Protein–RNA interactions for Protein: Q9DB70

Fundc1, FUN14 domain-containing protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 155 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fundc1Q9DB70 Gnb2-203ENSMUST00000111023 1471 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Fundc1Q9DB70 4932702P03Rik-201ENSMUST00000138447 1482 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Fundc1Q9DB70 Gm15939-201ENSMUST00000160756 2147 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Fundc1Q9DB70 Efcab14-204ENSMUST00000106525 2792 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Fundc1Q9DB70 Lcn12-202ENSMUST00000114245 619 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Fundc1Q9DB70 Gm11950-201ENSMUST00000121615 838 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
Fundc1Q9DB70 Flg-207ENSMUST00000180293 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Fundc1Q9DB70 Gm7507-201ENSMUST00000183053 1008 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
Fundc1Q9DB70 Gm29518-201ENSMUST00000190858 372 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
Fundc1Q9DB70 Erlec1-201ENSMUST00000073192 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Fundc1Q9DB70 Disc1-205ENSMUST00000117658 2671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Fundc1Q9DB70 Pak1ip1-201ENSMUST00000046951 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Fundc1Q9DB70 Mmp17-201ENSMUST00000031390 6422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Fundc1Q9DB70 Rpl5-201ENSMUST00000082223 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Fundc1Q9DB70 Srcin1-203ENSMUST00000107596 7054 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Fundc1Q9DB70 Rflnb-201ENSMUST00000021207 3512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Fundc1Q9DB70 Arrb2-203ENSMUST00000102563 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Fundc1Q9DB70 Ddx39-201ENSMUST00000019576 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Fundc1Q9DB70 Gna15-201ENSMUST00000043709 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Fundc1Q9DB70 Itga5-201ENSMUST00000023128 4382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Fundc1Q9DB70 Cep57-201ENSMUST00000034398 2523 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Fundc1Q9DB70 Svip-201ENSMUST00000098414 3053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Fundc1Q9DB70 Spire2-202ENSMUST00000212404 2158 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Fundc1Q9DB70 Coro1c-201ENSMUST00000004646 3491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Fundc1Q9DB70 Pqlc3-208ENSMUST00000222203 1706 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Fundc1Q9DB70 Ccdc115-201ENSMUST00000042493 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Fundc1Q9DB70 Tm6sf2-202ENSMUST00000110160 1446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Fundc1Q9DB70 Unc5a-201ENSMUST00000026994 3995 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Fundc1Q9DB70 Spint2-202ENSMUST00000108236 1211 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Fundc1Q9DB70 Fbxo9-203ENSMUST00000159099 1201 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Fundc1Q9DB70 Hint3-203ENSMUST00000161074 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Fundc1Q9DB70 Gm6257-201ENSMUST00000163864 910 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
Fundc1Q9DB70 AC130713.1-201ENSMUST00000228853 1096 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
Fundc1Q9DB70 Mrpl28-201ENSMUST00000025014 1048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Fundc1Q9DB70 Hint2-201ENSMUST00000030192 610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Fundc1Q9DB70 Hist1h2ab-201ENSMUST00000078369 473 ntAPPRIS P1 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Fundc1Q9DB70 Rab10-201ENSMUST00000021001 3513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Fundc1Q9DB70 Psmd8-203ENSMUST00000186182 1512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Fundc1Q9DB70 Pdhb-201ENSMUST00000022268 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Fundc1Q9DB70 Foxp4-202ENSMUST00000113262 3198 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Fundc1Q9DB70 Zfp691-201ENSMUST00000052715 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Fundc1Q9DB70 Ppp6r2-208ENSMUST00000228284 3297 ntAPPRIS P1 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Fundc1Q9DB70 Rassf3-201ENSMUST00000026902 3522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Fundc1Q9DB70 Eif2b1-201ENSMUST00000031334 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Fundc1Q9DB70 Mdp1-201ENSMUST00000002400 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Fundc1Q9DB70 Gm14029-201ENSMUST00000151051 1348 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Fundc1Q9DB70 Fam159b-201ENSMUST00000043061 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Fundc1Q9DB70 Sik2-201ENSMUST00000041375 3552 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Fundc1Q9DB70 Efemp2-204ENSMUST00000165485 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Fundc1Q9DB70 Ppp1r11-201ENSMUST00000040402 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Fundc1Q9DB70 Zfp821-203ENSMUST00000212000 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Fundc1Q9DB70 Pla2g16-203ENSMUST00000136756 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Fundc1Q9DB70 Dcaf17-201ENSMUST00000064141 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Fundc1Q9DB70 Shroom1-204ENSMUST00000109013 3312 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Fundc1Q9DB70 Zscan10-204ENSMUST00000118369 1006 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Fundc1Q9DB70 Zfp629-206ENSMUST00000132524 215 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Fundc1Q9DB70 Eloc-203ENSMUST00000185771 742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Fundc1Q9DB70 Gm17808-201ENSMUST00000200859 894 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
Fundc1Q9DB70 Ppt1-202ENSMUST00000097902 1191 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Fundc1Q9DB70 Arrb1-210ENSMUST00000179755 7135 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Fundc1Q9DB70 Arrb1-202ENSMUST00000098266 7132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Fundc1Q9DB70 Pkp2-201ENSMUST00000039408 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Fundc1Q9DB70 4933427J07Rik-201ENSMUST00000156275 1533 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Fundc1Q9DB70 Coq6-202ENSMUST00000110276 1776 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Fundc1Q9DB70 1700066M21Rik-201ENSMUST00000042734 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Fundc1Q9DB70 Klhl26-204ENSMUST00000209567 2615 ntTSL 3 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Fundc1Q9DB70 Gm31774-201ENSMUST00000212910 1366 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Fundc1Q9DB70 Ilvbl-204ENSMUST00000218271 1606 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Fundc1Q9DB70 AL691505.1-201ENSMUST00000219965 1618 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Fundc1Q9DB70 Elmo2-203ENSMUST00000094329 3466 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Fundc1Q9DB70 Mri1-203ENSMUST00000126435 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Fundc1Q9DB70 Hhat-201ENSMUST00000044190 2839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Fundc1Q9DB70 Plscr3-202ENSMUST00000108632 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Fundc1Q9DB70 Ptpa-203ENSMUST00000113603 2169 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Fundc1Q9DB70 Crem-239ENSMUST00000165086 2778 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Fundc1Q9DB70 Gm2694-204ENSMUST00000181898 1303 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Fundc1Q9DB70 Max-202ENSMUST00000110395 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Fundc1Q9DB70 Gm45351-201ENSMUST00000210683 2545 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Fundc1Q9DB70 Ralb-201ENSMUST00000004565 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Fundc1Q9DB70 Arrdc1-201ENSMUST00000028349 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Fundc1Q9DB70 Samd4-204ENSMUST00000125688 1773 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Fundc1Q9DB70 Zfp109-203ENSMUST00000206960 2130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Fundc1Q9DB70 Cacna1b-202ENSMUST00000070864 9655 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Fundc1Q9DB70 Ripk3-203ENSMUST00000178399 1865 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Fundc1Q9DB70 Tbc1d10b-201ENSMUST00000120705 3614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Fundc1Q9DB70 Impdh1-205ENSMUST00000160878 2314 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Fundc1Q9DB70 Gm16075-201ENSMUST00000135873 361 ntTSL 3 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Fundc1Q9DB70 Pthlh-202ENSMUST00000204197 1281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Fundc1Q9DB70 Gm45328-201ENSMUST00000210942 917 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
Fundc1Q9DB70 Mrpl36-202ENSMUST00000221730 717 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Fundc1Q9DB70 Snx12-201ENSMUST00000077876 1002 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Fundc1Q9DB70 Rplp2-201ENSMUST00000084434 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Fundc1Q9DB70 Kmt5c-202ENSMUST00000108582 2774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Fundc1Q9DB70 Cep55-203ENSMUST00000169673 2761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Fundc1Q9DB70 D1Pas1-201ENSMUST00000045108 3212 ntAPPRIS P1 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Fundc1Q9DB70 Cacna1a-202ENSMUST00000122053 7589 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Fundc1Q9DB70 Rab34-201ENSMUST00000002128 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Fundc1Q9DB70 Adgrb2-204ENSMUST00000106015 4982 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Fundc1Q9DB70 Prkab1-202ENSMUST00000111999 2026 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.18
Fundc1Q9DB70 Hpca-203ENSMUST00000116442 1568 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.21■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.9 ms