Protein–RNA interactions for Protein: Q9ER71

Rhoj, Rho-related GTP-binding protein RhoJ, mousemouse

Predictions only

Length 214 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RhojQ9ER71 Gck-202ENSMUST00000109822 1786 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
RhojQ9ER71 Pcbp3-206ENSMUST00000168465 1748 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
RhojQ9ER71 Mier2-212ENSMUST00000172158 1400 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
RhojQ9ER71 Gm12866-201ENSMUST00000128998 1671 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
RhojQ9ER71 Kif21a-204ENSMUST00000109287 6124 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
RhojQ9ER71 Kif21a-205ENSMUST00000109288 6142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
RhojQ9ER71 Fam133b-205ENSMUST00000197082 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
RhojQ9ER71 Foxc2-201ENSMUST00000054691 2725 ntAPPRIS P1 BASIC15.76■□□□□ 0.11
RhojQ9ER71 Tnip2-203ENSMUST00000114359 1642 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
RhojQ9ER71 Eml3-202ENSMUST00000224272 2978 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
RhojQ9ER71 Adam9-204ENSMUST00000208247 4044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
RhojQ9ER71 Gm14029-201ENSMUST00000151051 1348 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
RhojQ9ER71 Gm6257-201ENSMUST00000163864 910 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
RhojQ9ER71 Pabpn1l-202ENSMUST00000212966 1113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
RhojQ9ER71 Npcd-201ENSMUST00000023060 1162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
RhojQ9ER71 Atp23-201ENSMUST00000026504 903 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
RhojQ9ER71 Abhd3-203ENSMUST00000117828 1962 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
RhojQ9ER71 Idh2-201ENSMUST00000107384 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
RhojQ9ER71 Cnot10-206ENSMUST00000216785 1723 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
RhojQ9ER71 Hsf4-201ENSMUST00000036127 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
RhojQ9ER71 Pex1-202ENSMUST00000121291 4555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
RhojQ9ER71 Stard7-202ENSMUST00000110375 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
RhojQ9ER71 Selenok-201ENSMUST00000112268 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
RhojQ9ER71 Trim54-202ENSMUST00000202769 1408 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
RhojQ9ER71 Zfp13-202ENSMUST00000115516 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
RhojQ9ER71 Tcf25-205ENSMUST00000212470 2572 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
RhojQ9ER71 Dynlt1c-201ENSMUST00000092966 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
RhojQ9ER71 Tyro3-201ENSMUST00000028763 3989 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
RhojQ9ER71 Vill-207ENSMUST00000141185 1645 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
RhojQ9ER71 Ubp1-206ENSMUST00000216558 1623 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
RhojQ9ER71 Chuk-202ENSMUST00000119591 3481 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
RhojQ9ER71 Gm16279-201ENSMUST00000149452 2945 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
RhojQ9ER71 Cobl-203ENSMUST00000109651 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
RhojQ9ER71 Kctd20-208ENSMUST00000168507 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
RhojQ9ER71 Nrxn1-216ENSMUST00000174331 6282 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
RhojQ9ER71 P2ry6-201ENSMUST00000060174 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
RhojQ9ER71 Tnnt2-202ENSMUST00000112085 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
RhojQ9ER71 Tnnt2-203ENSMUST00000112086 1094 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
RhojQ9ER71 Tnnt2-204ENSMUST00000112087 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
RhojQ9ER71 Tnnt2-206ENSMUST00000178854 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
RhojQ9ER71 Gm6345-202ENSMUST00000180900 204 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
RhojQ9ER71 Tnnt2-211ENSMUST00000189355 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
RhojQ9ER71 Metrn-201ENSMUST00000002344 987 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
RhojQ9ER71 Wnt10b-206ENSMUST00000228546 2709 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
RhojQ9ER71 Fgf17-201ENSMUST00000022697 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
RhojQ9ER71 Nrsn1-204ENSMUST00000167305 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
RhojQ9ER71 Cxxc5-201ENSMUST00000060722 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
RhojQ9ER71 Eif4g1-202ENSMUST00000073840 5394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
RhojQ9ER71 Isg20l2-201ENSMUST00000055984 2893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
RhojQ9ER71 Chpf-201ENSMUST00000079205 2892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
RhojQ9ER71 Fus-203ENSMUST00000106251 5536 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
RhojQ9ER71 Ankrd44-210ENSMUST00000179030 6140 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
RhojQ9ER71 Lmnb2-202ENSMUST00000105332 1643 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
RhojQ9ER71 Elavl3-203ENSMUST00000215901 3037 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
RhojQ9ER71 Gm42901-201ENSMUST00000197735 3171 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
RhojQ9ER71 Adam15-202ENSMUST00000074582 2799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
RhojQ9ER71 Ccdc115-201ENSMUST00000042493 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
RhojQ9ER71 Clcn3-203ENSMUST00000093490 5518 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
RhojQ9ER71 Commd7-202ENSMUST00000109782 1343 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
RhojQ9ER71 Igfbp2-201ENSMUST00000047328 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
RhojQ9ER71 Apmap-201ENSMUST00000046399 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
RhojQ9ER71 Mafg-202ENSMUST00000106180 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
RhojQ9ER71 Mafg-204ENSMUST00000106182 1104 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
RhojQ9ER71 Lcn12-202ENSMUST00000114245 619 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
RhojQ9ER71 Ccnd3-ps-201ENSMUST00000117963 881 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
RhojQ9ER71 Gm17178-201ENSMUST00000163273 357 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
RhojQ9ER71 Ciao1-204ENSMUST00000174030 1109 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
RhojQ9ER71 Flt3l-206ENSMUST00000210197 834 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
RhojQ9ER71 Wdr74-202ENSMUST00000210512 1078 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
RhojQ9ER71 4930451I11Rik-201ENSMUST00000061695 481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
RhojQ9ER71 Gmnn-201ENSMUST00000006898 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
RhojQ9ER71 Crk-201ENSMUST00000017920 3642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
RhojQ9ER71 Foxo3-201ENSMUST00000056974 2889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
RhojQ9ER71 Ddc-202ENSMUST00000109659 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
RhojQ9ER71 Flt1-203ENSMUST00000110529 6292 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
RhojQ9ER71 Ttbk1-201ENSMUST00000047034 6959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
RhojQ9ER71 Vangl2-202ENSMUST00000111263 6528 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
RhojQ9ER71 Zfx-201ENSMUST00000088102 7002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
RhojQ9ER71 Trim11-201ENSMUST00000093061 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
RhojQ9ER71 Zfp277-202ENSMUST00000069692 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
RhojQ9ER71 Ap1s1-201ENSMUST00000111080 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
RhojQ9ER71 Atat1-214ENSMUST00000149277 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
RhojQ9ER71 Gm31774-201ENSMUST00000212910 1366 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
RhojQ9ER71 Hbegf-201ENSMUST00000025363 2373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
RhojQ9ER71 Bnip2-202ENSMUST00000085393 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
RhojQ9ER71 Mettl7a2-202ENSMUST00000176287 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
RhojQ9ER71 Mettl7a2-201ENSMUST00000088142 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
RhojQ9ER71 Uxs1-202ENSMUST00000126008 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
RhojQ9ER71 Pde4d-208ENSMUST00000120671 2455 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
RhojQ9ER71 Gm11950-201ENSMUST00000121615 838 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
RhojQ9ER71 Asnsd1-202ENSMUST00000123519 983 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
RhojQ9ER71 Bola2-203ENSMUST00000130498 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
RhojQ9ER71 Hint2-201ENSMUST00000030192 610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
RhojQ9ER71 Odf3b-201ENSMUST00000049968 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
RhojQ9ER71 Ppp1r37-201ENSMUST00000058444 3816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
RhojQ9ER71 Rpl21-202ENSMUST00000075453 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
RhojQ9ER71 Taar2-201ENSMUST00000079134 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
RhojQ9ER71 Pth1r-204ENSMUST00000198865 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
RhojQ9ER71 Cdk2-201ENSMUST00000026415 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
RhojQ9ER71 Zxdc-202ENSMUST00000075117 4126 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.3 ms