Protein–RNA interactions for Protein: Q9D902

Gtf2e2, General transcription factor IIE subunit 2, mousemouse

Predictions only

Length 292 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gtf2e2Q9D902 Atg101-201ENSMUST00000048393 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Gtf2e2Q9D902 Serf2-201ENSMUST00000099475 525 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Gtf2e2Q9D902 Ralgapa1-201ENSMUST00000085385 7901 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Gtf2e2Q9D902 Erlec1-201ENSMUST00000073192 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Gtf2e2Q9D902 Camk2d-221ENSMUST00000171289 2217 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Gtf2e2Q9D902 Fbxo31-201ENSMUST00000059018 4358 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Gtf2e2Q9D902 Mettl27-205ENSMUST00000111221 1796 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Gtf2e2Q9D902 Mcm9-201ENSMUST00000075540 4882 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Gtf2e2Q9D902 Ppfia3-207ENSMUST00000211067 4565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Gtf2e2Q9D902 Myb-203ENSMUST00000188495 3693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Gtf2e2Q9D902 Cap1-203ENSMUST00000106257 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Gtf2e2Q9D902 Edem3-201ENSMUST00000059498 6327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Gtf2e2Q9D902 Dok3-201ENSMUST00000047877 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Gtf2e2Q9D902 Gtpbp3-201ENSMUST00000007754 2800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Gtf2e2Q9D902 Gm26825-201ENSMUST00000181751 2026 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Gtf2e2Q9D902 Zfp451-201ENSMUST00000019861 3958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Gtf2e2Q9D902 Tmem229b-201ENSMUST00000056660 3860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Gtf2e2Q9D902 Sik2-201ENSMUST00000041375 3552 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Gtf2e2Q9D902 Ccdc13-202ENSMUST00000135986 2640 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Gtf2e2Q9D902 Sept11-205ENSMUST00000201700 3478 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Gtf2e2Q9D902 Klk12-202ENSMUST00000107970 1115 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Gtf2e2Q9D902 Gm24589-201ENSMUST00000116692 94 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
Gtf2e2Q9D902 2410004I01Rik-201ENSMUST00000138424 1187 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Gtf2e2Q9D902 Gm15889-201ENSMUST00000159142 1083 ntTSL 3 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Gtf2e2Q9D902 Gm20675-201ENSMUST00000175861 338 ntTSL 3 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Gtf2e2Q9D902 Gm38119-201ENSMUST00000192027 755 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Gtf2e2Q9D902 Gm44430-201ENSMUST00000203376 995 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
Gtf2e2Q9D902 Olfr571-201ENSMUST00000061738 969 ntAPPRIS P1 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Gtf2e2Q9D902 Adam9-204ENSMUST00000208247 4044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Gtf2e2Q9D902 Jam2-201ENSMUST00000098407 1998 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Gtf2e2Q9D902 Tef-201ENSMUST00000023024 4079 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Gtf2e2Q9D902 Erich2-203ENSMUST00000134607 1659 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Gtf2e2Q9D902 4931440P22Rik-202ENSMUST00000147424 2430 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Gtf2e2Q9D902 Sh2b1-201ENSMUST00000032978 3393 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Gtf2e2Q9D902 Skor1-202ENSMUST00000116613 3591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Gtf2e2Q9D902 Kifc3-212ENSMUST00000213004 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Gtf2e2Q9D902 Atg4d-201ENSMUST00000065005 5951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Gtf2e2Q9D902 Gm26568-201ENSMUST00000180496 1594 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Gtf2e2Q9D902 Taf6l-213ENSMUST00000189739 1794 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Gtf2e2Q9D902 Zkscan2-203ENSMUST00000128217 2218 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Gtf2e2Q9D902 Paxbp1-202ENSMUST00000118522 3973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Gtf2e2Q9D902 Kcnq2-205ENSMUST00000103048 2827 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Gtf2e2Q9D902 Rabl6-201ENSMUST00000058137 3230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Gtf2e2Q9D902 Gm12895-201ENSMUST00000122214 226 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
Gtf2e2Q9D902 Gm12963-201ENSMUST00000131846 783 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Gtf2e2Q9D902 Vegfc-203ENSMUST00000210831 555 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Gtf2e2Q9D902 Ephx4-201ENSMUST00000049146 1279 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Gtf2e2Q9D902 Ctage5-213ENSMUST00000176464 4434 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Gtf2e2Q9D902 Cask-204ENSMUST00000115438 8366 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Gtf2e2Q9D902 Pacsin3-202ENSMUST00000059566 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Gtf2e2Q9D902 A130010J15Rik-201ENSMUST00000110831 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Gtf2e2Q9D902 Gpr37l1-201ENSMUST00000027682 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Gtf2e2Q9D902 Ly6e-201ENSMUST00000051698 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Gtf2e2Q9D902 Dyrk3-201ENSMUST00000016670 3164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Gtf2e2Q9D902 Stpg1-201ENSMUST00000063707 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Gtf2e2Q9D902 Ino80e-203ENSMUST00000106343 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Gtf2e2Q9D902 Timm44-201ENSMUST00000003029 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Gtf2e2Q9D902 Fbxl16-201ENSMUST00000045692 3478 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Gtf2e2Q9D902 Nisch-208ENSMUST00000165981 2415 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Gtf2e2Q9D902 Pgap3-202ENSMUST00000090827 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Gtf2e2Q9D902 Dennd1a-201ENSMUST00000102787 4342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Gtf2e2Q9D902 Chrm3-202ENSMUST00000187510 4336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Gtf2e2Q9D902 Mst1-204ENSMUST00000162886 2209 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Gtf2e2Q9D902 Tll1-201ENSMUST00000066166 4767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Gtf2e2Q9D902 Fam160b1-201ENSMUST00000036407 5630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Gtf2e2Q9D902 Exoc8-201ENSMUST00000098312 4598 ntAPPRIS P1 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Gtf2e2Q9D902 Pum2-202ENSMUST00000111122 6311 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Gtf2e2Q9D902 Ret-202ENSMUST00000088790 4497 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Gtf2e2Q9D902 Haghl-201ENSMUST00000077938 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Gtf2e2Q9D902 Mgat1-201ENSMUST00000081794 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Gtf2e2Q9D902 Nipal2-201ENSMUST00000040791 4331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Gtf2e2Q9D902 Narfl-201ENSMUST00000002350 2555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Gtf2e2Q9D902 Kat2a-202ENSMUST00000103118 3046 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Gtf2e2Q9D902 Atp6v1b2-201ENSMUST00000006435 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Gtf2e2Q9D902 Rbck1-202ENSMUST00000109847 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Gtf2e2Q9D902 Pola2-202ENSMUST00000165143 2397 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Gtf2e2Q9D902 9130019P16Rik-202ENSMUST00000145111 4486 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Gtf2e2Q9D902 Rbm12b2-202ENSMUST00000095143 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Gtf2e2Q9D902 Nat9-203ENSMUST00000103040 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Gtf2e2Q9D902 Nat9-204ENSMUST00000103041 953 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Gtf2e2Q9D902 Rnf141-201ENSMUST00000106682 1101 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Gtf2e2Q9D902 C030037D09Rik-202ENSMUST00000136201 1216 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Gtf2e2Q9D902 Pafah1b3-207ENSMUST00000155118 679 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Gtf2e2Q9D902 Hikeshi-207ENSMUST00000207309 835 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Gtf2e2Q9D902 Rpl27-201ENSMUST00000077856 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Gtf2e2Q9D902 Cmtm7-202ENSMUST00000084867 874 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Gtf2e2Q9D902 Kif7-201ENSMUST00000059836 4521 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Gtf2e2Q9D902 Tmem176a-201ENSMUST00000101426 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Gtf2e2Q9D902 Gm15442-201ENSMUST00000117905 1527 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
Gtf2e2Q9D902 Gatc-201ENSMUST00000139167 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Gtf2e2Q9D902 Gm13425-201ENSMUST00000145389 5391 ntTSL 3 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Gtf2e2Q9D902 Ivns1abp-203ENSMUST00000111887 2783 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Gtf2e2Q9D902 Il3ra-203ENSMUST00000224163 2315 ntAPPRIS P2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Gtf2e2Q9D902 Zfp334-201ENSMUST00000103084 8205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Gtf2e2Q9D902 Ak3-201ENSMUST00000025696 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Gtf2e2Q9D902 Fam184a-201ENSMUST00000020003 4164 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Gtf2e2Q9D902 Rhbg-201ENSMUST00000171887 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Gtf2e2Q9D902 Zmym3-201ENSMUST00000063577 6057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Gtf2e2Q9D902 Tm6sf2-201ENSMUST00000049197 1418 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Gtf2e2Q9D902 Hist1h2ac-201ENSMUST00000171127 2482 ntAPPRIS P1 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.1 ms