Protein–RNA interactions for Protein: Q9DCG9

Trmt112, Multifunctional methyltransferase subunit TRM112-like protein, mousemouse

Predictions only

Length 125 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trmt112Q9DCG9 Pde4b-208ENSMUST00000106911 3020 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Trmt112Q9DCG9 Fars2-201ENSMUST00000021857 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Trmt112Q9DCG9 Hhatl-201ENSMUST00000035110 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Trmt112Q9DCG9 Gstt2-201ENSMUST00000038257 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Trmt112Q9DCG9 Pgap3-202ENSMUST00000090827 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Trmt112Q9DCG9 Zfp277-201ENSMUST00000069637 2188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Trmt112Q9DCG9 Letmd1-201ENSMUST00000037001 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Trmt112Q9DCG9 Rbm42-202ENSMUST00000108141 1526 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Trmt112Q9DCG9 E2f2-201ENSMUST00000061721 4739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Trmt112Q9DCG9 Cd164l2-201ENSMUST00000105910 986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Trmt112Q9DCG9 Il11ra2-201ENSMUST00000108006 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Trmt112Q9DCG9 Get4-202ENSMUST00000110878 1180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Trmt112Q9DCG9 Gm15358-201ENSMUST00000119249 520 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
Trmt112Q9DCG9 Gm17114-201ENSMUST00000164716 511 ntTSL 3 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Trmt112Q9DCG9 BC022687-202ENSMUST00000177808 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Trmt112Q9DCG9 Gm3764-206ENSMUST00000181356 1088 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Trmt112Q9DCG9 Cela3a-201ENSMUST00000024200 958 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Trmt112Q9DCG9 Wfdc6b-201ENSMUST00000094346 984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Trmt112Q9DCG9 Adam33-201ENSMUST00000052104 2795 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Trmt112Q9DCG9 Glis1-201ENSMUST00000046005 2906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Trmt112Q9DCG9 Taf5l-201ENSMUST00000093039 2912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Trmt112Q9DCG9 Atp6v1c2-201ENSMUST00000020884 1569 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Trmt112Q9DCG9 Spag16-201ENSMUST00000065425 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Trmt112Q9DCG9 Snx27-201ENSMUST00000029783 6261 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Trmt112Q9DCG9 Arntl-204ENSMUST00000210238 2976 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Trmt112Q9DCG9 A830018L16Rik-208ENSMUST00000171690 6158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Trmt112Q9DCG9 Sphk1-206ENSMUST00000106388 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Trmt112Q9DCG9 Nrip2-201ENSMUST00000001561 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Trmt112Q9DCG9 Ikbke-204ENSMUST00000161764 2867 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Trmt112Q9DCG9 Gm32369-201ENSMUST00000222630 1467 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Trmt112Q9DCG9 Alg3-201ENSMUST00000045918 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Trmt112Q9DCG9 Gm44729-201ENSMUST00000206759 2052 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
Trmt112Q9DCG9 Unc13b-203ENSMUST00000107953 5034 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Trmt112Q9DCG9 A930003O13Rik-203ENSMUST00000199056 1955 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Trmt112Q9DCG9 Akp-ps1-202ENSMUST00000212812 1959 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Trmt112Q9DCG9 Avl9-201ENSMUST00000031805 6670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Trmt112Q9DCG9 Dmpk-203ENSMUST00000108474 2591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Trmt112Q9DCG9 Dtwd2-203ENSMUST00000163590 2857 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Trmt112Q9DCG9 Dcaf17-203ENSMUST00000112159 2490 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Trmt112Q9DCG9 Olfr1564-201ENSMUST00000112162 1091 ntAPPRIS P2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Trmt112Q9DCG9 Hmgb1-208ENSMUST00000139443 923 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Trmt112Q9DCG9 Gm2308-201ENSMUST00000166539 1004 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
Trmt112Q9DCG9 Gpc5-202ENSMUST00000175665 2187 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Trmt112Q9DCG9 4930442P19Rik-201ENSMUST00000193163 1240 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
Trmt112Q9DCG9 Gm19164-201ENSMUST00000210667 640 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
Trmt112Q9DCG9 AC154222.1-201ENSMUST00000223882 475 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
Trmt112Q9DCG9 Jade1-202ENSMUST00000163764 5584 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Trmt112Q9DCG9 Wdr90-205ENSMUST00000176923 5666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Trmt112Q9DCG9 Fam221a-202ENSMUST00000121903 1304 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Trmt112Q9DCG9 Ankrd9-202ENSMUST00000128353 2577 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Trmt112Q9DCG9 Chrd-202ENSMUST00000115423 2417 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Trmt112Q9DCG9 Gm43072-201ENSMUST00000200283 1671 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
Trmt112Q9DCG9 1700001O22Rik-201ENSMUST00000050003 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Trmt112Q9DCG9 Pde8b-214ENSMUST00000172104 2493 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Trmt112Q9DCG9 P2rx6-203ENSMUST00000171002 1353 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Trmt112Q9DCG9 Zswim8-201ENSMUST00000022358 6073 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Trmt112Q9DCG9 Iqcd-201ENSMUST00000069259 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Trmt112Q9DCG9 Mtcl1-201ENSMUST00000086693 7221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Trmt112Q9DCG9 Gabrd-201ENSMUST00000030925 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Trmt112Q9DCG9 Tmem254c-202ENSMUST00000100819 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Trmt112Q9DCG9 Ifngr1-201ENSMUST00000020188 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Trmt112Q9DCG9 Ap2s1-204ENSMUST00000205607 372 ntTSL 3 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Trmt112Q9DCG9 Psmb5-202ENSMUST00000227257 622 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
Trmt112Q9DCG9 Ndufb7-201ENSMUST00000036996 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Trmt112Q9DCG9 Fam26f-201ENSMUST00000062784 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Trmt112Q9DCG9 Sgta-202ENSMUST00000218208 1964 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Trmt112Q9DCG9 Igf2-205ENSMUST00000121128 4722 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Trmt112Q9DCG9 Arl11-201ENSMUST00000055159 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Trmt112Q9DCG9 Nrbf2-201ENSMUST00000077839 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Trmt112Q9DCG9 Agtr1a-201ENSMUST00000066412 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Trmt112Q9DCG9 Trim8-201ENSMUST00000026008 3230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Trmt112Q9DCG9 Gm26891-201ENSMUST00000181644 2599 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Trmt112Q9DCG9 Zic1-201ENSMUST00000034927 5606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Trmt112Q9DCG9 Camsap2-203ENSMUST00000192314 4916 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Trmt112Q9DCG9 Agfg1-208ENSMUST00000190052 2991 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Trmt112Q9DCG9 Ptges2-201ENSMUST00000028162 4978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Trmt112Q9DCG9 Pcbp3-206ENSMUST00000168465 1748 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Trmt112Q9DCG9 Dpys-201ENSMUST00000022915 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Trmt112Q9DCG9 Gnb2-212ENSMUST00000150063 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Trmt112Q9DCG9 Ldha-201ENSMUST00000005051 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Trmt112Q9DCG9 Robo3-202ENSMUST00000115038 4797 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Trmt112Q9DCG9 Rabl2-201ENSMUST00000023294 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Trmt112Q9DCG9 Cap1-203ENSMUST00000106257 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Trmt112Q9DCG9 Ints8-201ENSMUST00000044616 3433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Trmt112Q9DCG9 Wdr61-203ENSMUST00000121204 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Trmt112Q9DCG9 Ctcflos-201ENSMUST00000142165 469 ntTSL 3 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Trmt112Q9DCG9 Gm26756-201ENSMUST00000181689 1294 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Trmt112Q9DCG9 1810008I18Rik-202ENSMUST00000187848 819 ntTSL 3 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Trmt112Q9DCG9 Cort-201ENSMUST00000030815 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Trmt112Q9DCG9 Igflr1-201ENSMUST00000043850 1186 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Trmt112Q9DCG9 Sbf2-213ENSMUST00000171218 1476 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Trmt112Q9DCG9 Cnih3-201ENSMUST00000027795 2668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Trmt112Q9DCG9 Gnas-202ENSMUST00000087871 3903 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Trmt112Q9DCG9 Snn-201ENSMUST00000089011 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Trmt112Q9DCG9 Gm11611-201ENSMUST00000134289 1326 ntTSL 3 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Trmt112Q9DCG9 Grk6-207ENSMUST00000225925 2769 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
Trmt112Q9DCG9 Trim7-202ENSMUST00000109213 2356 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Trmt112Q9DCG9 Glb1-201ENSMUST00000063042 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Trmt112Q9DCG9 Cdc25a-201ENSMUST00000094324 3632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Trmt112Q9DCG9 Trim39-203ENSMUST00000113706 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.6 ms