Protein–RNA interactions for Protein: Q9EPQ1

Tlr1, Toll-like receptor 1, mousemouse

Predictions only

Length 795 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tlr1Q9EPQ1 Slc46a3-202ENSMUST00000118527 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
Tlr1Q9EPQ1 Asb2-204ENSMUST00000149431 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
Tlr1Q9EPQ1 Tsc22d2-201ENSMUST00000099090 9799 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC14.29□□□□□ -0.12
Tlr1Q9EPQ1 Rpl18-ps2-201ENSMUST00000118863 567 ntBASIC14.29□□□□□ -0.12
Tlr1Q9EPQ1 Gm11539-201ENSMUST00000119837 557 ntBASIC14.29□□□□□ -0.12
Tlr1Q9EPQ1 Gm13436-201ENSMUST00000120418 567 ntBASIC14.29□□□□□ -0.12
Tlr1Q9EPQ1 Gm13474-201ENSMUST00000122466 815 ntBASIC14.29□□□□□ -0.12
Tlr1Q9EPQ1 Gm14453-201ENSMUST00000139677 553 ntTSL 3 BASIC14.29□□□□□ -0.12
Tlr1Q9EPQ1 Gm28876-201ENSMUST00000188137 703 ntTSL 3 BASIC14.29□□□□□ -0.12
Tlr1Q9EPQ1 AC159205.3-201ENSMUST00000224614 874 ntBASIC14.29□□□□□ -0.12
Tlr1Q9EPQ1 Pfdn4-201ENSMUST00000063682 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
Tlr1Q9EPQ1 Psmd4-201ENSMUST00000071664 1276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
Tlr1Q9EPQ1 Snx11-201ENSMUST00000021246 2551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
Tlr1Q9EPQ1 Pdk1-201ENSMUST00000006669 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
Tlr1Q9EPQ1 Bdkrb1-202ENSMUST00000182899 1313 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.29□□□□□ -0.12
Tlr1Q9EPQ1 Bdkrb1-201ENSMUST00000041229 1338 ntAPPRIS P1 BASIC14.29□□□□□ -0.12
Tlr1Q9EPQ1 Men1-204ENSMUST00000113500 2742 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.29□□□□□ -0.12
Tlr1Q9EPQ1 Zbtb20-202ENSMUST00000114690 2759 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
Tlr1Q9EPQ1 Lipo3-202ENSMUST00000112508 2839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
Tlr1Q9EPQ1 B3gat2-203ENSMUST00000144602 1488 ntTSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
Tlr1Q9EPQ1 Brd2-203ENSMUST00000114242 4483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
Tlr1Q9EPQ1 Zpbp2-203ENSMUST00000107509 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
Tlr1Q9EPQ1 9130017K11Rik-202ENSMUST00000135670 3338 ntTSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
Tlr1Q9EPQ1 Wnt10b-204ENSMUST00000226655 1807 ntBASIC14.29□□□□□ -0.12
Tlr1Q9EPQ1 Nsmce3-201ENSMUST00000094331 5946 ntAPPRIS P1 BASIC14.29□□□□□ -0.12
Tlr1Q9EPQ1 Anxa4-201ENSMUST00000001187 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
Tlr1Q9EPQ1 Gm10501-201ENSMUST00000151136 2200 ntTSL 2 BASIC14.29□□□□□ -0.12
Tlr1Q9EPQ1 Rilpl1-201ENSMUST00000062153 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
Tlr1Q9EPQ1 Gm45133-201ENSMUST00000207548 2773 ntBASIC14.28□□□□□ -0.12
Tlr1Q9EPQ1 Tcf3-210ENSMUST00000105346 2839 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
Tlr1Q9EPQ1 Dbn1-203ENSMUST00000109923 2940 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
Tlr1Q9EPQ1 Ccr9-202ENSMUST00000163559 3004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
Tlr1Q9EPQ1 Evpl-201ENSMUST00000037007 6384 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.28□□□□□ -0.12
Tlr1Q9EPQ1 Vldlr-202ENSMUST00000047645 3260 ntTSL 5 BASIC14.28□□□□□ -0.12
Tlr1Q9EPQ1 March4-201ENSMUST00000047786 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
Tlr1Q9EPQ1 Dnajc6-205ENSMUST00000106933 5191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
Tlr1Q9EPQ1 Matn1-201ENSMUST00000102576 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
Tlr1Q9EPQ1 Syt8-202ENSMUST00000105976 1289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
Tlr1Q9EPQ1 Atf4-201ENSMUST00000109605 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
Tlr1Q9EPQ1 Eda-204ENSMUST00000113777 1056 ntTSL 5 BASIC14.28□□□□□ -0.12
Tlr1Q9EPQ1 Eme2-202ENSMUST00000121542 1521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
Tlr1Q9EPQ1 Gm16061-201ENSMUST00000122167 857 ntBASIC14.28□□□□□ -0.12
Tlr1Q9EPQ1 Syt8-205ENSMUST00000122393 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
Tlr1Q9EPQ1 Tbx3os2-201ENSMUST00000135385 1345 ntTSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
Tlr1Q9EPQ1 Trim54-201ENSMUST00000013771 1434 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
Tlr1Q9EPQ1 Ing4-205ENSMUST00000140131 1446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
Tlr1Q9EPQ1 Spag1-202ENSMUST00000171205 3219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
Tlr1Q9EPQ1 Pdxk-ps-203ENSMUST00000183934 680 ntTSL 3 BASIC14.28□□□□□ -0.12
Tlr1Q9EPQ1 Gm10830-201ENSMUST00000186379 636 ntTSL 5 BASIC14.28□□□□□ -0.12
Tlr1Q9EPQ1 1700096K18Rik-201ENSMUST00000188465 1454 ntBASIC14.28□□□□□ -0.12
Tlr1Q9EPQ1 Gm44965-201ENSMUST00000204121 360 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.28□□□□□ -0.12
Tlr1Q9EPQ1 Fuz-209ENSMUST00000208179 1164 ntTSL 5 BASIC14.28□□□□□ -0.12
Tlr1Q9EPQ1 Gm31774-201ENSMUST00000212910 1366 ntTSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
Tlr1Q9EPQ1 6030419C18Rik-202ENSMUST00000216294 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
Tlr1Q9EPQ1 Gm27528-202ENSMUST00000222916 2012 ntBASIC14.28□□□□□ -0.12
Tlr1Q9EPQ1 Dhx16-201ENSMUST00000025292 3351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
Tlr1Q9EPQ1 Isl2-201ENSMUST00000034869 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
Tlr1Q9EPQ1 Cd2bp2-201ENSMUST00000035771 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
Tlr1Q9EPQ1 Eda-201ENSMUST00000071453 1152 ntTSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
Tlr1Q9EPQ1 Zar1-201ENSMUST00000073528 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
Tlr1Q9EPQ1 Trappc10-201ENSMUST00000000384 5047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
Tlr1Q9EPQ1 Rcbtb1-201ENSMUST00000022551 3957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
Tlr1Q9EPQ1 Ctdp1-201ENSMUST00000036229 3713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
Tlr1Q9EPQ1 Mef2d-204ENSMUST00000119251 3488 ntTSL 5 BASIC14.28□□□□□ -0.12
Tlr1Q9EPQ1 Ppp6r2-208ENSMUST00000228284 3297 ntAPPRIS P1 BASIC14.28□□□□□ -0.12
Tlr1Q9EPQ1 Spire2-202ENSMUST00000212404 2158 ntTSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.12
Tlr1Q9EPQ1 Dab2ip-202ENSMUST00000091010 6455 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.12
Tlr1Q9EPQ1 Abraxas1-202ENSMUST00000055245 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.12
Tlr1Q9EPQ1 Card9-201ENSMUST00000028294 1880 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.27□□□□□ -0.12
Tlr1Q9EPQ1 6430573F11Rik-205ENSMUST00000171777 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.12
Tlr1Q9EPQ1 Gba2-201ENSMUST00000030189 3544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.12
Tlr1Q9EPQ1 Wwox-207ENSMUST00000160862 1715 ntTSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.12
Tlr1Q9EPQ1 A930029G22Rik-201ENSMUST00000181032 1710 ntTSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.12
Tlr1Q9EPQ1 C77080-201ENSMUST00000052602 5187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.12
Tlr1Q9EPQ1 Slc25a39-201ENSMUST00000018821 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.12
Tlr1Q9EPQ1 Elavl3-201ENSMUST00000003501 5014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.12
Tlr1Q9EPQ1 Shank1-202ENSMUST00000107935 6649 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.27□□□□□ -0.12
Tlr1Q9EPQ1 Dlc1-203ENSMUST00000098826 6241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.12
Tlr1Q9EPQ1 Klhdc8b-207ENSMUST00000193286 2956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.12
Tlr1Q9EPQ1 Gk-201ENSMUST00000026039 4340 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.12
Tlr1Q9EPQ1 App-207ENSMUST00000227737 2827 ntBASIC14.27□□□□□ -0.12
Tlr1Q9EPQ1 Gm2788-202ENSMUST00000147173 1390 ntTSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.12
Tlr1Q9EPQ1 Foxl1-201ENSMUST00000181609 2705 ntAPPRIS P1 BASIC14.27□□□□□ -0.12
Tlr1Q9EPQ1 Zfp90-203ENSMUST00000212606 2685 ntTSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.12
Tlr1Q9EPQ1 Pabpc1l2b-ps-201ENSMUST00000124538 690 ntBASIC14.27□□□□□ -0.13
Tlr1Q9EPQ1 2210408F21Rik-213ENSMUST00000153057 652 ntTSL 3 BASIC14.27□□□□□ -0.13
Tlr1Q9EPQ1 Gm20403-201ENSMUST00000173803 372 ntAPPRIS P1 BASIC14.27□□□□□ -0.13
Tlr1Q9EPQ1 Gm18958-201ENSMUST00000174258 762 ntBASIC14.27□□□□□ -0.13
Tlr1Q9EPQ1 Gm3764-209ENSMUST00000181550 1093 ntTSL 3 BASIC14.27□□□□□ -0.13
Tlr1Q9EPQ1 Gm43799-201ENSMUST00000201845 579 ntBASIC14.27□□□□□ -0.13
Tlr1Q9EPQ1 AC159205.6-201ENSMUST00000224935 887 ntBASIC14.27□□□□□ -0.13
Tlr1Q9EPQ1 Slc4a5-203ENSMUST00000113900 3630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.27□□□□□ -0.13
Tlr1Q9EPQ1 Ror1-201ENSMUST00000039630 5762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.13
Tlr1Q9EPQ1 Steap2-202ENSMUST00000115424 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.13
Tlr1Q9EPQ1 Map6d1-201ENSMUST00000040880 3273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.13
Tlr1Q9EPQ1 Plekha4-207ENSMUST00000211227 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.13
Tlr1Q9EPQ1 Magi1-202ENSMUST00000089317 7209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.13
Tlr1Q9EPQ1 Syt17-204ENSMUST00000203796 2957 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.13
Tlr1Q9EPQ1 9930021J03Rik-204ENSMUST00000177155 6632 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.27□□□□□ -0.13
Tlr1Q9EPQ1 Itpripl1-201ENSMUST00000110386 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 80.4 ms