Protein–RNA interactions for Protein: Q9DA08

Sgf29, SAGA-associated factor 29, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 293 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sgf29Q9DA08 App-201ENSMUST00000005406 3176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Sgf29Q9DA08 Mff-212ENSMUST00000162003 2087 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Sgf29Q9DA08 Tmed9-201ENSMUST00000109905 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Sgf29Q9DA08 Serpine2-201ENSMUST00000027467 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Sgf29Q9DA08 Shisa7-201ENSMUST00000066041 6006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Sgf29Q9DA08 Zkscan3-203ENSMUST00000116434 2600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Sgf29Q9DA08 Wdr91-201ENSMUST00000081214 2682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Sgf29Q9DA08 Syngr3-201ENSMUST00000007236 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Sgf29Q9DA08 Fam221a-201ENSMUST00000060561 2730 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Sgf29Q9DA08 Crybb1-202ENSMUST00000112375 793 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Sgf29Q9DA08 Platr15-201ENSMUST00000147128 768 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Sgf29Q9DA08 Stard3nl-208ENSMUST00000200323 1128 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Sgf29Q9DA08 Gm44264-201ENSMUST00000203049 742 ntTSL 3 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Sgf29Q9DA08 Nagpa-201ENSMUST00000023911 2143 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Sgf29Q9DA08 Mios-201ENSMUST00000040017 3710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Sgf29Q9DA08 Ext2-201ENSMUST00000028623 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Sgf29Q9DA08 1700034J05Rik-202ENSMUST00000111622 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Sgf29Q9DA08 Gm26889-201ENSMUST00000181523 2252 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Sgf29Q9DA08 Pofut2-201ENSMUST00000020493 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Sgf29Q9DA08 Rfesd-203ENSMUST00000179078 1436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Sgf29Q9DA08 Robo3-202ENSMUST00000115038 4797 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Sgf29Q9DA08 Sirt6-202ENSMUST00000119324 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Sgf29Q9DA08 Nfkbie-201ENSMUST00000024742 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Sgf29Q9DA08 Ptpa-201ENSMUST00000042055 2586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Sgf29Q9DA08 Il3ra-203ENSMUST00000224163 2315 ntAPPRIS P2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Sgf29Q9DA08 Nrip1-201ENSMUST00000054178 4529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Sgf29Q9DA08 Dag1-203ENSMUST00000171412 4415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Sgf29Q9DA08 Sgsm2-201ENSMUST00000057631 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Sgf29Q9DA08 Dvl2-207ENSMUST00000190940 5037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Sgf29Q9DA08 Rabep1-201ENSMUST00000076270 5408 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Sgf29Q9DA08 Bcor-203ENSMUST00000115512 6887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Sgf29Q9DA08 D10Jhu81e-201ENSMUST00000001242 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Sgf29Q9DA08 Cyp2w1-201ENSMUST00000031521 1512 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Sgf29Q9DA08 Gm10564-201ENSMUST00000097750 3113 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Sgf29Q9DA08 Il7-203ENSMUST00000192202 2057 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Sgf29Q9DA08 Hnrnpa1l2-ps-201ENSMUST00000129154 964 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
Sgf29Q9DA08 Scpep1os-201ENSMUST00000139592 811 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Sgf29Q9DA08 Tmem208-201ENSMUST00000015000 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Sgf29Q9DA08 Gm7461-201ENSMUST00000058918 827 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
Sgf29Q9DA08 Slc48a1-201ENSMUST00000117892 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Sgf29Q9DA08 Pten-201ENSMUST00000013807 8292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Sgf29Q9DA08 Lgr6-202ENSMUST00000137968 2820 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Sgf29Q9DA08 Cacna1h-205ENSMUST00000159610 8230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Sgf29Q9DA08 Cacna1h-201ENSMUST00000078496 8220 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Sgf29Q9DA08 Gm45470-202ENSMUST00000210817 2192 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Sgf29Q9DA08 Nap1l1-201ENSMUST00000065917 1486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Sgf29Q9DA08 Foxp4-202ENSMUST00000113262 3198 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Sgf29Q9DA08 Cdc23-201ENSMUST00000025228 2084 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Sgf29Q9DA08 Sept8-201ENSMUST00000108987 4436 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Sgf29Q9DA08 Inhba-202ENSMUST00000164993 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Sgf29Q9DA08 Ccdc51-201ENSMUST00000026735 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Sgf29Q9DA08 Hs3st1-201ENSMUST00000053116 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Sgf29Q9DA08 Mansc4-201ENSMUST00000100780 1125 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Sgf29Q9DA08 Scml4-203ENSMUST00000105495 1033 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Sgf29Q9DA08 Oraov1-203ENSMUST00000105895 1016 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Sgf29Q9DA08 Btn1a1-202ENSMUST00000110434 1077 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Sgf29Q9DA08 Nrn1l-202ENSMUST00000118920 603 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Sgf29Q9DA08 Spock3-204ENSMUST00000119068 3201 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Sgf29Q9DA08 Gm17200-201ENSMUST00000170214 2022 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Sgf29Q9DA08 Gm8349-201ENSMUST00000182720 1003 ntBASIC16.66■□□□□ 0.26
Sgf29Q9DA08 Gm42456-201ENSMUST00000196840 387 ntTSL 3 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Sgf29Q9DA08 Ten1-201ENSMUST00000021130 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Sgf29Q9DA08 Gdf5-201ENSMUST00000040162 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Sgf29Q9DA08 Entpd7-201ENSMUST00000081079 5911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Sgf29Q9DA08 Olfr632-201ENSMUST00000098189 954 ntAPPRIS P1 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Sgf29Q9DA08 Zkscan3-204ENSMUST00000117721 5788 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Sgf29Q9DA08 Agrn-206ENSMUST00000180572 6891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Sgf29Q9DA08 Ttl-201ENSMUST00000035812 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Sgf29Q9DA08 Kat2a-202ENSMUST00000103118 3046 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Sgf29Q9DA08 Kctd12-202ENSMUST00000184744 6057 ntAPPRIS P1 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Sgf29Q9DA08 Sctr-202ENSMUST00000189037 1819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Sgf29Q9DA08 Wee1-201ENSMUST00000033326 3419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Sgf29Q9DA08 Sil1-201ENSMUST00000025215 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Sgf29Q9DA08 Gm40773-201ENSMUST00000218113 1502 ntTSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Sgf29Q9DA08 Psmd8-201ENSMUST00000059642 1540 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Sgf29Q9DA08 D430001F17Rik-201ENSMUST00000141344 1858 ntTSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Sgf29Q9DA08 Wipi2-201ENSMUST00000036872 5171 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Sgf29Q9DA08 Kifc3-203ENSMUST00000169748 3384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Sgf29Q9DA08 Camk2d-221ENSMUST00000171289 2217 ntTSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Sgf29Q9DA08 Tnfaip2-202ENSMUST00000109792 3284 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Sgf29Q9DA08 Thap3-202ENSMUST00000105665 832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Sgf29Q9DA08 Taf5l-202ENSMUST00000165628 2973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Sgf29Q9DA08 Urgcp-206ENSMUST00000170116 5528 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Sgf29Q9DA08 Gm5864-201ENSMUST00000202263 970 ntBASIC16.65■□□□□ 0.26
Sgf29Q9DA08 Gm7506-201ENSMUST00000207758 815 ntBASIC16.65■□□□□ 0.26
Sgf29Q9DA08 AC159301.1-201ENSMUST00000225130 1182 ntBASIC16.65■□□□□ 0.26
Sgf29Q9DA08 Prdx6-201ENSMUST00000051925 959 ntTSL 2 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Sgf29Q9DA08 Gm10190-201ENSMUST00000086549 324 ntAPPRIS P1 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Sgf29Q9DA08 Rptor-201ENSMUST00000026671 6594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Sgf29Q9DA08 Ubb-201ENSMUST00000019649 1499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Sgf29Q9DA08 Fkbp14-202ENSMUST00000117375 1830 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Sgf29Q9DA08 Wscd1-203ENSMUST00000108511 2866 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Sgf29Q9DA08 Atp8b2-210ENSMUST00000168276 4265 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Sgf29Q9DA08 Sbk2-202ENSMUST00000182214 2236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Sgf29Q9DA08 Sept11-205ENSMUST00000201700 3478 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Sgf29Q9DA08 Ccdc154-201ENSMUST00000073277 2417 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Sgf29Q9DA08 Gstm4-201ENSMUST00000029489 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Sgf29Q9DA08 Slc22a16-202ENSMUST00000078314 2269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Sgf29Q9DA08 Rnf168-203ENSMUST00000171474 4460 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.26
Sgf29Q9DA08 Knl1-201ENSMUST00000028799 5527 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.1 ms