Protein–RNA interactions for Protein: Q9ERE8

Tlnrd1, Talin rod domain-containing protein 1, mousemouse

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Length 362 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tlnrd1Q9ERE8 Spdya-202ENSMUST00000124001 1247 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Tlnrd1Q9ERE8 Gm14453-201ENSMUST00000139677 553 ntTSL 3 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Tlnrd1Q9ERE8 Prr23a1-201ENSMUST00000170349 883 ntAPPRIS P1 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Tlnrd1Q9ERE8 Usf3-201ENSMUST00000088356 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Tlnrd1Q9ERE8 Mbd6-201ENSMUST00000026476 4165 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Tlnrd1Q9ERE8 Tomm70a-201ENSMUST00000166897 3778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Tlnrd1Q9ERE8 Cpz-201ENSMUST00000038676 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Tlnrd1Q9ERE8 Mospd2-201ENSMUST00000004715 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Tlnrd1Q9ERE8 Dnajc1-209ENSMUST00000166495 5497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Tlnrd1Q9ERE8 Pacsin1-202ENSMUST00000097360 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Tlnrd1Q9ERE8 Mtx2-201ENSMUST00000028511 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Tlnrd1Q9ERE8 Spock1-203ENSMUST00000185905 2794 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Tlnrd1Q9ERE8 Mtg2-202ENSMUST00000108901 1444 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Tlnrd1Q9ERE8 Dzip3-201ENSMUST00000114516 3331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Tlnrd1Q9ERE8 Gm45546-201ENSMUST00000211053 2394 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
Tlnrd1Q9ERE8 Nes-203ENSMUST00000160694 5958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Tlnrd1Q9ERE8 Ssfa2-202ENSMUST00000111785 5168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Tlnrd1Q9ERE8 Nfat5-211ENSMUST00000151114 4982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Tlnrd1Q9ERE8 Usb1-201ENSMUST00000034245 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Tlnrd1Q9ERE8 Cadps2-206ENSMUST00000115361 4571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Tlnrd1Q9ERE8 Pbx4-201ENSMUST00000081503 1560 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Tlnrd1Q9ERE8 Jph4-202ENSMUST00000124493 3200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Tlnrd1Q9ERE8 Arrb2-203ENSMUST00000102563 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Tlnrd1Q9ERE8 Nptn-212ENSMUST00000177292 1390 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Tlnrd1Q9ERE8 Nyap1-204ENSMUST00000212152 2499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Tlnrd1Q9ERE8 Sp8-201ENSMUST00000063918 4478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Tlnrd1Q9ERE8 Myh14-204ENSMUST00000207775 6499 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Tlnrd1Q9ERE8 Irak2-203ENSMUST00000089023 1734 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Tlnrd1Q9ERE8 Pim1-201ENSMUST00000024811 2638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Tlnrd1Q9ERE8 Dctd-203ENSMUST00000170263 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Tlnrd1Q9ERE8 Fam102a-201ENSMUST00000048375 4223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Tlnrd1Q9ERE8 Tmem116-204ENSMUST00000111795 2221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Tlnrd1Q9ERE8 4933402J07Rik-201ENSMUST00000093342 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Tlnrd1Q9ERE8 Gm27528-202ENSMUST00000222916 2012 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
Tlnrd1Q9ERE8 Supt5-208ENSMUST00000209141 3755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Tlnrd1Q9ERE8 Lats1-202ENSMUST00000165952 7209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Tlnrd1Q9ERE8 Ttyh1-217ENSMUST00000206869 1491 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Tlnrd1Q9ERE8 Scaf4-201ENSMUST00000039280 4165 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Tlnrd1Q9ERE8 Rps5-202ENSMUST00000108539 794 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Tlnrd1Q9ERE8 Cenps-207ENSMUST00000177408 689 ntTSL 2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Tlnrd1Q9ERE8 Comtd1-204ENSMUST00000177527 714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Tlnrd1Q9ERE8 Krtap5-1-202ENSMUST00000188274 742 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
Tlnrd1Q9ERE8 Spata33-206ENSMUST00000212637 569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Tlnrd1Q9ERE8 Gm7370-201ENSMUST00000219471 767 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
Tlnrd1Q9ERE8 H2afz-201ENSMUST00000041045 1069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Tlnrd1Q9ERE8 Steap2-205ENSMUST00000115427 3470 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Tlnrd1Q9ERE8 Gm26697-201ENSMUST00000180898 1760 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Tlnrd1Q9ERE8 Gm45760-201ENSMUST00000212190 1782 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
Tlnrd1Q9ERE8 Hpse-201ENSMUST00000045617 3117 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Tlnrd1Q9ERE8 Tbx3-202ENSMUST00000079719 4982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Tlnrd1Q9ERE8 Sybu-209ENSMUST00000228639 4113 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
Tlnrd1Q9ERE8 Aldh7a1-201ENSMUST00000066208 1914 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Tlnrd1Q9ERE8 Fbxo30-202ENSMUST00000129456 5060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Tlnrd1Q9ERE8 Hebp2-203ENSMUST00000214548 2083 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Tlnrd1Q9ERE8 Haus3-201ENSMUST00000060049 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Tlnrd1Q9ERE8 Pnma1-201ENSMUST00000061425 2359 ntAPPRIS P1 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Tlnrd1Q9ERE8 AC163637.1-201ENSMUST00000215491 1894 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
Tlnrd1Q9ERE8 Pygo2-201ENSMUST00000060061 3198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Tlnrd1Q9ERE8 Brd2-203ENSMUST00000114242 4483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Tlnrd1Q9ERE8 Snx14-206ENSMUST00000173039 2970 ntTSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Tlnrd1Q9ERE8 Klhdc8b-207ENSMUST00000193286 2956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Tlnrd1Q9ERE8 Nhlh2-202ENSMUST00000196324 2647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Tlnrd1Q9ERE8 Atf3-201ENSMUST00000027941 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Tlnrd1Q9ERE8 Pkn2-201ENSMUST00000043812 6207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Tlnrd1Q9ERE8 Commd7-202ENSMUST00000109782 1343 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Tlnrd1Q9ERE8 Micall2-201ENSMUST00000044642 3346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Tlnrd1Q9ERE8 Mus81-202ENSMUST00000124334 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Tlnrd1Q9ERE8 Apmap-201ENSMUST00000046399 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Tlnrd1Q9ERE8 Safb-201ENSMUST00000095224 3106 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Tlnrd1Q9ERE8 Garem2-201ENSMUST00000058045 3865 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Tlnrd1Q9ERE8 Gk-201ENSMUST00000026039 4340 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Tlnrd1Q9ERE8 Vcan-201ENSMUST00000109543 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Tlnrd1Q9ERE8 Gpha2-202ENSMUST00000113526 762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Tlnrd1Q9ERE8 Ptpa-203ENSMUST00000113603 2169 ntTSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Tlnrd1Q9ERE8 Zbtb20-202ENSMUST00000114690 2759 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Tlnrd1Q9ERE8 Gm16061-201ENSMUST00000122167 857 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
Tlnrd1Q9ERE8 1810062O18Rik-202ENSMUST00000128848 745 ntTSL 3 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Tlnrd1Q9ERE8 Gm19426-201ENSMUST00000181711 726 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Tlnrd1Q9ERE8 Sec11c-201ENSMUST00000025394 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Tlnrd1Q9ERE8 Gpha2-201ENSMUST00000025698 609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Tlnrd1Q9ERE8 Thrsp-201ENSMUST00000043077 1277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Tlnrd1Q9ERE8 Lrrc56-201ENSMUST00000047093 2197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Tlnrd1Q9ERE8 Zfp316-201ENSMUST00000051665 3054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Tlnrd1Q9ERE8 Keap1-201ENSMUST00000049567 3172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Tlnrd1Q9ERE8 Tnxb-202ENSMUST00000168533 9381 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Tlnrd1Q9ERE8 Men1-204ENSMUST00000113500 2742 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Tlnrd1Q9ERE8 Kdr-201ENSMUST00000113516 5924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Tlnrd1Q9ERE8 Gm2788-204ENSMUST00000209288 1966 ntTSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Tlnrd1Q9ERE8 Rundc3a-202ENSMUST00000107102 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Tlnrd1Q9ERE8 Wnt10b-204ENSMUST00000226655 1807 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
Tlnrd1Q9ERE8 Nkx1-2-201ENSMUST00000054562 3264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Tlnrd1Q9ERE8 Nup54-201ENSMUST00000038514 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Tlnrd1Q9ERE8 Cobl-203ENSMUST00000109651 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Tlnrd1Q9ERE8 Lurap1l-201ENSMUST00000055922 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Tlnrd1Q9ERE8 Gm996-203ENSMUST00000188161 2925 ntAPPRIS P1 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Tlnrd1Q9ERE8 Nkain2-203ENSMUST00000191234 3760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Tlnrd1Q9ERE8 Fgfr1op2-203ENSMUST00000067404 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Tlnrd1Q9ERE8 Cyp4f37-201ENSMUST00000077639 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Tlnrd1Q9ERE8 Tnip2-203ENSMUST00000114359 1642 ntTSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Tlnrd1Q9ERE8 Slc6a8-206ENSMUST00000164449 2151 ntTSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 51.2 ms