Protein–RNA interactions for Protein: Q9DCQ7

Serpina1f, Alpha-1-antitrypsin 1-6, mousemouse

Predictions only

Length 411 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Serpina1fQ9DCQ7 Entpd4-205ENSMUST00000184314 989 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Serpina1fQ9DCQ7 AC133183.1-201ENSMUST00000221229 429 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Serpina1fQ9DCQ7 Pnmt-201ENSMUST00000041301 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Serpina1fQ9DCQ7 Entpd4b-201ENSMUST00000064846 989 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Serpina1fQ9DCQ7 Spr-ps1-201ENSMUST00000089584 605 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
Serpina1fQ9DCQ7 Tead3-206ENSMUST00000156862 2573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Serpina1fQ9DCQ7 Pak1ip1-201ENSMUST00000046951 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Serpina1fQ9DCQ7 Igfbp1-201ENSMUST00000020704 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Serpina1fQ9DCQ7 Esr1-203ENSMUST00000105589 2612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Serpina1fQ9DCQ7 Tfap2d-201ENSMUST00000037294 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Serpina1fQ9DCQ7 Wipi2-201ENSMUST00000036872 5171 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Serpina1fQ9DCQ7 Kcnk10-203ENSMUST00000221305 1357 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Serpina1fQ9DCQ7 Lmnb2-202ENSMUST00000105332 1643 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Serpina1fQ9DCQ7 Tle3-211ENSMUST00000161689 2836 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Serpina1fQ9DCQ7 Bcl7b-203ENSMUST00000111188 1434 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Serpina1fQ9DCQ7 Ate1-203ENSMUST00000094017 1938 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Serpina1fQ9DCQ7 Hmgb3-204ENSMUST00000114582 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Serpina1fQ9DCQ7 Hmgb3-203ENSMUST00000088874 1728 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Serpina1fQ9DCQ7 Rom1-201ENSMUST00000096242 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Serpina1fQ9DCQ7 Rnf141-201ENSMUST00000106682 1101 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Serpina1fQ9DCQ7 Gm17092-201ENSMUST00000166606 698 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Serpina1fQ9DCQ7 Mgst3-201ENSMUST00000028005 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Serpina1fQ9DCQ7 Sumo1-201ENSMUST00000091374 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Serpina1fQ9DCQ7 Lrfn1-202ENSMUST00000108288 3060 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Serpina1fQ9DCQ7 Aste1-202ENSMUST00000123807 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Serpina1fQ9DCQ7 Cope-201ENSMUST00000066469 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Serpina1fQ9DCQ7 Gnal-201ENSMUST00000025402 5616 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Serpina1fQ9DCQ7 9230020A06Rik-203ENSMUST00000214621 1682 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Serpina1fQ9DCQ7 Arrdc1-201ENSMUST00000028349 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Serpina1fQ9DCQ7 Ralgapa1-202ENSMUST00000110687 7874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Serpina1fQ9DCQ7 Tm6sf2-201ENSMUST00000049197 1418 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Serpina1fQ9DCQ7 Cmc2-205ENSMUST00000148235 1459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Serpina1fQ9DCQ7 Taf5l-202ENSMUST00000165628 2973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Serpina1fQ9DCQ7 Rbfox2-204ENSMUST00000171751 3558 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Serpina1fQ9DCQ7 Ep300-201ENSMUST00000068387 9566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Serpina1fQ9DCQ7 AC153526.5-201ENSMUST00000218661 2147 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
Serpina1fQ9DCQ7 AC069562.2-201ENSMUST00000224644 2146 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
Serpina1fQ9DCQ7 Stx6-201ENSMUST00000027743 4589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Serpina1fQ9DCQ7 Cyp2w1-201ENSMUST00000031521 1512 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Serpina1fQ9DCQ7 Ppp1r11-201ENSMUST00000040402 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Serpina1fQ9DCQ7 Rffl-206ENSMUST00000108173 3489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Serpina1fQ9DCQ7 Eapp-203ENSMUST00000160085 676 ntTSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Serpina1fQ9DCQ7 C130032M10Rik-201ENSMUST00000180393 728 ntAPPRIS P1 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Serpina1fQ9DCQ7 Vti1a-206ENSMUST00000225529 1244 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
Serpina1fQ9DCQ7 Pdcd2l-201ENSMUST00000002710 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Serpina1fQ9DCQ7 Zscan29-203ENSMUST00000146243 2894 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Serpina1fQ9DCQ7 Grwd1-202ENSMUST00000131384 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Serpina1fQ9DCQ7 Dscc1-201ENSMUST00000023059 1324 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Serpina1fQ9DCQ7 Col11a2-201ENSMUST00000087497 6048 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Serpina1fQ9DCQ7 CT010456.1-201ENSMUST00000222465 1688 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Serpina1fQ9DCQ7 Ttll5-201ENSMUST00000040179 5081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Serpina1fQ9DCQ7 Pex5-202ENSMUST00000080557 3073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Serpina1fQ9DCQ7 Tmem229b-201ENSMUST00000056660 3860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Serpina1fQ9DCQ7 Rgs7-203ENSMUST00000192227 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Serpina1fQ9DCQ7 Hnrnph1-202ENSMUST00000077817 2126 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Serpina1fQ9DCQ7 4933436I20Rik-201ENSMUST00000189405 1434 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Serpina1fQ9DCQ7 Itga5-201ENSMUST00000023128 4382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Serpina1fQ9DCQ7 Trim50-201ENSMUST00000065785 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Serpina1fQ9DCQ7 Nrxn1-216ENSMUST00000174331 6282 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Serpina1fQ9DCQ7 Gabrd-201ENSMUST00000030925 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Serpina1fQ9DCQ7 Sgsm2-201ENSMUST00000057631 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Serpina1fQ9DCQ7 Tmem132c-201ENSMUST00000119026 5134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Serpina1fQ9DCQ7 Snrk-201ENSMUST00000118886 4811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Serpina1fQ9DCQ7 Axin1-202ENSMUST00000118904 2833 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Serpina1fQ9DCQ7 Nr3c2-203ENSMUST00000109912 5675 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Serpina1fQ9DCQ7 Pak4-202ENSMUST00000108283 2899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Serpina1fQ9DCQ7 Plcl1-201ENSMUST00000042986 6580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Serpina1fQ9DCQ7 Vmn1r17-204ENSMUST00000228294 2084 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Serpina1fQ9DCQ7 Thap3-202ENSMUST00000105665 832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Serpina1fQ9DCQ7 Naa10-206ENSMUST00000114391 834 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Serpina1fQ9DCQ7 Gm7506-201ENSMUST00000207758 815 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
Serpina1fQ9DCQ7 Dupd1-201ENSMUST00000073870 1138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Serpina1fQ9DCQ7 Gm4756-201ENSMUST00000207585 1716 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Serpina1fQ9DCQ7 Spg21-201ENSMUST00000034955 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Serpina1fQ9DCQ7 Micall1-201ENSMUST00000040320 6701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Serpina1fQ9DCQ7 Atp6v0a1-203ENSMUST00000103110 2716 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Serpina1fQ9DCQ7 Cnbd2-201ENSMUST00000037096 2277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Serpina1fQ9DCQ7 Gabrb3-201ENSMUST00000039697 5579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Serpina1fQ9DCQ7 Rab9-202ENSMUST00000112091 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Serpina1fQ9DCQ7 Rbm11-201ENSMUST00000046378 1400 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Serpina1fQ9DCQ7 Pdlim7-206ENSMUST00000131306 1915 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Serpina1fQ9DCQ7 Lrrn2-201ENSMUST00000027706 3428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Serpina1fQ9DCQ7 Ckb-201ENSMUST00000001304 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Serpina1fQ9DCQ7 Dvl2-207ENSMUST00000190940 5037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Serpina1fQ9DCQ7 Rmi2-201ENSMUST00000037913 3742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Serpina1fQ9DCQ7 Chst13-201ENSMUST00000070890 1653 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Serpina1fQ9DCQ7 Ift74-202ENSMUST00000107104 1713 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Serpina1fQ9DCQ7 Mrpl57-201ENSMUST00000022538 2877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Serpina1fQ9DCQ7 Rfx5-201ENSMUST00000029772 4189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Serpina1fQ9DCQ7 Megf11-210ENSMUST00000164113 6018 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Serpina1fQ9DCQ7 Mettl7a1-201ENSMUST00000067752 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Serpina1fQ9DCQ7 Hace1-201ENSMUST00000037044 3785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Serpina1fQ9DCQ7 Gpr142-202ENSMUST00000106584 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Serpina1fQ9DCQ7 Pgam1-ps2-201ENSMUST00000117129 765 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
Serpina1fQ9DCQ7 Epsti1-202ENSMUST00000169978 1175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Serpina1fQ9DCQ7 Gm26871-202ENSMUST00000180774 695 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Serpina1fQ9DCQ7 Jpx-202ENSMUST00000182447 712 ntTSL 3 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Serpina1fQ9DCQ7 Tm4sf5-201ENSMUST00000019063 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Serpina1fQ9DCQ7 AC171004.1-201ENSMUST00000221723 664 ntTSL 3 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Serpina1fQ9DCQ7 Epsti1-203ENSMUST00000227903 1178 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.6 ms