Protein–RNA interactions for Protein: Q9EQ41

Vmn1r29, Vomeronasal type-1 receptor, mousemouse

Predictions only

Length 303 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vmn1r29Q9EQ41 Rab34-203ENSMUST00000108322 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Vmn1r29Q9EQ41 AC132265.1-201ENSMUST00000219233 1665 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
Vmn1r29Q9EQ41 Rps6kl1-201ENSMUST00000019379 2304 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Vmn1r29Q9EQ41 Abhd3-203ENSMUST00000117828 1962 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Vmn1r29Q9EQ41 Sash1-201ENSMUST00000015449 7183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Vmn1r29Q9EQ41 Hmga1b-201ENSMUST00000105046 1626 ntAPPRIS P1 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Vmn1r29Q9EQ41 Gm1673-202ENSMUST00000114382 451 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Vmn1r29Q9EQ41 Uba52-203ENSMUST00000125184 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Vmn1r29Q9EQ41 Sytl3-204ENSMUST00000159880 1296 ntTSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Vmn1r29Q9EQ41 Ndufab1-ps-201ENSMUST00000166096 468 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
Vmn1r29Q9EQ41 Arpc4-204ENSMUST00000204802 794 ntTSL 3 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Vmn1r29Q9EQ41 Gm35240-201ENSMUST00000218335 661 ntTSL 2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Vmn1r29Q9EQ41 Mrpl21-201ENSMUST00000025743 802 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Vmn1r29Q9EQ41 Olfr279-201ENSMUST00000050451 933 ntAPPRIS P1 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Vmn1r29Q9EQ41 Ttll3-202ENSMUST00000038889 3114 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Vmn1r29Q9EQ41 Spdya-201ENSMUST00000064420 1877 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Vmn1r29Q9EQ41 Acbd5-203ENSMUST00000114526 3725 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Vmn1r29Q9EQ41 Dact1-201ENSMUST00000061273 3650 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Vmn1r29Q9EQ41 Phkg2-202ENSMUST00000121004 1840 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Vmn1r29Q9EQ41 Zfp13-202ENSMUST00000115516 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Vmn1r29Q9EQ41 Ube2d1-201ENSMUST00000020085 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Vmn1r29Q9EQ41 Asic4-201ENSMUST00000037708 2464 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Vmn1r29Q9EQ41 Gm13074-201ENSMUST00000124848 2735 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Vmn1r29Q9EQ41 Ptn-201ENSMUST00000101534 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Vmn1r29Q9EQ41 Lhx5-201ENSMUST00000031591 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Vmn1r29Q9EQ41 Fam155a-206ENSMUST00000208933 1569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Vmn1r29Q9EQ41 Twf2-201ENSMUST00000024047 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Vmn1r29Q9EQ41 Prlhr-201ENSMUST00000051277 1572 ntAPPRIS P1 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Vmn1r29Q9EQ41 Rnf220-203ENSMUST00000102690 1842 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Vmn1r29Q9EQ41 Prr23a3-201ENSMUST00000167951 1817 ntAPPRIS P1 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Vmn1r29Q9EQ41 Gm15565-201ENSMUST00000118890 427 ntBASIC14.74□□□□□ -0.05
Vmn1r29Q9EQ41 Psmd13-209ENSMUST00000164681 726 ntTSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Vmn1r29Q9EQ41 Gm26643-201ENSMUST00000180854 1274 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Vmn1r29Q9EQ41 Gm8797-201ENSMUST00000192045 490 ntAPPRIS P1 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Vmn1r29Q9EQ41 Sdhaf4-201ENSMUST00000027338 683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Vmn1r29Q9EQ41 Entpd6-201ENSMUST00000094467 2540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Vmn1r29Q9EQ41 D1Pas1-201ENSMUST00000045108 3212 ntAPPRIS P1 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Vmn1r29Q9EQ41 Gnas-211ENSMUST00000109096 2465 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Vmn1r29Q9EQ41 Hsf4-201ENSMUST00000036127 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Vmn1r29Q9EQ41 Hpn-201ENSMUST00000039435 1743 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Vmn1r29Q9EQ41 Adat2-201ENSMUST00000019944 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Vmn1r29Q9EQ41 Fam149b-216ENSMUST00000225942 2151 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Vmn1r29Q9EQ41 Shank1-201ENSMUST00000107934 6477 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Vmn1r29Q9EQ41 Islr2-205ENSMUST00000170421 4071 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Vmn1r29Q9EQ41 Gm8668-201ENSMUST00000120559 1447 ntBASIC14.74□□□□□ -0.05
Vmn1r29Q9EQ41 Enah-204ENSMUST00000111030 2844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Vmn1r29Q9EQ41 Ier5-201ENSMUST00000055322 3276 ntAPPRIS P1 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Vmn1r29Q9EQ41 Prrg2-208ENSMUST00000210690 1623 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Vmn1r29Q9EQ41 Nrros-201ENSMUST00000099991 2548 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Vmn1r29Q9EQ41 Gm2788-202ENSMUST00000147173 1390 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Vmn1r29Q9EQ41 Cdk16-201ENSMUST00000033380 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Vmn1r29Q9EQ41 Dok2-201ENSMUST00000022698 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Vmn1r29Q9EQ41 Mvd-201ENSMUST00000006692 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Vmn1r29Q9EQ41 Elmo2-202ENSMUST00000074046 3502 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Vmn1r29Q9EQ41 9630013D21Rik-204ENSMUST00000156790 3096 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Vmn1r29Q9EQ41 Mex3c-201ENSMUST00000091852 3738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Vmn1r29Q9EQ41 Hhat-201ENSMUST00000044190 2839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Vmn1r29Q9EQ41 Jup-202ENSMUST00000107403 2386 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Vmn1r29Q9EQ41 Adnp-201ENSMUST00000057793 4917 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Vmn1r29Q9EQ41 P2ry6-201ENSMUST00000060174 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Vmn1r29Q9EQ41 Utp23-204ENSMUST00000161651 582 ntTSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Vmn1r29Q9EQ41 Gm21559-201ENSMUST00000220638 855 ntBASIC14.73□□□□□ -0.05
Vmn1r29Q9EQ41 Sec61b-201ENSMUST00000065678 564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Vmn1r29Q9EQ41 Gm8587-201ENSMUST00000076538 843 ntBASIC14.73□□□□□ -0.05
Vmn1r29Q9EQ41 Hist1h2ad-201ENSMUST00000090776 572 ntAPPRIS P1 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Vmn1r29Q9EQ41 Zdhhc8-201ENSMUST00000076957 4867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Vmn1r29Q9EQ41 Acsl3-201ENSMUST00000035779 3950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Vmn1r29Q9EQ41 Mettl7a1-201ENSMUST00000067752 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Vmn1r29Q9EQ41 Pofut2-201ENSMUST00000020493 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Vmn1r29Q9EQ41 Zbed5-201ENSMUST00000041466 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Vmn1r29Q9EQ41 Mamstr-201ENSMUST00000148532 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Vmn1r29Q9EQ41 Slc22a7-201ENSMUST00000087012 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Vmn1r29Q9EQ41 Cry1-201ENSMUST00000020227 3026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Vmn1r29Q9EQ41 Retreg3-202ENSMUST00000107295 3179 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Vmn1r29Q9EQ41 Kdr-201ENSMUST00000113516 5924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Vmn1r29Q9EQ41 Sfmbt1-201ENSMUST00000054230 7837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Vmn1r29Q9EQ41 Fbxo34-201ENSMUST00000043112 2937 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Vmn1r29Q9EQ41 Zfp691-201ENSMUST00000052715 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Vmn1r29Q9EQ41 P2ry2-206ENSMUST00000208340 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Vmn1r29Q9EQ41 Zkscan4-202ENSMUST00000225845 1506 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
Vmn1r29Q9EQ41 Slc35f4-205ENSMUST00000146164 2480 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Vmn1r29Q9EQ41 Gadd45gip1-201ENSMUST00000036734 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Vmn1r29Q9EQ41 Trim11-201ENSMUST00000093061 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Vmn1r29Q9EQ41 9930021J03Rik-204ENSMUST00000177155 6632 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Vmn1r29Q9EQ41 Ablim2-202ENSMUST00000101280 3042 ntTSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Vmn1r29Q9EQ41 Olah-202ENSMUST00000115087 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Vmn1r29Q9EQ41 Atp6v1g2-203ENSMUST00000130992 524 ntTSL 2 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Vmn1r29Q9EQ41 Gm12979-201ENSMUST00000145488 405 ntTSL 2 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Vmn1r29Q9EQ41 Pyy-201ENSMUST00000017455 555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Vmn1r29Q9EQ41 Gm19553-201ENSMUST00000175723 494 ntTSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Vmn1r29Q9EQ41 Gm26644-201ENSMUST00000181365 958 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Vmn1r29Q9EQ41 Gm27389-201ENSMUST00000183622 195 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
Vmn1r29Q9EQ41 Tnnt2-212ENSMUST00000189732 1123 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Vmn1r29Q9EQ41 Srrd-201ENSMUST00000031289 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Vmn1r29Q9EQ41 Rpl39l-201ENSMUST00000044103 805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Vmn1r29Q9EQ41 Hist3h2ba-201ENSMUST00000078267 614 ntAPPRIS P1 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Vmn1r29Q9EQ41 Olfr1272-201ENSMUST00000099750 927 ntAPPRIS P1 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Vmn1r29Q9EQ41 Erlec1-201ENSMUST00000073192 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Vmn1r29Q9EQ41 Pnkp-203ENSMUST00000107876 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Vmn1r29Q9EQ41 Hoxaas2-202ENSMUST00000155922 1567 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.5 ms