Protein–RNA interactions for Protein: Q9EPB7

Gpr88, Probable G-protein coupled receptor 88, mousemouse

Predictions only

Length 384 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gpr88Q9EPB7 Slc35a1-201ENSMUST00000029970 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Gpr88Q9EPB7 Gm26755-201ENSMUST00000180703 2657 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Gpr88Q9EPB7 9530085L11Rik-201ENSMUST00000203963 2115 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Gpr88Q9EPB7 Anp32a-201ENSMUST00000085519 2113 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Gpr88Q9EPB7 Psmd8-201ENSMUST00000059642 1540 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Gpr88Q9EPB7 Trip6-201ENSMUST00000024119 2168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Gpr88Q9EPB7 Adamts19-201ENSMUST00000052907 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Gpr88Q9EPB7 Gm26889-201ENSMUST00000181523 2252 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Gpr88Q9EPB7 Pofut2-201ENSMUST00000020493 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Gpr88Q9EPB7 Fam83f-201ENSMUST00000023044 2988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Gpr88Q9EPB7 Exoc8-201ENSMUST00000098312 4598 ntAPPRIS P1 BASIC15.06■□□□□ 0
Gpr88Q9EPB7 Mccc1-201ENSMUST00000029259 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Gpr88Q9EPB7 Shisa7-201ENSMUST00000066041 6006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Gpr88Q9EPB7 Sh3yl1-201ENSMUST00000020997 1750 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Gpr88Q9EPB7 Sh2b1-201ENSMUST00000032978 3393 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Gpr88Q9EPB7 Tap1-201ENSMUST00000041633 2614 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Gpr88Q9EPB7 Oraov1-203ENSMUST00000105895 1016 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
Gpr88Q9EPB7 Gm12497-201ENSMUST00000138778 237 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Gpr88Q9EPB7 Cabp2-205ENSMUST00000162908 911 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Gpr88Q9EPB7 Gm8349-201ENSMUST00000182720 1003 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Gpr88Q9EPB7 Msh3-205ENSMUST00000187424 666 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
Gpr88Q9EPB7 Timm8a2-201ENSMUST00000045976 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Gpr88Q9EPB7 Olfr632-201ENSMUST00000098189 954 ntAPPRIS P1 BASIC15.06■□□□□ 0
Gpr88Q9EPB7 Mapt-202ENSMUST00000106988 2202 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Gpr88Q9EPB7 Agap1-204ENSMUST00000190096 4078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Gpr88Q9EPB7 Slc22a16-202ENSMUST00000078314 2269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Gpr88Q9EPB7 Alox12-202ENSMUST00000108574 2314 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Gpr88Q9EPB7 Rfesd-203ENSMUST00000179078 1436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Gpr88Q9EPB7 Pfkfb4-201ENSMUST00000051873 3316 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Gpr88Q9EPB7 Fam214a-202ENSMUST00000170846 4355 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Gpr88Q9EPB7 Ckb-201ENSMUST00000001304 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Gpr88Q9EPB7 B3gat2-203ENSMUST00000144602 1488 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Gpr88Q9EPB7 Tsc22d2-203ENSMUST00000199164 4659 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Gpr88Q9EPB7 Arrdc1-201ENSMUST00000028349 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Gpr88Q9EPB7 Chn1-203ENSMUST00000112024 4050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Gpr88Q9EPB7 Chn1-210ENSMUST00000180045 4050 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Gpr88Q9EPB7 Ttll11-202ENSMUST00000112976 3077 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Gpr88Q9EPB7 Pou3f2-201ENSMUST00000178174 5587 ntAPPRIS P1 BASIC15.06■□□□□ 0
Gpr88Q9EPB7 Mesp2-201ENSMUST00000107394 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Gpr88Q9EPB7 A4galt-201ENSMUST00000049530 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Gpr88Q9EPB7 AC133083.1-201ENSMUST00000221736 2209 ntBASIC15.05■□□□□ 0
Gpr88Q9EPB7 AC093043.3-201ENSMUST00000226531 2273 ntBASIC15.05■□□□□ 0
Gpr88Q9EPB7 Zdhhc15-201ENSMUST00000042070 5509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Gpr88Q9EPB7 Dmpk-202ENSMUST00000108473 2588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Gpr88Q9EPB7 Parg-201ENSMUST00000022470 4413 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Gpr88Q9EPB7 G3bp2-202ENSMUST00000164378 3026 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Gpr88Q9EPB7 Zc3h14-204ENSMUST00000110105 3514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Gpr88Q9EPB7 Thap3-202ENSMUST00000105665 832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Gpr88Q9EPB7 9430038I01Rik-202ENSMUST00000117404 699 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Gpr88Q9EPB7 BC048679-202ENSMUST00000144156 640 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Gpr88Q9EPB7 9530052E02Rik-201ENSMUST00000180750 949 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Gpr88Q9EPB7 Smim22-208ENSMUST00000185147 399 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
Gpr88Q9EPB7 Gm28659-201ENSMUST00000188013 759 ntBASIC15.05■□□□□ -0
Gpr88Q9EPB7 Dnmt3a-ps1-201ENSMUST00000192011 1271 ntBASIC15.05■□□□□ -0
Gpr88Q9EPB7 Samd13-205ENSMUST00000197989 591 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Gpr88Q9EPB7 Ppt1-202ENSMUST00000097902 1191 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Gpr88Q9EPB7 Gnas-202ENSMUST00000087871 3903 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Gpr88Q9EPB7 Rbm3-206ENSMUST00000115621 1338 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Gpr88Q9EPB7 Cope-201ENSMUST00000066469 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Gpr88Q9EPB7 Gm26718-201ENSMUST00000181048 1378 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Gpr88Q9EPB7 Gm42743-201ENSMUST00000051089 1511 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Gpr88Q9EPB7 Ppp2r2a-204ENSMUST00000225380 1988 ntBASIC15.05■□□□□ -0
Gpr88Q9EPB7 Acp7-201ENSMUST00000040112 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Gpr88Q9EPB7 Tuba8-201ENSMUST00000032233 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Gpr88Q9EPB7 Prpf3-207ENSMUST00000161476 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Gpr88Q9EPB7 Dsg2-202ENSMUST00000120102 3590 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Gpr88Q9EPB7 Papd4-201ENSMUST00000048702 2990 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Gpr88Q9EPB7 Nagpa-201ENSMUST00000023911 2143 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Gpr88Q9EPB7 Dnajc2-204ENSMUST00000115195 1994 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Gpr88Q9EPB7 Syngr3-201ENSMUST00000007236 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Gpr88Q9EPB7 H2-Q4-201ENSMUST00000081435 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Gpr88Q9EPB7 Ssfa2-201ENSMUST00000111784 4999 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Gpr88Q9EPB7 Gde1-201ENSMUST00000038791 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Gpr88Q9EPB7 Ppif-201ENSMUST00000022419 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Gpr88Q9EPB7 Cyp2w1-201ENSMUST00000031521 1512 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Gpr88Q9EPB7 Ahsa1-201ENSMUST00000021425 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Gpr88Q9EPB7 Fam107b-203ENSMUST00000115053 688 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
Gpr88Q9EPB7 Scpep1os-201ENSMUST00000139592 811 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Gpr88Q9EPB7 Atp6v0b-208ENSMUST00000150204 935 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Gpr88Q9EPB7 Cklf-201ENSMUST00000034342 667 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Gpr88Q9EPB7 Galnt17-202ENSMUST00000160609 2875 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Gpr88Q9EPB7 Gm16201-202ENSMUST00000139218 2330 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Gpr88Q9EPB7 Akp-ps1-202ENSMUST00000212812 1959 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Gpr88Q9EPB7 Gm6277-201ENSMUST00000180860 1839 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Gpr88Q9EPB7 Mtx2-201ENSMUST00000028511 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Gpr88Q9EPB7 Gm43072-201ENSMUST00000200283 1671 ntBASIC15.03■□□□□ -0
Gpr88Q9EPB7 Slc29a4-201ENSMUST00000058418 2789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Gpr88Q9EPB7 Foxc2-201ENSMUST00000054691 2725 ntAPPRIS P1 BASIC15.03■□□□□ -0
Gpr88Q9EPB7 Ilvbl-204ENSMUST00000218271 1606 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Gpr88Q9EPB7 Gm16011-201ENSMUST00000121567 2662 ntBASIC15.03■□□□□ -0
Gpr88Q9EPB7 Cfap20-208ENSMUST00000213086 2544 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
Gpr88Q9EPB7 Cmc2-205ENSMUST00000148235 1459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Gpr88Q9EPB7 Ncoa1-201ENSMUST00000085814 7329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Gpr88Q9EPB7 Tpd52-205ENSMUST00000120143 6317 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Gpr88Q9EPB7 Pi4k2b-202ENSMUST00000031082 3034 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
Gpr88Q9EPB7 Btn1a1-202ENSMUST00000110434 1077 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Gpr88Q9EPB7 Naa10-206ENSMUST00000114391 834 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Gpr88Q9EPB7 Nrn1l-202ENSMUST00000118920 603 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Gpr88Q9EPB7 Psmc4-206ENSMUST00000140053 1244 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Gpr88Q9EPB7 Mir8098-201ENSMUST00000184011 137 ntBASIC15.03■□□□□ -0
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.8 ms