Protein–RNA interactions for Protein: Q9DC28

Csnk1d, Casein kinase I isoform delta, mousemouse

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Length 415 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Csnk1dQ9DC28 Cant1-204ENSMUST00000106288 2873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Csnk1dQ9DC28 Tgfb1i1-207ENSMUST00000167965 1746 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Csnk1dQ9DC28 Pqlc3-208ENSMUST00000222203 1706 ntTSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Csnk1dQ9DC28 Syf2-201ENSMUST00000030622 1369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Csnk1dQ9DC28 Bnipl-202ENSMUST00000107195 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Csnk1dQ9DC28 Nrbf2-201ENSMUST00000077839 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Csnk1dQ9DC28 Gm45412-201ENSMUST00000210217 2275 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
Csnk1dQ9DC28 Map6-207ENSMUST00000208924 2906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Csnk1dQ9DC28 Jmy-201ENSMUST00000065537 8776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Csnk1dQ9DC28 Kank3-202ENSMUST00000172649 2652 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Csnk1dQ9DC28 Crhbp-202ENSMUST00000221025 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Csnk1dQ9DC28 Nr1h2-203ENSMUST00000107911 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Csnk1dQ9DC28 Cnih1-201ENSMUST00000015903 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Csnk1dQ9DC28 Vill-207ENSMUST00000141185 1645 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Csnk1dQ9DC28 Ubp1-206ENSMUST00000216558 1623 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Csnk1dQ9DC28 Rabl2-201ENSMUST00000023294 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Csnk1dQ9DC28 BC024978-204ENSMUST00000179391 1748 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Csnk1dQ9DC28 Ttc39b-202ENSMUST00000048274 1804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Csnk1dQ9DC28 Gm26891-201ENSMUST00000181644 2599 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Csnk1dQ9DC28 Aaed1-202ENSMUST00000220895 2858 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Csnk1dQ9DC28 Gm7222-201ENSMUST00000117512 906 ntBASIC15.69■□□□□ 0.1
Csnk1dQ9DC28 Hbb-bh0-201ENSMUST00000124800 129 ntBASIC15.69■□□□□ 0.1
Csnk1dQ9DC28 A4galt-202ENSMUST00000164614 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Csnk1dQ9DC28 Hrh3-204ENSMUST00000165248 1224 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Csnk1dQ9DC28 Bag2-203ENSMUST00000187602 378 ntTSL 2 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Csnk1dQ9DC28 Syce1l-204ENSMUST00000212269 753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Csnk1dQ9DC28 Prm1-201ENSMUST00000023144 469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Csnk1dQ9DC28 Psmb4-201ENSMUST00000005923 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Csnk1dQ9DC28 Cdh24-201ENSMUST00000067784 3489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Csnk1dQ9DC28 Acaa1b-201ENSMUST00000010795 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Csnk1dQ9DC28 Tle3-211ENSMUST00000161689 2836 ntTSL 2 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Csnk1dQ9DC28 Wdtc1-201ENSMUST00000043305 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Csnk1dQ9DC28 Trim8-201ENSMUST00000026008 3230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Csnk1dQ9DC28 Fhl1-201ENSMUST00000023854 2356 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Csnk1dQ9DC28 Phf1-201ENSMUST00000073724 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Csnk1dQ9DC28 Dtx2-203ENSMUST00000111144 2545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Csnk1dQ9DC28 Esr1-203ENSMUST00000105589 2612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Csnk1dQ9DC28 Ngly1-201ENSMUST00000022310 2935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Csnk1dQ9DC28 Asf1b-201ENSMUST00000005607 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Csnk1dQ9DC28 Pdlim5-212ENSMUST00000200043 1581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Csnk1dQ9DC28 Uhmk1-202ENSMUST00000123399 7775 ntTSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Csnk1dQ9DC28 Pitx2-206ENSMUST00000174623 1493 ntTSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Csnk1dQ9DC28 Gm2308-201ENSMUST00000166539 1004 ntBASIC15.68■□□□□ 0.1
Csnk1dQ9DC28 Urah-204ENSMUST00000185612 716 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Csnk1dQ9DC28 Samd13-205ENSMUST00000197989 591 ntTSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Csnk1dQ9DC28 Urah-207ENSMUST00000211372 688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Csnk1dQ9DC28 Pard6a-204ENSMUST00000212352 1234 ntTSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Csnk1dQ9DC28 Urah-201ENSMUST00000026554 890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Csnk1dQ9DC28 Bpifa3-201ENSMUST00000028984 1107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Csnk1dQ9DC28 Myl12b-201ENSMUST00000038446 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Csnk1dQ9DC28 Malsu1-203ENSMUST00000128616 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Csnk1dQ9DC28 Ctsd-202ENSMUST00000151120 2127 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Csnk1dQ9DC28 Matn1-201ENSMUST00000102576 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Csnk1dQ9DC28 Mex3a-201ENSMUST00000172699 5778 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Csnk1dQ9DC28 Gm7669-201ENSMUST00000210184 1603 ntBASIC15.68■□□□□ 0.1
Csnk1dQ9DC28 4921536K21Rik-201ENSMUST00000020712 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Csnk1dQ9DC28 Iqsec2-202ENSMUST00000112604 5967 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Csnk1dQ9DC28 Rerg-202ENSMUST00000117919 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Csnk1dQ9DC28 Arhgap39-202ENSMUST00000077821 4494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Csnk1dQ9DC28 Scin-201ENSMUST00000002640 2995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Csnk1dQ9DC28 Gjb1-201ENSMUST00000052130 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Csnk1dQ9DC28 Tjp1-202ENSMUST00000102592 7049 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Csnk1dQ9DC28 Spag16-201ENSMUST00000065425 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Csnk1dQ9DC28 Cnih3-201ENSMUST00000027795 2668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Csnk1dQ9DC28 Cmtm4-201ENSMUST00000179802 7734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Csnk1dQ9DC28 Pde4d-208ENSMUST00000120671 2455 ntTSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Csnk1dQ9DC28 Dtx3-204ENSMUST00000130855 1925 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Csnk1dQ9DC28 Dtx3-201ENSMUST00000038217 1944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Csnk1dQ9DC28 Camsap2-203ENSMUST00000192314 4916 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Csnk1dQ9DC28 Mkln1os-202ENSMUST00000144232 964 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Csnk1dQ9DC28 Gm18733-201ENSMUST00000173950 856 ntBASIC15.67■□□□□ 0.1
Csnk1dQ9DC28 Gm6550-201ENSMUST00000187574 993 ntBASIC15.67■□□□□ 0.1
Csnk1dQ9DC28 AC158538.2-201ENSMUST00000225455 906 ntBASIC15.67■□□□□ 0.1
Csnk1dQ9DC28 Tmem52-201ENSMUST00000023920 932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Csnk1dQ9DC28 Izumo1r-201ENSMUST00000034409 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Csnk1dQ9DC28 Idnk-201ENSMUST00000051490 764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Csnk1dQ9DC28 Lce1l-201ENSMUST00000054426 670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Csnk1dQ9DC28 Dusp4-201ENSMUST00000033930 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Csnk1dQ9DC28 Casd1-201ENSMUST00000015333 3961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Csnk1dQ9DC28 Dmgdh-201ENSMUST00000048001 2992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Csnk1dQ9DC28 Ubqln4-201ENSMUST00000008748 3330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Csnk1dQ9DC28 Zmym3-204ENSMUST00000118092 1502 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Csnk1dQ9DC28 Spef1-201ENSMUST00000028801 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Csnk1dQ9DC28 Ptpro-203ENSMUST00000167679 5096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Csnk1dQ9DC28 Smad3-201ENSMUST00000034973 5090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Csnk1dQ9DC28 Slc39a7-201ENSMUST00000025186 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Csnk1dQ9DC28 Dmpk-203ENSMUST00000108474 2591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Csnk1dQ9DC28 Plekha4-207ENSMUST00000211227 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Csnk1dQ9DC28 Derl3-202ENSMUST00000217811 1316 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Csnk1dQ9DC28 Agfg1-208ENSMUST00000190052 2991 ntTSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Csnk1dQ9DC28 Iqcd-201ENSMUST00000069259 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Csnk1dQ9DC28 Myc-202ENSMUST00000159327 2186 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Csnk1dQ9DC28 Fgf15-201ENSMUST00000033389 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Csnk1dQ9DC28 Mta1-203ENSMUST00000109723 2790 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Csnk1dQ9DC28 Mta1-204ENSMUST00000109726 2775 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Csnk1dQ9DC28 Mta1-205ENSMUST00000109727 2789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Csnk1dQ9DC28 Ogfr-201ENSMUST00000029087 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Csnk1dQ9DC28 Tspyl2-201ENSMUST00000044509 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Csnk1dQ9DC28 Pskh1-201ENSMUST00000049699 3255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Csnk1dQ9DC28 Prkcb-201ENSMUST00000064921 2557 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
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