Protein–RNA interactions for Protein: Q9ERH8

Slc28a3, Solute carrier family 28 member 3, mousemouse

Predictions only

Length 703 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Slc28a3Q9ERH8 Ankrd44-210ENSMUST00000179030 6140 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Slc28a3Q9ERH8 Srpx-202ENSMUST00000115543 1218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Slc28a3Q9ERH8 Pqlc1-208ENSMUST00000144468 1050 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Slc28a3Q9ERH8 Psme2-208ENSMUST00000161807 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Slc28a3Q9ERH8 Rnf13-209ENSMUST00000199041 1062 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Slc28a3Q9ERH8 1810010D01Rik-204ENSMUST00000208788 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Slc28a3Q9ERH8 AC130713.1-201ENSMUST00000228853 1096 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
Slc28a3Q9ERH8 Tesc-201ENSMUST00000031304 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Slc28a3Q9ERH8 4930465K10Rik-201ENSMUST00000056675 1238 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
Slc28a3Q9ERH8 Ctnna2-205ENSMUST00000161846 4018 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Slc28a3Q9ERH8 4933436I20Rik-201ENSMUST00000189405 1434 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Slc28a3Q9ERH8 Dohh-201ENSMUST00000072751 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Slc28a3Q9ERH8 Hoxaas2-202ENSMUST00000155922 1567 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Slc28a3Q9ERH8 Fgf17-201ENSMUST00000022697 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Slc28a3Q9ERH8 Gm44616-201ENSMUST00000206417 1732 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
Slc28a3Q9ERH8 Pcdha9-201ENSMUST00000115659 5341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Slc28a3Q9ERH8 Spdya-204ENSMUST00000167641 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Slc28a3Q9ERH8 Ubr2-201ENSMUST00000113335 5691 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Slc28a3Q9ERH8 Plekha4-207ENSMUST00000211227 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Slc28a3Q9ERH8 Tead4-201ENSMUST00000006311 3076 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Slc28a3Q9ERH8 Jph4-202ENSMUST00000124493 3200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Slc28a3Q9ERH8 Gm45212-201ENSMUST00000205831 3403 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
Slc28a3Q9ERH8 Ctage5-213ENSMUST00000176464 4434 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Slc28a3Q9ERH8 Git2-204ENSMUST00000112185 5032 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Slc28a3Q9ERH8 Atp8b2-210ENSMUST00000168276 4265 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Slc28a3Q9ERH8 BC037032-204ENSMUST00000155191 3291 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Slc28a3Q9ERH8 Trim39-203ENSMUST00000113706 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Slc28a3Q9ERH8 I0C0044D17Rik-201ENSMUST00000097964 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Slc28a3Q9ERH8 Matn1-201ENSMUST00000102576 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Slc28a3Q9ERH8 Mettl21a-202ENSMUST00000114079 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Slc28a3Q9ERH8 Actg1-202ENSMUST00000071555 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Slc28a3Q9ERH8 Gabrd-201ENSMUST00000030925 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Slc28a3Q9ERH8 D430001F17Rik-201ENSMUST00000141344 1858 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Slc28a3Q9ERH8 Golt1a-201ENSMUST00000094557 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Slc28a3Q9ERH8 Spon1-202ENSMUST00000084696 5201 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Slc28a3Q9ERH8 Zfx-204ENSMUST00000113927 6933 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Slc28a3Q9ERH8 Sap18-202ENSMUST00000111268 662 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Slc28a3Q9ERH8 Gm15794-201ENSMUST00000120182 631 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Slc28a3Q9ERH8 E2f7-205ENSMUST00000173634 827 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Slc28a3Q9ERH8 Bex3-204ENSMUST00000178632 933 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Slc28a3Q9ERH8 Gm33142-201ENSMUST00000193913 867 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Slc28a3Q9ERH8 1700022H01Rik-201ENSMUST00000219142 387 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Slc28a3Q9ERH8 AC130711.1-201ENSMUST00000224277 906 ntAPPRIS P1 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Slc28a3Q9ERH8 Olfr601-201ENSMUST00000080474 990 ntAPPRIS P1 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Slc28a3Q9ERH8 Lce1i-201ENSMUST00000090866 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Slc28a3Q9ERH8 Chuk-202ENSMUST00000119591 3481 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Slc28a3Q9ERH8 G3bp2-202ENSMUST00000164378 3026 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Slc28a3Q9ERH8 Mau2-204ENSMUST00000212308 2887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Slc28a3Q9ERH8 Chpf-201ENSMUST00000079205 2892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Slc28a3Q9ERH8 Tlnrd1-201ENSMUST00000094216 4433 ntAPPRIS P1 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Slc28a3Q9ERH8 Bend4-201ENSMUST00000169190 7935 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Slc28a3Q9ERH8 Wasf2-201ENSMUST00000084241 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Slc28a3Q9ERH8 Elp6-201ENSMUST00000068071 2219 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Slc28a3Q9ERH8 Tbc1d10b-201ENSMUST00000120705 3614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Slc28a3Q9ERH8 Crk-201ENSMUST00000017920 3642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Slc28a3Q9ERH8 Gba2-201ENSMUST00000030189 3544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Slc28a3Q9ERH8 Tmem184b-201ENSMUST00000074991 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Slc28a3Q9ERH8 Chst14-202ENSMUST00000110837 1991 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Slc28a3Q9ERH8 Espn-212ENSMUST00000105658 2815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Slc28a3Q9ERH8 Cd40-202ENSMUST00000073707 1596 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Slc28a3Q9ERH8 Erg-207ENSMUST00000171646 1519 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Slc28a3Q9ERH8 Ppm1e-201ENSMUST00000055438 6344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Slc28a3Q9ERH8 Gcnt4-201ENSMUST00000171324 5087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Slc28a3Q9ERH8 Pgc-201ENSMUST00000024782 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Slc28a3Q9ERH8 Zmynd11-207ENSMUST00000110638 4003 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Slc28a3Q9ERH8 Jade1-203ENSMUST00000168086 4790 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Slc28a3Q9ERH8 6430548M08Rik-201ENSMUST00000034281 5564 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Slc28a3Q9ERH8 Oip5-202ENSMUST00000123818 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Slc28a3Q9ERH8 Gm42477-201ENSMUST00000202427 469 ntTSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Slc28a3Q9ERH8 Zkscan17-202ENSMUST00000101150 3771 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Slc28a3Q9ERH8 Rnf13-205ENSMUST00000198214 2027 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Slc28a3Q9ERH8 Pgap2-203ENSMUST00000120119 1979 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Slc28a3Q9ERH8 Pex5l-206ENSMUST00000108226 2632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Slc28a3Q9ERH8 Arpp19-201ENSMUST00000007800 4046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Slc28a3Q9ERH8 Syn1-201ENSMUST00000081893 3209 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Slc28a3Q9ERH8 Mfsd10-203ENSMUST00000114331 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Slc28a3Q9ERH8 Ldha-201ENSMUST00000005051 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Slc28a3Q9ERH8 Pitpna-206ENSMUST00000179521 3727 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Slc28a3Q9ERH8 Fus-203ENSMUST00000106251 5536 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Slc28a3Q9ERH8 Tal1-201ENSMUST00000030489 4213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Slc28a3Q9ERH8 Pias3-201ENSMUST00000064900 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Slc28a3Q9ERH8 B3gat2-203ENSMUST00000144602 1488 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Slc28a3Q9ERH8 Fyn-202ENSMUST00000099967 3528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Slc28a3Q9ERH8 Cd2bp2-201ENSMUST00000035771 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Slc28a3Q9ERH8 Fgfr4-201ENSMUST00000005452 3324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Slc28a3Q9ERH8 Lcn12-202ENSMUST00000114245 619 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Slc28a3Q9ERH8 Gm16075-201ENSMUST00000135873 361 ntTSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Slc28a3Q9ERH8 Gm27704-201ENSMUST00000185094 107 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Slc28a3Q9ERH8 AC154471.1-201ENSMUST00000224418 436 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Slc28a3Q9ERH8 Npcd-201ENSMUST00000023060 1162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Slc28a3Q9ERH8 Insl3-201ENSMUST00000034261 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Slc28a3Q9ERH8 Nthl1-201ENSMUST00000047611 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Slc28a3Q9ERH8 Rpl36al-201ENSMUST00000054544 526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Slc28a3Q9ERH8 Hist1h1a-201ENSMUST00000055770 741 ntAPPRIS P1 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Slc28a3Q9ERH8 Fam110a-201ENSMUST00000062047 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Slc28a3Q9ERH8 Trmt2a-202ENSMUST00000100099 2235 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Slc28a3Q9ERH8 6430548M08Rik-204ENSMUST00000108951 5531 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Slc28a3Q9ERH8 1700001O22Rik-201ENSMUST00000050003 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Slc28a3Q9ERH8 Tpm4-201ENSMUST00000003575 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Slc28a3Q9ERH8 Dctd-203ENSMUST00000170263 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 47.4 ms