Protein–RNA interactions for Protein: Q9ESN6

Trim2, Tripartite motif-containing protein 2, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 744 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trim2Q9ESN6 Hpn-201ENSMUST00000039435 1743 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Trim2Q9ESN6 Gm42473-201ENSMUST00000201056 2291 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
Trim2Q9ESN6 Bag4-201ENSMUST00000038498 4876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Trim2Q9ESN6 Slc22a16-202ENSMUST00000078314 2269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Trim2Q9ESN6 Kat5-201ENSMUST00000113641 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Trim2Q9ESN6 Fndc3a-201ENSMUST00000089017 6143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Trim2Q9ESN6 Kif21a-201ENSMUST00000067205 6307 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Trim2Q9ESN6 Txnrd2-215ENSMUST00000206151 2874 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Trim2Q9ESN6 Pqlc1-205ENSMUST00000131780 2080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Trim2Q9ESN6 Bhlhe41-202ENSMUST00000111703 744 ntTSL 3 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Trim2Q9ESN6 Rnf170-208ENSMUST00000153528 1026 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Trim2Q9ESN6 1110065P20Rik-204ENSMUST00000163946 762 ntTSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Trim2Q9ESN6 Tppp3-202ENSMUST00000176419 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Trim2Q9ESN6 Syngr2-206ENSMUST00000177131 935 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Trim2Q9ESN6 1810010D01Rik-204ENSMUST00000208788 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Trim2Q9ESN6 Mtnr1b-201ENSMUST00000057920 1095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Trim2Q9ESN6 Tmem128-201ENSMUST00000087511 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Trim2Q9ESN6 Tap1-201ENSMUST00000041633 2614 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Trim2Q9ESN6 Isoc2a-201ENSMUST00000125249 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Trim2Q9ESN6 Elp6-201ENSMUST00000068071 2219 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Trim2Q9ESN6 Kcnh2-202ENSMUST00000115098 3193 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Trim2Q9ESN6 Atxn7l2-203ENSMUST00000117784 2387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Trim2Q9ESN6 Tmem254b-201ENSMUST00000022418 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Trim2Q9ESN6 Nagk-201ENSMUST00000037376 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Trim2Q9ESN6 Fam155a-206ENSMUST00000208933 1569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Trim2Q9ESN6 AC153526.5-201ENSMUST00000218661 2147 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
Trim2Q9ESN6 Sh2b1-201ENSMUST00000032978 3393 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Trim2Q9ESN6 Cklf-208ENSMUST00000212433 1304 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Trim2Q9ESN6 Cbx8-201ENSMUST00000026663 3580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Trim2Q9ESN6 Ldha-201ENSMUST00000005051 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Trim2Q9ESN6 Gm44729-201ENSMUST00000206759 2052 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
Trim2Q9ESN6 Golga5-201ENSMUST00000021609 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Trim2Q9ESN6 Mast3-201ENSMUST00000166004 5305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Trim2Q9ESN6 Fam57a-205ENSMUST00000169560 1806 ntTSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Trim2Q9ESN6 Adam9-204ENSMUST00000208247 4044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Trim2Q9ESN6 Kit-204ENSMUST00000144270 5241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Trim2Q9ESN6 Men1-204ENSMUST00000113500 2742 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Trim2Q9ESN6 Cacng2-201ENSMUST00000019290 5510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Trim2Q9ESN6 Adgrl1-210ENSMUST00000152978 5734 ntTSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Trim2Q9ESN6 H2-DMb1-201ENSMUST00000114232 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Trim2Q9ESN6 Ndufb11-201ENSMUST00000116621 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Trim2Q9ESN6 Gm15545-202ENSMUST00000141011 899 ntTSL 3 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Trim2Q9ESN6 Umad1-202ENSMUST00000159335 2615 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Trim2Q9ESN6 E2f7-205ENSMUST00000173634 827 ntTSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Trim2Q9ESN6 Sh3glb1-205ENSMUST00000199854 1416 ntTSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Trim2Q9ESN6 Emd-201ENSMUST00000002029 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Trim2Q9ESN6 AC114585.2-202ENSMUST00000228094 426 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
Trim2Q9ESN6 Il17a-201ENSMUST00000027061 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Trim2Q9ESN6 Tesc-201ENSMUST00000031304 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Trim2Q9ESN6 Dgkz-202ENSMUST00000099709 3512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Trim2Q9ESN6 Nfat5-203ENSMUST00000125721 5899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Trim2Q9ESN6 Borcs5-201ENSMUST00000062755 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Trim2Q9ESN6 Gm14029-201ENSMUST00000151051 1348 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Trim2Q9ESN6 Elf2-201ENSMUST00000062009 3353 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Trim2Q9ESN6 2210016F16Rik-201ENSMUST00000022032 3051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Trim2Q9ESN6 Zpr1-206ENSMUST00000156440 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Trim2Q9ESN6 Crebl2-201ENSMUST00000046303 3629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Trim2Q9ESN6 Taf10-203ENSMUST00000141116 4281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Trim2Q9ESN6 Proca1-203ENSMUST00000108317 1359 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Trim2Q9ESN6 Rad54l2-201ENSMUST00000046502 9305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Trim2Q9ESN6 Arrdc1-202ENSMUST00000102935 1574 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Trim2Q9ESN6 Gm8258-201ENSMUST00000055593 1449 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
Trim2Q9ESN6 Naa35-201ENSMUST00000022038 3793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Trim2Q9ESN6 Asb2-204ENSMUST00000149431 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Trim2Q9ESN6 Gm26889-201ENSMUST00000181523 2252 ntTSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Trim2Q9ESN6 Mfsd10-203ENSMUST00000114331 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Trim2Q9ESN6 Ctsg-201ENSMUST00000015583 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Trim2Q9ESN6 Letm2-208ENSMUST00000210616 2974 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Trim2Q9ESN6 AC125350.1-201ENSMUST00000225115 903 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
Trim2Q9ESN6 BC049762-201ENSMUST00000054226 760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Trim2Q9ESN6 Olfr601-201ENSMUST00000080474 990 ntAPPRIS P1 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Trim2Q9ESN6 Slc4a7-201ENSMUST00000057015 8132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Trim2Q9ESN6 Pde4b-208ENSMUST00000106911 3020 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Trim2Q9ESN6 Ocrl-201ENSMUST00000001202 5253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Trim2Q9ESN6 Klf7-201ENSMUST00000055001 1477 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Trim2Q9ESN6 Rad23a-202ENSMUST00000109761 1842 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Trim2Q9ESN6 Fnbp1-208ENSMUST00000113560 4726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Trim2Q9ESN6 Kcnh1-201ENSMUST00000078470 7242 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Trim2Q9ESN6 Inhbc-201ENSMUST00000026472 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Trim2Q9ESN6 Taz-201ENSMUST00000069722 1851 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Trim2Q9ESN6 Cap1-203ENSMUST00000106257 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Trim2Q9ESN6 Shd-201ENSMUST00000044216 1546 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Trim2Q9ESN6 Mbtps2-201ENSMUST00000058098 4797 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Trim2Q9ESN6 Shcbp1l-201ENSMUST00000042373 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Trim2Q9ESN6 Gm26578-201ENSMUST00000181702 4611 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Trim2Q9ESN6 AC093043.3-201ENSMUST00000226531 2273 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
Trim2Q9ESN6 Fmnl2-202ENSMUST00000050719 3380 ntTSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Trim2Q9ESN6 Zscan29-203ENSMUST00000146243 2894 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Trim2Q9ESN6 Irak1-201ENSMUST00000033769 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Trim2Q9ESN6 Xpo6-201ENSMUST00000009344 4455 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Trim2Q9ESN6 Pax8-201ENSMUST00000028355 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Trim2Q9ESN6 Dok1-201ENSMUST00000089651 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Trim2Q9ESN6 Kifc3-203ENSMUST00000169748 3384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Trim2Q9ESN6 Ptprn-201ENSMUST00000027404 3554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Trim2Q9ESN6 Kctd15-203ENSMUST00000108070 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Trim2Q9ESN6 Gm4316-202ENSMUST00000212490 1115 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Trim2Q9ESN6 CT009713.7-201ENSMUST00000224689 571 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
Trim2Q9ESN6 Ppp1r27-201ENSMUST00000026121 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Trim2Q9ESN6 Nkx2-6-201ENSMUST00000062437 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Trim2Q9ESN6 Hist1h2ab-201ENSMUST00000078369 473 ntAPPRIS P1 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 140.2 ms