Protein–RNA interactions for Protein: Q9ET38

Cldn19, Claudin-19, mousemouse

Predictions only

Length 224 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cldn19Q9ET38 Gm42473-201ENSMUST00000201056 2291 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
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Cldn19Q9ET38 Utp18-201ENSMUST00000066888 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Cldn19Q9ET38 Fars2-205ENSMUST00000224241 1665 ntAPPRIS P1 BASIC15.86■□□□□ 0.13
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Cldn19Q9ET38 Gm16675-202ENSMUST00000208508 2586 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
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Cldn19Q9ET38 Rab34-201ENSMUST00000002128 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Cldn19Q9ET38 Tmem229b-201ENSMUST00000056660 3860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Cldn19Q9ET38 4933436I20Rik-201ENSMUST00000189405 1434 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Cldn19Q9ET38 Hook2-201ENSMUST00000064495 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Cldn19Q9ET38 Hsf4-201ENSMUST00000036127 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
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Cldn19Q9ET38 Rnf26-208ENSMUST00000185479 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
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Cldn19Q9ET38 Wnt2b-201ENSMUST00000029429 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
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Cldn19Q9ET38 Tyro3-201ENSMUST00000028763 3989 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Cldn19Q9ET38 Ddx39-201ENSMUST00000019576 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
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Cldn19Q9ET38 Wwox-207ENSMUST00000160862 1715 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Cldn19Q9ET38 Pcbp3-206ENSMUST00000168465 1748 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Cldn19Q9ET38 Tes-202ENSMUST00000115467 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Cldn19Q9ET38 Sik3-204ENSMUST00000126865 6287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Cldn19Q9ET38 Dgkz-202ENSMUST00000099709 3512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
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Cldn19Q9ET38 Pde8b-201ENSMUST00000022192 2517 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
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Cldn19Q9ET38 Itm2c-201ENSMUST00000027425 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Cldn19Q9ET38 Zfp36l3-201ENSMUST00000071711 2347 ntAPPRIS P1 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Cldn19Q9ET38 Gm4353-201ENSMUST00000111755 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
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Cldn19Q9ET38 Ado-201ENSMUST00000075686 4445 ntAPPRIS P1 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Cldn19Q9ET38 Fam160a2-203ENSMUST00000118726 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
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Cldn19Q9ET38 Dtx2-204ENSMUST00000111145 2493 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Cldn19Q9ET38 Pde4d-208ENSMUST00000120671 2455 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Cldn19Q9ET38 Fam81a-201ENSMUST00000034749 3703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Cldn19Q9ET38 Dbx1-201ENSMUST00000032717 2091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Cldn19Q9ET38 Afg1l-201ENSMUST00000041024 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Cldn19Q9ET38 Wnt8b-201ENSMUST00000041163 3376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
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Cldn19Q9ET38 Mef2b-201ENSMUST00000110140 1223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Cldn19Q9ET38 Mef2b-202ENSMUST00000110141 1253 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Cldn19Q9ET38 Gm5138-201ENSMUST00000113842 1002 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
Cldn19Q9ET38 H2-Q6-201ENSMUST00000113879 981 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Cldn19Q9ET38 Gm15191-201ENSMUST00000117933 1000 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
Cldn19Q9ET38 Fgf20-202ENSMUST00000118639 587 ntTSL 3 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Cldn19Q9ET38 Gm12182-201ENSMUST00000118655 1008 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
Cldn19Q9ET38 Gm13882-201ENSMUST00000120886 1002 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
Cldn19Q9ET38 Gm10284-201ENSMUST00000145057 1005 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
Cldn19Q9ET38 Gm10481-201ENSMUST00000179228 1002 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
Cldn19Q9ET38 Gapdh-ps15-201ENSMUST00000180966 1002 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
Cldn19Q9ET38 Gm2574-201ENSMUST00000181051 1002 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
Cldn19Q9ET38 Gm3200-201ENSMUST00000181493 1002 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
Cldn19Q9ET38 Gm8825-201ENSMUST00000182565 998 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
Cldn19Q9ET38 Gm4518-201ENSMUST00000182638 718 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
Cldn19Q9ET38 Gm8330-201ENSMUST00000182754 1008 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
Cldn19Q9ET38 Gm4575-201ENSMUST00000182991 1002 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
Cldn19Q9ET38 Gm8709-201ENSMUST00000183230 1012 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
Cldn19Q9ET38 Apof-201ENSMUST00000050901 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Cldn19Q9ET38 Vamp8-201ENSMUST00000059983 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
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