Protein–RNA interactions for Protein: Q9DBE9

Ftsj3, pre-rRNA processing protein FTSJ3, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 838 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ftsj3Q9DBE9 Rhd-201ENSMUST00000030627 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Ftsj3Q9DBE9 Cdipt-201ENSMUST00000032920 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Ftsj3Q9DBE9 Etfrf1-204ENSMUST00000111723 842 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Ftsj3Q9DBE9 Fam107b-203ENSMUST00000115053 688 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Ftsj3Q9DBE9 Gm13431-203ENSMUST00000147012 388 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Ftsj3Q9DBE9 Coa3-201ENSMUST00000017332 886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Ftsj3Q9DBE9 Gm4189-202ENSMUST00000174167 367 ntTSL 3 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Ftsj3Q9DBE9 Gm29456-201ENSMUST00000189894 768 ntTSL 3 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Ftsj3Q9DBE9 AC154757.1-201ENSMUST00000228289 336 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
Ftsj3Q9DBE9 Tsfm-201ENSMUST00000040560 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Ftsj3Q9DBE9 H2-D1-202ENSMUST00000172785 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Ftsj3Q9DBE9 Gm16401-202ENSMUST00000197463 2074 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
Ftsj3Q9DBE9 Slc23a4-205ENSMUST00000201355 2003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Ftsj3Q9DBE9 P2ry1-203ENSMUST00000193943 2203 ntAPPRIS P1 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Ftsj3Q9DBE9 Fam78b-206ENSMUST00000190081 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Ftsj3Q9DBE9 9430097D07Rik-201ENSMUST00000100190 1501 ntAPPRIS P1 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Ftsj3Q9DBE9 Gpr20-201ENSMUST00000064166 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Ftsj3Q9DBE9 Cstf2-201ENSMUST00000033609 4502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Ftsj3Q9DBE9 Yipf2-204ENSMUST00000213809 1883 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Ftsj3Q9DBE9 Dag1-203ENSMUST00000171412 4415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Ftsj3Q9DBE9 Adarb1-202ENSMUST00000098374 6584 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Ftsj3Q9DBE9 1700008O03Rik-201ENSMUST00000107933 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Ftsj3Q9DBE9 Gm12480-201ENSMUST00000129576 774 ntTSL 3 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Ftsj3Q9DBE9 2200002J24Rik-201ENSMUST00000013227 333 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Ftsj3Q9DBE9 Gm9727-201ENSMUST00000161387 555 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
Ftsj3Q9DBE9 Nudt3-209ENSMUST00000176876 465 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Ftsj3Q9DBE9 Hsd3b2-203ENSMUST00000177651 1122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Ftsj3Q9DBE9 Gm6550-201ENSMUST00000187574 993 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
Ftsj3Q9DBE9 Gm45683-201ENSMUST00000210825 1247 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
Ftsj3Q9DBE9 1300002E11Rik-207ENSMUST00000211443 767 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Ftsj3Q9DBE9 Icam4-202ENSMUST00000215077 1028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Ftsj3Q9DBE9 4931406C07Rik-209ENSMUST00000217042 691 ntTSL 3 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Ftsj3Q9DBE9 Cfd-202ENSMUST00000217837 871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Ftsj3Q9DBE9 Wdyhv1-204ENSMUST00000226955 1094 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
Ftsj3Q9DBE9 AC114585.2-202ENSMUST00000228094 426 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
Ftsj3Q9DBE9 Nudt3-202ENSMUST00000062397 558 ntTSL 3 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Ftsj3Q9DBE9 Hbb-bt-201ENSMUST00000098192 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Ftsj3Q9DBE9 Nfkbie-201ENSMUST00000024742 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Ftsj3Q9DBE9 Etl4-208ENSMUST00000114614 5898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Ftsj3Q9DBE9 Atg4c-201ENSMUST00000030279 3178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Ftsj3Q9DBE9 Lhx3-202ENSMUST00000054099 2184 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Ftsj3Q9DBE9 Slc11a1-201ENSMUST00000027368 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Ftsj3Q9DBE9 Gapvd1-202ENSMUST00000102800 8339 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Ftsj3Q9DBE9 Atxn7l3-202ENSMUST00000107132 3706 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Ftsj3Q9DBE9 Tbp-202ENSMUST00000117593 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Ftsj3Q9DBE9 Hivep3-201ENSMUST00000084306 2973 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
Ftsj3Q9DBE9 2010007H06Rik-202ENSMUST00000186025 4934 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Ftsj3Q9DBE9 Lzts2-203ENSMUST00000179108 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Ftsj3Q9DBE9 Isoc2a-201ENSMUST00000125249 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Ftsj3Q9DBE9 Gm21974-201ENSMUST00000126662 2037 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Ftsj3Q9DBE9 Zfyve19-201ENSMUST00000090174 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Ftsj3Q9DBE9 Ppm1d-201ENSMUST00000020835 2899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Ftsj3Q9DBE9 Zufsp-202ENSMUST00000218055 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Ftsj3Q9DBE9 Gfra2-202ENSMUST00000227633 1480 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
Ftsj3Q9DBE9 Tnfrsf25-202ENSMUST00000035275 1603 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Ftsj3Q9DBE9 Ddhd1-203ENSMUST00000111828 9802 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Ftsj3Q9DBE9 Ccl27a-202ENSMUST00000108032 350 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Ftsj3Q9DBE9 Tmsb4x-202ENSMUST00000112175 864 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Ftsj3Q9DBE9 Crybb1-202ENSMUST00000112375 793 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Ftsj3Q9DBE9 Gssos1-201ENSMUST00000142509 716 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Ftsj3Q9DBE9 Gm7616-201ENSMUST00000143112 624 ntTSL 3 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Ftsj3Q9DBE9 Gm16838-201ENSMUST00000144594 816 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Ftsj3Q9DBE9 Ankrd65-202ENSMUST00000165000 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Ftsj3Q9DBE9 Gm10576-201ENSMUST00000191927 825 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
Ftsj3Q9DBE9 Apof-201ENSMUST00000050901 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Ftsj3Q9DBE9 Fmr1nb-201ENSMUST00000069731 799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Ftsj3Q9DBE9 Hist1h1c-201ENSMUST00000040914 1560 ntAPPRIS P1 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Ftsj3Q9DBE9 Fbxo31-201ENSMUST00000059018 4358 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Ftsj3Q9DBE9 Vps53-203ENSMUST00000108419 2209 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Ftsj3Q9DBE9 Nmur1-203ENSMUST00000212541 1534 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Ftsj3Q9DBE9 Hectd3-201ENSMUST00000050067 4583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Ftsj3Q9DBE9 C77080-201ENSMUST00000052602 5187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Ftsj3Q9DBE9 Tmx1-201ENSMUST00000021471 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Ftsj3Q9DBE9 Jam2-201ENSMUST00000098407 1998 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Ftsj3Q9DBE9 Ostf1-201ENSMUST00000025631 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Ftsj3Q9DBE9 Plekhh3-206ENSMUST00000164474 3010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Ftsj3Q9DBE9 Sigirr-203ENSMUST00000209294 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Ftsj3Q9DBE9 Bag4-201ENSMUST00000038498 4876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Ftsj3Q9DBE9 Rassf1-204ENSMUST00000122225 1783 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Ftsj3Q9DBE9 Rassf1-202ENSMUST00000093786 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Ftsj3Q9DBE9 Cand2-201ENSMUST00000075995 5474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Ftsj3Q9DBE9 E530001F21Rik-201ENSMUST00000120991 730 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
Ftsj3Q9DBE9 Gatad2a-203ENSMUST00000177851 5007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Ftsj3Q9DBE9 Sfrp2-201ENSMUST00000029625 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Ftsj3Q9DBE9 Msmo1-201ENSMUST00000034015 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Ftsj3Q9DBE9 Igflr1-201ENSMUST00000043850 1186 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Ftsj3Q9DBE9 Map1s-201ENSMUST00000019405 3314 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Ftsj3Q9DBE9 Evx1-201ENSMUST00000031787 2877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Ftsj3Q9DBE9 Slc16a7-205ENSMUST00000210780 2562 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.47
Ftsj3Q9DBE9 Nkpd1-201ENSMUST00000078908 2753 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Ftsj3Q9DBE9 Zmynd15-203ENSMUST00000108563 2649 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Ftsj3Q9DBE9 A130014A01Rik-201ENSMUST00000183021 2323 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
Ftsj3Q9DBE9 Tm4sf4-201ENSMUST00000029377 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Ftsj3Q9DBE9 Arhgef16-201ENSMUST00000030898 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Ftsj3Q9DBE9 Arntl-204ENSMUST00000210238 2976 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Ftsj3Q9DBE9 Apba3-211ENSMUST00000220297 2268 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Ftsj3Q9DBE9 Gm13830-202ENSMUST00000144202 381 ntTSL 3 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Ftsj3Q9DBE9 Gm37584-201ENSMUST00000193595 1290 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
Ftsj3Q9DBE9 AL731706.1-201ENSMUST00000227806 944 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Ftsj3Q9DBE9 Sod1-201ENSMUST00000023707 646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.5 ms