Protein–RNA interactions for Protein: Q9D915

Tcim, Transcriptional and immune response regulator, mousemouse

Predictions only

Length 106 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TcimQ9D915 Jtb-202ENSMUST00000119304 878 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
TcimQ9D915 BC051226-201ENSMUST00000172526 837 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
TcimQ9D915 AC122351.1-201ENSMUST00000220467 126 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
TcimQ9D915 Nme3-201ENSMUST00000024978 715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
TcimQ9D915 Snrnp35-201ENSMUST00000031349 1115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
TcimQ9D915 Zbtb48-201ENSMUST00000066715 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
TcimQ9D915 Cd151-201ENSMUST00000058746 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
TcimQ9D915 Mis12-206ENSMUST00000164220 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
TcimQ9D915 Dohh-201ENSMUST00000072751 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
TcimQ9D915 4930448E22Rik-201ENSMUST00000181712 1581 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
TcimQ9D915 Rasgrp2-208ENSMUST00000113476 2296 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
TcimQ9D915 Kif12-205ENSMUST00000156618 2258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
TcimQ9D915 Sytl1-202ENSMUST00000105908 1730 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
TcimQ9D915 Hps1-201ENSMUST00000026194 2647 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
TcimQ9D915 Dkk1-201ENSMUST00000025803 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
TcimQ9D915 Gm42743-201ENSMUST00000051089 1511 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
TcimQ9D915 Spns1-203ENSMUST00000119846 2017 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
TcimQ9D915 Plk1-201ENSMUST00000033154 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
TcimQ9D915 Mrps27-201ENSMUST00000052249 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
TcimQ9D915 Gm13034-201ENSMUST00000121342 3177 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
TcimQ9D915 Keap1-201ENSMUST00000049567 3172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
TcimQ9D915 6030419C18Rik-202ENSMUST00000216294 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
TcimQ9D915 Nsl1-203ENSMUST00000139340 837 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
TcimQ9D915 Ssr2-207ENSMUST00000195014 1059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
TcimQ9D915 Kif22-201ENSMUST00000032915 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
TcimQ9D915 Sohlh1-201ENSMUST00000076989 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
TcimQ9D915 Gm7579-201ENSMUST00000097943 732 ntAPPRIS P1 BASIC15.48■□□□□ 0.07
TcimQ9D915 Vps37c-201ENSMUST00000087951 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
TcimQ9D915 Arfgap2-202ENSMUST00000080008 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
TcimQ9D915 Ythdc2-201ENSMUST00000037763 7215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
TcimQ9D915 Bag4-201ENSMUST00000038498 4876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
TcimQ9D915 Zfp202-203ENSMUST00000168832 3329 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
TcimQ9D915 Pcbp4-201ENSMUST00000024260 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
TcimQ9D915 Med26-201ENSMUST00000058534 2997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
TcimQ9D915 Irf2bpl-201ENSMUST00000038422 4098 ntAPPRIS P1 BASIC15.48■□□□□ 0.07
TcimQ9D915 Fam178b-201ENSMUST00000114981 1659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
TcimQ9D915 9230020A06Rik-203ENSMUST00000214621 1682 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
TcimQ9D915 Glg1-204ENSMUST00000169020 7021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
TcimQ9D915 Zfp13-202ENSMUST00000115516 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
TcimQ9D915 Plch2-212ENSMUST00000186598 2119 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
TcimQ9D915 Dlg4-201ENSMUST00000018700 3204 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
TcimQ9D915 Ythdf3-202ENSMUST00000108346 4929 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
TcimQ9D915 Pald1-201ENSMUST00000020289 4282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
TcimQ9D915 Ptn-201ENSMUST00000101534 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
TcimQ9D915 Vgll3-201ENSMUST00000168064 7009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
TcimQ9D915 4833422C13Rik-201ENSMUST00000099331 2083 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
TcimQ9D915 BC037039-201ENSMUST00000192003 2205 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
TcimQ9D915 Itm2c-201ENSMUST00000027425 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
TcimQ9D915 Hhat-201ENSMUST00000044190 2839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
TcimQ9D915 Scara3-201ENSMUST00000042046 3597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
TcimQ9D915 Gnas-211ENSMUST00000109096 2465 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
TcimQ9D915 Psme2-208ENSMUST00000161807 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
TcimQ9D915 Snrnp48-202ENSMUST00000178564 847 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
TcimQ9D915 Gm2274-201ENSMUST00000184539 609 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
TcimQ9D915 Smarcc1-204ENSMUST00000197984 3538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
TcimQ9D915 AC135963.1-201ENSMUST00000211640 717 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
TcimQ9D915 4930512B01Rik-201ENSMUST00000021378 1856 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
TcimQ9D915 Map7-205ENSMUST00000214231 675 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
TcimQ9D915 Gm7213-201ENSMUST00000215977 950 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
TcimQ9D915 Ogfod2-201ENSMUST00000024470 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
TcimQ9D915 Srrd-201ENSMUST00000031289 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
TcimQ9D915 Zmym3-201ENSMUST00000063577 6057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
TcimQ9D915 Igdcc4-202ENSMUST00000077696 6361 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
TcimQ9D915 Gm26578-201ENSMUST00000181702 4611 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
TcimQ9D915 Smox-204ENSMUST00000110181 2299 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
TcimQ9D915 Tnfrsf13c-202ENSMUST00000109535 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
TcimQ9D915 Cryzl1-201ENSMUST00000073466 1965 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
TcimQ9D915 Hs3st1-201ENSMUST00000053116 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
TcimQ9D915 Iqcd-202ENSMUST00000094391 1673 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
TcimQ9D915 Srsf11-204ENSMUST00000121326 3106 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
TcimQ9D915 Sesn1-202ENSMUST00000099931 3809 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
TcimQ9D915 Cdon-202ENSMUST00000119129 7503 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
TcimQ9D915 St7l-211ENSMUST00000200132 2636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
TcimQ9D915 Pfkfb4-203ENSMUST00000198140 3488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
TcimQ9D915 H2-K1-201ENSMUST00000025181 1605 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
TcimQ9D915 Ubash3b-201ENSMUST00000044155 6354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
TcimQ9D915 Mrap2-203ENSMUST00000179313 2039 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
TcimQ9D915 Myh14-204ENSMUST00000207775 6499 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
TcimQ9D915 Dab2ip-202ENSMUST00000091010 6455 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
TcimQ9D915 Muc3a-201ENSMUST00000179412 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
TcimQ9D915 Dnm2-211ENSMUST00000173397 3510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
TcimQ9D915 Elmo2-202ENSMUST00000074046 3502 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
TcimQ9D915 Tmem201-201ENSMUST00000054459 4631 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
TcimQ9D915 Dlgap4-204ENSMUST00000109566 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
TcimQ9D915 Pias3-201ENSMUST00000064900 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
TcimQ9D915 AC154412.1-201ENSMUST00000226540 2786 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
TcimQ9D915 Plscr3-202ENSMUST00000108632 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
TcimQ9D915 Gm14321-201ENSMUST00000127441 632 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
TcimQ9D915 Tnfaip8-208ENSMUST00000148989 1002 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
TcimQ9D915 Gm20403-201ENSMUST00000173803 372 ntAPPRIS P1 BASIC15.46■□□□□ 0.07
TcimQ9D915 4933427E11Rik-201ENSMUST00000056711 1214 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
TcimQ9D915 Gm29676-201ENSMUST00000222396 1689 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
TcimQ9D915 Pde3b-201ENSMUST00000032909 6573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
TcimQ9D915 Hook2-201ENSMUST00000064495 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
TcimQ9D915 Btbd3-202ENSMUST00000091556 4657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
TcimQ9D915 Atp2b3-203ENSMUST00000114479 4637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.06
TcimQ9D915 Tm9sf1-203ENSMUST00000121791 2148 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.06
TcimQ9D915 Kcnq4-201ENSMUST00000030376 3919 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.06
TcimQ9D915 Zfp42-202ENSMUST00000209356 1744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
TcimQ9D915 Wnk2-207ENSMUST00000159559 6584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.7 ms