Protein–RNA interactions for Protein: Q9D9M2

Usp12, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 12, mousemouse

Predictions only

Length 370 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp12Q9D9M2 4930442P19Rik-201ENSMUST00000193163 1240 ntBASIC15.66■□□□□ 0.1
Usp12Q9D9M2 Gm6296-201ENSMUST00000222599 943 ntBASIC15.66■□□□□ 0.1
Usp12Q9D9M2 Fcnb-201ENSMUST00000028179 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Usp12Q9D9M2 Phax-201ENSMUST00000008445 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Usp12Q9D9M2 Hpca-203ENSMUST00000116442 1568 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Usp12Q9D9M2 Gm26568-201ENSMUST00000180496 1594 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Usp12Q9D9M2 Ofd1-201ENSMUST00000049501 4453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Usp12Q9D9M2 Nubpl-201ENSMUST00000040090 2987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Usp12Q9D9M2 Plekha8-202ENSMUST00000119706 6739 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Usp12Q9D9M2 Grb7-201ENSMUST00000019456 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Usp12Q9D9M2 Zfx-204ENSMUST00000113927 6933 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Usp12Q9D9M2 Pus1-204ENSMUST00000112426 1389 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Usp12Q9D9M2 Gm26891-201ENSMUST00000181644 2599 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Usp12Q9D9M2 Myef2-201ENSMUST00000067780 2999 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Usp12Q9D9M2 Pi4k2a-201ENSMUST00000066778 3771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Usp12Q9D9M2 Shox2-202ENSMUST00000162060 1537 ntTSL 3 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Usp12Q9D9M2 AK157302-201ENSMUST00000104942 1924 ntAPPRIS P1 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Usp12Q9D9M2 Rcc1-203ENSMUST00000105951 2326 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Usp12Q9D9M2 Rgs6-206ENSMUST00000186309 1693 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Usp12Q9D9M2 Trmt112-ps2-201ENSMUST00000117987 378 ntBASIC15.65■□□□□ 0.1
Usp12Q9D9M2 Gm1401-201ENSMUST00000122048 772 ntBASIC15.65■□□□□ 0.1
Usp12Q9D9M2 Atp6v1g2-203ENSMUST00000130992 524 ntTSL 2 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Usp12Q9D9M2 Mir5131-201ENSMUST00000175426 93 ntBASIC15.65■□□□□ 0.1
Usp12Q9D9M2 4930477E14Rik-201ENSMUST00000181412 621 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Usp12Q9D9M2 Gnal-201ENSMUST00000025402 5616 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Usp12Q9D9M2 Cops6-201ENSMUST00000019638 1787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.1
Usp12Q9D9M2 Aurka-202ENSMUST00000109139 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Usp12Q9D9M2 Aurka-201ENSMUST00000028997 1905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Usp12Q9D9M2 Tef-201ENSMUST00000023024 4079 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Usp12Q9D9M2 Poli-203ENSMUST00000159389 2662 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Usp12Q9D9M2 Cbl-204ENSMUST00000205968 2809 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Usp12Q9D9M2 Naa35-201ENSMUST00000022038 3793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Usp12Q9D9M2 Gm15165-201ENSMUST00000118140 502 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
Usp12Q9D9M2 Cdk9-202ENSMUST00000120105 1565 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Usp12Q9D9M2 Gm13830-201ENSMUST00000124378 417 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Usp12Q9D9M2 Rps27l-203ENSMUST00000127896 575 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Usp12Q9D9M2 Mfap2-203ENSMUST00000166376 890 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Usp12Q9D9M2 Gps1-207ENSMUST00000172809 2000 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Usp12Q9D9M2 Gm42802-201ENSMUST00000202475 456 ntTSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Usp12Q9D9M2 Gm44202-201ENSMUST00000203549 532 ntTSL 3 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Usp12Q9D9M2 Lmo1-203ENSMUST00000208136 772 ntTSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Usp12Q9D9M2 Tssc4-208ENSMUST00000208779 647 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Usp12Q9D9M2 Ndufb7-201ENSMUST00000036996 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Usp12Q9D9M2 Tbcc-201ENSMUST00000040434 1164 ntAPPRIS P1 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Usp12Q9D9M2 Dsg2-202ENSMUST00000120102 3590 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Usp12Q9D9M2 Pwwp2a-201ENSMUST00000061070 3277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Usp12Q9D9M2 Tmem150b-202ENSMUST00000086364 2822 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Usp12Q9D9M2 Ubap1-202ENSMUST00000108060 2514 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Usp12Q9D9M2 Hira-202ENSMUST00000120532 2063 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Usp12Q9D9M2 Bend4-201ENSMUST00000169190 7935 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Usp12Q9D9M2 Secisbp2-202ENSMUST00000110044 1915 ntTSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Usp12Q9D9M2 Krt28-201ENSMUST00000006963 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Usp12Q9D9M2 Cactin-201ENSMUST00000050867 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Usp12Q9D9M2 Pick1-202ENSMUST00000053926 2415 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Usp12Q9D9M2 A130010J15Rik-201ENSMUST00000110831 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Usp12Q9D9M2 Dpys-201ENSMUST00000022915 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Usp12Q9D9M2 Xrcc1-205ENSMUST00000205573 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Usp12Q9D9M2 Sh3bp2-203ENSMUST00000118545 3034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Usp12Q9D9M2 Lrig2-207ENSMUST00000199070 5991 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Usp12Q9D9M2 Zbtb46-202ENSMUST00000087409 2577 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Usp12Q9D9M2 Pkp2-202ENSMUST00000161342 2931 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Usp12Q9D9M2 Dnajb5-201ENSMUST00000037872 3291 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Usp12Q9D9M2 Tprn-201ENSMUST00000114336 2787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Usp12Q9D9M2 Mfsd4b3-201ENSMUST00000095749 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Usp12Q9D9M2 Ndufb6-202ENSMUST00000108108 480 ntTSL 3 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Usp12Q9D9M2 Kbtbd2-202ENSMUST00000114323 3816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Usp12Q9D9M2 Ctsd-202ENSMUST00000151120 2127 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Usp12Q9D9M2 Gm45890-204ENSMUST00000212356 545 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Usp12Q9D9M2 Tac4-201ENSMUST00000021242 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Usp12Q9D9M2 Zfyve21-204ENSMUST00000221375 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Usp12Q9D9M2 Ube2f-201ENSMUST00000059743 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Usp12Q9D9M2 Axin1-202ENSMUST00000118904 2833 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Usp12Q9D9M2 Zbtb7c-201ENSMUST00000058997 4569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Usp12Q9D9M2 Gfra2-202ENSMUST00000227633 1480 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
Usp12Q9D9M2 Rgl3-201ENSMUST00000045726 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Usp12Q9D9M2 Eif4a2-201ENSMUST00000023599 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Usp12Q9D9M2 Hnrnpll-201ENSMUST00000061331 3116 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Usp12Q9D9M2 Mn1-201ENSMUST00000094463 6860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Usp12Q9D9M2 Zfp24-203ENSMUST00000153337 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Usp12Q9D9M2 Taf5l-202ENSMUST00000165628 2973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Usp12Q9D9M2 Men1-203ENSMUST00000079327 2639 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Usp12Q9D9M2 6430548M08Rik-201ENSMUST00000034281 5564 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Usp12Q9D9M2 Magi1-202ENSMUST00000089317 7209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Usp12Q9D9M2 0610010F05Rik-203ENSMUST00000109532 4106 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Usp12Q9D9M2 Eif6-202ENSMUST00000109638 1382 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Usp12Q9D9M2 Bcor-204ENSMUST00000115513 6941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Usp12Q9D9M2 Efemp2-204ENSMUST00000165485 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Usp12Q9D9M2 Gdf5-201ENSMUST00000040162 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Usp12Q9D9M2 Dnajc2-204ENSMUST00000115195 1994 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Usp12Q9D9M2 Rock1-201ENSMUST00000067947 6187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Usp12Q9D9M2 Casp8-204ENSMUST00000191201 1849 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Usp12Q9D9M2 Ttc39b-202ENSMUST00000048274 1804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Usp12Q9D9M2 Hif3a-201ENSMUST00000037762 2206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Usp12Q9D9M2 Usp27x-201ENSMUST00000115744 3240 ntAPPRIS P1 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Usp12Q9D9M2 Dnajc24-201ENSMUST00000102555 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Usp12Q9D9M2 Zscan10-204ENSMUST00000118369 1006 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Usp12Q9D9M2 Chchd7-205ENSMUST00000120732 711 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Usp12Q9D9M2 Gm44454-201ENSMUST00000198541 138 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
Usp12Q9D9M2 Prm1-201ENSMUST00000023144 469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Usp12Q9D9M2 1700037H04Rik-201ENSMUST00000028800 832 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.2 ms