Protein–RNA interactions for Protein: Q9DCD2

Xab2, Pre-mRNA-splicing factor SYF1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 855 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Xab2Q9DCD2 Slc2a8-204ENSMUST00000153484 1168 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Xab2Q9DCD2 Rab32-201ENSMUST00000019974 2149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Xab2Q9DCD2 Gadd45b-203ENSMUST00000220246 732 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Xab2Q9DCD2 Mrpl43-201ENSMUST00000097715 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Xab2Q9DCD2 Ube2d2b-201ENSMUST00000072578 1678 ntAPPRIS P1 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Xab2Q9DCD2 Paxbp1-202ENSMUST00000118522 3973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Xab2Q9DCD2 Tyro3-201ENSMUST00000028763 3989 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Xab2Q9DCD2 Kpna4-203ENSMUST00000194558 3726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Xab2Q9DCD2 Nap1l4-206ENSMUST00000208190 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Xab2Q9DCD2 Pde4d-207ENSMUST00000120664 4207 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
Xab2Q9DCD2 Gbe1-203ENSMUST00000163832 2984 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.26
Xab2Q9DCD2 Gm44443-201ENSMUST00000204396 5633 ntBASIC16.71■□□□□ 0.26
Xab2Q9DCD2 Zkscan4-202ENSMUST00000225845 1506 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
Xab2Q9DCD2 Sytl1-202ENSMUST00000105908 1730 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Xab2Q9DCD2 Mob2-206ENSMUST00000211206 2140 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Xab2Q9DCD2 Vcan-201ENSMUST00000109543 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Xab2Q9DCD2 Kctd20-208ENSMUST00000168507 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Xab2Q9DCD2 Nsmaf-201ENSMUST00000029910 3507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Xab2Q9DCD2 Cobl-203ENSMUST00000109651 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Xab2Q9DCD2 Myc-202ENSMUST00000159327 2186 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Xab2Q9DCD2 Mettl7a1-201ENSMUST00000067752 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Xab2Q9DCD2 March11-203ENSMUST00000152841 1365 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Xab2Q9DCD2 Gm6433-201ENSMUST00000118634 875 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
Xab2Q9DCD2 Rab3d-202ENSMUST00000119055 694 ntTSL 3 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Xab2Q9DCD2 Gm9745-201ENSMUST00000021573 684 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Xab2Q9DCD2 Efcab11-207ENSMUST00000223114 1122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Xab2Q9DCD2 Nudt8-202ENSMUST00000025802 787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Xab2Q9DCD2 Nudt1-201ENSMUST00000050205 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Xab2Q9DCD2 Nudt1-202ENSMUST00000071881 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Xab2Q9DCD2 Tmem128-201ENSMUST00000087511 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Xab2Q9DCD2 Rell1-204ENSMUST00000154169 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Xab2Q9DCD2 Bnip2-202ENSMUST00000085393 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Xab2Q9DCD2 Scube3-201ENSMUST00000043503 6699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Xab2Q9DCD2 Eml3-202ENSMUST00000224272 2978 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Xab2Q9DCD2 Notch3-201ENSMUST00000087723 8044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Xab2Q9DCD2 Apba3-211ENSMUST00000220297 2268 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Xab2Q9DCD2 Gm16279-201ENSMUST00000149452 2945 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Xab2Q9DCD2 Ugcg-201ENSMUST00000030074 4012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Xab2Q9DCD2 Gm42901-201ENSMUST00000197735 3171 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
Xab2Q9DCD2 Tcf25-205ENSMUST00000212470 2572 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Xab2Q9DCD2 Tcf3-204ENSMUST00000105340 2826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Xab2Q9DCD2 Tcf3-202ENSMUST00000020379 2829 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Xab2Q9DCD2 Gm11860-201ENSMUST00000122346 1010 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
Xab2Q9DCD2 Gm13025-201ENSMUST00000141469 1163 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Xab2Q9DCD2 Has3-202ENSMUST00000175987 1154 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Xab2Q9DCD2 1810010D01Rik-204ENSMUST00000208788 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Xab2Q9DCD2 C530025M09Rik-201ENSMUST00000099264 690 ntAPPRIS P1 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Xab2Q9DCD2 Pitpna-206ENSMUST00000179521 3727 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Xab2Q9DCD2 Usp53-201ENSMUST00000090379 6185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Xab2Q9DCD2 Zfp42-202ENSMUST00000209356 1744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Xab2Q9DCD2 Gm45212-201ENSMUST00000205831 3403 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
Xab2Q9DCD2 Itpkc-201ENSMUST00000003850 3247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Xab2Q9DCD2 Mfsd10-203ENSMUST00000114331 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Xab2Q9DCD2 Mcm9-201ENSMUST00000075540 4882 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Xab2Q9DCD2 Tead4-201ENSMUST00000006311 3076 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Xab2Q9DCD2 Dock4-201ENSMUST00000037488 8552 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Xab2Q9DCD2 Fgfr4-201ENSMUST00000005452 3324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Xab2Q9DCD2 Alk-201ENSMUST00000086639 4866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Xab2Q9DCD2 Ankrd44-201ENSMUST00000044359 6192 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Xab2Q9DCD2 Pcsk6-201ENSMUST00000055576 4405 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Xab2Q9DCD2 Adam15-202ENSMUST00000074582 2799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Xab2Q9DCD2 Pxn-201ENSMUST00000067268 3706 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Xab2Q9DCD2 Cyp21a1-201ENSMUST00000025223 2058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Xab2Q9DCD2 Rbm26-202ENSMUST00000100327 3634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Xab2Q9DCD2 Hsf4-201ENSMUST00000036127 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Xab2Q9DCD2 Abhd3-203ENSMUST00000117828 1962 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Xab2Q9DCD2 Hook2-201ENSMUST00000064495 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Xab2Q9DCD2 Smarcd1-201ENSMUST00000023759 3153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Xab2Q9DCD2 Ptprs-211ENSMUST00000223859 5588 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
Xab2Q9DCD2 Gm13420-201ENSMUST00000129574 1091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Xab2Q9DCD2 4930405A21Rik-202ENSMUST00000139042 994 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Xab2Q9DCD2 Prr23a1-201ENSMUST00000170349 883 ntAPPRIS P1 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Xab2Q9DCD2 Lamtor5-202ENSMUST00000199317 743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Xab2Q9DCD2 AC153881.2-201ENSMUST00000214877 204 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
Xab2Q9DCD2 Mrpl36-203ENSMUST00000222030 680 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Xab2Q9DCD2 AC156576.2-201ENSMUST00000222752 503 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Xab2Q9DCD2 B230219D22Rik-201ENSMUST00000057844 4652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Xab2Q9DCD2 Sftpb-201ENSMUST00000070437 1131 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Xab2Q9DCD2 Ewsr1-204ENSMUST00000093365 1290 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Xab2Q9DCD2 Snx17-201ENSMUST00000031029 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Xab2Q9DCD2 Pofut2-201ENSMUST00000020493 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Xab2Q9DCD2 Disc1-208ENSMUST00000122389 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Xab2Q9DCD2 9230020A06Rik-203ENSMUST00000214621 1682 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Xab2Q9DCD2 P2ry6-201ENSMUST00000060174 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Xab2Q9DCD2 Strn4-202ENSMUST00000108495 3082 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Xab2Q9DCD2 Idh1-201ENSMUST00000097709 2302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Xab2Q9DCD2 Rnf208-202ENSMUST00000114355 1333 ntAPPRIS P1 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Xab2Q9DCD2 Chuk-202ENSMUST00000119591 3481 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Xab2Q9DCD2 Chst8-204ENSMUST00000205259 1980 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Xab2Q9DCD2 Zfp800-202ENSMUST00000115320 4311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Xab2Q9DCD2 Coch-202ENSMUST00000164782 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Xab2Q9DCD2 Pdlim7-206ENSMUST00000131306 1915 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Xab2Q9DCD2 Rps6kl1-201ENSMUST00000019379 2304 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Xab2Q9DCD2 Cldn18-203ENSMUST00000131922 860 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Xab2Q9DCD2 Apopt1-204ENSMUST00000163220 671 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Xab2Q9DCD2 Syngr2-206ENSMUST00000177131 935 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Xab2Q9DCD2 Gm26827-201ENSMUST00000181911 148 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Xab2Q9DCD2 Rnf13-209ENSMUST00000199041 1062 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Xab2Q9DCD2 CT009713.7-201ENSMUST00000224689 571 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
Xab2Q9DCD2 Sec11c-201ENSMUST00000025394 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.8 ms