Protein–RNA interactions for Protein: Q9D9M4

Pdzd9, PDZ domain-containing protein 9, mousemouse

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Length 266 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pdzd9Q9D9M4 9130204K15Rik-201ENSMUST00000131441 867 ntTSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.8
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Pdzd9Q9D9M4 Gm45612-201ENSMUST00000211320 160 ntBASIC20.02■□□□□ 0.8
Pdzd9Q9D9M4 Gm18246-201ENSMUST00000221023 728 ntBASIC20.02■□□□□ 0.8
Pdzd9Q9D9M4 Galnt6os-201ENSMUST00000160960 1389 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Pdzd9Q9D9M4 Aldh1a3-203ENSMUST00000174209 1496 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Pdzd9Q9D9M4 Asf1b-201ENSMUST00000005607 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
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Pdzd9Q9D9M4 Kctd6-202ENSMUST00000170111 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Pdzd9Q9D9M4 Fam83f-201ENSMUST00000023044 2988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Pdzd9Q9D9M4 Sf1-203ENSMUST00000113488 2282 ntTSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
Pdzd9Q9D9M4 Ankrd10-201ENSMUST00000033905 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Pdzd9Q9D9M4 Glrx2-210ENSMUST00000185362 3337 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
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Pdzd9Q9D9M4 Chchd10-201ENSMUST00000058906 939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
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Pdzd9Q9D9M4 Gapdh-201ENSMUST00000073605 1272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
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Pdzd9Q9D9M4 Zcchc4-203ENSMUST00000113904 2485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
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Pdzd9Q9D9M4 Vim-201ENSMUST00000028062 2193 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
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Pdzd9Q9D9M4 Afg1l-201ENSMUST00000041024 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Pdzd9Q9D9M4 Reep4-201ENSMUST00000047218 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
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Pdzd9Q9D9M4 Dok1-201ENSMUST00000089651 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
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Pdzd9Q9D9M4 Timm13-203ENSMUST00000218481 471 ntTSL 3 BASIC19.98■□□□□ 0.79
Pdzd9Q9D9M4 Calcb-201ENSMUST00000032902 962 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Pdzd9Q9D9M4 Cfdp1-201ENSMUST00000034432 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Pdzd9Q9D9M4 Lce1f-201ENSMUST00000047153 728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Pdzd9Q9D9M4 Gm9789-201ENSMUST00000062524 397 ntAPPRIS P1 BASIC19.98■□□□□ 0.79
Pdzd9Q9D9M4 Klk15-201ENSMUST00000068625 845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Pdzd9Q9D9M4 H2-K1-202ENSMUST00000087189 579 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Pdzd9Q9D9M4 9530018F02Rik-201ENSMUST00000219513 2599 ntBASIC19.98■□□□□ 0.79
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Pdzd9Q9D9M4 Dhodh-201ENSMUST00000123605 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Pdzd9Q9D9M4 Rcc1-203ENSMUST00000105951 2326 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
Pdzd9Q9D9M4 Tmub1-201ENSMUST00000030799 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Pdzd9Q9D9M4 Ate1-203ENSMUST00000094017 1938 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Pdzd9Q9D9M4 Disc1-206ENSMUST00000118942 2860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Pdzd9Q9D9M4 Ptgfrn-201ENSMUST00000102694 5902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Pdzd9Q9D9M4 B4galt3-201ENSMUST00000064272 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
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