Protein–RNA interactions for Protein: Q9DAW9

Cnn3, Calponin-3, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 330 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cnn3Q9DAW9 Hist1h2ab-201ENSMUST00000078369 473 ntAPPRIS P1 BASIC12.76□□□□□ -0.37
Cnn3Q9DAW9 Arpc1b-211ENSMUST00000196111 1394 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Cnn3Q9DAW9 Slit1-203ENSMUST00000169141 5673 ntTSL 5 BASIC12.76□□□□□ -0.37
Cnn3Q9DAW9 Mark2-209ENSMUST00000165965 2874 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Cnn3Q9DAW9 Elavl3-201ENSMUST00000003501 5014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Cnn3Q9DAW9 Cend1-202ENSMUST00000124444 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Cnn3Q9DAW9 Irf2bpl-201ENSMUST00000038422 4098 ntAPPRIS P1 BASIC12.76□□□□□ -0.37
Cnn3Q9DAW9 Tpm2-202ENSMUST00000107913 2098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Cnn3Q9DAW9 Hap1-201ENSMUST00000103124 2120 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Cnn3Q9DAW9 Zufsp-202ENSMUST00000218055 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Cnn3Q9DAW9 Spef1-201ENSMUST00000028801 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Cnn3Q9DAW9 Btbd10-203ENSMUST00000119278 2394 ntTSL 5 BASIC12.76□□□□□ -0.37
Cnn3Q9DAW9 Tmx1-201ENSMUST00000021471 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Cnn3Q9DAW9 Hdac2-202ENSMUST00000105510 3250 ntTSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Cnn3Q9DAW9 Asic2-201ENSMUST00000021045 3436 ntTSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Cnn3Q9DAW9 Tsacc-202ENSMUST00000107556 584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Cnn3Q9DAW9 Mdm1-204ENSMUST00000169817 2022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Cnn3Q9DAW9 Rfesd-203ENSMUST00000179078 1436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Cnn3Q9DAW9 Gm26752-201ENSMUST00000181086 1537 ntTSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Cnn3Q9DAW9 Washc3-203ENSMUST00000182183 838 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.75□□□□□ -0.37
Cnn3Q9DAW9 Gm5864-201ENSMUST00000202263 970 ntBASIC12.75□□□□□ -0.37
Cnn3Q9DAW9 Sh2b1-203ENSMUST00000205440 3089 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Cnn3Q9DAW9 Zfp524-203ENSMUST00000209030 1128 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.75□□□□□ -0.37
Cnn3Q9DAW9 Gpaa1-201ENSMUST00000023221 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Cnn3Q9DAW9 Slc39a7-201ENSMUST00000025186 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Cnn3Q9DAW9 Nipal2-201ENSMUST00000040791 4331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Cnn3Q9DAW9 Gpank1-201ENSMUST00000052167 1295 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Cnn3Q9DAW9 Epm2a-201ENSMUST00000069106 3287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Cnn3Q9DAW9 Dupd1-201ENSMUST00000073870 1138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Cnn3Q9DAW9 Efr3b-201ENSMUST00000111178 6547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Cnn3Q9DAW9 Slc4a4-207ENSMUST00000148750 7931 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.75□□□□□ -0.37
Cnn3Q9DAW9 Syt12-201ENSMUST00000059295 3581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Cnn3Q9DAW9 Fcho1-209ENSMUST00000146100 3188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Cnn3Q9DAW9 Mepce-201ENSMUST00000031740 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Cnn3Q9DAW9 Insr-201ENSMUST00000091291 9355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Cnn3Q9DAW9 Kcnq2-201ENSMUST00000016491 3067 ntTSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Cnn3Q9DAW9 Cap1-202ENSMUST00000106255 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Cnn3Q9DAW9 Itgav-202ENSMUST00000111740 6788 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.74□□□□□ -0.37
Cnn3Q9DAW9 Mybl2-201ENSMUST00000018005 3651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Cnn3Q9DAW9 Slain1-201ENSMUST00000069443 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Cnn3Q9DAW9 Gm32996-201ENSMUST00000199828 1447 ntBASIC12.74□□□□□ -0.37
Cnn3Q9DAW9 D10Jhu81e-201ENSMUST00000001242 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Cnn3Q9DAW9 Drap1-202ENSMUST00000113673 744 ntTSL 2 BASIC12.74□□□□□ -0.37
Cnn3Q9DAW9 Gm13216-201ENSMUST00000117145 591 ntBASIC12.74□□□□□ -0.37
Cnn3Q9DAW9 Kxd1-202ENSMUST00000117580 696 ntTSL 5 BASIC12.74□□□□□ -0.37
Cnn3Q9DAW9 Gm26661-201ENSMUST00000181025 471 ntAPPRIS P1 BASIC12.74□□□□□ -0.37
Cnn3Q9DAW9 Gm7507-201ENSMUST00000183053 1008 ntBASIC12.74□□□□□ -0.37
Cnn3Q9DAW9 1810026B05Rik-205ENSMUST00000184855 409 ntTSL 3 BASIC12.74□□□□□ -0.37
Cnn3Q9DAW9 AC164629.2-201ENSMUST00000217916 270 ntBASIC12.74□□□□□ -0.37
Cnn3Q9DAW9 AC133183.1-201ENSMUST00000221229 429 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.74□□□□□ -0.37
Cnn3Q9DAW9 AC127349.1-201ENSMUST00000224590 266 ntBASIC12.74□□□□□ -0.37
Cnn3Q9DAW9 Mzt1-203ENSMUST00000227948 952 ntBASIC12.74□□□□□ -0.37
Cnn3Q9DAW9 Psmg3-201ENSMUST00000031531 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Cnn3Q9DAW9 Lurap1-201ENSMUST00000030469 5742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Cnn3Q9DAW9 Pdk3-201ENSMUST00000045748 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Cnn3Q9DAW9 Bloc1s3-201ENSMUST00000077408 3188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Cnn3Q9DAW9 Tbp-201ENSMUST00000014911 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Cnn3Q9DAW9 Taz-201ENSMUST00000069722 1851 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Cnn3Q9DAW9 Adamtsl1-201ENSMUST00000048885 1842 ntTSL 5 BASIC12.74□□□□□ -0.37
Cnn3Q9DAW9 Itgb7-201ENSMUST00000001327 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Cnn3Q9DAW9 Ankra2-201ENSMUST00000022164 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Cnn3Q9DAW9 Wwc2-201ENSMUST00000057561 8678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Cnn3Q9DAW9 1700066B19Rik-201ENSMUST00000097617 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Cnn3Q9DAW9 BC037032-204ENSMUST00000155191 3291 ntTSL 5 BASIC12.73□□□□□ -0.37
Cnn3Q9DAW9 Pbx4-201ENSMUST00000081503 1560 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.73□□□□□ -0.37
Cnn3Q9DAW9 Ndufs2-202ENSMUST00000111318 1545 ntTSL 5 BASIC12.73□□□□□ -0.37
Cnn3Q9DAW9 Zbtb45-201ENSMUST00000051390 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Cnn3Q9DAW9 Gm2694-204ENSMUST00000181898 1303 ntTSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Cnn3Q9DAW9 AK157302-201ENSMUST00000104942 1924 ntAPPRIS P1 BASIC12.73□□□□□ -0.37
Cnn3Q9DAW9 Bhlhe41-202ENSMUST00000111703 744 ntTSL 3 BASIC12.73□□□□□ -0.37
Cnn3Q9DAW9 Crybb1-202ENSMUST00000112375 793 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.73□□□□□ -0.37
Cnn3Q9DAW9 Gm12536-201ENSMUST00000129102 358 ntTSL 2 BASIC12.73□□□□□ -0.37
Cnn3Q9DAW9 Gm1818-201ENSMUST00000169406 1184 ntBASIC12.73□□□□□ -0.37
Cnn3Q9DAW9 9530052E02Rik-201ENSMUST00000180750 949 ntTSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Cnn3Q9DAW9 Gm42456-201ENSMUST00000196840 387 ntTSL 3 BASIC12.73□□□□□ -0.37
Cnn3Q9DAW9 Ten1-201ENSMUST00000021130 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Cnn3Q9DAW9 Icam4-202ENSMUST00000215077 1028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Cnn3Q9DAW9 Zfyve21-204ENSMUST00000221375 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Cnn3Q9DAW9 Il17b-201ENSMUST00000025471 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Cnn3Q9DAW9 Sphk1-202ENSMUST00000063446 2527 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.73□□□□□ -0.37
Cnn3Q9DAW9 Cd151-202ENSMUST00000106000 1865 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.73□□□□□ -0.37
Cnn3Q9DAW9 Phkg2-202ENSMUST00000121004 1840 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.73□□□□□ -0.37
Cnn3Q9DAW9 Fam208b-201ENSMUST00000096069 8338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Cnn3Q9DAW9 Olah-203ENSMUST00000194918 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Cnn3Q9DAW9 Gpsm1-202ENSMUST00000066936 3384 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Cnn3Q9DAW9 Mettl21a-201ENSMUST00000053469 2666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Cnn3Q9DAW9 Tbl1x-201ENSMUST00000088217 5234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Cnn3Q9DAW9 Cdk17-201ENSMUST00000069965 3615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Cnn3Q9DAW9 Ggnbp1-201ENSMUST00000053683 1525 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Cnn3Q9DAW9 Dnase2a-202ENSMUST00000109744 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Cnn3Q9DAW9 Gm9821-201ENSMUST00000178895 1953 ntAPPRIS P1 BASIC12.72□□□□□ -0.37
Cnn3Q9DAW9 Actg1-202ENSMUST00000071555 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Cnn3Q9DAW9 Igsf11-201ENSMUST00000023478 3443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Cnn3Q9DAW9 Rab6a-201ENSMUST00000032946 3214 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Cnn3Q9DAW9 Ankle2-206ENSMUST00000197188 4077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Cnn3Q9DAW9 App-202ENSMUST00000226232 3120 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.72□□□□□ -0.37
Cnn3Q9DAW9 Usp43-202ENSMUST00000108677 4447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Cnn3Q9DAW9 Sec24a-204ENSMUST00000109097 6581 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Cnn3Q9DAW9 Gm10516-201ENSMUST00000180598 2615 ntTSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Cnn3Q9DAW9 Speg-202ENSMUST00000113587 1254 ntTSL 5 BASIC12.72□□□□□ -0.37
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.4 ms