Protein–RNA interactions for Protein: Q9ERH7

Hipk3, Homeodomain-interacting protein kinase 3, mousemouse

Predictions only

Length 1,192 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hipk3Q9ERH7 Iscu-201ENSMUST00000026937 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Hipk3Q9ERH7 Gdf3-201ENSMUST00000032211 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Hipk3Q9ERH7 Krtap1-5-201ENSMUST00000054532 1041 ntAPPRIS P1 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Hipk3Q9ERH7 Tmem35b-201ENSMUST00000094712 1120 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Hipk3Q9ERH7 Tbpl1-201ENSMUST00000095794 1195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Hipk3Q9ERH7 Atp2b3-203ENSMUST00000114479 4637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Hipk3Q9ERH7 Slit1-203ENSMUST00000169141 5673 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Hipk3Q9ERH7 Mapk8ip3-203ENSMUST00000115229 5603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Hipk3Q9ERH7 Cdk16-201ENSMUST00000033380 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Hipk3Q9ERH7 4930524O07Rik-203ENSMUST00000193135 2289 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
Hipk3Q9ERH7 Acvrl1-203ENSMUST00000119063 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Hipk3Q9ERH7 Hand1-203ENSMUST00000160392 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Hipk3Q9ERH7 Des-201ENSMUST00000027409 3028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Hipk3Q9ERH7 Gm26578-201ENSMUST00000181702 4611 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Hipk3Q9ERH7 Pcdha7-201ENSMUST00000192631 5337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Hipk3Q9ERH7 Npnt-206ENSMUST00000117811 4532 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Hipk3Q9ERH7 Nfkb1-201ENSMUST00000029812 4117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Hipk3Q9ERH7 Malt1-201ENSMUST00000049248 5073 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Hipk3Q9ERH7 Gpr3-202ENSMUST00000105911 2518 ntAPPRIS P1 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Hipk3Q9ERH7 Impad1-201ENSMUST00000084949 6543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Hipk3Q9ERH7 Maged1-201ENSMUST00000026142 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Hipk3Q9ERH7 Rufy3-205ENSMUST00000198965 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Hipk3Q9ERH7 Cfap206-201ENSMUST00000029971 2246 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Hipk3Q9ERH7 2810408A11Rik-204ENSMUST00000108621 1455 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Hipk3Q9ERH7 Wnt10b-204ENSMUST00000226655 1807 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
Hipk3Q9ERH7 Tlcd2-202ENSMUST00000108435 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Hipk3Q9ERH7 Acaa1a-203ENSMUST00000175743 1219 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Hipk3Q9ERH7 Acaa1a-207ENSMUST00000176397 996 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Hipk3Q9ERH7 Calml4-206ENSMUST00000215870 803 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Hipk3Q9ERH7 Mrpl28-201ENSMUST00000025014 1048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Hipk3Q9ERH7 Uck2-202ENSMUST00000053686 4731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Hipk3Q9ERH7 Akirin1-201ENSMUST00000102636 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Hipk3Q9ERH7 Cacna1g-201ENSMUST00000021234 8139 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Hipk3Q9ERH7 Pde4a-201ENSMUST00000003395 2524 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Hipk3Q9ERH7 Cux1-212ENSMUST00000176778 5520 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Hipk3Q9ERH7 Gm43598-201ENSMUST00000202482 2479 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
Hipk3Q9ERH7 Klhl42-201ENSMUST00000036003 6267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Hipk3Q9ERH7 Nsfl1c-201ENSMUST00000028949 1364 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Hipk3Q9ERH7 Ap1g1-202ENSMUST00000093157 6899 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Hipk3Q9ERH7 Rilpl1-201ENSMUST00000062153 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Hipk3Q9ERH7 Fam76a-202ENSMUST00000097856 1863 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Hipk3Q9ERH7 Lrrc56-203ENSMUST00000084446 2390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Hipk3Q9ERH7 Kat2a-201ENSMUST00000006973 3043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Hipk3Q9ERH7 Llgl1-201ENSMUST00000052346 4303 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Hipk3Q9ERH7 App-207ENSMUST00000227737 2827 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
Hipk3Q9ERH7 Zkscan17-202ENSMUST00000101150 3771 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Hipk3Q9ERH7 Dusp14-205ENSMUST00000164891 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Hipk3Q9ERH7 Ehd4-201ENSMUST00000028755 3730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Hipk3Q9ERH7 Tfap2d-201ENSMUST00000037294 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Hipk3Q9ERH7 Zbtb46-202ENSMUST00000087409 2577 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Hipk3Q9ERH7 Slc25a32-201ENSMUST00000022908 5905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Hipk3Q9ERH7 St6gal2-201ENSMUST00000025000 6066 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Hipk3Q9ERH7 Tcf3-203ENSMUST00000105339 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Hipk3Q9ERH7 Bola2-203ENSMUST00000130498 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Hipk3Q9ERH7 Taco1os-201ENSMUST00000140736 644 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Hipk3Q9ERH7 Gm17349-201ENSMUST00000163472 300 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Hipk3Q9ERH7 Prr3-209ENSMUST00000174849 581 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Hipk3Q9ERH7 Ankrd39-202ENSMUST00000194894 664 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Hipk3Q9ERH7 Spsb2-202ENSMUST00000052727 1219 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Hipk3Q9ERH7 Pafah1b3-201ENSMUST00000005583 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Hipk3Q9ERH7 Slc12a5-201ENSMUST00000099092 6028 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Hipk3Q9ERH7 Pcdha5-201ENSMUST00000192168 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Hipk3Q9ERH7 Prss54-201ENSMUST00000052690 1438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Hipk3Q9ERH7 Adarb1-202ENSMUST00000098374 6584 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Hipk3Q9ERH7 Stk40-202ENSMUST00000116286 3860 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Hipk3Q9ERH7 Gm14634-201ENSMUST00000139163 1662 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Hipk3Q9ERH7 Gm45203-201ENSMUST00000206384 1831 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
Hipk3Q9ERH7 Prrx1-202ENSMUST00000075805 4986 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Hipk3Q9ERH7 Skor1-202ENSMUST00000116613 3591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Hipk3Q9ERH7 Mettl16-201ENSMUST00000010698 2073 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Hipk3Q9ERH7 Dctd-203ENSMUST00000170263 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Hipk3Q9ERH7 Tubb6-201ENSMUST00000001513 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Hipk3Q9ERH7 Tdrd12-201ENSMUST00000032701 1620 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Hipk3Q9ERH7 Dbndd2-201ENSMUST00000017878 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Hipk3Q9ERH7 Derl3-201ENSMUST00000009236 1321 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Hipk3Q9ERH7 Strn4-201ENSMUST00000019220 3535 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Hipk3Q9ERH7 Txnrd3-202ENSMUST00000101171 2494 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Hipk3Q9ERH7 Fbxo17-203ENSMUST00000108279 1563 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Hipk3Q9ERH7 Hist1h1c-201ENSMUST00000040914 1560 ntAPPRIS P1 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Hipk3Q9ERH7 Slc16a7-205ENSMUST00000210780 2562 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Hipk3Q9ERH7 Large2-201ENSMUST00000068586 2445 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Hipk3Q9ERH7 Zfp689-202ENSMUST00000106299 1417 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Hipk3Q9ERH7 Tenm3-204ENSMUST00000110346 2267 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Hipk3Q9ERH7 1700024G13Rik-201ENSMUST00000100723 850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Hipk3Q9ERH7 Hist1h2bf-201ENSMUST00000105106 461 ntAPPRIS P1 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Hipk3Q9ERH7 Gm18115-201ENSMUST00000221209 621 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
Hipk3Q9ERH7 Pdcd2-201ENSMUST00000054450 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Hipk3Q9ERH7 Ly6h-202ENSMUST00000065417 985 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Hipk3Q9ERH7 Usp4-201ENSMUST00000035237 3662 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Hipk3Q9ERH7 Trim39-203ENSMUST00000113706 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Hipk3Q9ERH7 Fbxo34-201ENSMUST00000043112 2937 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Hipk3Q9ERH7 Rdx-202ENSMUST00000061352 1502 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Hipk3Q9ERH7 Dab2-208ENSMUST00000160134 1374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.02
Hipk3Q9ERH7 Gm9774-202ENSMUST00000192538 1392 ntAPPRIS P1 BASIC15.21■□□□□ 0.02
Hipk3Q9ERH7 Il11ra1-204ENSMUST00000108042 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Hipk3Q9ERH7 Stradb-201ENSMUST00000027185 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Hipk3Q9ERH7 Pank3-201ENSMUST00000018990 7376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Hipk3Q9ERH7 Inhbc-201ENSMUST00000026472 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Hipk3Q9ERH7 Golt1a-201ENSMUST00000094557 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Hipk3Q9ERH7 Ythdf3-202ENSMUST00000108346 4929 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 41.1 ms