Protein–RNA interactions for Protein: Q9D8Q6

Uncharacterized protein C11orf53 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 235 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q9D8Q6 Casp2-201ENSMUST00000031895 3529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Q9D8Q6 Casp8ap2-201ENSMUST00000029950 6799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Q9D8Q6 Runx2-213ENSMUST00000162878 2987 ntTSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Q9D8Q6 Mtx2-201ENSMUST00000028511 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Q9D8Q6 Adam15-202ENSMUST00000074582 2799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Q9D8Q6 Ap1s1-201ENSMUST00000111080 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Q9D8Q6 2810468N07Rik-201ENSMUST00000163493 1349 ntTSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Q9D8Q6 Rnf13-209ENSMUST00000199041 1062 ntTSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Q9D8Q6 Hist1h2af-201ENSMUST00000073261 399 ntAPPRIS P1 BASIC11.72□□□□□ -0.53
Q9D8Q6 Olfr601-201ENSMUST00000080474 990 ntAPPRIS P1 BASIC11.72□□□□□ -0.53
Q9D8Q6 Paox-202ENSMUST00000097967 1024 ntTSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Q9D8Q6 Rab10-201ENSMUST00000021001 3513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Q9D8Q6 Tmem56-203ENSMUST00000128909 6696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Q9D8Q6 Clcn3-203ENSMUST00000093490 5518 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Q9D8Q6 Snx1-201ENSMUST00000034946 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Q9D8Q6 Bin2-207ENSMUST00000183211 2036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.72□□□□□ -0.53
Q9D8Q6 Git2-204ENSMUST00000112185 5032 ntTSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Q9D8Q6 Fut7-203ENSMUST00000114278 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Q9D8Q6 Dnajc2-204ENSMUST00000115195 1994 ntTSL 5 BASIC11.72□□□□□ -0.53
Q9D8Q6 Fut7-201ENSMUST00000041654 1970 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.72□□□□□ -0.53
Q9D8Q6 Sfmbt1-201ENSMUST00000054230 7837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.72□□□□□ -0.53
Q9D8Q6 Stx6-201ENSMUST00000027743 4589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Q9D8Q6 Mfsd10-203ENSMUST00000114331 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Q9D8Q6 Tmx4-203ENSMUST00000110120 2602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Q9D8Q6 Tcf25-205ENSMUST00000212470 2572 ntTSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Q9D8Q6 Slc38a10-203ENSMUST00000076697 1672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
Q9D8Q6 Ube2d3-208ENSMUST00000197134 2493 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.71□□□□□ -0.53
Q9D8Q6 Zxdc-202ENSMUST00000075117 4126 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
Q9D8Q6 Ankle2-206ENSMUST00000197188 4077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
Q9D8Q6 Pla2g2c-201ENSMUST00000030530 1618 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.71□□□□□ -0.53
Q9D8Q6 Spock3-204ENSMUST00000119068 3201 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.71□□□□□ -0.53
Q9D8Q6 Gm9889-202ENSMUST00000206983 1577 ntBASIC11.71□□□□□ -0.53
Q9D8Q6 Taf5l-201ENSMUST00000093039 2912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
Q9D8Q6 Sash1-201ENSMUST00000015449 7183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
Q9D8Q6 Lmo4-202ENSMUST00000121112 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
Q9D8Q6 Klhl33-202ENSMUST00000170855 1422 ntTSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
Q9D8Q6 Gm32996-201ENSMUST00000199828 1447 ntBASIC11.71□□□□□ -0.53
Q9D8Q6 Pgc-201ENSMUST00000024782 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
Q9D8Q6 Hsd17b1-201ENSMUST00000019445 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
Q9D8Q6 Gm26560-201ENSMUST00000181240 2619 ntTSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
Q9D8Q6 Jph4-201ENSMUST00000022819 4489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
Q9D8Q6 Mdfi-203ENSMUST00000113280 1281 ntTSL 5 BASIC11.71□□□□□ -0.53
Q9D8Q6 Gm16181-201ENSMUST00000118793 567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
Q9D8Q6 Gm12781-201ENSMUST00000146269 395 ntTSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
Q9D8Q6 Bex3-204ENSMUST00000178632 933 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC11.71□□□□□ -0.53
Q9D8Q6 Gm21362-201ENSMUST00000194272 928 ntBASIC11.71□□□□□ -0.53
Q9D8Q6 Upk3a-201ENSMUST00000023070 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
Q9D8Q6 Ctage5-213ENSMUST00000176464 4434 ntTSL 5 BASIC11.71□□□□□ -0.53
Q9D8Q6 Kif26a-201ENSMUST00000128402 6918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
Q9D8Q6 Mapk8ip2-201ENSMUST00000023291 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
Q9D8Q6 Chpf-202ENSMUST00000094818 3065 ntTSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
Q9D8Q6 Sctr-202ENSMUST00000189037 1819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.54
Q9D8Q6 Irf7-202ENSMUST00000097952 1764 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.54
Q9D8Q6 Rcc1-203ENSMUST00000105951 2326 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.71□□□□□ -0.54
Q9D8Q6 Gdf5-201ENSMUST00000040162 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.54
Q9D8Q6 Arid4b-204ENSMUST00000110536 5783 ntTSL 5 BASIC11.71□□□□□ -0.54
Q9D8Q6 Gm44616-201ENSMUST00000206417 1732 ntBASIC11.71□□□□□ -0.54
Q9D8Q6 Dera-201ENSMUST00000087675 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.54
Q9D8Q6 Kif7-201ENSMUST00000059836 4521 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.54
Q9D8Q6 A4galt-202ENSMUST00000164614 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.54
Q9D8Q6 Flt1-202ENSMUST00000031653 6895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.54
Q9D8Q6 Zfp668-201ENSMUST00000054415 5768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.54
Q9D8Q6 Kctd6-202ENSMUST00000170111 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.54
Q9D8Q6 Kcnj6-202ENSMUST00000099508 3086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.54
Q9D8Q6 Gm17200-201ENSMUST00000170214 2022 ntTSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Q9D8Q6 Stx7-201ENSMUST00000020174 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Q9D8Q6 Cfap20-208ENSMUST00000213086 2544 ntTSL 2 BASIC11.7□□□□□ -0.54
Q9D8Q6 Cdc42ep1-201ENSMUST00000059619 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Q9D8Q6 Rassf3-201ENSMUST00000026902 3522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Q9D8Q6 Nes-203ENSMUST00000160694 5958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Q9D8Q6 Nlk-201ENSMUST00000142739 4444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Q9D8Q6 Mcm9-201ENSMUST00000075540 4882 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.7□□□□□ -0.54
Q9D8Q6 Rft1-201ENSMUST00000064230 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Q9D8Q6 Nipal3-201ENSMUST00000102549 5153 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Q9D8Q6 Spdya-204ENSMUST00000167641 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.7□□□□□ -0.54
Q9D8Q6 Sh2d4a-201ENSMUST00000066594 2718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Q9D8Q6 Zbtb11-201ENSMUST00000050248 4920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.7□□□□□ -0.54
Q9D8Q6 Dtx2-202ENSMUST00000111142 2650 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Q9D8Q6 Tmem5-205ENSMUST00000140299 4793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Q9D8Q6 Cidec-202ENSMUST00000113089 1720 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Q9D8Q6 Gss-203ENSMUST00000130881 1724 ntTSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Q9D8Q6 Adcy3-207ENSMUST00000152065 4728 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Q9D8Q6 Rps27a-202ENSMUST00000102845 791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Q9D8Q6 Znhit1-203ENSMUST00000111090 698 ntTSL 2 BASIC11.7□□□□□ -0.54
Q9D8Q6 4930401G09Rik-201ENSMUST00000139500 637 ntTSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Q9D8Q6 Syngr2-206ENSMUST00000177131 935 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC11.7□□□□□ -0.54
Q9D8Q6 AC130671.1-201ENSMUST00000227384 1237 ntBASIC11.7□□□□□ -0.54
Q9D8Q6 AC114585.2-202ENSMUST00000228094 426 ntBASIC11.7□□□□□ -0.54
Q9D8Q6 Otx2os1-206ENSMUST00000228153 787 ntBASIC11.7□□□□□ -0.54
Q9D8Q6 Lefty2-201ENSMUST00000085797 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Q9D8Q6 Actg1-202ENSMUST00000071555 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Q9D8Q6 Zscan2-201ENSMUST00000044115 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Q9D8Q6 Bnip2-202ENSMUST00000085393 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Q9D8Q6 Inhba-202ENSMUST00000164993 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Q9D8Q6 Rhd-201ENSMUST00000030627 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Q9D8Q6 Baz1b-201ENSMUST00000002825 6492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Q9D8Q6 Pcdhb22-201ENSMUST00000097609 2266 ntTSL 2 BASIC11.7□□□□□ -0.54
Q9D8Q6 Cstf2-201ENSMUST00000033609 4502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Q9D8Q6 Mindy4-203ENSMUST00000204842 2211 ntTSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Q9D8Q6 Sdk1-202ENSMUST00000085774 10352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
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