Protein–RNA interactions for Protein: Q9ET30

Tm9sf3, Transmembrane 9 superfamily member 3, mousemouse

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Length 587 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tm9sf3Q9ET30 Prpf40b-212ENSMUST00000145482 3308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Tm9sf3Q9ET30 Brpf1-202ENSMUST00000113119 4826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Tm9sf3Q9ET30 Gm23935-201ENSMUST00000102303 57 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Tm9sf3Q9ET30 Gm24270-201ENSMUST00000102326 57 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Tm9sf3Q9ET30 Gm24245-201ENSMUST00000157318 57 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Tm9sf3Q9ET30 Braf-201ENSMUST00000002487 9728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Tm9sf3Q9ET30 Ada-201ENSMUST00000017841 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Tm9sf3Q9ET30 Rab6a-201ENSMUST00000032946 3214 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Tm9sf3Q9ET30 Eda-203ENSMUST00000113776 5105 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Tm9sf3Q9ET30 Olah-203ENSMUST00000194918 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Tm9sf3Q9ET30 Ccnl1-201ENSMUST00000029416 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Tm9sf3Q9ET30 Tex261-201ENSMUST00000014892 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Tm9sf3Q9ET30 Dmgdh-201ENSMUST00000048001 2992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Tm9sf3Q9ET30 Trmt2a-202ENSMUST00000100099 2235 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Tm9sf3Q9ET30 Zfp995-205ENSMUST00000190066 2221 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Tm9sf3Q9ET30 Pkn1-201ENSMUST00000005616 6662 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Tm9sf3Q9ET30 Bend5-201ENSMUST00000030274 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Tm9sf3Q9ET30 Lmo4-202ENSMUST00000121112 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Tm9sf3Q9ET30 Uso1-201ENSMUST00000031355 3898 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Tm9sf3Q9ET30 Ptprj-204ENSMUST00000168621 7634 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Tm9sf3Q9ET30 Gm28372-201ENSMUST00000188900 1876 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Tm9sf3Q9ET30 Cmc2-205ENSMUST00000148235 1459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Tm9sf3Q9ET30 Inpp5e-202ENSMUST00000114090 2790 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Tm9sf3Q9ET30 Tead3-201ENSMUST00000114799 2448 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Tm9sf3Q9ET30 Smox-203ENSMUST00000110180 1617 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Tm9sf3Q9ET30 Parg-204ENSMUST00000164137 3013 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.09
Tm9sf3Q9ET30 Prelid3a-201ENSMUST00000025411 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Tm9sf3Q9ET30 Mmd-201ENSMUST00000004050 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Tm9sf3Q9ET30 F2rl1-201ENSMUST00000022185 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Tm9sf3Q9ET30 Tlk1-201ENSMUST00000038584 4280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Tm9sf3Q9ET30 Anapc5-201ENSMUST00000086216 2760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Tm9sf3Q9ET30 Rasa2-201ENSMUST00000034984 5813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Tm9sf3Q9ET30 Gm14822-201ENSMUST00000122247 291 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
Tm9sf3Q9ET30 Gm12999-201ENSMUST00000124471 485 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Tm9sf3Q9ET30 Evx1-202ENSMUST00000129243 1034 ntTSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Tm9sf3Q9ET30 Tex30-213ENSMUST00000156392 1122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
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Tm9sf3Q9ET30 Gnmt-201ENSMUST00000002846 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Tm9sf3Q9ET30 Sh2b1-202ENSMUST00000205340 3366 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Tm9sf3Q9ET30 Tbx21-201ENSMUST00000001484 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Tm9sf3Q9ET30 Msantd3-202ENSMUST00000064807 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Tm9sf3Q9ET30 Tfap2b-202ENSMUST00000064976 1946 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Tm9sf3Q9ET30 Prkcb-201ENSMUST00000064921 2557 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Tm9sf3Q9ET30 Por-202ENSMUST00000122113 2606 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Tm9sf3Q9ET30 Xpo4-209ENSMUST00000174545 8680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Tm9sf3Q9ET30 Tmem131l-201ENSMUST00000052342 4815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Tm9sf3Q9ET30 Cacna1b-204ENSMUST00000102939 9736 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Tm9sf3Q9ET30 Trmt2a-203ENSMUST00000115640 2367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Tm9sf3Q9ET30 Hsf4-201ENSMUST00000036127 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Tm9sf3Q9ET30 Pde8b-214ENSMUST00000172104 2493 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Tm9sf3Q9ET30 Irf7-202ENSMUST00000097952 1764 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Tm9sf3Q9ET30 Cacna1h-205ENSMUST00000159610 8230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Tm9sf3Q9ET30 Cacna1h-201ENSMUST00000078496 8220 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Tm9sf3Q9ET30 Sh3glb1-202ENSMUST00000198254 5945 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Tm9sf3Q9ET30 Wipf1-202ENSMUST00000102679 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Tm9sf3Q9ET30 Phf7-201ENSMUST00000022459 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
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Tm9sf3Q9ET30 Gm29456-201ENSMUST00000189894 768 ntTSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
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Tm9sf3Q9ET30 P2rx6-203ENSMUST00000171002 1353 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
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Tm9sf3Q9ET30 Wscd2-201ENSMUST00000094452 4302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Tm9sf3Q9ET30 Prkar2b-202ENSMUST00000036497 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
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Tm9sf3Q9ET30 Mettl27-202ENSMUST00000068617 1685 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Tm9sf3Q9ET30 Gstm4-201ENSMUST00000029489 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Tm9sf3Q9ET30 Gm27029-201ENSMUST00000107257 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Tm9sf3Q9ET30 Chga-201ENSMUST00000021610 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
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Tm9sf3Q9ET30 Eefsec-201ENSMUST00000165242 2679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Tm9sf3Q9ET30 Ube2i-207ENSMUST00000172868 2755 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Tm9sf3Q9ET30 Shh-201ENSMUST00000002708 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Tm9sf3Q9ET30 Asph-204ENSMUST00000084915 2884 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
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Tm9sf3Q9ET30 Gm10284-201ENSMUST00000145057 1005 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
Tm9sf3Q9ET30 Gm15598-201ENSMUST00000156965 763 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Tm9sf3Q9ET30 Gm10481-201ENSMUST00000179228 1002 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
Tm9sf3Q9ET30 Gapdh-ps15-201ENSMUST00000180966 1002 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
Tm9sf3Q9ET30 Gm2574-201ENSMUST00000181051 1002 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
Tm9sf3Q9ET30 Gm3200-201ENSMUST00000181493 1002 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
Tm9sf3Q9ET30 Gm8825-201ENSMUST00000182565 998 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
Tm9sf3Q9ET30 Gm4518-201ENSMUST00000182638 718 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
Tm9sf3Q9ET30 Gm8330-201ENSMUST00000182754 1008 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
Tm9sf3Q9ET30 Gm4575-201ENSMUST00000182991 1002 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
Tm9sf3Q9ET30 Gm8709-201ENSMUST00000183230 1012 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
Tm9sf3Q9ET30 D530033B14Rik-201ENSMUST00000205412 546 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Tm9sf3Q9ET30 1700025J12Rik-201ENSMUST00000205586 630 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Tm9sf3Q9ET30 Scamp5-203ENSMUST00000214256 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Tm9sf3Q9ET30 Olfr30-201ENSMUST00000055204 1066 ntAPPRIS P1 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Tm9sf3Q9ET30 Gm10293-201ENSMUST00000076317 1002 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
Tm9sf3Q9ET30 Ifi27-204ENSMUST00000079294 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Tm9sf3Q9ET30 Gm6316-201ENSMUST00000082064 1020 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 44.7 ms