Protein–RNA interactions for Protein: Q9D9D9

Uncharacterized protein C1orf189 homolog, mousemouse

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Length 101 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q9D9D9 Cyp4f14-202ENSMUST00000179434 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Q9D9D9 Cyp4f14-201ENSMUST00000054174 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Q9D9D9 Clasrp-201ENSMUST00000086041 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Q9D9D9 Gm12350-201ENSMUST00000121208 462 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
Q9D9D9 Tmem141-205ENSMUST00000142087 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Q9D9D9 Rbm14-203ENSMUST00000180008 370 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Q9D9D9 Gm18206-201ENSMUST00000207027 926 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
Q9D9D9 AC110091.2-202ENSMUST00000216718 1148 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Q9D9D9 Dync1li2-201ENSMUST00000041769 4627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Q9D9D9 Fem1b-201ENSMUST00000034775 6785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Q9D9D9 Zyx-205ENSMUST00000203401 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Q9D9D9 Slit1-203ENSMUST00000169141 5673 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Q9D9D9 Tyro3-201ENSMUST00000028763 3989 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Q9D9D9 Lrrtm1-202ENSMUST00000159616 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Q9D9D9 Gmppa-202ENSMUST00000113584 1692 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Q9D9D9 Tmem214-201ENSMUST00000114716 2220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Q9D9D9 Ercc6l2-202ENSMUST00000021926 1592 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Q9D9D9 Tstd3-201ENSMUST00000029915 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Q9D9D9 Cobl-203ENSMUST00000109651 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Q9D9D9 Rab34-201ENSMUST00000002128 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Q9D9D9 Cpq-201ENSMUST00000042167 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Q9D9D9 Hectd3-201ENSMUST00000050067 4583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Q9D9D9 Ttbk1-201ENSMUST00000047034 6959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Q9D9D9 Nnat-202ENSMUST00000109526 1213 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Q9D9D9 Nkx1-2-201ENSMUST00000054562 3264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Q9D9D9 Tll1-201ENSMUST00000066166 4767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Q9D9D9 Gm26904-201ENSMUST00000181301 1742 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Q9D9D9 Taf6l-212ENSMUST00000177216 2167 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Q9D9D9 Plppr3-207ENSMUST00000167250 3063 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Q9D9D9 Evpl-201ENSMUST00000037007 6384 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Q9D9D9 Ebf1-203ENSMUST00000109268 2864 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Q9D9D9 Zmym3-204ENSMUST00000118092 1502 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Q9D9D9 Ppfia3-207ENSMUST00000211067 4565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Q9D9D9 Tead3-205ENSMUST00000154873 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Q9D9D9 Rcc1-203ENSMUST00000105951 2326 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Q9D9D9 Slc11a1-201ENSMUST00000027368 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Q9D9D9 Hoxb5-201ENSMUST00000049272 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Q9D9D9 Nox4-202ENSMUST00000068829 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Q9D9D9 Ankrd10-201ENSMUST00000033905 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Q9D9D9 Umad1-202ENSMUST00000159335 2615 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Q9D9D9 Hey2-201ENSMUST00000019924 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Q9D9D9 Pfkfb4-203ENSMUST00000198140 3488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Q9D9D9 Arl4a-201ENSMUST00000101472 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Q9D9D9 Gm13962-201ENSMUST00000131512 611 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Q9D9D9 Nat8b-ps-201ENSMUST00000162660 699 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
Q9D9D9 Gm20478-201ENSMUST00000173648 1031 ntTSL 3 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Q9D9D9 Mir5126-201ENSMUST00000175513 77 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
Q9D9D9 Gm20324-201ENSMUST00000186291 1118 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Q9D9D9 Gm6550-201ENSMUST00000187574 993 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
Q9D9D9 2810030D12Rik-203ENSMUST00000190461 1039 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
Q9D9D9 Gm45144-201ENSMUST00000207473 354 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Q9D9D9 Cfd-202ENSMUST00000217837 871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Q9D9D9 Csrp2-207ENSMUST00000220409 780 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Q9D9D9 Il3ra-205ENSMUST00000224877 1128 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Q9D9D9 Sod1-201ENSMUST00000023707 646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Q9D9D9 Tmem52-201ENSMUST00000023920 932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Q9D9D9 Izumo1r-201ENSMUST00000034409 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Q9D9D9 P2rx4-201ENSMUST00000031429 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Q9D9D9 Map3k10-202ENSMUST00000108341 3403 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Q9D9D9 5730480H06Rik-205ENSMUST00000196950 3300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Q9D9D9 Fnbp1-204ENSMUST00000100208 1859 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Q9D9D9 Haglr-201ENSMUST00000100000 2085 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
Q9D9D9 Golph3-201ENSMUST00000059680 2652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Q9D9D9 Map6-207ENSMUST00000208924 2906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Q9D9D9 Sucla2-203ENSMUST00000160507 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Q9D9D9 Gm3928-201ENSMUST00000121141 1307 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
Q9D9D9 Lcat-201ENSMUST00000038896 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Q9D9D9 Map2k3-201ENSMUST00000019076 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Q9D9D9 Ubqln4-201ENSMUST00000008748 3330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Q9D9D9 Cadps2-201ENSMUST00000018122 4723 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Q9D9D9 Ftl2-ps-201ENSMUST00000118517 552 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
Q9D9D9 Sec22b-202ENSMUST00000122288 1177 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Q9D9D9 Timm23-206ENSMUST00000170331 777 ntTSL 3 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Q9D9D9 1700039E22Rik-201ENSMUST00000174082 770 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Q9D9D9 Pantr2-201ENSMUST00000180589 463 ntTSL 3 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Q9D9D9 Zfp524-202ENSMUST00000207901 1263 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Q9D9D9 Cenpp-201ENSMUST00000021818 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Q9D9D9 Lce1l-201ENSMUST00000054426 670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Q9D9D9 Gm15590-201ENSMUST00000078419 552 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
Q9D9D9 Psma5-201ENSMUST00000090569 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Q9D9D9 Ociad2-202ENSMUST00000200776 2359 ntTSL 3 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Q9D9D9 Acbd3-201ENSMUST00000027780 3471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Q9D9D9 Stx6-201ENSMUST00000027743 4589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Q9D9D9 Rnf13-205ENSMUST00000198214 2027 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Q9D9D9 Pitx2-206ENSMUST00000174623 1493 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Q9D9D9 4933433G15Rik-201ENSMUST00000180533 1481 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Q9D9D9 Sf1-203ENSMUST00000113488 2282 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Q9D9D9 D930048G16Rik-201ENSMUST00000180975 2266 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Q9D9D9 Hmgb3-204ENSMUST00000114582 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Q9D9D9 Zfp42-202ENSMUST00000209356 1744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Q9D9D9 Hmgb3-203ENSMUST00000088874 1728 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Q9D9D9 Micall1-201ENSMUST00000040320 6701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Q9D9D9 Inip-202ENSMUST00000107526 1438 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Q9D9D9 Rbm47-203ENSMUST00000113724 2186 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Q9D9D9 Fscn1-207ENSMUST00000198017 2157 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Q9D9D9 Osbpl1a-208ENSMUST00000121888 2674 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Q9D9D9 Chst8-201ENSMUST00000078686 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Q9D9D9 Zbtb7c-201ENSMUST00000058997 4569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Q9D9D9 Shh-201ENSMUST00000002708 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Q9D9D9 Shank1-201ENSMUST00000107934 6477 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.3 ms