc29a1Q9JIM1 Pdia3-201ENSMUST00000028683 2770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Slc29a1Q9JIM1 Tcf3-203ENSMUST00000105339 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Slc29a1Q9JIM1 Med7-203ENSMUST00000109232 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Slc29a1Q9JIM1 Apaf1-202ENSMUST00000159110 6433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
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