Protein–RNA interactions for Protein: Q9D8S4

Rexo2, Oligoribonuclease, mitochondrial, mousemouse

Predictions only

Length 237 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rexo2Q9D8S4 Chrm3-202ENSMUST00000187510 4336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Rexo2Q9D8S4 Zfp212-201ENSMUST00000009411 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Rexo2Q9D8S4 Klhl31-201ENSMUST00000057781 6494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Rexo2Q9D8S4 Lamp2-201ENSMUST00000016678 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Rexo2Q9D8S4 Dtx3-202ENSMUST00000116229 1994 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Rexo2Q9D8S4 Nectin3-202ENSMUST00000023335 9116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Rexo2Q9D8S4 Ppfia3-207ENSMUST00000211067 4565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Rexo2Q9D8S4 Usp6nl-202ENSMUST00000114937 7484 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Rexo2Q9D8S4 Pptc7-202ENSMUST00000119015 2233 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Rexo2Q9D8S4 Ankle2-206ENSMUST00000197188 4077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Rexo2Q9D8S4 Stk40-202ENSMUST00000116286 3860 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Rexo2Q9D8S4 Ehd4-201ENSMUST00000028755 3730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Rexo2Q9D8S4 Ube2j1-202ENSMUST00000124992 3530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Rexo2Q9D8S4 Fam171b-201ENSMUST00000051454 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Rexo2Q9D8S4 Slc35e2-201ENSMUST00000043829 2910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Rexo2Q9D8S4 Gm26793-201ENSMUST00000180930 2732 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Rexo2Q9D8S4 Gm11748-201ENSMUST00000153825 1498 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Rexo2Q9D8S4 Gm13034-201ENSMUST00000121342 3177 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
Rexo2Q9D8S4 Dyrk3-201ENSMUST00000016670 3164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Rexo2Q9D8S4 Smim14-202ENSMUST00000121661 1056 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Rexo2Q9D8S4 Khdc3-204ENSMUST00000173734 1228 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Rexo2Q9D8S4 1810010D01Rik-204ENSMUST00000208788 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Rexo2Q9D8S4 3110040N11Rik-201ENSMUST00000026092 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Rexo2Q9D8S4 Srrd-201ENSMUST00000031289 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Rexo2Q9D8S4 Spag16-201ENSMUST00000065425 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Rexo2Q9D8S4 Hist1h2ad-201ENSMUST00000090776 572 ntAPPRIS P1 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Rexo2Q9D8S4 Cep55-203ENSMUST00000169673 2761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Rexo2Q9D8S4 Ydjc-203ENSMUST00000115706 3097 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Rexo2Q9D8S4 Usp43-202ENSMUST00000108677 4447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Rexo2Q9D8S4 Edem3-202ENSMUST00000187951 3115 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Rexo2Q9D8S4 Apol8-201ENSMUST00000070911 1838 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Rexo2Q9D8S4 Usp4-201ENSMUST00000035237 3662 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Rexo2Q9D8S4 Gnat1-201ENSMUST00000010205 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Rexo2Q9D8S4 Kcnn1-201ENSMUST00000110078 4047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Rexo2Q9D8S4 Kcnn1-202ENSMUST00000110081 4045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Rexo2Q9D8S4 Selenok-201ENSMUST00000112268 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Rexo2Q9D8S4 Rnps1-203ENSMUST00000163717 1920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Rexo2Q9D8S4 Plppr5-201ENSMUST00000039564 4670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Rexo2Q9D8S4 Ube2d3-210ENSMUST00000197539 2515 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Rexo2Q9D8S4 Gm37728-201ENSMUST00000195025 2292 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
Rexo2Q9D8S4 Sap18-203ENSMUST00000111269 459 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Rexo2Q9D8S4 Snx12-204ENSMUST00000156473 1114 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Rexo2Q9D8S4 Sytl3-204ENSMUST00000159880 1296 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Rexo2Q9D8S4 Gm3764-209ENSMUST00000181550 1093 ntTSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Rexo2Q9D8S4 Gm37722-201ENSMUST00000193757 208 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
Rexo2Q9D8S4 Ttc32-203ENSMUST00000219488 768 ntTSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Rexo2Q9D8S4 CT009713.7-201ENSMUST00000224689 571 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
Rexo2Q9D8S4 Fam8a1-201ENSMUST00000099547 3664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Rexo2Q9D8S4 Gjb6-201ENSMUST00000039380 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Rexo2Q9D8S4 Bicc1-201ENSMUST00000014473 3231 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Rexo2Q9D8S4 Atp2c2-201ENSMUST00000095171 3222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Rexo2Q9D8S4 Stox2-208ENSMUST00000211737 4573 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Rexo2Q9D8S4 Tdrd12-201ENSMUST00000032701 1620 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Rexo2Q9D8S4 St8sia1-201ENSMUST00000032421 8991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Rexo2Q9D8S4 Cadm2-203ENSMUST00000120898 2768 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Rexo2Q9D8S4 Csrnp1-203ENSMUST00000214058 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Rexo2Q9D8S4 Unc5d-202ENSMUST00000209401 3081 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Rexo2Q9D8S4 Unc5d-203ENSMUST00000210298 3060 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Rexo2Q9D8S4 Unc5d-205ENSMUST00000211448 3087 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Rexo2Q9D8S4 Eps8l1-201ENSMUST00000086372 2522 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Rexo2Q9D8S4 Tbc1d20-201ENSMUST00000028963 3386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Rexo2Q9D8S4 Zfp90-201ENSMUST00000034382 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Rexo2Q9D8S4 Brpf1-202ENSMUST00000113119 4826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Rexo2Q9D8S4 Mettl7a2-202ENSMUST00000176287 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Rexo2Q9D8S4 Mettl7a2-201ENSMUST00000088142 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Rexo2Q9D8S4 Stard7-201ENSMUST00000110374 1530 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Rexo2Q9D8S4 Ano8-201ENSMUST00000093450 3653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Rexo2Q9D8S4 Cdkl3-201ENSMUST00000063303 2765 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Rexo2Q9D8S4 Clcn2-201ENSMUST00000007207 3128 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Rexo2Q9D8S4 Fndc11-202ENSMUST00000108835 1154 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Rexo2Q9D8S4 Atp6v1g2-203ENSMUST00000130992 524 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Rexo2Q9D8S4 Creb1-203ENSMUST00000171164 1287 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Rexo2Q9D8S4 Bcl7c-205ENSMUST00000205977 891 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Rexo2Q9D8S4 6530437J22Rik-201ENSMUST00000207515 773 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Rexo2Q9D8S4 Sdhaf4-201ENSMUST00000027338 683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Rexo2Q9D8S4 Wdr33-202ENSMUST00000082319 1152 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Rexo2Q9D8S4 Unc93b1-203ENSMUST00000162708 2266 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Rexo2Q9D8S4 Utp3-201ENSMUST00000090413 1629 ntAPPRIS P1 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Rexo2Q9D8S4 Dsn1-202ENSMUST00000103130 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Rexo2Q9D8S4 Cryzl1-201ENSMUST00000073466 1965 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Rexo2Q9D8S4 Bbs10-201ENSMUST00000040454 2744 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Rexo2Q9D8S4 Frrs1l-201ENSMUST00000053681 6817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Rexo2Q9D8S4 Cep19-202ENSMUST00000115168 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Rexo2Q9D8S4 Vps37c-201ENSMUST00000087951 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Rexo2Q9D8S4 Txnrd1-206ENSMUST00000219442 3531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Rexo2Q9D8S4 Fubp3-201ENSMUST00000055244 3648 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Rexo2Q9D8S4 Edn2-201ENSMUST00000030384 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Rexo2Q9D8S4 Acbd5-203ENSMUST00000114526 3725 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Rexo2Q9D8S4 Glis1-202ENSMUST00000106738 2744 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Rexo2Q9D8S4 Gpr135-201ENSMUST00000050649 3150 ntAPPRIS P1 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Rexo2Q9D8S4 Cmtm3-201ENSMUST00000034343 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Rexo2Q9D8S4 Zpbp-201ENSMUST00000020413 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Rexo2Q9D8S4 0610009B22Rik-202ENSMUST00000109098 892 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Rexo2Q9D8S4 Unc5a-202ENSMUST00000109994 3827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Rexo2Q9D8S4 1110046J04Rik-201ENSMUST00000147622 397 ntTSL 3 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Rexo2Q9D8S4 Utp23-204ENSMUST00000161651 582 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Rexo2Q9D8S4 BC051226-201ENSMUST00000172526 837 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Rexo2Q9D8S4 Fau-203ENSMUST00000179142 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Rexo2Q9D8S4 4930544I03Rik-201ENSMUST00000181184 1276 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Rexo2Q9D8S4 Pabpn1l-202ENSMUST00000212966 1113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.3 ms