Protein–RNA interactions for Protein: Q9JI38

Pus3, tRNA pseudouridine(38/39) synthase, mousemouse

Predictions only

Length 481 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pus3Q9JI38 Ddit4l-201ENSMUST00000053855 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Pus3Q9JI38 Mrpl57-201ENSMUST00000022538 2877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Pus3Q9JI38 Gm16183-201ENSMUST00000127527 1193 ntTSL 5 BASIC18.79■□□□□ 0.6
Pus3Q9JI38 Prr3-202ENSMUST00000165613 767 ntTSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Pus3Q9JI38 Tnnt2-205ENSMUST00000178204 1172 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.79■□□□□ 0.6
Pus3Q9JI38 Tnnt2-207ENSMUST00000179863 1097 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.79■□□□□ 0.6
Pus3Q9JI38 Gm26549-201ENSMUST00000181112 1209 ntTSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Pus3Q9JI38 Tnnt2-209ENSMUST00000188028 1200 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.79■□□□□ 0.6
Pus3Q9JI38 Abhd18-206ENSMUST00000203650 797 ntTSL 5 BASIC18.79■□□□□ 0.6
Pus3Q9JI38 Cd151-203ENSMUST00000177840 1708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.79■□□□□ 0.6
Pus3Q9JI38 Gm6588-201ENSMUST00000100882 2313 ntAPPRIS P1 BASIC18.79■□□□□ 0.6
Pus3Q9JI38 AC069562.2-201ENSMUST00000224644 2146 ntBASIC18.79■□□□□ 0.6
Pus3Q9JI38 Rmi2-201ENSMUST00000037913 3742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Pus3Q9JI38 Slc6a8-204ENSMUST00000114467 2509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Pus3Q9JI38 Prrg2-208ENSMUST00000210690 1623 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Pus3Q9JI38 Sbf1-205ENSMUST00000144585 6165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Pus3Q9JI38 Mapk14-201ENSMUST00000004990 3547 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Pus3Q9JI38 Mapk14-202ENSMUST00000062694 3547 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Pus3Q9JI38 Rsrc1-205ENSMUST00000161726 3213 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Pus3Q9JI38 Ruvbl2-205ENSMUST00000211214 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Pus3Q9JI38 Ryr2-203ENSMUST00000220597 4924 ntTSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Pus3Q9JI38 Pqlc3-208ENSMUST00000222203 1706 ntTSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
Pus3Q9JI38 Pdlim5-212ENSMUST00000200043 1581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Pus3Q9JI38 Bex1-203ENSMUST00000113120 718 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.78■□□□□ 0.6
Pus3Q9JI38 1700023H06Rik-201ENSMUST00000161006 1044 ntTSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Pus3Q9JI38 Snx14-206ENSMUST00000173039 2970 ntTSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
Pus3Q9JI38 4930445N18Rik-202ENSMUST00000181345 1033 ntTSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Pus3Q9JI38 Gm27646-201ENSMUST00000183989 110 ntBASIC18.78■□□□□ 0.6
Pus3Q9JI38 Pard6a-204ENSMUST00000212352 1234 ntTSL 2 BASIC18.78■□□□□ 0.6
Pus3Q9JI38 Rhebl1-201ENSMUST00000024518 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Pus3Q9JI38 Stk35-202ENSMUST00000166282 5445 ntTSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Pus3Q9JI38 Ftsj1-202ENSMUST00000115594 1529 ntTSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
Pus3Q9JI38 Agbl5-208ENSMUST00000201168 3199 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
Pus3Q9JI38 Lrrn2-201ENSMUST00000027706 3428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Pus3Q9JI38 Kbtbd2-202ENSMUST00000114323 3816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Pus3Q9JI38 Senp7-211ENSMUST00000202000 3218 ntTSL 2 BASIC18.78■□□□□ 0.6
Pus3Q9JI38 Npdc1-202ENSMUST00000071442 1485 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Pus3Q9JI38 Ndufaf3-201ENSMUST00000074208 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Pus3Q9JI38 Zfp13-202ENSMUST00000115516 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Pus3Q9JI38 Lcat-201ENSMUST00000038896 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Pus3Q9JI38 Gm10516-201ENSMUST00000180598 2615 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Pus3Q9JI38 Snx27-202ENSMUST00000107283 3531 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Pus3Q9JI38 Ppp1cb-201ENSMUST00000015100 5962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Pus3Q9JI38 Nek2-201ENSMUST00000027931 3227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Pus3Q9JI38 Krt9-201ENSMUST00000059707 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Pus3Q9JI38 4930477E14Rik-201ENSMUST00000181412 621 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Pus3Q9JI38 Bag2-203ENSMUST00000187602 378 ntTSL 2 BASIC18.77■□□□□ 0.6
Pus3Q9JI38 Gm6089-201ENSMUST00000197666 938 ntBASIC18.77■□□□□ 0.6
Pus3Q9JI38 Zfp524-202ENSMUST00000207901 1263 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.6
Pus3Q9JI38 Gm31727-201ENSMUST00000210102 360 ntTSL 3 BASIC18.77■□□□□ 0.6
Pus3Q9JI38 Mrps18a-201ENSMUST00000024763 884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Pus3Q9JI38 Ube2f-201ENSMUST00000059743 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Pus3Q9JI38 Nphp1-201ENSMUST00000028857 2260 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Pus3Q9JI38 Sh3bp2-203ENSMUST00000118545 3034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Pus3Q9JI38 A4galt-202ENSMUST00000164614 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Pus3Q9JI38 Rabl2-201ENSMUST00000023294 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Pus3Q9JI38 Npnt-202ENSMUST00000042744 4619 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Pus3Q9JI38 Chchd4-201ENSMUST00000040835 3472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
Pus3Q9JI38 Pitx2-206ENSMUST00000174623 1493 ntTSL 2 BASIC18.77■□□□□ 0.59
Pus3Q9JI38 Gm38575-203ENSMUST00000215824 1490 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
Pus3Q9JI38 Gramd4-204ENSMUST00000138134 4292 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
Pus3Q9JI38 Wnt5b-201ENSMUST00000117171 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Pus3Q9JI38 Exoc8-201ENSMUST00000098312 4598 ntAPPRIS P1 BASIC18.76■□□□□ 0.59
Pus3Q9JI38 Pla2g16-203ENSMUST00000136756 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Pus3Q9JI38 Fam161a-205ENSMUST00000172602 1935 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
Pus3Q9JI38 Fam160a2-203ENSMUST00000118726 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Pus3Q9JI38 Ntn1-201ENSMUST00000021284 5738 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
Pus3Q9JI38 Dhodh-201ENSMUST00000123605 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Pus3Q9JI38 Cog8-201ENSMUST00000034391 2954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Pus3Q9JI38 Arfgap2-202ENSMUST00000080008 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Pus3Q9JI38 Pex5-202ENSMUST00000080557 3073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Pus3Q9JI38 Zfp24-203ENSMUST00000153337 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Pus3Q9JI38 Emx2-201ENSMUST00000062216 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Pus3Q9JI38 Ptpdc1-201ENSMUST00000035824 4402 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Pus3Q9JI38 Slc22a1-201ENSMUST00000024596 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Pus3Q9JI38 Vill-207ENSMUST00000141185 1645 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Pus3Q9JI38 Tpt1-201ENSMUST00000110894 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Pus3Q9JI38 Csrp2-207ENSMUST00000220409 780 ntTSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
Pus3Q9JI38 Mrpl17-201ENSMUST00000033170 1028 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Pus3Q9JI38 Idnk-201ENSMUST00000051490 764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Pus3Q9JI38 Dars-201ENSMUST00000027602 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Pus3Q9JI38 Dnase1l2-201ENSMUST00000088506 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Pus3Q9JI38 Mettl27-202ENSMUST00000068617 1685 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Pus3Q9JI38 Otp-201ENSMUST00000022195 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Pus3Q9JI38 Gm38392-202ENSMUST00000165196 1303 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
Pus3Q9JI38 Gbe1-203ENSMUST00000163832 2984 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
Pus3Q9JI38 Ubap1-202ENSMUST00000108060 2514 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Pus3Q9JI38 Zfp821-203ENSMUST00000212000 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Pus3Q9JI38 Dbx1-201ENSMUST00000032717 2091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Pus3Q9JI38 Homez-202ENSMUST00000142283 4713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Pus3Q9JI38 Wnt2b-201ENSMUST00000029429 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Pus3Q9JI38 A330040F15Rik-202ENSMUST00000224046 1918 ntBASIC18.75■□□□□ 0.59
Pus3Q9JI38 Fam3a-203ENSMUST00000114139 931 ntTSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
Pus3Q9JI38 Ubl5-204ENSMUST00000160682 489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
Pus3Q9JI38 Prm1-201ENSMUST00000023144 469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Pus3Q9JI38 Rgp1-201ENSMUST00000030190 1292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Pus3Q9JI38 Mtus2-201ENSMUST00000071878 1211 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Pus3Q9JI38 Slc39a7-201ENSMUST00000025186 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Pus3Q9JI38 Elp6-201ENSMUST00000068071 2219 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Pus3Q9JI38 Gata6-201ENSMUST00000047762 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.8 ms